MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 2820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017310	TGCGC	2	10	705	714	0 %	20 %	40 %	40 %	387151874
2	NC_017310	ATCAA	2	10	990	999	60 %	20 %	0 %	20 %	387151874
3	NC_017310	ACAGA	2	10	2405	2414	60 %	0 %	20 %	20 %	387151876
4	NC_017310	CAGGA	2	10	3792	3801	40 %	0 %	40 %	20 %	387151878
5	NC_017310	ACGCC	2	10	4045	4054	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_017310	GCCCA	2	10	4425	4434	20 %	0 %	20 %	60 %	387151879
7	NC_017310	CCCGG	2	10	4527	4536	0 %	0 %	40 %	60 %	387151879
8	NC_017310	GCCCG	2	10	5826	5835	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9	NC_017310	TCACA	2	10	6812	6821	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017310	CGCCT	2	10	6957	6966	0 %	20 %	20 %	60 %	387151881
11	NC_017310	CACGC	2	10	7179	7188	20 %	0 %	20 %	60 %	387151881
12	NC_017310	TGCGG	2	10	8220	8229	0 %	20 %	60 %	20 %	387151882
13	NC_017310	CCCAT	2	10	10368	10377	20 %	20 %	0 %	60 %	387151883
14	NC_017310	CTGCG	2	10	10768	10777	0 %	20 %	40 %	40 %	387151884
15	NC_017310	CGCGG	2	10	12564	12573	0 %	0 %	60 %	40 %	387151885
16	NC_017310	CGAGA	2	10	12580	12589	40 %	0 %	40 %	20 %	387151885
17	NC_017310	GCCAC	2	10	12878	12887	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_017310	CCCCG	2	10	12904	12913	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
19	NC_017310	GCCGC	2	10	17950	17959	0 %	0 %	40 %	60 %	387151888
20	NC_017310	AGGGC	2	10	18323	18332	20 %	0 %	60 %	20 %	387151888
21	NC_017310	CCGCC	2	10	18335	18344	0 %	0 %	20 %	80 %	387151888
22	NC_017310	CGTAT	2	10	20250	20259	20 %	40 %	20 %	20 %	387151890
23	NC_017310	CATGG	2	10	22182	22191	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017310	TGCCG	2	10	22414	22423	0 %	20 %	40 %	40 %	387151893
25	NC_017310	AGGGG	2	10	22458	22467	20 %	0 %	80 %	0 %	387151893
26	NC_017310	ACCGA	2	10	23931	23940	40 %	0 %	20 %	40 %	387151894
27	NC_017310	TCGAT	2	10	23989	23998	20 %	40 %	20 %	20 %	387151894
28	NC_017310	GCGCC	2	10	24300	24309	0 %	0 %	40 %	60 %	387151894
29	NC_017310	CATTC	2	10	24839	24848	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_017310	TAAAA	2	10	25053	25062	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017310	GCACG	2	10	25192	25201	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_017310	GTGCC	2	10	26973	26982	0 %	20 %	40 %	40 %	387151896
33	NC_017310	GCCCG	2	10	27119	27128	0 %	0 %	40 %	60 %	387151896
34	NC_017310	GGCAT	2	10	29316	29325	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017310	CACTG	2	10	29761	29770	20 %	20 %	20 %	40 %	387151897
36	NC_017310	CCGGC	2	10	30844	30853	0 %	0 %	40 %	60 %	387151898
37	NC_017310	CGCGT	2	10	31430	31439	0 %	20 %	40 %	40 %	387151898
38	NC_017310	ACGTG	2	10	32680	32689	20 %	20 %	40 %	20 %	387151899
39	NC_017310	CGAAC	2	10	32692	32701	40 %	0 %	20 %	40 %	387151899
40	NC_017310	CACGC	2	10	32985	32994	20 %	0 %	20 %	60 %	387151899
41	NC_017310	GTGGG	2	10	33856	33865	0 %	20 %	80 %	0 %	387151900
42	NC_017310	ACCCG	2	10	34976	34985	20 %	0 %	20 %	60 %	387151901
43	NC_017310	AAGGC	2	10	35032	35041	40 %	0 %	40 %	20 %	387151901
44	NC_017310	GCACG	2	10	37983	37992	20 %	0 %	40 %	40 %	387151902
45	NC_017310	CCGTG	2	10	38612	38621	0 %	20 %	40 %	40 %	387151903
46	NC_017310	GCAAC	2	10	39503	39512	40 %	0 %	20 %	40 %	387151903
47	NC_017310	ACGGA	2	10	42596	42605	40 %	0 %	40 %	20 %	387151906
48	NC_017310	GAAAA	2	10	43541	43550	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017310	GGGCA	2	10	47571	47580	20 %	0 %	60 %	20 %	387151909
50	NC_017310	GTCGC	2	10	48785	48794	0 %	20 %	40 %	40 %	387151909
51	NC_017310	CGGAA	2	10	49760	49769	40 %	0 %	40 %	20 %	387151909
52	NC_017310	GGGAA	2	10	51532	51541	40 %	0 %	60 %	0 %	387151912
53	NC_017310	CCGGG	2	10	52923	52932	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_017310	TGCCA	2	10	55133	55142	20 %	20 %	20 %	40 %	387151914
55	NC_017310	CGTGA	2	10	55186	55195	20 %	20 %	40 %	20 %	387151914
56	NC_017310	GGGGT	2	10	55962	55971	0 %	20 %	80 %	0 %	387151915
57	NC_017310	GAAGT	2	10	56102	56111	40 %	20 %	40 %	0 %	387151915
58	NC_017310	GCAGG	2	10	57635	57644	20 %	0 %	60 %	20 %	387151916
59	NC_017310	TTCGG	2	10	58603	58612	0 %	40 %	40 %	20 %	387151917
60	NC_017310	GGAAG	2	10	62537	62546	40 %	0 %	60 %	0 %	387151920
61	NC_017310	GCCCC	2	10	62645	62654	0 %	0 %	20 %	80 %	387151920
62	NC_017310	CTGGG	2	10	62706	62715	0 %	20 %	60 %	20 %	387151920
63	NC_017310	TTTGT	2	10	65076	65085	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017310	TGCCC	2	10	65732	65741	0 %	20 %	20 %	60 %	387151922
65	NC_017310	CGGCA	2	10	66733	66742	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017310	GGCGC	2	10	66750	66759	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_017310	CACGC	2	10	68375	68384	20 %	0 %	20 %	60 %	387151923
68	NC_017310	AGGGT	2	10	69286	69295	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017310	AGTGA	2	10	71493	71502	40 %	20 %	40 %	0 %	387151925
70	NC_017310	CGGTG	2	10	71614	71623	0 %	20 %	60 %	20 %	387151925
71	NC_017310	CCATG	2	10	73287	73296	20 %	20 %	20 %	40 %	387151927
72	NC_017310	AGGGC	2	10	74632	74641	20 %	0 %	60 %	20 %	387151927
73	NC_017310	CCGTG	2	10	75680	75689	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_017310	TTGCC	2	10	75812	75821	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_017310	CGCGG	2	10	77524	77533	0 %	0 %	60 %	40 %	387151929
76	NC_017310	CGGCG	2	10	78152	78161	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017310	GACGG	2	10	80216	80225	20 %	0 %	60 %	20 %	387151932
78	NC_017310	GGGCA	2	10	80238	80247	20 %	0 %	60 %	20 %	387151932
79	NC_017310	ACCGT	2	10	81726	81735	20 %	20 %	20 %	40 %	387151934
80	NC_017310	GGGGA	2	10	82338	82347	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017310	GGGTG	2	10	82350	82359	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017310	GGAAG	2	10	83436	83445	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017310	TATCG	2	10	84124	84133	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017310	CGGGA	2	10	84190	84199	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017310	GGAAG	2	10	84313	84322	40 %	0 %	60 %	0 %	387151937
86	NC_017310	TGCCT	2	10	86372	86381	0 %	40 %	20 %	40 %	387151939
87	NC_017310	CACGG	2	10	86393	86402	20 %	0 %	40 %	40 %	387151939
88	NC_017310	CGGTG	2	10	86860	86869	0 %	20 %	60 %	20 %	387151939
89	NC_017310	GGTCG	2	10	87115	87124	0 %	20 %	60 %	20 %	387151939
90	NC_017310	GCAGG	2	10	87700	87709	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017310	GCGCC	2	10	87914	87923	0 %	0 %	40 %	60 %	387151940
92	NC_017310	GCATC	2	10	88022	88031	20 %	20 %	20 %	40 %	387151940
93	NC_017310	GACGG	2	10	88208	88217	20 %	0 %	60 %	20 %	387151940
94	NC_017310	TTCCC	2	10	88780	88789	0 %	40 %	0 %	60 %	387151941
95	NC_017310	CTGCG	2	10	89386	89395	0 %	20 %	40 %	40 %	387151942
96	NC_017310	TGCCA	2	10	89591	89600	20 %	20 %	20 %	40 %	387151942
97	NC_017310	GCAGG	2	10	91448	91457	20 %	0 %	60 %	20 %	387151943
98	NC_017310	ACCGT	2	10	92450	92459	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_017310	CGTTG	2	10	93958	93967	0 %	40 %	40 %	20 %	387151946
100	NC_017310	CGGGG	2	10	94312	94321	0 %	0 %	80 %	20 %	387151947
101	NC_017310	CCTGT	2	10	95429	95438	0 %	40 %	20 %	40 %	387151949
102	NC_017310	CGGGG	2	10	96139	96148	0 %	0 %	80 %	20 %	387151950
103	NC_017310	GCCGT	2	10	96927	96936	0 %	20 %	40 %	40 %	387151950
104	NC_017310	GGCGT	2	10	96966	96975	0 %	20 %	60 %	20 %	387151951
105	NC_017310	CGCAG	2	10	97331	97340	20 %	0 %	40 %	40 %	387151951
106	NC_017310	CGGCG	2	10	98638	98647	0 %	0 %	60 %	40 %	387151952
107	NC_017310	GGGCC	2	10	99174	99183	0 %	0 %	60 %	40 %	387151953
108	NC_017310	CGCAC	3	15	100009	100023	20 %	0 %	20 %	60 %	387151954
109	NC_017310	ACGGG	2	10	100058	100067	20 %	0 %	60 %	20 %	387151954
110	NC_017310	GCGGG	2	10	102859	102868	0 %	0 %	80 %	20 %	387151955
111	NC_017310	GCCGG	2	10	104071	104080	0 %	0 %	60 %	40 %	387151956
112	NC_017310	TTCGG	2	10	104163	104172	0 %	40 %	40 %	20 %	387151956
113	NC_017310	GACGC	2	10	104556	104565	20 %	0 %	40 %	40 %	387151956
114	NC_017310	TCTCG	2	10	105357	105366	0 %	40 %	20 %	40 %	387151957
115	NC_017310	TTCTC	2	10	105449	105458	0 %	60 %	0 %	40 %	387151957
116	NC_017310	GCGTG	2	10	105736	105745	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017310	GAGGC	2	10	106470	106479	20 %	0 %	60 %	20 %	387151958
118	NC_017310	CATGC	2	10	107757	107766	20 %	20 %	20 %	40 %	387151960
119	NC_017310	GTGCG	2	10	108151	108160	0 %	20 %	60 %	20 %	387151960
120	NC_017310	GCGAC	2	10	108439	108448	20 %	0 %	40 %	40 %	387151960
121	NC_017310	CGCGC	2	10	108449	108458	0 %	0 %	40 %	60 %	387151960
122	NC_017310	TCGGT	2	10	109693	109702	0 %	40 %	40 %	20 %	387151960
123	NC_017310	TGGGC	2	10	109754	109763	0 %	20 %	60 %	20 %	387151960
124	NC_017310	CGGGC	2	10	110017	110026	0 %	0 %	60 %	40 %	387151960
125	NC_017310	GACCA	2	10	112300	112309	40 %	0 %	20 %	40 %	387151961
126	NC_017310	GCCGC	2	10	112879	112888	0 %	0 %	40 %	60 %	387151962
127	NC_017310	CTCGC	2	10	115081	115090	0 %	20 %	20 %	60 %	387151962
128	NC_017310	TCGGC	2	10	115262	115271	0 %	20 %	40 %	40 %	387151962
129	NC_017310	TCCTG	2	10	118930	118939	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_017310	CGGCG	2	10	120173	120182	0 %	0 %	60 %	40 %	387151967
131	NC_017310	GCCGT	2	10	120822	120831	0 %	20 %	40 %	40 %	387151968
132	NC_017310	GTGCC	2	10	123693	123702	0 %	20 %	40 %	40 %	387151970
133	NC_017310	GCGGT	2	10	124579	124588	0 %	20 %	60 %	20 %	387151970
134	NC_017310	CAGTC	2	10	126515	126524	20 %	20 %	20 %	40 %	387151970
135	NC_017310	CCTCG	2	10	127909	127918	0 %	20 %	20 %	60 %	387151971
136	NC_017310	TGCCG	2	10	128456	128465	0 %	20 %	40 %	40 %	387151971
137	NC_017310	GTGCA	2	10	128469	128478	20 %	20 %	40 %	20 %	387151971
138	NC_017310	AGCGA	2	10	128655	128664	40 %	0 %	40 %	20 %	387151971
139	NC_017310	TGTCC	2	10	129168	129177	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_017310	GTCTC	2	10	129194	129203	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_017310	ACGCC	2	10	130680	130689	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
142	NC_017310	GCTGT	2	10	132752	132761	0 %	40 %	40 %	20 %	387151974
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169	NC_017310	GGTGA	2	10	174296	174305	20 %	20 %	60 %	0 %	387152000
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199	NC_017310	TGTGC	2	10	212094	212103	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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252	NC_017310	CGTGA	2	10	285782	285791	20 %	20 %	40 %	20 %	387152094
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254	NC_017310	GCCGC	2	10	289118	289127	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
255	NC_017310	ATGCA	2	10	289163	289172	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
256	NC_017310	GCGGG	2	10	289235	289244	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
257	NC_017310	GCGCC	2	10	289549	289558	0 %	0 %	40 %	60 %	387152097
258	NC_017310	CGGTA	2	10	289806	289815	20 %	20 %	40 %	20 %	387152097
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260	NC_017310	GCGCT	2	10	296943	296952	0 %	20 %	40 %	40 %	387152101
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263	NC_017310	GGGGC	2	10	298255	298264	0 %	0 %	80 %	20 %	387152101
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265	NC_017310	CCACG	2	10	306462	306471	20 %	0 %	20 %	60 %	387152103
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270	NC_017310	ATCCT	2	10	316105	316114	20 %	40 %	0 %	40 %	387152113
271	NC_017310	CCCGT	2	10	316199	316208	0 %	20 %	20 %	60 %	387152113
272	NC_017310	CCGCC	2	10	317930	317939	0 %	0 %	20 %	80 %	387152114
273	NC_017310	CCTGA	2	10	319610	319619	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
274	NC_017310	TTCCT	2	10	319661	319670	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
275	NC_017310	CCATG	2	10	320416	320425	20 %	20 %	20 %	40 %	387152115
276	NC_017310	CAGGC	2	10	322856	322865	20 %	0 %	40 %	40 %	387152118
277	NC_017310	TCCGC	2	10	323693	323702	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
278	NC_017310	GCGAA	2	10	324027	324036	40 %	0 %	40 %	20 %	387152119
279	NC_017310	GACGT	2	10	328662	328671	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
280	NC_017310	GCGTT	2	10	329339	329348	0 %	40 %	40 %	20 %	387152124
281	NC_017310	AGGCG	2	10	329710	329719	20 %	0 %	60 %	20 %	387152124
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285	NC_017310	GCCCC	2	10	335223	335232	0 %	0 %	20 %	80 %	387152128
286	NC_017310	GGGCG	2	10	335284	335293	0 %	0 %	80 %	20 %	387152128
287	NC_017310	CATGC	2	10	335954	335963	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
288	NC_017310	ACCAG	2	10	336062	336071	40 %	0 %	20 %	40 %	387152130
289	NC_017310	GGCAG	2	10	336174	336183	20 %	0 %	60 %	20 %	387152130
290	NC_017310	CGGGC	2	10	336561	336570	0 %	0 %	60 %	40 %	387152130
291	NC_017310	CCATC	2	10	337077	337086	20 %	20 %	0 %	60 %	387152131
292	NC_017310	ATTCG	2	10	337853	337862	20 %	40 %	20 %	20 %	387152132
293	NC_017310	AGTAC	2	10	338254	338263	40 %	20 %	20 %	20 %	387152132
294	NC_017310	CGCAT	2	10	338326	338335	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
295	NC_017310	AGACG	2	10	338558	338567	40 %	0 %	40 %	20 %	387152133
296	NC_017310	TGCGT	2	10	338915	338924	0 %	40 %	40 %	20 %	387152133
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298	NC_017310	GCCGC	2	10	340549	340558	0 %	0 %	40 %	60 %	387152135
299	NC_017310	TGCCA	2	10	340935	340944	20 %	20 %	20 %	40 %	387152136
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302	NC_017310	CGCCT	2	10	342883	342892	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
303	NC_017310	GCGTG	2	10	343369	343378	0 %	20 %	60 %	20 %	387152138
304	NC_017310	AGCGC	2	10	346898	346907	20 %	0 %	40 %	40 %	387152140
305	NC_017310	TCGCA	2	10	348876	348885	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
306	NC_017310	GCCGT	2	10	349522	349531	0 %	20 %	40 %	40 %	387152142
307	NC_017310	GAGGG	2	10	354005	354014	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
308	NC_017310	AAGGC	2	10	357322	357331	40 %	0 %	40 %	20 %	387152151
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316	NC_017310	TGCCC	2	10	363801	363810	0 %	20 %	20 %	60 %	387152157
317	NC_017310	CTCCC	2	10	366594	366603	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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333	NC_017310	CGTCC	2	10	385436	385445	0 %	20 %	20 %	60 %	387152176
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343	NC_017310	CACGG	2	10	392806	392815	20 %	0 %	40 %	40 %	387152182
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348	NC_017310	GCGAT	2	10	393893	393902	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
349	NC_017310	TGGTG	2	10	396191	396200	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
350	NC_017310	GCCGT	2	10	398540	398549	0 %	20 %	40 %	40 %	387152186
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364	NC_017310	CCCGG	2	10	414415	414424	0 %	0 %	40 %	60 %	387152199
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367	NC_017310	AGGCG	2	10	418073	418082	20 %	0 %	60 %	20 %	387152202
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369	NC_017310	GTCGC	2	10	420179	420188	0 %	20 %	40 %	40 %	387152205
370	NC_017310	GCCGC	2	10	420243	420252	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
371	NC_017310	GAAAA	2	10	421529	421538	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
372	NC_017310	TTGAT	2	10	422595	422604	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
373	NC_017310	CGCAA	2	10	424648	424657	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
374	NC_017310	CGTGG	2	10	425793	425802	0 %	20 %	60 %	20 %	387152210
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389	NC_017310	TGACC	2	10	453436	453445	20 %	20 %	20 %	40 %	387152235
390	NC_017310	CTCGT	2	10	453684	453693	0 %	40 %	20 %	40 %	387152235
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392	NC_017310	GTGAA	2	10	457101	457110	40 %	20 %	40 %	0 %	387152239
393	NC_017310	GCCCT	2	10	459153	459162	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
394	NC_017310	CTTGC	2	10	463581	463590	0 %	40 %	20 %	40 %	387152244
395	NC_017310	ACGCC	2	10	467579	467588	20 %	0 %	20 %	60 %	387152248
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399	NC_017310	AGGCG	2	10	471331	471340	20 %	0 %	60 %	20 %	387152250
400	NC_017310	GTTCG	2	10	473641	473650	0 %	40 %	40 %	20 %	387152252
401	NC_017310	GTGCG	2	10	475104	475113	0 %	20 %	60 %	20 %	387152252
402	NC_017310	CCCGG	2	10	475252	475261	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
403	NC_017310	CAGGG	2	10	476543	476552	20 %	0 %	60 %	20 %	387152253
404	NC_017310	ACGGG	2	10	476647	476656	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
405	NC_017310	CTTGC	2	10	482996	483005	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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442	NC_017310	CAGGG	2	10	512584	512593	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
443	NC_017310	TGCCA	2	10	514219	514228	20 %	20 %	20 %	40 %	387152284
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445	NC_017310	CTCGC	2	10	515174	515183	0 %	20 %	20 %	60 %	387152284
446	NC_017310	GCGTC	2	10	515568	515577	0 %	20 %	40 %	40 %	387152284
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