MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 plasmid P5

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017806	CCAC	2	8	229	236	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2	NC_017806	ACCC	2	8	818	825	25 %	0 %	0 %	75 %	386855130
3	NC_017806	GCGG	2	8	872	879	0 %	0 %	75 %	25 %	386855130
4	NC_017806	GACC	2	8	976	983	25 %	0 %	25 %	50 %	386855130
5	NC_017806	AGGG	2	8	1198	1205	25 %	0 %	75 %	0 %	386855130
6	NC_017806	CGCC	2	8	1273	1280	0 %	0 %	25 %	75 %	386855130
7	NC_017806	GTGC	2	8	1503	1510	0 %	25 %	50 %	25 %	386855130
8	NC_017806	GTCA	2	8	1613	1620	25 %	25 %	25 %	25 %	386855130
9	NC_017806	GGAG	2	8	1664	1671	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017806	AGCG	2	8	2340	2347	25 %	0 %	50 %	25 %	386855132
11	NC_017806	GGCT	2	8	2664	2671	0 %	25 %	50 %	25 %	386855132
12	NC_017806	GCGT	2	8	3155	3162	0 %	25 %	50 %	25 %	386855133
13	NC_017806	CGGT	2	8	3318	3325	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017806	CGAG	2	8	3429	3436	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017806	GCCG	2	8	3437	3444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017806	GTCA	2	8	3542	3549	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017806	CAAA	2	8	3644	3651	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017806	CGGG	2	8	3732	3739	0 %	0 %	75 %	25 %	386855134
19	NC_017806	TCAG	2	8	4068	4075	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017806	AATG	2	8	4219	4226	50 %	25 %	25 %	0 %	386855136
21	NC_017806	GCCA	2	8	4577	4584	25 %	0 %	25 %	50 %	386855137
22	NC_017806	CGGC	2	8	4944	4951	0 %	0 %	50 %	50 %	386855137
23	NC_017806	GGGC	2	8	5153	5160	0 %	0 %	75 %	25 %	386855137
24	NC_017806	GGGC	2	8	5621	5628	0 %	0 %	75 %	25 %	386855138
25	NC_017806	GCCA	2	8	5929	5936	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017806	GCGG	2	8	7271	7278	0 %	0 %	75 %	25 %	386855140
27	NC_017806	GCGG	2	8	7574	7581	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017806	CAGC	2	8	7966	7973	25 %	0 %	25 %	50 %	386855141
29	NC_017806	ACGC	2	8	8187	8194	25 %	0 %	25 %	50 %	386855142
30	NC_017806	GTAG	2	8	8239	8246	25 %	25 %	50 %	0 %	386855142
31	NC_017806	TGCG	2	8	8352	8359	0 %	25 %	50 %	25 %	386855142
32	NC_017806	CACC	2	8	8693	8700	25 %	0 %	0 %	75 %	386855142
33	NC_017806	TGAC	2	8	8746	8753	25 %	25 %	25 %	25 %	386855142
34	NC_017806	GATA	2	8	10037	10044	50 %	25 %	25 %	0 %	386855144
35	NC_017806	CCGG	2	8	10125	10132	0 %	0 %	50 %	50 %	386855144
36	NC_017806	TTGG	2	8	10229	10236	0 %	50 %	50 %	0 %	386855144
37	NC_017806	AGCC	2	8	10293	10300	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017806	CAGC	2	8	10502	10509	25 %	0 %	25 %	50 %	386855145
39	NC_017806	CAGC	2	8	10946	10953	25 %	0 %	25 %	50 %	386855145
40	NC_017806	CTCA	2	8	11082	11089	25 %	25 %	0 %	50 %	386855145
41	NC_017806	GCGA	2	8	11262	11269	25 %	0 %	50 %	25 %	386855145
42	NC_017806	TGCA	2	8	11723	11730	25 %	25 %	25 %	25 %	386855146
43	NC_017806	GCCA	2	8	12006	12013	25 %	0 %	25 %	50 %	386855146
44	NC_017806	AGCG	2	8	12045	12052	25 %	0 %	50 %	25 %	386855146
45	NC_017806	CCCA	2	8	13327	13334	25 %	0 %	0 %	75 %	386855147
46	NC_017806	GTGG	2	8	13838	13845	0 %	25 %	75 %	0 %	386855147
47	NC_017806	CCAG	2	8	15181	15188	25 %	0 %	25 %	50 %	386855149
48	NC_017806	CAGC	2	8	15266	15273	25 %	0 %	25 %	50 %	386855149
49	NC_017806	CCGG	2	8	15951	15958	0 %	0 %	50 %	50 %	386855149
50	NC_017806	GCAG	2	8	15962	15969	25 %	0 %	50 %	25 %	386855149
51	NC_017806	GAAG	2	8	16761	16768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017806	GGGC	2	8	16808	16815	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017806	TCAC	2	8	17223	17230	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017806	GCTG	2	8	17391	17398	0 %	25 %	50 %	25 %	386855151
55	NC_017806	AGCC	2	8	17560	17567	25 %	0 %	25 %	50 %	386855151
56	NC_017806	GAAC	2	8	17830	17837	50 %	0 %	25 %	25 %	386855151
57	NC_017806	GCCC	2	8	18196	18203	0 %	0 %	25 %	75 %	386855151
58	NC_017806	GCGG	2	8	18274	18281	0 %	0 %	75 %	25 %	386855151
59	NC_017806	ACCC	2	8	18310	18317	25 %	0 %	0 %	75 %	386855151
60	NC_017806	GCCC	2	8	18482	18489	0 %	0 %	25 %	75 %	386855151
61	NC_017806	GACG	2	8	19669	19676	25 %	0 %	50 %	25 %	386855151
62	NC_017806	GACC	2	8	21705	21712	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017806	GACC	2	8	22071	22078	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017806	CCTG	2	8	22217	22224	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017806	CCGG	2	8	23540	23547	0 %	0 %	50 %	50 %	386855156
66	NC_017806	GATT	2	8	24225	24232	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017806	GCAA	2	8	25435	25442	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017806	GGAT	2	8	26087	26094	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017806	GTCC	2	8	27447	27454	0 %	25 %	25 %	50 %	386855160
70	NC_017806	GACC	2	8	27719	27726	25 %	0 %	25 %	50 %	386855160
71	NC_017806	GCTG	2	8	28081	28088	0 %	25 %	50 %	25 %	386855160
72	NC_017806	GCCT	2	8	28403	28410	0 %	25 %	25 %	50 %	386855161
73	NC_017806	AGGT	2	8	29169	29176	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017806	GGCA	2	8	29851	29858	25 %	0 %	50 %	25 %	386855163
75	NC_017806	GGAG	2	8	30414	30421	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017806	TTCC	2	8	31463	31470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017806	CTGT	2	8	31583	31590	0 %	50 %	25 %	25 %	386855166
78	NC_017806	TCTG	2	8	31591	31598	0 %	50 %	25 %	25 %	386855166
79	NC_017806	CCCG	2	8	31834	31841	0 %	0 %	25 %	75 %	386855167
80	NC_017806	GCTT	2	8	31928	31935	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017806	GAGG	2	8	31963	31970	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017806	CATC	2	8	32097	32104	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017806	CTTC	2	8	32751	32758	0 %	50 %	0 %	50 %	386855168
84	NC_017806	CCCG	2	8	32878	32885	0 %	0 %	25 %	75 %	386855168
85	NC_017806	TCCG	2	8	33048	33055	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017806	TTGA	2	8	33771	33778	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017806	AGCG	2	8	33798	33805	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017806	ACAG	2	8	33995	34002	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017806	CGAT	2	8	34221	34228	25 %	25 %	25 %	25 %	386855171
90	NC_017806	CCCG	2	8	35002	35009	0 %	0 %	25 %	75 %	386855172
91	NC_017806	TCCA	2	8	35173	35180	25 %	25 %	0 %	50 %	386855172
92	NC_017806	GTTC	2	8	35340	35347	0 %	50 %	25 %	25 %	386855172
93	NC_017806	CTGG	2	8	35885	35892	0 %	25 %	50 %	25 %	386855172
94	NC_017806	CCCG	2	8	36222	36229	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
95	NC_017806	GCAG	2	8	36826	36833	25 %	0 %	50 %	25 %	386855174
96	NC_017806	GTCT	2	8	36900	36907	0 %	50 %	25 %	25 %	386855174
97	NC_017806	CCGC	2	8	37141	37148	0 %	0 %	25 %	75 %	386855175
98	NC_017806	CACC	2	8	37195	37202	25 %	0 %	0 %	75 %	386855175
99	NC_017806	ACGG	2	8	37635	37642	25 %	0 %	50 %	25 %	386855177
100	NC_017806	CCGG	2	8	37997	38004	0 %	0 %	50 %	50 %	386855178
101	NC_017806	CAGG	2	8	38326	38333	25 %	0 %	50 %	25 %	386855179
102	NC_017806	CAGG	2	8	38403	38410	25 %	0 %	50 %	25 %	386855180
103	NC_017806	CAGC	2	8	38881	38888	25 %	0 %	25 %	50 %	386855181
104	NC_017806	TATC	2	8	40058	40065	25 %	50 %	0 %	25 %	386855184
105	NC_017806	TCTT	2	8	40679	40686	0 %	75 %	0 %	25 %	386855184
106	NC_017806	TCTA	2	8	40842	40849	25 %	50 %	0 %	25 %	386855184
107	NC_017806	ATGT	2	8	40893	40900	25 %	50 %	25 %	0 %	386855185
108	NC_017806	GTGC	2	8	42174	42181	0 %	25 %	50 %	25 %	386855187
109	NC_017806	GACC	2	8	42940	42947	25 %	0 %	25 %	50 %	386855189
110	NC_017806	AGGA	2	8	43222	43229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017806	AGTG	2	8	43600	43607	25 %	25 %	50 %	0 %	386855191
112	NC_017806	CGGG	2	8	44015	44022	0 %	0 %	75 %	25 %	386855192
113	NC_017806	CTTG	2	8	44439	44446	0 %	50 %	25 %	25 %	386855193
114	NC_017806	CATA	2	8	45251	45258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017806	CATG	2	8	46221	46228	25 %	25 %	25 %	25 %	386855195
116	NC_017806	CTGA	2	8	46349	46356	25 %	25 %	25 %	25 %	386855195
117	NC_017806	TGAA	2	8	46536	46543	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017806	TATT	2	8	46717	46724	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017806	ATCT	2	8	46771	46778	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017806	GAAT	2	8	46887	46894	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017806	TAGA	2	8	46939	46946	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017806	CGAC	2	8	48271	48278	25 %	0 %	25 %	50 %	386855198
123	NC_017806	GCTG	2	8	48943	48950	0 %	25 %	50 %	25 %	386855198
124	NC_017806	TCAT	2	8	49111	49118	25 %	50 %	0 %	25 %	386855198
125	NC_017806	CACC	2	8	49209	49216	25 %	0 %	0 %	75 %	386855198
126	NC_017806	GCTG	2	8	50319	50326	0 %	25 %	50 %	25 %	386855198
127	NC_017806	CCCT	2	8	51726	51733	0 %	25 %	0 %	75 %	386855201
128	NC_017806	GGAA	2	8	52084	52091	50 %	0 %	50 %	0 %	386855202
129	NC_017806	GAGC	2	8	53175	53182	25 %	0 %	50 %	25 %	386855205
130	NC_017806	CGAC	2	8	53337	53344	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017806	CGAC	2	8	53613	53620	25 %	0 %	25 %	50 %	386855206
132	NC_017806	CCAC	2	8	54011	54018	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.