MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 78697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_017310	CTG	2	6	109431	109436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151960
2503	NC_017310	GAC	2	6	109440	109445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151960
2504	NC_017310	GGT	2	6	109448	109453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151960
2505	NC_017310	GGCG	2	8	109454	109461	0 %	0 %	75 %	25 %	387151960
2506	NC_017310	GCG	2	6	109506	109511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151960
2507	NC_017310	CCA	2	6	109522	109527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151960
2508	NC_017310	CG	3	6	109532	109537	0 %	0 %	50 %	50 %	387151960
2509	NC_017310	CTG	2	6	109587	109592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151960
2510	NC_017310	GTG	2	6	109635	109640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151960
2511	NC_017310	TGG	2	6	109651	109656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151960
2512	NC_017310	TCGGT	2	10	109693	109702	0 %	40 %	40 %	20 %	387151960
2513	NC_017310	GCT	2	6	109703	109708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151960
2514	NC_017310	GGA	2	6	109736	109741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387151960
2515	NC_017310	GC	3	6	109745	109750	0 %	0 %	50 %	50 %	387151960
2516	NC_017310	TGGGC	2	10	109754	109763	0 %	20 %	60 %	20 %	387151960
2517	NC_017310	TAC	2	6	109770	109775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151960
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2519	NC_017310	TGC	2	6	109828	109833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151960
2520	NC_017310	TGG	3	9	109834	109842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151960
2521	NC_017310	TTC	2	6	109878	109883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151960
2522	NC_017310	GGA	2	6	109928	109933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387151960
2523	NC_017310	GC	3	6	109953	109958	0 %	0 %	50 %	50 %	387151960
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2529	NC_017310	GCA	2	6	110192	110197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151960
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2532	NC_017310	GCGG	2	8	110312	110319	0 %	0 %	75 %	25 %	387151960
2533	NC_017310	CG	3	6	110365	110370	0 %	0 %	50 %	50 %	387151960
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2538	NC_017310	GC	3	6	110664	110669	0 %	0 %	50 %	50 %	387151960
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2541	NC_017310	CG	3	6	110716	110721	0 %	0 %	50 %	50 %	387151960
2542	NC_017310	TGC	2	6	110728	110733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151960
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2551	NC_017310	AAT	2	6	111400	111405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_017310	TAA	2	6	111414	111419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_017310	GAC	2	6	111444	111449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_017310	GGA	2	6	111484	111489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_017310	TTC	2	6	111505	111510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151961
2556	NC_017310	TGC	2	6	111524	111529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151961
2557	NC_017310	TGG	2	6	111539	111544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151961
2558	NC_017310	ATG	2	6	111550	111555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151961
2559	NC_017310	GCG	2	6	111556	111561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151961
2560	NC_017310	CCGC	2	8	111598	111605	0 %	0 %	25 %	75 %	387151961
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2572	NC_017310	CCTG	2	8	112239	112246	0 %	25 %	25 %	50 %	387151961
2573	NC_017310	GACCA	2	10	112300	112309	40 %	0 %	20 %	40 %	387151961
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2577	NC_017310	CAT	2	6	112569	112574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151961
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2579	NC_017310	GCC	2	6	112639	112644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151961
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2581	NC_017310	CAGC	2	8	112667	112674	25 %	0 %	25 %	50 %	387151961
2582	NC_017310	GGA	2	6	112681	112686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2586	NC_017310	TCA	2	6	112748	112753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151962
2587	NC_017310	CAT	2	6	112806	112811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151962
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2589	NC_017310	AGGTCG	2	12	112820	112831	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387151962
2590	NC_017310	GCC	2	6	112867	112872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151962
2591	NC_017310	GCCGC	2	10	112879	112888	0 %	0 %	40 %	60 %	387151962
2592	NC_017310	CAG	2	6	112894	112899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151962
2593	NC_017310	ACA	2	6	112913	112918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387151962
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2595	NC_017310	GACC	2	8	112986	112993	25 %	0 %	25 %	50 %	387151962
2596	NC_017310	CAA	2	6	113016	113021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387151962
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2598	NC_017310	GCG	2	6	113069	113074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151962
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2601	NC_017310	CGA	2	6	113130	113135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151962
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2603	NC_017310	ACT	2	6	113240	113245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151962
2604	NC_017310	CGC	2	6	113340	113345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151962
2605	NC_017310	GCA	2	6	113358	113363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151962
2606	NC_017310	CAT	2	6	113442	113447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151962
2607	NC_017310	GAG	2	6	113458	113463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387151962
2608	NC_017310	CTCAAG	2	12	113476	113487	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	387151962
2609	NC_017310	ACC	2	6	113683	113688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151962
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2612	NC_017310	CCA	2	6	113789	113794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151962
2613	NC_017310	CGA	2	6	113916	113921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151962
2614	NC_017310	CAT	2	6	113925	113930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151962
2615	NC_017310	CAT	2	6	113952	113957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151962
2616	NC_017310	CCA	2	6	113987	113992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151962
2617	NC_017310	TCG	2	6	114023	114028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151962
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2619	NC_017310	GGC	2	6	114076	114081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151962
2620	NC_017310	CGCC	2	8	114164	114171	0 %	0 %	25 %	75 %	387151962
2621	NC_017310	TTC	2	6	114217	114222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151962
2622	NC_017310	CAA	2	6	114231	114236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387151962
2623	NC_017310	CGG	2	6	114266	114271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151962
2624	NC_017310	CGG	2	6	114363	114368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151962
2625	NC_017310	CGA	2	6	114378	114383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151962
2626	NC_017310	CATGGC	2	12	114399	114410	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	387151962
2627	NC_017310	ACCG	2	8	114454	114461	25 %	0 %	25 %	50 %	387151962
2628	NC_017310	GGC	2	6	114471	114476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151962
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2632	NC_017310	CGT	2	6	114666	114671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151962
2633	NC_017310	C	6	6	114684	114689	0 %	0 %	0 %	100 %	387151962
2634	NC_017310	CAC	2	6	114708	114713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151962
2635	NC_017310	GGC	2	6	114715	114720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151962
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2641	NC_017310	GCAG	2	8	114999	115006	25 %	0 %	50 %	25 %	387151962
2642	NC_017310	CGA	2	6	115029	115034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151962
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2644	NC_017310	TCA	2	6	115091	115096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151962
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2708	NC_017310	GTC	2	6	117650	117655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151964
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2712	NC_017310	ACCG	2	8	117855	117862	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2713	NC_017310	GGC	2	6	117871	117876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2714	NC_017310	ACA	2	6	117883	117888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2715	NC_017310	CGCC	2	8	117920	117927	0 %	0 %	25 %	75 %	387151965
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2731	NC_017310	GTC	2	6	118628	118633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151965
2732	NC_017310	GT	3	6	118645	118650	0 %	50 %	50 %	0 %	387151965
2733	NC_017310	TCACCG	2	12	118678	118689	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387151965
2734	NC_017310	ACG	2	6	118729	118734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151965
2735	NC_017310	CGA	2	6	118742	118747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151965
2736	NC_017310	TGC	2	6	118786	118791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151965
2737	NC_017310	CCAT	2	8	118845	118852	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2738	NC_017310	G	6	6	118859	118864	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2739	NC_017310	C	6	6	118872	118877	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2740	NC_017310	TCCTG	2	10	118930	118939	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2741	NC_017310	GCG	2	6	118978	118983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2742	NC_017310	GCCA	2	8	118994	119001	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2743	NC_017310	ACC	2	6	119030	119035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2744	NC_017310	CAC	2	6	119039	119044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2745	NC_017310	AGG	2	6	119051	119056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2987	NC_017310	GCC	2	6	129036	129041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2988	NC_017310	GCA	2	6	129058	129063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2989	NC_017310	AGG	2	6	129110	129115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2990	NC_017310	ACG	2	6	129131	129136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2991	NC_017310	TGTCC	2	10	129168	129177	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2992	NC_017310	GTCTC	2	10	129194	129203	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2993	NC_017310	TCGT	2	8	129247	129254	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2994	NC_017310	GGC	2	6	129271	129276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2995	NC_017310	G	7	7	129312	129318	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2996	NC_017310	TCG	2	6	129326	129331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2997	NC_017310	CCCG	2	8	129384	129391	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2998	NC_017310	GCC	2	6	129423	129428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2999	NC_017310	ATC	2	6	129433	129438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3000	NC_017310	C	6	6	129469	129474	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding

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