MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 3122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016629	CCAAG	2	10	465	474	40 %	0 %	20 %	40 %	374298387
2	NC_016629	CAGGA	2	10	725	734	40 %	0 %	40 %	20 %	374298387
3	NC_016629	AAGTG	2	10	1857	1866	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016629	GGCGC	2	10	2641	2650	0 %	0 %	60 %	40 %	374298388
5	NC_016629	CGCAG	2	10	2822	2831	20 %	0 %	40 %	40 %	374298389
6	NC_016629	GCCGC	2	10	5388	5397	0 %	0 %	40 %	60 %	374298392
7	NC_016629	ACGCC	2	10	8591	8600	20 %	0 %	20 %	60 %	374298395
8	NC_016629	TCTCC	2	10	9364	9373	0 %	40 %	0 %	60 %	374298396
9	NC_016629	CCAGC	2	10	9391	9400	20 %	0 %	20 %	60 %	374298396
10	NC_016629	GCCTG	2	10	10777	10786	0 %	20 %	40 %	40 %	374298397
11	NC_016629	GCGCA	2	10	10879	10888	20 %	0 %	40 %	40 %	374298398
12	NC_016629	GCTCT	2	10	11081	11090	0 %	40 %	20 %	40 %	374298398
13	NC_016629	TGCCG	2	10	11854	11863	0 %	20 %	40 %	40 %	374298398
14	NC_016629	CCTTG	2	10	12345	12354	0 %	40 %	20 %	40 %	374298399
15	NC_016629	CACGG	2	10	17236	17245	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_016629	CGCAC	2	10	20394	20403	20 %	0 %	20 %	60 %	374298407
17	NC_016629	GCCCG	2	10	25681	25690	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_016629	GACGC	2	10	25949	25958	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_016629	CCGGG	2	10	27744	27753	0 %	0 %	60 %	40 %	374298413
20	NC_016629	GGGCG	2	10	34179	34188	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
21	NC_016629	GCAGC	2	10	37644	37653	20 %	0 %	40 %	40 %	374298423
22	NC_016629	CCTCG	2	10	39497	39506	0 %	20 %	20 %	60 %	374298425
23	NC_016629	TCAAG	2	10	39986	39995	40 %	20 %	20 %	20 %	374298425
24	NC_016629	AGCGG	2	10	40990	40999	20 %	0 %	60 %	20 %	374298426
25	NC_016629	GCGCC	2	10	41081	41090	0 %	0 %	40 %	60 %	374298426
26	NC_016629	AGGGG	2	10	41911	41920	20 %	0 %	80 %	0 %	374298426
27	NC_016629	CCTGC	2	10	42322	42331	0 %	20 %	20 %	60 %	374298427
28	NC_016629	CCGGC	2	10	44419	44428	0 %	0 %	40 %	60 %	374298429
29	NC_016629	CATCG	2	10	49447	49456	20 %	20 %	20 %	40 %	374298434
30	NC_016629	GCCTT	2	10	49937	49946	0 %	40 %	20 %	40 %	374298435
31	NC_016629	TTCGC	2	10	50702	50711	0 %	40 %	20 %	40 %	374298435
32	NC_016629	GCGTA	2	10	51364	51373	20 %	20 %	40 %	20 %	374298437
33	NC_016629	ACTCG	2	10	51788	51797	20 %	20 %	20 %	40 %	374298437
34	NC_016629	AGCGC	2	10	52784	52793	20 %	0 %	40 %	40 %	374298438
35	NC_016629	CCAGA	2	10	53004	53013	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_016629	CCACT	2	10	57134	57143	20 %	20 %	0 %	60 %	374298442
37	NC_016629	GCCAA	2	10	59883	59892	40 %	0 %	20 %	40 %	374298447
38	NC_016629	TTTGG	2	10	61292	61301	0 %	60 %	40 %	0 %	374298448
39	NC_016629	TCCCG	2	10	62588	62597	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_016629	CGCAA	2	10	62911	62920	40 %	0 %	20 %	40 %	374298450
41	NC_016629	ACCCG	2	10	63350	63359	20 %	0 %	20 %	60 %	374298450
42	NC_016629	CCTGG	2	10	64678	64687	0 %	20 %	40 %	40 %	374298450
43	NC_016629	ACCCG	2	10	64827	64836	20 %	0 %	20 %	60 %	374298450
44	NC_016629	GAATC	2	10	67482	67491	40 %	20 %	20 %	20 %	374298452
45	NC_016629	ATGCA	2	10	67619	67628	40 %	20 %	20 %	20 %	374298452
46	NC_016629	CGCAG	2	10	68644	68653	20 %	0 %	40 %	40 %	374298453
47	NC_016629	AGAGT	2	10	69827	69836	40 %	20 %	40 %	0 %	374298454
48	NC_016629	CTCTC	2	10	71625	71634	0 %	40 %	0 %	60 %	374298455
49	NC_016629	GGCAT	2	10	76947	76956	20 %	20 %	40 %	20 %	374298458
50	NC_016629	CAGGC	2	10	77560	77569	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_016629	CTTTT	2	10	79674	79683	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_016629	TTCAT	2	10	80311	80320	20 %	60 %	0 %	20 %	374298460
53	NC_016629	TCAAT	2	10	80435	80444	40 %	40 %	0 %	20 %	374298460
54	NC_016629	GCGTG	2	10	81238	81247	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_016629	ATCAG	2	10	81583	81592	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016629	CGGCG	2	10	86512	86521	0 %	0 %	60 %	40 %	374298466
57	NC_016629	CGAGG	2	10	86770	86779	20 %	0 %	60 %	20 %	374298466
58	NC_016629	CGGCT	2	10	88862	88871	0 %	20 %	40 %	40 %	374298468
59	NC_016629	GGCTT	2	10	90364	90373	0 %	40 %	40 %	20 %	374298469
60	NC_016629	CTGCT	2	10	91419	91428	0 %	40 %	20 %	40 %	374298469
61	NC_016629	CCAGC	2	10	92538	92547	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
62	NC_016629	TGGAC	2	10	95581	95590	20 %	20 %	40 %	20 %	374298472
63	NC_016629	CGGCA	2	10	98110	98119	20 %	0 %	40 %	40 %	374298474
64	NC_016629	CCTTC	2	10	100177	100186	0 %	40 %	0 %	60 %	374298475
65	NC_016629	GAAAC	2	10	100869	100878	60 %	0 %	20 %	20 %	374298475
66	NC_016629	GGCCG	2	10	101192	101201	0 %	0 %	60 %	40 %	374298475
67	NC_016629	CGCAT	2	10	103317	103326	20 %	20 %	20 %	40 %	374298476
68	NC_016629	CGGGA	2	10	105100	105109	20 %	0 %	60 %	20 %	374298478
69	NC_016629	CGCGG	2	10	109474	109483	0 %	0 %	60 %	40 %	374298482
70	NC_016629	CCACG	2	10	112514	112523	20 %	0 %	20 %	60 %	374298484
71	NC_016629	TCCAC	2	10	112813	112822	20 %	20 %	0 %	60 %	374298484
72	NC_016629	GCTGG	2	10	114965	114974	0 %	20 %	60 %	20 %	374298487
73	NC_016629	CTGGA	2	10	115929	115938	20 %	20 %	40 %	20 %	374298488
74	NC_016629	GCCCT	2	10	116042	116051	0 %	20 %	20 %	60 %	374298488
75	NC_016629	CCGGC	2	10	116079	116088	0 %	0 %	40 %	60 %	374298488
76	NC_016629	CCATG	2	10	116380	116389	20 %	20 %	20 %	40 %	374298488
77	NC_016629	CAGAC	2	10	117709	117718	40 %	0 %	20 %	40 %	374298488
78	NC_016629	TGCCT	2	10	120522	120531	0 %	40 %	20 %	40 %	374298490
79	NC_016629	TTGCA	2	10	120844	120853	20 %	40 %	20 %	20 %	374298490
80	NC_016629	CGGGC	2	10	122048	122057	0 %	0 %	60 %	40 %	374298491
81	NC_016629	GTCCC	2	10	122677	122686	0 %	20 %	20 %	60 %	374298491
82	NC_016629	GACTC	2	10	122889	122898	20 %	20 %	20 %	40 %	374298492
83	NC_016629	AGGCC	2	10	123651	123660	20 %	0 %	40 %	40 %	374298493
84	NC_016629	GGATG	2	10	124182	124191	20 %	20 %	60 %	0 %	374298493
85	NC_016629	ACGGC	2	10	127594	127603	20 %	0 %	40 %	40 %	374298494
86	NC_016629	CAGGA	2	10	127687	127696	40 %	0 %	40 %	20 %	374298494
87	NC_016629	TTCAG	2	10	129039	129048	20 %	40 %	20 %	20 %	374298496
88	NC_016629	GCGCA	2	10	129375	129384	20 %	0 %	40 %	40 %	374298496
89	NC_016629	CTGGG	2	10	130716	130725	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
90	NC_016629	TTTTG	2	10	131565	131574	0 %	80 %	20 %	0 %	374298498
91	NC_016629	GCCGC	3	15	131642	131656	0 %	0 %	40 %	60 %	374298498
92	NC_016629	GGTCT	2	10	133697	133706	0 %	40 %	40 %	20 %	374298500
93	NC_016629	TCGGC	2	10	134703	134712	0 %	20 %	40 %	40 %	374298500
94	NC_016629	GCCAG	2	10	135715	135724	20 %	0 %	40 %	40 %	374298501
95	NC_016629	ACGCC	2	10	136468	136477	20 %	0 %	20 %	60 %	374298502
96	NC_016629	GCCAA	2	10	139751	139760	40 %	0 %	20 %	40 %	374298507
97	NC_016629	CGCGC	2	10	140126	140135	0 %	0 %	40 %	60 %	374298508
98	NC_016629	GGTCT	2	10	140881	140890	0 %	40 %	40 %	20 %	374298509
99	NC_016629	GGCCA	2	10	140983	140992	20 %	0 %	40 %	40 %	374298509
100	NC_016629	GCCTG	2	10	141497	141506	0 %	20 %	40 %	40 %	374298509
101	NC_016629	ATCGC	2	10	143368	143377	20 %	20 %	20 %	40 %	374298511
102	NC_016629	CTGGT	2	10	143873	143882	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_016629	GCCAC	2	10	144413	144422	20 %	0 %	20 %	60 %	374298512
104	NC_016629	TGAAA	2	10	145487	145496	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016629	GCCGA	2	10	146297	146306	20 %	0 %	40 %	40 %	374298515
106	NC_016629	GGCTG	2	10	147576	147585	0 %	20 %	60 %	20 %	374298517
107	NC_016629	GCACG	2	10	147670	147679	20 %	0 %	40 %	40 %	374298517
108	NC_016629	TCAGC	2	10	151846	151855	20 %	20 %	20 %	40 %	374298521
109	NC_016629	CAGAA	2	10	152636	152645	60 %	0 %	20 %	20 %	374298522
110	NC_016629	GCAGT	2	10	154681	154690	20 %	20 %	40 %	20 %	374298523
111	NC_016629	GCCCG	2	10	155395	155404	0 %	0 %	40 %	60 %	374298524
112	NC_016629	GCCGT	2	10	157153	157162	0 %	20 %	40 %	40 %	374298525
113	NC_016629	CTGGT	2	10	157309	157318	0 %	40 %	40 %	20 %	374298525
114	NC_016629	CGGTG	2	10	158579	158588	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_016629	CCACG	2	10	160587	160596	20 %	0 %	20 %	60 %	374298528
116	NC_016629	CCGAT	2	10	160961	160970	20 %	20 %	20 %	40 %	374298529
117	NC_016629	CGGCC	2	10	161411	161420	0 %	0 %	40 %	60 %	374298529
118	NC_016629	GTTCC	2	10	165031	165040	0 %	40 %	20 %	40 %	374298533
119	NC_016629	CACCC	2	10	166769	166778	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
120	NC_016629	TTCTC	2	10	166992	167001	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_016629	CTGGG	2	10	167041	167050	0 %	20 %	60 %	20 %	374298535
122	NC_016629	CGGCG	2	10	167097	167106	0 %	0 %	60 %	40 %	374298535
123	NC_016629	CCCGG	2	10	167793	167802	0 %	0 %	40 %	60 %	374298535
124	NC_016629	GCCTT	2	10	170670	170679	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_016629	GACCA	2	10	175961	175970	40 %	0 %	20 %	40 %	374298541
126	NC_016629	TCGTC	2	10	176522	176531	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_016629	GCAAG	2	10	178003	178012	40 %	0 %	40 %	20 %	374298545
128	NC_016629	GCCCA	2	10	178349	178358	20 %	0 %	20 %	60 %	374298545
129	NC_016629	GCGAC	2	10	178512	178521	20 %	0 %	40 %	40 %	374298545
130	NC_016629	CTGGC	2	10	179925	179934	0 %	20 %	40 %	40 %	374298545
131	NC_016629	AAGGC	2	10	180769	180778	40 %	0 %	40 %	20 %	374298546
132	NC_016629	CTCGG	2	10	181425	181434	0 %	20 %	40 %	40 %	374298546
133	NC_016629	AATGA	2	10	181476	181485	60 %	20 %	20 %	0 %	374298546
134	NC_016629	GTCAG	2	10	184547	184556	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_016629	AGAAA	2	10	184615	184624	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016629	CAGGA	2	10	185978	185987	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_016629	CGATG	2	10	186041	186050	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_016629	TCCGC	2	10	187367	187376	0 %	20 %	20 %	60 %	374298550
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249	NC_016629	GACAG	2	10	336784	336793	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
250	NC_016629	TGCCC	2	10	336848	336857	0 %	20 %	20 %	60 %	374298688
251	NC_016629	CCTGC	2	10	337265	337274	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
252	NC_016629	GCGAG	2	10	337963	337972	20 %	0 %	60 %	20 %	374298690
253	NC_016629	CTTTT	2	10	338762	338771	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
254	NC_016629	CGGCC	2	10	339820	339829	0 %	0 %	40 %	60 %	374298692
255	NC_016629	CGTTG	2	10	341334	341343	0 %	40 %	40 %	20 %	374298693
256	NC_016629	CATCG	2	10	342072	342081	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
257	NC_016629	GCCAA	2	10	344857	344866	40 %	0 %	20 %	40 %	374298698
258	NC_016629	CTGTG	2	10	346121	346130	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
259	NC_016629	ACGGA	2	10	346239	346248	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
260	NC_016629	GCCCT	2	10	347681	347690	0 %	20 %	20 %	60 %	374298699
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263	NC_016629	TCATG	2	10	358486	358495	20 %	40 %	20 %	20 %	374298710
264	NC_016629	GACTT	2	10	359599	359608	20 %	40 %	20 %	20 %	374298711
265	NC_016629	CCGGA	2	10	365840	365849	20 %	0 %	40 %	40 %	374298715
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400	NC_016629	CGTGC	2	10	533392	533401	0 %	20 %	40 %	40 %	374298852
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