MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 59768

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016629	TTG	2	6	159	164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016629	GCA	2	6	214	219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298387
3	NC_016629	TAC	2	6	361	366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298387
4	NC_016629	GCC	2	6	380	385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298387
5	NC_016629	GCA	2	6	423	428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298387
6	NC_016629	GAT	2	6	575	580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298387
7	NC_016629	TCA	2	6	663	668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298387
8	NC_016629	TGC	2	6	718	723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298387
9	NC_016629	CCA	2	6	783	788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298387
10	NC_016629	GGA	2	6	868	873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298387
11	NC_016629	TCC	2	6	882	887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298387
12	NC_016629	GCT	2	6	913	918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298387
13	NC_016629	GCC	2	6	1071	1076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298387
14	NC_016629	GCA	2	6	1084	1089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298387
15	NC_016629	GCT	2	6	1210	1215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298387
16	NC_016629	AAG	2	6	1508	1513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298387
17	NC_016629	GCC	2	6	1630	1635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_016629	CCG	2	6	1661	1666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_016629	AAT	2	6	1820	1825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016629	TTA	2	6	1921	1926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374298388
21	NC_016629	GCC	2	6	1937	1942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298388
22	NC_016629	GCA	2	6	2087	2092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298388
23	NC_016629	ACC	2	6	2123	2128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298388
24	NC_016629	GCA	2	6	2247	2252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298388
25	NC_016629	CCA	2	6	2256	2261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298388
26	NC_016629	CCA	2	6	2304	2309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298388
27	NC_016629	CCA	2	6	2343	2348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298388
28	NC_016629	CGG	2	6	2370	2375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298388
29	NC_016629	CGC	2	6	2388	2393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298388
30	NC_016629	CGG	2	6	2400	2405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298388
31	NC_016629	TCC	2	6	2582	2587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298388
32	NC_016629	GTC	2	6	2712	2717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298389
33	NC_016629	CAG	2	6	2775	2780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298389
34	NC_016629	GCA	2	6	2783	2788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298389
35	NC_016629	GCC	2	6	2843	2848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298389
36	NC_016629	CGG	2	6	2960	2965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298389
37	NC_016629	AGG	2	6	3095	3100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298389
38	NC_016629	TGA	2	6	3332	3337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298389
39	NC_016629	ATG	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298389
40	NC_016629	CGG	2	6	3359	3364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016629	TGG	2	6	3505	3510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016629	GCC	2	6	3712	3717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298390
43	NC_016629	TGA	2	6	3729	3734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298390
44	NC_016629	GCA	2	6	3867	3872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298390
45	NC_016629	GCG	2	6	3888	3893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298390
46	NC_016629	TGA	2	6	3969	3974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298390
47	NC_016629	TGG	2	6	3975	3980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298390
48	NC_016629	GCG	2	6	4038	4043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298390
49	NC_016629	CCA	2	6	4074	4079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298390
50	NC_016629	TCC	2	6	4154	4159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298390
51	NC_016629	TCC	2	6	4178	4183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298390
52	NC_016629	TCG	2	6	4208	4213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298390
53	NC_016629	GCC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298390
54	NC_016629	CGC	2	6	4263	4268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298390
55	NC_016629	GGT	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298390
56	NC_016629	GTC	2	6	4459	4464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298390
57	NC_016629	AAT	2	6	4598	4603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374298391
58	NC_016629	CCT	3	9	4623	4631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298391
59	NC_016629	GCA	2	6	4671	4676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298391
60	NC_016629	CGG	2	6	4710	4715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298391
61	NC_016629	TGC	2	6	4760	4765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298391
62	NC_016629	TCT	2	6	4770	4775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298391
63	NC_016629	CGC	2	6	4801	4806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298391
64	NC_016629	GCA	2	6	4818	4823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298391
65	NC_016629	GTC	2	6	4837	4842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298391
66	NC_016629	CAG	2	6	4900	4905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298391
67	NC_016629	CCT	2	6	4995	5000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298391
68	NC_016629	CGC	2	6	5058	5063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298391
69	NC_016629	CGG	2	6	5064	5069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298391
70	NC_016629	TCA	2	6	5244	5249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298392
71	NC_016629	CCG	2	6	5307	5312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298392
72	NC_016629	CCA	2	6	5314	5319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298392
73	NC_016629	ATG	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298392
74	NC_016629	CGG	2	6	5464	5469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298392
75	NC_016629	CCA	2	6	5551	5556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298392
76	NC_016629	CGG	2	6	5560	5565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298392
77	NC_016629	CCA	2	6	5566	5571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298392
78	NC_016629	CAC	2	6	5597	5602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298392
79	NC_016629	CGT	3	9	5737	5745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298393
80	NC_016629	TCC	2	6	5889	5894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298393
81	NC_016629	CCG	2	6	5896	5901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298393
82	NC_016629	GTA	2	6	5912	5917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298393
83	NC_016629	GTC	4	12	5918	5929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298393
84	NC_016629	CAC	2	6	5930	5935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298393
85	NC_016629	CTT	2	6	6011	6016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298393
86	NC_016629	CGC	2	6	6055	6060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298393
87	NC_016629	TTG	2	6	6105	6110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374298393
88	NC_016629	GCC	2	6	6117	6122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298393
89	NC_016629	ATG	2	6	6129	6134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298393
90	NC_016629	TCG	2	6	6171	6176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298393
91	NC_016629	CGC	3	9	6298	6306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298393
92	NC_016629	CTT	2	6	6359	6364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298393
93	NC_016629	TCC	2	6	6431	6436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_016629	GCC	2	6	6524	6529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_016629	GCA	2	6	6729	6734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298394
96	NC_016629	AAT	2	6	6865	6870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374298394
97	NC_016629	TCC	2	6	6923	6928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298394
98	NC_016629	GGC	2	6	6931	6936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298394
99	NC_016629	GCC	2	6	7036	7041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298394
100	NC_016629	TTG	2	6	7136	7141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374298394
101	NC_016629	CTT	2	6	7183	7188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298394
102	NC_016629	CTT	2	6	7216	7221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298394
103	NC_016629	GCT	2	6	7229	7234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016629	GCC	2	6	7420	7425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298395
105	NC_016629	GCC	2	6	7491	7496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298395
106	NC_016629	GCC	2	6	7782	7787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298395
107	NC_016629	CCT	2	6	7893	7898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298395
108	NC_016629	TGG	2	6	7975	7980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298395
109	NC_016629	GCC	2	6	7987	7992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298395
110	NC_016629	CTG	2	6	7993	7998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298395
111	NC_016629	GAC	2	6	8005	8010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298395
112	NC_016629	TTG	2	6	8050	8055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374298395
113	NC_016629	GCC	2	6	8068	8073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298395
114	NC_016629	TTC	2	6	8173	8178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298395
115	NC_016629	TGG	2	6	8257	8262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298395
116	NC_016629	ACT	2	6	8459	8464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298395
117	NC_016629	GGC	2	6	8572	8577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298395
118	NC_016629	TCA	2	6	8582	8587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298395
119	NC_016629	GAG	2	6	8620	8625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298395
120	NC_016629	GCT	2	6	8775	8780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298395
121	NC_016629	ACA	2	6	8845	8850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016629	TTG	2	6	8870	8875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016629	GTC	2	6	8924	8929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016629	CCA	2	6	8949	8954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_016629	TTG	2	6	8975	8980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016629	ATT	2	6	9142	9147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016629	GAG	2	6	9252	9257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016629	CGA	2	6	9272	9277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016629	ACG	2	6	9344	9349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298396
130	NC_016629	GCG	2	6	9591	9596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298396
131	NC_016629	GGT	2	6	9661	9666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298396
132	NC_016629	CAT	2	6	9712	9717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298396
133	NC_016629	TCC	2	6	9807	9812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_016629	CGG	2	6	9837	9842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016629	AAG	2	6	9886	9891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016629	GGC	2	6	9899	9904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016629	GAA	2	6	9972	9977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016629	TTC	2	6	10008	10013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016629	GCG	2	6	10172	10177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298397
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154	NC_016629	CCG	3	9	11464	11472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298398
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158	NC_016629	CTT	2	6	11659	11664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298398
159	NC_016629	CTG	2	6	11699	11704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298398
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169	NC_016629	CTC	2	6	12134	12139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
170	NC_016629	TCA	2	6	12240	12245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_016629	CCT	2	6	12417	12422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298399
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178	NC_016629	ACC	2	6	13069	13074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298400
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230	NC_016629	GGA	2	6	17350	17355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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240	NC_016629	CGA	2	6	17812	17817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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245	NC_016629	CAG	2	6	18037	18042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298405
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249	NC_016629	CTG	2	6	18172	18177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298405
250	NC_016629	TTC	2	6	18187	18192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298405
251	NC_016629	ATG	2	6	18217	18222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298405
252	NC_016629	CGC	2	6	18279	18284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298405
253	NC_016629	CAG	2	6	18292	18297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298405
254	NC_016629	GCA	2	6	18446	18451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298405
255	NC_016629	GCC	2	6	18595	18600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298405
256	NC_016629	CTG	2	6	18631	18636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298405
257	NC_016629	CCT	2	6	18648	18653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298405
258	NC_016629	AGC	2	6	18662	18667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298405
259	NC_016629	ACG	2	6	18776	18781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298405
260	NC_016629	GCG	2	6	18904	18909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_016629	CTG	2	6	18927	18932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_016629	CCG	2	6	18957	18962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
263	NC_016629	CAT	2	6	18976	18981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298406
264	NC_016629	CAA	2	6	18988	18993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298406
265	NC_016629	GCC	2	6	19038	19043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298406
266	NC_016629	GCC	2	6	19401	19406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298406
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271	NC_016629	CGG	2	6	19777	19782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298406
272	NC_016629	TGG	2	6	19785	19790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298406
273	NC_016629	CAT	2	6	19852	19857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298406
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280	NC_016629	CAT	2	6	20641	20646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298407
281	NC_016629	TGG	2	6	20664	20669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298407
282	NC_016629	GCG	2	6	20724	20729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298407
283	NC_016629	CTG	2	6	20765	20770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298407
284	NC_016629	GAA	2	6	20891	20896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298407
285	NC_016629	GCA	2	6	20904	20909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298407
286	NC_016629	TGG	2	6	20976	20981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298407
287	NC_016629	GCT	2	6	20992	20997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298407
288	NC_016629	GCT	2	6	21043	21048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298407
289	NC_016629	GTC	2	6	21074	21079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298407
290	NC_016629	CTC	2	6	21230	21235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
291	NC_016629	GAC	2	6	21315	21320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298408
292	NC_016629	CTT	2	6	21356	21361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298408
293	NC_016629	TGA	2	6	21402	21407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298408
294	NC_016629	ACA	2	6	21422	21427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298408
295	NC_016629	ATT	2	6	21553	21558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374298408
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322	NC_016629	GCG	2	6	23001	23006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
323	NC_016629	GGC	2	6	23073	23078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
324	NC_016629	CCG	2	6	23098	23103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298410
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332	NC_016629	TTC	2	6	23675	23680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298410
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335	NC_016629	TTG	2	6	24055	24060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
336	NC_016629	ATC	2	6	24114	24119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
337	NC_016629	CCA	2	6	24142	24147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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339	NC_016629	GCC	2	6	24216	24221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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343	NC_016629	GCC	2	6	24506	24511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
344	NC_016629	TGA	2	6	24627	24632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298411
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367	NC_016629	GCG	2	6	26167	26172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298412
368	NC_016629	TGC	2	6	26179	26184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298412
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378	NC_016629	CGG	2	6	26587	26592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298412
379	NC_016629	AGG	2	6	26605	26610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298412
380	NC_016629	CAC	2	6	26922	26927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298412
381	NC_016629	GCT	2	6	26975	26980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298412
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383	NC_016629	CGA	2	6	27029	27034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298412
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499	NC_016629	CAT	2	6	34081	34086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298419
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