MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 plasmid P2

Total Repeats: 375

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017791	CCGCT	2	10	1365	1374	0 %	20 %	20 %	60 %	386854606
2	NC_017791	GCCGC	2	10	1864	1873	0 %	0 %	40 %	60 %	386854606
3	NC_017791	GCTCC	2	10	2083	2092	0 %	20 %	20 %	60 %	386854607
4	NC_017791	GAACG	2	10	2431	2440	40 %	0 %	40 %	20 %	386854607
5	NC_017791	GGTCA	2	10	2705	2714	20 %	20 %	40 %	20 %	386854607
6	NC_017791	TCGTC	2	10	3760	3769	0 %	40 %	20 %	40 %	386854609
7	NC_017791	CCCAC	2	10	4346	4355	20 %	0 %	0 %	80 %	386854610
8	NC_017791	GGGGA	2	10	6192	6201	20 %	0 %	80 %	0 %	386854612
9	NC_017791	GGGTG	2	10	6416	6425	0 %	20 %	80 %	0 %	386854612
10	NC_017791	GCCAC	2	10	7119	7128	20 %	0 %	20 %	60 %	386854614
11	NC_017791	CGGGG	2	10	11677	11686	0 %	0 %	80 %	20 %	386854619
12	NC_017791	CAGCC	2	10	13561	13570	20 %	0 %	20 %	60 %	386854620
13	NC_017791	CGGCA	2	10	14866	14875	20 %	0 %	40 %	40 %	386854624
14	NC_017791	GGAAC	2	10	15258	15267	40 %	0 %	40 %	20 %	386854625
15	NC_017791	GACGC	2	10	16948	16957	20 %	0 %	40 %	40 %	386854627
16	NC_017791	CGCGC	2	10	17224	17233	0 %	0 %	40 %	60 %	386854627
17	NC_017791	GGTCT	2	10	18882	18891	0 %	40 %	40 %	20 %	386854630
18	NC_017791	CATGG	2	10	19118	19127	20 %	20 %	40 %	20 %	386854630
19	NC_017791	CGCGT	2	10	20947	20956	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017791	GTGGA	2	10	22415	22424	20 %	20 %	60 %	0 %	386854638
21	NC_017791	GGAAG	2	10	22946	22955	40 %	0 %	60 %	0 %	386854639
22	NC_017791	GGCGT	2	10	23843	23852	0 %	20 %	60 %	20 %	386854641
23	NC_017791	GGGCG	2	10	25389	25398	0 %	0 %	80 %	20 %	386854645
24	NC_017791	TGCAC	2	10	29364	29373	20 %	20 %	20 %	40 %	386854650
25	NC_017791	CGCAG	2	10	29738	29747	20 %	0 %	40 %	40 %	386854650
26	NC_017791	TGCCC	2	10	30200	30209	0 %	20 %	20 %	60 %	386854651
27	NC_017791	GGTCA	2	10	30800	30809	20 %	20 %	40 %	20 %	386854653
28	NC_017791	GCAGA	2	10	32426	32435	40 %	0 %	40 %	20 %	386854655
29	NC_017791	AGCCA	2	10	32517	32526	40 %	0 %	20 %	40 %	386854655
30	NC_017791	AGGGC	2	10	38663	38672	20 %	0 %	60 %	20 %	386854666
31	NC_017791	AGCGC	2	10	38742	38751	20 %	0 %	40 %	40 %	386854666
32	NC_017791	GGGGC	2	10	38826	38835	0 %	0 %	80 %	20 %	386854666
33	NC_017791	GACCA	2	10	42092	42101	40 %	0 %	20 %	40 %	386854670
34	NC_017791	CGAGT	2	10	42567	42576	20 %	20 %	40 %	20 %	386854670
35	NC_017791	CCCAG	2	10	45502	45511	20 %	0 %	20 %	60 %	386854675
36	NC_017791	CTGGG	2	10	46311	46320	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017791	TGGGC	2	10	47161	47170	0 %	20 %	60 %	20 %	386854678
38	NC_017791	GGGTC	2	10	48010	48019	0 %	20 %	60 %	20 %	386854679
39	NC_017791	GGTAC	2	10	49238	49247	20 %	20 %	40 %	20 %	386854679
40	NC_017791	CCATG	2	10	50589	50598	20 %	20 %	20 %	40 %	386854680
41	NC_017791	GCCAC	2	10	50746	50755	20 %	0 %	20 %	60 %	386854681
42	NC_017791	GGTAC	2	10	51200	51209	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017791	CCAGG	2	10	55968	55977	20 %	0 %	40 %	40 %	386854685
44	NC_017791	TGCGT	2	10	56006	56015	0 %	40 %	40 %	20 %	386854685
45	NC_017791	GCCCC	2	10	57016	57025	0 %	0 %	20 %	80 %	386854687
46	NC_017791	TCAGT	2	10	57567	57576	20 %	40 %	20 %	20 %	386854687
47	NC_017791	GAGGC	2	10	57944	57953	20 %	0 %	60 %	20 %	386854687
48	NC_017791	TCAGG	2	10	58437	58446	20 %	20 %	40 %	20 %	386854687
49	NC_017791	CGAAG	2	10	63999	64008	40 %	0 %	40 %	20 %	386854692
50	NC_017791	CGACC	2	10	65327	65336	20 %	0 %	20 %	60 %	386854693
51	NC_017791	CACCC	2	10	71779	71788	20 %	0 %	0 %	80 %	386854698
52	NC_017791	ACACC	2	10	72003	72012	40 %	0 %	0 %	60 %	386854698
53	NC_017791	CCATC	2	10	72054	72063	20 %	20 %	0 %	60 %	386854698
54	NC_017791	GGCCA	2	10	72115	72124	20 %	0 %	40 %	40 %	386854698
55	NC_017791	CCTCG	2	10	72636	72645	0 %	20 %	20 %	60 %	386854698
56	NC_017791	CAAAG	2	10	75045	75054	60 %	0 %	20 %	20 %	386854702
57	NC_017791	TGCCT	2	10	77344	77353	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_017791	CCTTG	2	10	77402	77411	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017791	GCAGT	2	10	78125	78134	20 %	20 %	40 %	20 %	386854707
60	NC_017791	GCCGG	2	10	79138	79147	0 %	0 %	60 %	40 %	386854707
61	NC_017791	CGAGA	2	10	80470	80479	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017791	CAGCG	2	10	81146	81155	20 %	0 %	40 %	40 %	386854708
63	NC_017791	CACGC	2	10	81164	81173	20 %	0 %	20 %	60 %	386854708
64	NC_017791	GACCA	2	10	81308	81317	40 %	0 %	20 %	40 %	386854708
65	NC_017791	CAGGG	2	10	81747	81756	20 %	0 %	60 %	20 %	386854708
66	NC_017791	AGGTC	2	10	81912	81921	20 %	20 %	40 %	20 %	386854708
67	NC_017791	GCCGG	2	10	82237	82246	0 %	0 %	60 %	40 %	386854709
68	NC_017791	TGATC	2	10	83224	83233	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017791	CCGCG	2	10	83960	83969	0 %	0 %	40 %	60 %	386854710
70	NC_017791	GGGAA	2	10	87854	87863	40 %	0 %	60 %	0 %	386854716
71	NC_017791	AGATC	2	10	89688	89697	40 %	20 %	20 %	20 %	386854719
72	NC_017791	GAGCC	2	10	90841	90850	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_017791	GGGCG	2	10	91249	91258	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017791	ACGTC	2	10	94328	94337	20 %	20 %	20 %	40 %	386854725
75	NC_017791	GGGAA	2	10	94371	94380	40 %	0 %	60 %	0 %	386854725
76	NC_017791	ACCAA	2	10	95586	95595	60 %	0 %	0 %	40 %	386854727
77	NC_017791	ATGGC	2	10	96172	96181	20 %	20 %	40 %	20 %	386854728
78	NC_017791	CTTCA	2	10	98591	98600	20 %	40 %	0 %	40 %	386854732
79	NC_017791	TCATG	2	10	98721	98730	20 %	40 %	20 %	20 %	386854732
80	NC_017791	AAACC	2	10	99010	99019	60 %	0 %	0 %	40 %	386854733
81	NC_017791	GCGCC	2	10	99544	99553	0 %	0 %	40 %	60 %	386854734
82	NC_017791	CCGCC	2	10	100254	100263	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
83	NC_017791	GCGCC	2	10	101795	101804	0 %	0 %	40 %	60 %	386854736
84	NC_017791	GCGCT	2	10	101901	101910	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017791	GGCAC	2	10	101952	101961	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_017791	TCACC	2	10	102170	102179	20 %	20 %	0 %	60 %	386854737
87	NC_017791	ATCGA	2	10	102316	102325	40 %	20 %	20 %	20 %	386854737
88	NC_017791	CCCAG	2	10	102979	102988	20 %	0 %	20 %	60 %	386854738
89	NC_017791	CACCC	2	10	103673	103682	20 %	0 %	0 %	80 %	386854739
90	NC_017791	GTCGC	2	10	107837	107846	0 %	20 %	40 %	40 %	386854745
91	NC_017791	CGGCC	2	10	108070	108079	0 %	0 %	40 %	60 %	386854745
92	NC_017791	GGCGT	2	10	109736	109745	0 %	20 %	60 %	20 %	386854746
93	NC_017791	GGCGA	2	10	110480	110489	20 %	0 %	60 %	20 %	386854747
94	NC_017791	GCTCA	2	10	110875	110884	20 %	20 %	20 %	40 %	386854748
95	NC_017791	GTGAC	2	10	111738	111747	20 %	20 %	40 %	20 %	386854750
96	NC_017791	CGACC	2	10	113262	113271	20 %	0 %	20 %	60 %	386854754
97	NC_017791	GCCGG	2	10	114815	114824	0 %	0 %	60 %	40 %	386854757
98	NC_017791	CACCC	2	10	116043	116052	20 %	0 %	0 %	80 %	386854760
99	NC_017791	ACCCC	2	10	118324	118333	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
100	NC_017791	GATCG	2	10	120663	120672	20 %	20 %	40 %	20 %	386854766
101	NC_017791	CGATC	2	10	122815	122824	20 %	20 %	20 %	40 %	386854771
102	NC_017791	AGGCG	2	10	124087	124096	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017791	GTCTC	2	10	125075	125084	0 %	40 %	20 %	40 %	386854776
104	NC_017791	CCCAC	2	10	126547	126556	20 %	0 %	0 %	80 %	386854779
105	NC_017791	CTCCC	2	10	132561	132570	0 %	20 %	0 %	80 %	386854784
106	NC_017791	GGCGG	2	10	133235	133244	0 %	0 %	80 %	20 %	386854784
107	NC_017791	GCCAC	2	10	133592	133601	20 %	0 %	20 %	60 %	386854784
108	NC_017791	CCAGT	2	10	133773	133782	20 %	20 %	20 %	40 %	386854784
109	NC_017791	CCCTC	2	10	134210	134219	0 %	20 %	0 %	80 %	386854785
110	NC_017791	GCCTG	2	10	135876	135885	0 %	20 %	40 %	40 %	386854785
111	NC_017791	GGCCA	2	10	135931	135940	20 %	0 %	40 %	40 %	386854785
112	NC_017791	CCGGG	2	10	138763	138772	0 %	0 %	60 %	40 %	386854787
113	NC_017791	GACCT	2	10	140206	140215	20 %	20 %	20 %	40 %	386854790
114	NC_017791	GTAAT	2	10	142928	142937	40 %	40 %	20 %	0 %	386854792
115	NC_017791	GGGTT	2	10	143246	143255	0 %	40 %	60 %	0 %	386854792
116	NC_017791	GGATG	2	10	146331	146340	20 %	20 %	60 %	0 %	386854796
117	NC_017791	TTCGC	2	10	147340	147349	0 %	40 %	20 %	40 %	386854797
118	NC_017791	CTGCC	2	10	147856	147865	0 %	20 %	20 %	60 %	386854798
119	NC_017791	TGGCC	2	10	148708	148717	0 %	20 %	40 %	40 %	386854799
120	NC_017791	GCGCT	2	10	149504	149513	0 %	20 %	40 %	40 %	386854800
121	NC_017791	CACCG	2	10	150244	150253	20 %	0 %	20 %	60 %	386854800
122	NC_017791	GCGTC	2	10	151527	151536	0 %	20 %	40 %	40 %	386854801
123	NC_017791	TTCAG	2	10	151885	151894	20 %	40 %	20 %	20 %	386854801
124	NC_017791	TTCCA	2	10	151912	151921	20 %	40 %	0 %	40 %	386854801
125	NC_017791	AGGGC	2	10	152324	152333	20 %	0 %	60 %	20 %	386854801
126	NC_017791	GGGTA	2	10	152415	152424	20 %	20 %	60 %	0 %	386854801
127	NC_017791	TCACC	2	10	154193	154202	20 %	20 %	0 %	60 %	386854802
128	NC_017791	CGAGG	2	10	155207	155216	20 %	0 %	60 %	20 %	386854803
129	NC_017791	CGCTT	2	10	155361	155370	0 %	40 %	20 %	40 %	386854803
130	NC_017791	CCTGG	2	10	155406	155415	0 %	20 %	40 %	40 %	386854803
131	NC_017791	TCGCC	2	10	161187	161196	0 %	20 %	20 %	60 %	386854812
132	NC_017791	ATCCC	2	10	162781	162790	20 %	20 %	0 %	60 %	386854815
133	NC_017791	GGTGT	2	10	162983	162992	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017791	GCGCG	2	10	163506	163515	0 %	0 %	60 %	40 %	386854816
135	NC_017791	CCGAG	2	10	164932	164941	20 %	0 %	40 %	40 %	386854817
136	NC_017791	CGGTG	2	10	166068	166077	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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302	NC_017791	TGCAC	2	10	338911	338920	20 %	20 %	20 %	40 %	386855026
303	NC_017791	CCTTG	2	10	339556	339565	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
304	NC_017791	GGTGG	2	10	339844	339853	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.