MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 78697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_017310	CG	3	6	88348	88353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2002	NC_017310	GTG	2	6	88378	88383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_017310	GGA	2	6	88393	88398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_017310	GAT	2	6	88402	88407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151941
2005	NC_017310	GC	3	6	88439	88444	0 %	0 %	50 %	50 %	387151941
2006	NC_017310	CAT	2	6	88462	88467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151941
2007	NC_017310	GGC	2	6	88506	88511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151941
2008	NC_017310	TGG	2	6	88518	88523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151941
2009	NC_017310	GGAT	2	8	88597	88604	25 %	25 %	50 %	0 %	387151941
2010	NC_017310	GCC	2	6	88616	88621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151941
2011	NC_017310	AGG	2	6	88686	88691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387151941
2012	NC_017310	GCC	2	6	88697	88702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151941
2013	NC_017310	CACG	2	8	88726	88733	25 %	0 %	25 %	50 %	387151941
2014	NC_017310	TTCCC	2	10	88780	88789	0 %	40 %	0 %	60 %	387151941
2015	NC_017310	TCA	2	6	88923	88928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151941
2016	NC_017310	TGGA	2	8	88964	88971	25 %	25 %	50 %	0 %	387151941
2017	NC_017310	GGGC	2	8	88973	88980	0 %	0 %	75 %	25 %	387151941
2018	NC_017310	GGC	2	6	89095	89100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2019	NC_017310	TCA	2	6	89118	89123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2020	NC_017310	CCG	2	6	89135	89140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2021	NC_017310	CGC	2	6	89168	89173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2022	NC_017310	CGG	2	6	89181	89186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NC_017310	AGGC	2	8	89203	89210	25 %	0 %	50 %	25 %	387151942
2024	NC_017310	CTG	2	6	89336	89341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151942
2025	NC_017310	CGG	3	9	89371	89379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151942
2026	NC_017310	CTGCG	2	10	89386	89395	0 %	20 %	40 %	40 %	387151942
2027	NC_017310	GGC	2	6	89408	89413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151942
2028	NC_017310	GCTT	2	8	89503	89510	0 %	50 %	25 %	25 %	387151942
2029	NC_017310	GCG	2	6	89524	89529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151942
2030	NC_017310	CCG	2	6	89544	89549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151942
2031	NC_017310	TGCCA	2	10	89591	89600	20 %	20 %	20 %	40 %	387151942
2032	NC_017310	TG	3	6	89634	89639	0 %	50 %	50 %	0 %	387151942
2033	NC_017310	GC	3	6	89703	89708	0 %	0 %	50 %	50 %	387151942
2034	NC_017310	CCG	2	6	89745	89750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151942
2035	NC_017310	TGC	2	6	89764	89769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151942
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2037	NC_017310	TTG	2	6	89796	89801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387151942
2038	NC_017310	GC	3	6	89832	89837	0 %	0 %	50 %	50 %	387151942
2039	NC_017310	AGAT	2	8	89955	89962	50 %	25 %	25 %	0 %	387151942
2040	NC_017310	TCG	2	6	90219	90224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151942
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2042	NC_017310	GC	3	6	90280	90285	0 %	0 %	50 %	50 %	387151942
2043	NC_017310	GGC	2	6	90314	90319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151942
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2046	NC_017310	CCA	2	6	90416	90421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151942
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2048	NC_017310	CGA	2	6	90520	90525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151942
2049	NC_017310	TTC	2	6	90542	90547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151942
2050	NC_017310	CGG	2	6	90603	90608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151942
2051	NC_017310	CG	3	6	90628	90633	0 %	0 %	50 %	50 %	387151942
2052	NC_017310	GTA	2	6	90644	90649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151942
2053	NC_017310	GAC	2	6	90662	90667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151942
2054	NC_017310	G	7	7	90764	90770	0 %	0 %	100 %	0 %	387151942
2055	NC_017310	ACC	2	6	90783	90788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151942
2056	NC_017310	CTG	2	6	90795	90800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151942
2057	NC_017310	GGA	2	6	90803	90808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387151942
2058	NC_017310	CGG	2	6	90841	90846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151942
2059	NC_017310	GAA	2	6	90852	90857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151942
2060	NC_017310	CAT	2	6	90914	90919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151942
2061	NC_017310	AGA	2	6	90921	90926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151942
2062	NC_017310	GCG	3	9	90953	90961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151942
2063	NC_017310	GTG	2	6	90983	90988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2064	NC_017310	AAG	2	6	91013	91018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2065	NC_017310	CTG	2	6	91033	91038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2066	NC_017310	CAA	2	6	91080	91085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2067	NC_017310	AGC	2	6	91109	91114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2068	NC_017310	CGGCGA	2	12	91166	91177	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387151943
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2072	NC_017310	CTATGC	2	12	91370	91381	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	387151943
2073	NC_017310	C	6	6	91402	91407	0 %	0 %	0 %	100 %	387151943
2074	NC_017310	CGA	2	6	91412	91417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151943
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2093	NC_017310	CG	4	8	91994	92001	0 %	0 %	50 %	50 %	387151943
2094	NC_017310	CGA	2	6	92006	92011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151943
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2098	NC_017310	TGC	2	6	92179	92184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151943
2099	NC_017310	GCT	2	6	92233	92238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151943
2100	NC_017310	CTG	2	6	92250	92255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151943
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2102	NC_017310	GCA	2	6	92311	92316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2103	NC_017310	CGA	2	6	92344	92349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2104	NC_017310	CATT	2	8	92361	92368	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2105	NC_017310	AGG	2	6	92376	92381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2106	NC_017310	ACCGT	2	10	92450	92459	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2107	NC_017310	ACC	2	6	92610	92615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151944
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2109	NC_017310	AGC	2	6	92721	92726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151944
2110	NC_017310	TCC	2	6	92784	92789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2111	NC_017310	CAG	2	6	92826	92831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151945
2112	NC_017310	CAG	3	9	92856	92864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151945
2113	NC_017310	CAT	2	6	92883	92888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151945
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2115	NC_017310	CAT	3	9	92898	92906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151945
2116	NC_017310	TGA	2	6	93002	93007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151945
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2118	NC_017310	ATG	2	6	93025	93030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151945
2119	NC_017310	CGT	2	6	93038	93043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151945
2120	NC_017310	AGA	2	6	93080	93085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387151945
2121	NC_017310	CG	3	6	93101	93106	0 %	0 %	50 %	50 %	387151945
2122	NC_017310	CTT	2	6	93144	93149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151945
2123	NC_017310	ATG	2	6	93229	93234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151945
2124	NC_017310	ACC	2	6	93235	93240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387151945
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2126	NC_017310	GAT	3	9	93324	93332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151945
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2252	NC_017310	CGG	2	6	98674	98679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151952
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2257	NC_017310	CCG	2	6	98757	98762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2362	NC_017310	GAG	2	6	103803	103808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387151956
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2369	NC_017310	GCCGG	2	10	104071	104080	0 %	0 %	60 %	40 %	387151956
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2371	NC_017310	TTCGG	2	10	104163	104172	0 %	40 %	40 %	20 %	387151956
2372	NC_017310	GCG	2	6	104223	104228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151956
2373	NC_017310	GAC	2	6	104231	104236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151956
2374	NC_017310	ACGA	2	8	104278	104285	50 %	0 %	25 %	25 %	387151956
2375	NC_017310	GCA	2	6	104339	104344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151956
2376	NC_017310	TGG	4	12	104380	104391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151956
2377	NC_017310	GCC	2	6	104433	104438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387151956
2378	NC_017310	GAAT	2	8	104468	104475	50 %	25 %	25 %	0 %	387151956
2379	NC_017310	CAT	2	6	104510	104515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151956
2380	NC_017310	CGG	2	6	104524	104529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387151956
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2382	NC_017310	GACGC	2	10	104556	104565	20 %	0 %	40 %	40 %	387151956
2383	NC_017310	TCG	2	6	104678	104683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151957
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2394	NC_017310	TCGAGG	2	12	105251	105262	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	387151957
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2397	NC_017310	TCTCG	2	10	105357	105366	0 %	40 %	20 %	40 %	387151957
2398	NC_017310	GGAC	2	8	105387	105394	25 %	0 %	50 %	25 %	387151957
2399	NC_017310	TTCTC	2	10	105449	105458	0 %	60 %	0 %	40 %	387151957
2400	NC_017310	TCA	2	6	105464	105469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387151957
2401	NC_017310	CGA	2	6	105507	105512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151957
2402	NC_017310	AC	3	6	105535	105540	50 %	0 %	0 %	50 %	387151957
2403	NC_017310	CGCCCT	2	12	105552	105563	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	387151957
2404	NC_017310	GAGG	2	8	105622	105629	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2405	NC_017310	AGA	2	6	105659	105664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2406	NC_017310	CGG	2	6	105722	105727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2407	NC_017310	GCGTG	2	10	105736	105745	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2408	NC_017310	T	6	6	105836	105841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2491	NC_017310	TGG	2	6	108940	108945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151960
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2494	NC_017310	GTG	2	6	109188	109193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151960
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2496	NC_017310	TGG	3	9	109270	109278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387151960
2497	NC_017310	GCT	2	6	109316	109321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387151960
2498	NC_017310	ATG	2	6	109365	109370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387151960
2499	NC_017310	CTT	2	6	109374	109379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387151960
2500	NC_017310	GCA	2	6	109391	109396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387151960

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