MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio vulgaris RCH1 chromosome

Total Repeats: 78697

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017310	CGC	2	6	238626	238631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152056
5502	NC_017310	CGG	2	6	238644	238649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152056
5503	NC_017310	GCG	2	6	238661	238666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152056
5504	NC_017310	GTGG	2	8	238670	238677	0 %	25 %	75 %	0 %	387152056
5505	NC_017310	GCG	2	6	238693	238698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152056
5506	NC_017310	CAG	2	6	238778	238783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152056
5507	NC_017310	CACC	2	8	238804	238811	25 %	0 %	0 %	75 %	387152056
5508	NC_017310	CAG	2	6	238850	238855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152056
5509	NC_017310	GC	3	6	238879	238884	0 %	0 %	50 %	50 %	387152056
5510	NC_017310	GGC	2	6	238940	238945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152056
5511	NC_017310	CCG	2	6	238999	239004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152056
5512	NC_017310	CTT	2	6	239060	239065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152056
5513	NC_017310	ATG	2	6	239073	239078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152056
5514	NC_017310	CGC	2	6	239117	239122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152057
5515	NC_017310	CAG	2	6	239130	239135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152057
5516	NC_017310	GGT	2	6	239165	239170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152057
5517	NC_017310	CGT	2	6	239171	239176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152057
5518	NC_017310	ATG	2	6	239212	239217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152057
5519	NC_017310	ATG	2	6	239272	239277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152057
5520	NC_017310	CG	3	6	239291	239296	0 %	0 %	50 %	50 %	387152057
5521	NC_017310	ACGGC	2	10	239317	239326	20 %	0 %	40 %	40 %	387152057
5522	NC_017310	CCG	2	6	239365	239370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152057
5523	NC_017310	GCC	2	6	239394	239399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152057
5524	NC_017310	ACC	2	6	239446	239451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152057
5525	NC_017310	CGCAGC	2	12	239485	239496	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	387152057
5526	NC_017310	CCG	2	6	239512	239517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152057
5527	NC_017310	GGT	2	6	239519	239524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152057
5528	NC_017310	CCG	2	6	239600	239605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152057
5529	NC_017310	TGG	2	6	239606	239611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152057
5530	NC_017310	CGC	2	6	239654	239659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152057
5531	NC_017310	GAT	2	6	239718	239723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152057
5532	NC_017310	GC	3	6	239737	239742	0 %	0 %	50 %	50 %	387152057
5533	NC_017310	CGT	2	6	239804	239809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152057
5534	NC_017310	GAA	2	6	239859	239864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152057
5535	NC_017310	GGC	2	6	239892	239897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152057
5536	NC_017310	CCA	2	6	239909	239914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152057
5537	NC_017310	CAG	2	6	239964	239969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152057
5538	NC_017310	GTC	2	6	240084	240089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152057
5539	NC_017310	TGTCA	2	10	240090	240099	20 %	40 %	20 %	20 %	387152057
5540	NC_017310	CTT	2	6	240116	240121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152058
5541	NC_017310	G	6	6	240200	240205	0 %	0 %	100 %	0 %	387152058
5542	NC_017310	TGG	2	6	240273	240278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152058
5543	NC_017310	TCG	2	6	240321	240326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152058
5544	NC_017310	GCG	2	6	240391	240396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_017310	AGC	2	6	240400	240405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152059
5546	NC_017310	GCC	2	6	240425	240430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152059
5547	NC_017310	GGGAT	2	10	240441	240450	20 %	20 %	60 %	0 %	387152059
5548	NC_017310	AGT	2	6	240475	240480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152059
5549	NC_017310	GCA	2	6	240502	240507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152059
5550	NC_017310	GGC	2	6	240578	240583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152059
5551	NC_017310	GGGC	2	8	240638	240645	0 %	0 %	75 %	25 %	387152059
5552	NC_017310	CG	3	6	240697	240702	0 %	0 %	50 %	50 %	387152059
5553	NC_017310	TGG	2	6	240709	240714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152059
5554	NC_017310	GTC	2	6	240731	240736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152059
5555	NC_017310	ACC	2	6	241122	241127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152059
5556	NC_017310	CGAG	2	8	241141	241148	25 %	0 %	50 %	25 %	387152059
5557	NC_017310	CAG	2	6	241166	241171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152059
5558	NC_017310	CGGA	2	8	241232	241239	25 %	0 %	50 %	25 %	387152059
5559	NC_017310	TTG	3	9	241269	241277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152059
5560	NC_017310	GCC	2	6	241320	241325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152059
5561	NC_017310	TCC	2	6	241422	241427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387152059
5562	NC_017310	CGC	2	6	241434	241439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152059
5563	NC_017310	GTG	2	6	241542	241547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152059
5564	NC_017310	CGTT	2	8	241602	241609	0 %	50 %	25 %	25 %	387152059
5565	NC_017310	GTCC	2	8	241657	241664	0 %	25 %	25 %	50 %	387152059
5566	NC_017310	GGC	2	6	241733	241738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152059
5567	NC_017310	CTT	2	6	241795	241800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_017310	GTA	2	6	241823	241828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152060
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5570	NC_017310	GGCT	2	8	241864	241871	0 %	25 %	50 %	25 %	387152060
5571	NC_017310	GTG	2	6	241908	241913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152060
5572	NC_017310	GCCT	2	8	241941	241948	0 %	25 %	25 %	50 %	387152060
5573	NC_017310	CAC	2	6	241994	241999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152060
5574	NC_017310	CGA	2	6	242029	242034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152060
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5579	NC_017310	CTG	2	6	242210	242215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152060
5580	NC_017310	CCGC	2	8	242229	242236	0 %	0 %	25 %	75 %	387152060
5581	NC_017310	CTT	2	6	242257	242262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152060
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5583	NC_017310	GCGGCA	2	12	242449	242460	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	387152060
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5587	NC_017310	ATG	2	6	242700	242705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152060
5588	NC_017310	CGTCCA	2	12	242740	242751	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	387152060
5589	NC_017310	CACC	2	8	242806	242813	25 %	0 %	0 %	75 %	387152060
5590	NC_017310	AGG	2	6	242827	242832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387152060
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5593	NC_017310	CAC	3	9	242894	242902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387152060
5594	NC_017310	GCCT	2	8	242934	242941	0 %	25 %	25 %	50 %	387152060
5595	NC_017310	CCG	2	6	243105	243110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387152060
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5600	NC_017310	TGCCC	2	10	243310	243319	0 %	20 %	20 %	60 %	387152060
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5604	NC_017310	TAG	3	9	243402	243410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152060
5605	NC_017310	GGCGC	2	10	243557	243566	0 %	0 %	60 %	40 %	387152060
5606	NC_017310	GTC	2	6	243701	243706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152060
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5608	NC_017310	AGA	2	6	243742	243747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387152060
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5611	NC_017310	CGAG	2	8	243844	243851	25 %	0 %	50 %	25 %	387152060
5612	NC_017310	GGT	2	6	243923	243928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387152060
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5620	NC_017310	CAT	2	6	244256	244261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152060
5621	NC_017310	GAT	2	6	244355	244360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152060
5622	NC_017310	TTCC	2	8	244403	244410	0 %	50 %	0 %	50 %	387152060
5623	NC_017310	ATC	2	6	244431	244436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387152060
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5625	NC_017310	TGT	2	6	244495	244500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387152060
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5634	NC_017310	GCA	2	6	244786	244791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387152060
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5644	NC_017310	GCC	2	6	245184	245189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5645	NC_017310	TGA	2	6	245337	245342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5647	NC_017310	TGT	2	6	245422	245427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5649	NC_017310	TTC	2	6	245447	245452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5650	NC_017310	ATC	2	6	245465	245470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5688	NC_017310	G	7	7	247266	247272	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5742	NC_017310	CG	3	6	249633	249638	0 %	0 %	50 %	50 %	387152065
5743	NC_017310	CTT	3	9	249655	249663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387152065
5744	NC_017310	GTACG	2	10	249684	249693	20 %	20 %	40 %	20 %	387152065
5745	NC_017310	GCCCAC	2	12	249763	249774	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	387152065
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5752	NC_017310	ATG	2	6	250067	250072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152065
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5778	NC_017310	TGA	3	9	251158	251166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152066
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5986	NC_017310	TGC	2	6	260236	260241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387152071
5987	NC_017310	CGG	2	6	260254	260259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152071
5988	NC_017310	GGC	2	6	260272	260277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387152071
5989	NC_017310	CG	3	6	260332	260337	0 %	0 %	50 %	50 %	387152071
5990	NC_017310	GCCG	2	8	260393	260400	0 %	0 %	50 %	50 %	387152071
5991	NC_017310	ATG	2	6	260484	260489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387152071
5992	NC_017310	TCCTC	2	10	260545	260554	0 %	40 %	0 %	60 %	387152071
5993	NC_017310	GTG	2	6	260597	260602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5994	NC_017310	CAT	3	9	260623	260631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5995	NC_017310	GTG	2	6	260632	260637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5996	NC_017310	CAC	2	6	260643	260648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5997	NC_017310	CGTT	2	8	260773	260780	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5998	NC_017310	TCC	2	6	260789	260794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5999	NC_017310	GTG	2	6	260831	260836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6000	NC_017310	CGT	2	6	260837	260842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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