MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Deinococcus gobiensis I-0 plasmid P3

Total Repeats: 201

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017771	GGGGA	2	10	344	353	20 %	0 %	80 %	0 %	386854277
2	NC_017771	GTGCC	2	10	6802	6811	0 %	20 %	40 %	40 %	386854284
3	NC_017771	CTGGA	2	10	11835	11844	20 %	20 %	40 %	20 %	386854285
4	NC_017771	GACAC	2	10	13542	13551	40 %	0 %	20 %	40 %	386854285
5	NC_017771	GCTCA	2	10	14664	14673	20 %	20 %	20 %	40 %	386854286
6	NC_017771	GGCCC	2	10	14760	14769	0 %	0 %	40 %	60 %	386854286
7	NC_017771	CGTGA	2	10	14835	14844	20 %	20 %	40 %	20 %	386854286
8	NC_017771	AGGCC	2	10	14921	14930	20 %	0 %	40 %	40 %	386854286
9	NC_017771	CAGGG	2	10	15000	15009	20 %	0 %	60 %	20 %	386854286
10	NC_017771	GGGGC	2	10	15234	15243	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017771	CCCAG	2	10	15401	15410	20 %	0 %	20 %	60 %	386854287
12	NC_017771	AGGCC	2	10	15545	15554	20 %	0 %	40 %	40 %	386854287
13	NC_017771	TCATC	2	10	15800	15809	20 %	40 %	0 %	40 %	386854287
14	NC_017771	GGGGC	2	10	15942	15951	0 %	0 %	80 %	20 %	386854287
15	NC_017771	GCCGG	2	10	20203	20212	0 %	0 %	60 %	40 %	386854290
16	NC_017771	GCGCG	2	10	20324	20333	0 %	0 %	60 %	40 %	386854290
17	NC_017771	GCACG	2	10	22439	22448	20 %	0 %	40 %	40 %	386854292
18	NC_017771	CTCAA	2	10	22900	22909	40 %	20 %	0 %	40 %	386854293
19	NC_017771	GGTCT	2	10	22983	22992	0 %	40 %	40 %	20 %	386854293
20	NC_017771	CCAGT	2	10	27057	27066	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017771	CCTGG	2	10	29536	29545	0 %	20 %	40 %	40 %	386854301
22	NC_017771	AGGCG	2	10	30802	30811	20 %	0 %	60 %	20 %	386854301
23	NC_017771	CGCGC	2	10	32040	32049	0 %	0 %	40 %	60 %	386854302
24	NC_017771	GGTCT	2	10	32717	32726	0 %	40 %	40 %	20 %	386854303
25	NC_017771	GTCTG	2	10	33042	33051	0 %	40 %	40 %	20 %	386854303
26	NC_017771	CACCT	2	10	34408	34417	20 %	20 %	0 %	60 %	386854304
27	NC_017771	CATTC	2	10	35825	35834	20 %	40 %	0 %	40 %	386854306
28	NC_017771	CGGCG	2	10	36317	36326	0 %	0 %	60 %	40 %	386854306
29	NC_017771	CCCGC	2	10	39510	39519	0 %	0 %	20 %	80 %	386854313
30	NC_017771	GGGAT	2	10	40501	40510	20 %	20 %	60 %	0 %	386854313
31	NC_017771	GAGTG	2	10	41534	41543	20 %	20 %	60 %	0 %	386854314
32	NC_017771	CATCA	2	10	41561	41570	40 %	20 %	0 %	40 %	386854314
33	NC_017771	GTCGG	2	10	41918	41927	0 %	20 %	60 %	20 %	386854315
34	NC_017771	CACCG	2	10	43081	43090	20 %	0 %	20 %	60 %	386854317
35	NC_017771	CTGCT	2	10	43293	43302	0 %	40 %	20 %	40 %	386854318
36	NC_017771	GCTGT	2	10	46068	46077	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017771	TCGGT	2	10	47942	47951	0 %	40 %	40 %	20 %	386854322
38	NC_017771	CAGAA	2	10	48808	48817	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017771	CAATT	2	10	48988	48997	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017771	TCTCC	2	10	49648	49657	0 %	40 %	0 %	60 %	386854325
41	NC_017771	CCTCC	2	10	50026	50035	0 %	20 %	0 %	80 %	386854326
42	NC_017771	CCCCA	2	10	51439	51448	20 %	0 %	0 %	80 %	386854328
43	NC_017771	TCGCC	2	10	52244	52253	0 %	20 %	20 %	60 %	386854330
44	NC_017771	CGAGA	2	10	54358	54367	40 %	0 %	40 %	20 %	386854337
45	NC_017771	TCATA	2	10	55062	55071	40 %	40 %	0 %	20 %	386854337
46	NC_017771	AAAGA	2	10	55096	55105	80 %	0 %	20 %	0 %	386854337
47	NC_017771	GACTG	2	10	55509	55518	20 %	20 %	40 %	20 %	386854337
48	NC_017771	AAGGC	2	10	55902	55911	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017771	CAAAA	2	10	57466	57475	80 %	0 %	0 %	20 %	386854339
50	NC_017771	GTCAG	2	10	58947	58956	20 %	20 %	40 %	20 %	386854340
51	NC_017771	ACACC	2	10	59051	59060	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
52	NC_017771	GACCA	2	10	60060	60069	40 %	0 %	20 %	40 %	386854341
53	NC_017771	CGAGT	2	10	60535	60544	20 %	20 %	40 %	20 %	386854341
54	NC_017771	CCTGA	2	10	67725	67734	20 %	20 %	20 %	40 %	386854353
55	NC_017771	CCCCG	2	10	67891	67900	0 %	0 %	20 %	80 %	386854354
56	NC_017771	TCAGG	2	10	68402	68411	20 %	20 %	40 %	20 %	386854354
57	NC_017771	AGGCG	2	10	70425	70434	20 %	0 %	60 %	20 %	386854357
58	NC_017771	CGACG	2	10	71611	71620	20 %	0 %	40 %	40 %	386854358
59	NC_017771	GACGC	2	10	72982	72991	20 %	0 %	40 %	40 %	386854359
60	NC_017771	ACGCC	2	10	73145	73154	20 %	0 %	20 %	60 %	386854359
61	NC_017771	CGGCG	2	10	74208	74217	0 %	0 %	60 %	40 %	386854359
62	NC_017771	GAGAC	2	10	75022	75031	40 %	0 %	40 %	20 %	386854360
63	NC_017771	CCGGT	2	10	75679	75688	0 %	20 %	40 %	40 %	386854360
64	NC_017771	CCCGT	2	10	75901	75910	0 %	20 %	20 %	60 %	386854360
65	NC_017771	GGCAC	2	10	76007	76016	20 %	0 %	40 %	40 %	386854360
66	NC_017771	CCCTT	2	10	76537	76546	0 %	40 %	0 %	60 %	386854360
67	NC_017771	TCGCT	2	10	77062	77071	0 %	40 %	20 %	40 %	386854360
68	NC_017771	CCCTG	2	10	77496	77505	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
69	NC_017771	GAGTC	2	10	77513	77522	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017771	GTTTT	2	10	79872	79881	0 %	80 %	20 %	0 %	386854363
71	NC_017771	TTGAT	2	10	80041	80050	20 %	60 %	20 %	0 %	386854363
72	NC_017771	ACCAC	2	10	82788	82797	40 %	0 %	0 %	60 %	386854365
73	NC_017771	ATTCG	2	10	84530	84539	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017771	TCACC	2	10	84741	84750	20 %	20 %	0 %	60 %	386854368
75	NC_017771	CCCTA	2	10	85437	85446	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
76	NC_017771	CGACG	2	10	85976	85985	20 %	0 %	40 %	40 %	386854370
77	NC_017771	CGCCT	2	10	87195	87204	0 %	20 %	20 %	60 %	386854372
78	NC_017771	TGGAT	2	10	87992	88001	20 %	40 %	40 %	0 %	386854372
79	NC_017771	GCGAG	2	10	90567	90576	20 %	0 %	60 %	20 %	386854378
80	NC_017771	GCAGG	2	10	91468	91477	20 %	0 %	60 %	20 %	386854379
81	NC_017771	TGGTC	2	10	91655	91664	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017771	CTCAT	2	10	91691	91700	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_017771	GCACC	2	10	91965	91974	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_017771	GCACC	2	10	92498	92507	20 %	0 %	20 %	60 %	386854381
85	NC_017771	GTCCA	2	10	93155	93164	20 %	20 %	20 %	40 %	386854381
86	NC_017771	GCAGC	2	10	94323	94332	20 %	0 %	40 %	40 %	386854384
87	NC_017771	GCTGA	2	10	95328	95337	20 %	20 %	40 %	20 %	386854387
88	NC_017771	CTGGG	2	10	96111	96120	0 %	20 %	60 %	20 %	386854389
89	NC_017771	AAGAC	2	10	99217	99226	60 %	0 %	20 %	20 %	386854395
90	NC_017771	GGCCT	2	10	101728	101737	0 %	20 %	40 %	40 %	386854399
91	NC_017771	CTGTG	2	10	102573	102582	0 %	40 %	40 %	20 %	386854401
92	NC_017771	CCCCG	2	10	103046	103055	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
93	NC_017771	CCCTA	2	10	103894	103903	20 %	20 %	0 %	60 %	386854403
94	NC_017771	GGACG	2	10	105795	105804	20 %	0 %	60 %	20 %	386854406
95	NC_017771	CGGCC	2	10	106802	106811	0 %	0 %	40 %	60 %	386854407
96	NC_017771	AACTG	2	10	107199	107208	40 %	20 %	20 %	20 %	386854407
97	NC_017771	CCTGA	2	10	111644	111653	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_017771	CGATC	2	10	112409	112418	20 %	20 %	20 %	40 %	386854413
99	NC_017771	CCACC	2	10	112920	112929	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
100	NC_017771	TCTCT	2	10	114300	114309	0 %	60 %	0 %	40 %	386854415
101	NC_017771	GCCAA	2	10	115522	115531	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_017771	GACGC	2	10	115843	115852	20 %	0 %	40 %	40 %	386854417
103	NC_017771	CTCGC	2	10	116636	116645	0 %	20 %	20 %	60 %	386854417
104	NC_017771	CAGGC	2	10	117238	117247	20 %	0 %	40 %	40 %	386854417
105	NC_017771	CGCAT	2	10	117286	117295	20 %	20 %	20 %	40 %	386854417
106	NC_017771	CCTCT	2	10	118577	118586	0 %	40 %	0 %	60 %	386854421
107	NC_017771	ACCCC	2	10	121110	121119	20 %	0 %	0 %	80 %	386854427
108	NC_017771	GCGCG	2	10	122809	122818	0 %	0 %	60 %	40 %	386854427
109	NC_017771	TGGGG	2	10	124828	124837	0 %	20 %	80 %	0 %	386854430
110	NC_017771	GGCCA	2	10	125353	125362	20 %	0 %	40 %	40 %	386854430
111	NC_017771	TCCCC	2	10	125888	125897	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
112	NC_017771	GGCCA	2	10	127465	127474	20 %	0 %	40 %	40 %	386854432
113	NC_017771	GCCAG	2	10	131215	131224	20 %	0 %	40 %	40 %	386854437
114	NC_017771	GACCA	2	10	132051	132060	40 %	0 %	20 %	40 %	386854438
115	NC_017771	CAGTC	2	10	132078	132087	20 %	20 %	20 %	40 %	386854438
116	NC_017771	CCTGG	2	10	132909	132918	0 %	20 %	40 %	40 %	386854439
117	NC_017771	CCCCA	2	10	135187	135196	20 %	0 %	0 %	80 %	386854440
118	NC_017771	GCCCT	2	10	136769	136778	0 %	20 %	20 %	60 %	386854441
119	NC_017771	GCTGG	2	10	137711	137720	0 %	20 %	60 %	20 %	386854443
120	NC_017771	CCAGG	2	10	138206	138215	20 %	0 %	40 %	40 %	386854443
121	NC_017771	TGGAG	2	10	138248	138257	20 %	20 %	60 %	0 %	386854443
122	NC_017771	GGGAG	2	10	138351	138360	20 %	0 %	80 %	0 %	386854443
123	NC_017771	GCACC	2	10	139013	139022	20 %	0 %	20 %	60 %	386854443
124	NC_017771	TCAAT	2	10	140098	140107	40 %	40 %	0 %	20 %	386854445
125	NC_017771	GCCCG	2	10	144761	144770	0 %	0 %	40 %	60 %	386854449
126	NC_017771	TCGCC	3	15	144933	144947	0 %	20 %	20 %	60 %	386854449
127	NC_017771	GGTGG	2	10	145303	145312	0 %	20 %	80 %	0 %	386854449
128	NC_017771	ACACG	2	10	147276	147285	40 %	0 %	20 %	40 %	386854451
129	NC_017771	GCCGG	2	10	147858	147867	0 %	0 %	60 %	40 %	386854452
130	NC_017771	CGTTC	2	10	148166	148175	0 %	40 %	20 %	40 %	386854452
131	NC_017771	AGTAA	2	10	148322	148331	60 %	20 %	20 %	0 %	386854452
132	NC_017771	TTCTC	2	10	148808	148817	0 %	60 %	0 %	40 %	386854453
133	NC_017771	GGAGC	2	10	149170	149179	20 %	0 %	60 %	20 %	386854454
134	NC_017771	ACGCC	2	10	153615	153624	20 %	0 %	20 %	60 %	386854462
135	NC_017771	CAGCT	2	10	154462	154471	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
136	NC_017771	GGGGC	2	10	156422	156431	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017771	GACGT	2	10	157573	157582	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017771	CCCCT	2	10	158213	158222	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
139	NC_017771	TCGCC	2	10	158379	158388	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
140	NC_017771	TTGCC	2	10	158775	158784	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_017771	GCGTT	2	10	159731	159740	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017771	GCCCA	2	10	162344	162353	20 %	0 %	20 %	60 %	386854475
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151	NC_017771	CAGCA	2	10	168575	168584	40 %	0 %	20 %	40 %	386854482
152	NC_017771	CTCCA	2	10	168837	168846	20 %	20 %	0 %	60 %	386854483
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156	NC_017771	CCGCA	2	10	172784	172793	20 %	0 %	20 %	60 %	386854486
157	NC_017771	TGGGG	2	10	174013	174022	0 %	20 %	80 %	0 %	386854489
158	NC_017771	GGACT	2	10	175545	175554	20 %	20 %	40 %	20 %	386854490
159	NC_017771	CCAAT	2	10	175892	175901	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
160	NC_017771	GTGTT	2	10	176044	176053	0 %	60 %	40 %	0 %	386854491
161	NC_017771	TCGCC	2	10	177038	177047	0 %	20 %	20 %	60 %	386854493
162	NC_017771	CCTGC	2	10	182107	182116	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
163	NC_017771	GACCA	2	10	182759	182768	40 %	0 %	20 %	40 %	386854503
164	NC_017771	CAGCA	2	10	182939	182948	40 %	0 %	20 %	40 %	386854503
165	NC_017771	AATGA	2	10	183489	183498	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017771	GCAGG	2	10	184287	184296	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
167	NC_017771	GCGCG	2	10	189942	189951	0 %	0 %	60 %	40 %	386854507
168	NC_017771	GCCGC	2	10	190205	190214	0 %	0 %	40 %	60 %	386854507
169	NC_017771	CCCCG	2	10	191400	191409	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
170	NC_017771	CCGAC	2	10	192393	192402	20 %	0 %	20 %	60 %	386854510
171	NC_017771	TCTTG	2	10	193397	193406	0 %	60 %	20 %	20 %	386854512
172	NC_017771	GCATG	2	10	194828	194837	20 %	20 %	40 %	20 %	386854513
173	NC_017771	TACGG	2	10	195347	195356	20 %	20 %	40 %	20 %	386854514
174	NC_017771	CGGCG	2	10	197175	197184	0 %	0 %	60 %	40 %	386854516
175	NC_017771	AAATC	2	10	197730	197739	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
176	NC_017771	CGGCG	2	10	197910	197919	0 %	0 %	60 %	40 %	386854517
177	NC_017771	GCCGC	2	10	198520	198529	0 %	0 %	40 %	60 %	386854517
178	NC_017771	TGGCG	2	10	198991	199000	0 %	20 %	60 %	20 %	386854518
179	NC_017771	GCTCA	2	10	199331	199340	20 %	20 %	20 %	40 %	386854518
180	NC_017771	TGGGC	2	10	202274	202283	0 %	20 %	60 %	20 %	386854522
181	NC_017771	GACCA	2	10	206153	206162	40 %	0 %	20 %	40 %	386854527
182	NC_017771	GTCAA	2	10	207334	207343	40 %	20 %	20 %	20 %	386854529
183	NC_017771	CCTGC	2	10	209855	209864	0 %	20 %	20 %	60 %	386854533
184	NC_017771	AGTGG	2	10	210124	210133	20 %	20 %	60 %	0 %	386854533
185	NC_017771	GCGCC	2	10	210135	210144	0 %	0 %	40 %	60 %	386854533
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187	NC_017771	GCAGC	2	10	212218	212227	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
188	NC_017771	GCTCG	2	10	213531	213540	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
189	NC_017771	CCCTG	2	10	214701	214710	0 %	20 %	20 %	60 %	386854538
190	NC_017771	TTCTG	2	10	217316	217325	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
191	NC_017771	CGCCT	2	10	218216	218225	0 %	20 %	20 %	60 %	386854546
192	NC_017771	AGACC	2	10	220189	220198	40 %	0 %	20 %	40 %	386854547
193	NC_017771	CTGCC	2	10	223561	223570	0 %	20 %	20 %	60 %	386854552
194	NC_017771	CCGCC	2	10	223631	223640	0 %	0 %	20 %	80 %	386854552
195	NC_017771	TGGCC	2	10	225834	225843	0 %	20 %	40 %	40 %	386854553
196	NC_017771	CGAAG	2	10	226653	226662	40 %	0 %	40 %	20 %	386854554
197	NC_017771	TCCAC	2	10	227770	227779	20 %	20 %	0 %	60 %	386854555
198	NC_017771	CCAGC	2	10	228865	228874	20 %	0 %	20 %	60 %	386854556
199	NC_017771	ACCTC	2	10	229320	229329	20 %	20 %	0 %	60 %	386854556
200	NC_017771	AACTC	2	10	230032	230041	40 %	20 %	0 %	40 %	386854557
201	NC_017771	ACCAG	2	10	230689	230698	40 %	0 %	20 %	40 %	386854557

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.