MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 78697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017310	CTT	2	6	129512	129517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151972
3002	NC_017310	AGC	2	6	129529	129534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151972
3003	NC_017310	GAC	2	6	129537	129542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151972
3004	NC_017310	TCG	2	6	129579	129584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151972
3005	NC_017310	GTG	2	6	129594	129599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151972
3006	NC_017310	GCT	2	6	129603	129608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151972
3007	NC_017310	GC	3	6	129618	129623	0 %	0 %	50 %	50 %	387151972
3008	NC_017310	GC	3	6	129660	129665	0 %	0 %	50 %	50 %	387151972
3009	NC_017310	TGC	2	6	129742	129747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151972
3010	NC_017310	GGT	2	6	129761	129766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151972
3011	NC_017310	G	7	7	129878	129884	0 %	0 %	100 %	0 %	387151972
3012	NC_017310	GCC	2	6	129971	129976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151972
3013	NC_017310	GGA	2	6	129977	129982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387151972
3014	NC_017310	GGC	2	6	129986	129991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151972
3015	NC_017310	CTG	2	6	130059	130064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151972
3016	NC_017310	CGG	2	6	130075	130080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151972
3017	NC_017310	TGC	2	6	130087	130092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151972
3018	NC_017310	GGGC	2	8	130130	130137	0 %	0 %	75 %	25 %	387151972
3019	NC_017310	C	6	6	130194	130199	0 %	0 %	0 %	100 %	387151972
3020	NC_017310	TGC	2	6	130252	130257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151972
3021	NC_017310	GCT	2	6	130265	130270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151972
3022	NC_017310	GCG	2	6	130301	130306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151972
3023	NC_017310	CCTG	2	8	130382	130389	0 %	25 %	25 %	50 %	387151972
3024	NC_017310	CTT	2	6	130434	130439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151972
3025	NC_017310	TGG	2	6	130471	130476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151972
3026	NC_017310	CGG	2	6	130496	130501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151972
3027	NC_017310	CGG	2	6	130526	130531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151972
3028	NC_017310	CGC	2	6	130539	130544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151972
3029	NC_017310	CCG	2	6	130553	130558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151972
3030	NC_017310	GC	3	6	130593	130598	0 %	0 %	50 %	50 %	387151972
3031	NC_017310	GCG	2	6	130621	130626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151972
3032	NC_017310	CGA	2	6	130643	130648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151972
3033	NC_017310	CG	3	6	130662	130667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_017310	ACGCC	2	10	130680	130689	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3035	NC_017310	TGG	2	6	130703	130708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_017310	GGC	2	6	130711	130716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_017310	GGCA	2	8	130883	130890	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3038	NC_017310	CG	3	6	130925	130930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3039	NC_017310	CG	3	6	130932	130937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_017310	CTT	2	6	131014	131019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_017310	CCCG	2	8	131027	131034	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3042	NC_017310	TGA	2	6	131056	131061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151973
3043	NC_017310	TCA	3	9	131065	131073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151973
3044	NC_017310	GCG	2	6	131077	131082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151973
3045	NC_017310	CAT	2	6	131165	131170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151973
3046	NC_017310	TCA	2	6	131233	131238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151973
3047	NC_017310	GCT	2	6	131323	131328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151973
3048	NC_017310	ACCG	2	8	131415	131422	25 %	0 %	25 %	50 %	387151973
3049	NC_017310	ACGGCG	2	12	131437	131448	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387151973
3050	NC_017310	GACATC	2	12	131454	131465	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387151973
3051	NC_017310	AAG	2	6	131487	131492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151973
3052	NC_017310	CGA	2	6	131555	131560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151973
3053	NC_017310	CTT	2	6	131621	131626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151973
3054	NC_017310	AGC	2	6	131686	131691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151973
3055	NC_017310	GCC	2	6	131706	131711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151973
3056	NC_017310	GCT	2	6	131927	131932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151974
3057	NC_017310	CGCC	2	8	131980	131987	0 %	0 %	25 %	75 %	387151974
3058	NC_017310	CT	3	6	132006	132011	0 %	50 %	0 %	50 %	387151974
3059	NC_017310	GTG	2	6	132090	132095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151974
3060	NC_017310	GCG	2	6	132105	132110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151974
3061	NC_017310	ACG	2	6	132133	132138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151974
3062	NC_017310	CGG	2	6	132142	132147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151974
3063	NC_017310	CCGT	2	8	132207	132214	0 %	25 %	25 %	50 %	387151974
3064	NC_017310	GGT	2	6	132221	132226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151974
3065	NC_017310	ACG	2	6	132256	132261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151974
3066	NC_017310	GACC	2	8	132284	132291	25 %	0 %	25 %	50 %	387151974
3067	NC_017310	ATC	2	6	132339	132344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151974
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3069	NC_017310	CCA	2	6	132391	132396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151974
3070	NC_017310	CG	4	8	132397	132404	0 %	0 %	50 %	50 %	387151974
3071	NC_017310	CGG	3	9	132416	132424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151974
3072	NC_017310	GCA	2	6	132521	132526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151974
3073	NC_017310	GCT	2	6	132569	132574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151974
3074	NC_017310	AAC	2	6	132642	132647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387151974
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3077	NC_017310	GCTGT	2	10	132752	132761	0 %	40 %	40 %	20 %	387151974
3078	NC_017310	CAT	2	6	132979	132984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151975
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3080	NC_017310	TGC	2	6	133005	133010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151975
3081	NC_017310	TGC	2	6	133014	133019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151975
3082	NC_017310	TGC	2	6	133071	133076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151975
3083	NC_017310	GTC	3	9	133151	133159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151975
3084	NC_017310	ACG	2	6	133161	133166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151975
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3087	NC_017310	CTG	2	6	133235	133240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151975
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3089	NC_017310	CCG	2	6	133272	133277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151975
3090	NC_017310	AGG	2	6	133332	133337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387151975
3091	NC_017310	CCG	2	6	133359	133364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151975
3092	NC_017310	CGG	3	9	133394	133402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_017310	TGCC	2	8	133421	133428	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3094	NC_017310	CGC	2	6	133431	133436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3095	NC_017310	CGT	2	6	133494	133499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_017310	TCC	2	6	133517	133522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3097	NC_017310	TCG	2	6	133552	133557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_017310	GCG	2	6	133612	133617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_017310	CGA	2	6	133631	133636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_017310	CG	3	6	133646	133651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3101	NC_017310	TCG	2	6	133749	133754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151976
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3103	NC_017310	AGTGA	2	10	133817	133826	40 %	20 %	40 %	0 %	387151976
3104	NC_017310	CGC	2	6	133846	133851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151976
3105	NC_017310	TCA	2	6	133878	133883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151976
3106	NC_017310	CCG	2	6	133899	133904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151976
3107	NC_017310	GCAG	2	8	133921	133928	25 %	0 %	50 %	25 %	387151976
3108	NC_017310	CGT	2	6	133977	133982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151976
3109	NC_017310	CGC	2	6	134062	134067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151976
3110	NC_017310	CAT	2	6	134095	134100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151976
3111	NC_017310	CGA	2	6	134134	134139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151976
3112	NC_017310	GCC	2	6	134205	134210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151976
3113	NC_017310	ACG	2	6	134211	134216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151976
3114	NC_017310	TGG	2	6	134223	134228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151976
3115	NC_017310	GCG	2	6	134283	134288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151976
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3118	NC_017310	GCC	2	6	134453	134458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151976
3119	NC_017310	GCC	2	6	134519	134524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151976
3120	NC_017310	GAA	2	6	134534	134539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151976
3121	NC_017310	GGA	2	6	134581	134586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387151976
3122	NC_017310	CAT	2	6	134590	134595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151976
3123	NC_017310	GTG	2	6	134609	134614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151976
3124	NC_017310	CGC	2	6	134623	134628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151976
3125	NC_017310	GCG	2	6	134629	134634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151976
3126	NC_017310	AGG	2	6	134646	134651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387151976
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3141	NC_017310	TGA	2	6	135407	135412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151977
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3152	NC_017310	GCG	2	6	135897	135902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151977
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3154	NC_017310	GAT	2	6	135920	135925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3155	NC_017310	GCC	2	6	135953	135958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3156	NC_017310	G	7	7	136083	136089	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3158	NC_017310	G	6	6	136114	136119	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3159	NC_017310	CGA	2	6	136184	136189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3161	NC_017310	GAG	2	6	136258	136263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3162	NC_017310	GGAC	2	8	136271	136278	25 %	0 %	50 %	25 %	387151978
3163	NC_017310	GCGG	2	8	136288	136295	0 %	0 %	75 %	25 %	387151978
3164	NC_017310	GGC	2	6	136361	136366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151978
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3188	NC_017310	GGA	2	6	137388	137393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3240	NC_017310	CG	3	6	139684	139689	0 %	0 %	50 %	50 %	387151981
3241	NC_017310	CGC	2	6	139753	139758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151981
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3244	NC_017310	CAT	2	6	139915	139920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151981
3245	NC_017310	CCCA	2	8	139937	139944	25 %	0 %	0 %	75 %	387151981
3246	NC_017310	TGG	2	6	139962	139967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151981
3247	NC_017310	CTG	2	6	140081	140086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151981
3248	NC_017310	ATGC	2	8	140111	140118	25 %	25 %	25 %	25 %	387151981
3249	NC_017310	GCGG	2	8	140131	140138	0 %	0 %	75 %	25 %	387151981
3250	NC_017310	GGC	2	6	140218	140223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151981
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3252	NC_017310	CATG	2	8	140406	140413	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3253	NC_017310	GCC	2	6	140447	140452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3254	NC_017310	G	6	6	140503	140508	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_017310	GCC	2	6	140524	140529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151982
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3259	NC_017310	GCC	2	6	140647	140652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151982
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3266	NC_017310	TGG	2	6	140832	140837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151982
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3274	NC_017310	AGGT	2	8	141176	141183	25 %	25 %	50 %	0 %	387151982
3275	NC_017310	GAGGTC	2	12	141190	141201	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387151982
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3277	NC_017310	GGCA	2	8	141232	141239	25 %	0 %	50 %	25 %	387151982
3278	NC_017310	GGC	2	6	141252	141257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151982
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3282	NC_017310	TCT	2	6	141348	141353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151982
3283	NC_017310	CGGT	2	8	141386	141393	0 %	25 %	50 %	25 %	387151982
3284	NC_017310	ACG	2	6	141410	141415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151982
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3351	NC_017310	GGA	2	6	144049	144054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3352	NC_017310	GACG	2	8	144060	144067	25 %	0 %	50 %	25 %	387151984
3353	NC_017310	TGA	2	6	144114	144119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151984
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3355	NC_017310	CATG	2	8	144151	144158	25 %	25 %	25 %	25 %	387151984
3356	NC_017310	ATG	2	6	144161	144166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151984
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3360	NC_017310	C	6	6	144458	144463	0 %	0 %	0 %	100 %	387151984
3361	NC_017310	GGA	2	6	144468	144473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387151984
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3363	NC_017310	AAGG	2	8	144506	144513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3364	NC_017310	GA	3	6	144784	144789	50 %	0 %	50 %	0 %	387151985
3365	NC_017310	CAG	2	6	144828	144833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151985
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3495	NC_017310	ACC	2	6	151994	151999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3496	NC_017310	GGGA	2	8	152037	152044	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3497	NC_017310	TGG	2	6	152054	152059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3498	NC_017310	AGAC	2	8	152173	152180	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3499	NC_017310	GGT	2	6	152217	152222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3500	NC_017310	TCA	2	6	152332	152337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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