MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 85601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_016629	GGC	2	6	98640	98645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298474
2003	NC_016629	CTG	2	6	98668	98673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298474
2004	NC_016629	GGC	2	6	98748	98753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298474
2005	NC_016629	TGG	2	6	98801	98806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298474
2006	NC_016629	GGC	2	6	98896	98901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298474
2007	NC_016629	CAT	2	6	98916	98921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298474
2008	NC_016629	GGA	2	6	98922	98927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298474
2009	NC_016629	GAT	3	9	99048	99056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298474
2010	NC_016629	CTGG	2	8	99066	99073	0 %	25 %	50 %	25 %	374298474
2011	NC_016629	CCG	2	6	99080	99085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298474
2012	NC_016629	TAC	2	6	99100	99105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298474
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2015	NC_016629	GCG	2	6	99156	99161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2016	NC_016629	ATC	2	6	99225	99230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2018	NC_016629	ACGA	2	8	99366	99373	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2020	NC_016629	GCGCTG	2	12	99461	99472	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2021	NC_016629	TAC	2	6	99546	99551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2022	NC_016629	AGT	2	6	99571	99576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2055	NC_016629	CCT	2	6	101351	101356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2057	NC_016629	GAC	2	6	101428	101433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2108	NC_016629	GCC	2	6	104134	104139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2109	NC_016629	CTG	2	6	104163	104168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2120	NC_016629	ACG	2	6	104653	104658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298478
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2122	NC_016629	CGG	2	6	104974	104979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298478
2123	NC_016629	GC	3	6	104987	104992	0 %	0 %	50 %	50 %	374298478
2124	NC_016629	GGCG	2	8	105035	105042	0 %	0 %	75 %	25 %	374298478
2125	NC_016629	TGC	2	6	105067	105072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298478
2126	NC_016629	GATG	2	8	105091	105098	25 %	25 %	50 %	0 %	374298478
2127	NC_016629	CGGGA	2	10	105100	105109	20 %	0 %	60 %	20 %	374298478
2128	NC_016629	CAGG	2	8	105143	105150	25 %	0 %	50 %	25 %	374298478
2129	NC_016629	GGT	2	6	105173	105178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298478
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2131	NC_016629	G	6	6	105217	105222	0 %	0 %	100 %	0 %	374298478
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2145	NC_016629	CGG	2	6	105981	105986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2146	NC_016629	CAG	2	6	106028	106033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2149	NC_016629	CAG	2	6	106258	106263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298480
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2154	NC_016629	TCT	2	6	106510	106515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298481
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2229	NC_016629	CGGA	2	8	110205	110212	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2230	NC_016629	GGAA	2	8	110234	110241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2231	NC_016629	CGG	2	6	110246	110251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2232	NC_016629	GGCC	2	8	110307	110314	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2233	NC_016629	ATG	2	6	110337	110342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2234	NC_016629	TGA	2	6	110393	110398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298483
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2238	NC_016629	GCT	2	6	110597	110602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298483
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2241	NC_016629	ACC	3	9	110788	110796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298483
2242	NC_016629	AC	3	6	110833	110838	50 %	0 %	0 %	50 %	374298483
2243	NC_016629	T	6	6	110846	110851	0 %	100 %	0 %	0 %	374298483
2244	NC_016629	GGC	2	6	110896	110901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298483
2245	NC_016629	AAGG	2	8	110921	110928	50 %	0 %	50 %	0 %	374298483
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2366	NC_016629	C	6	6	116319	116324	0 %	0 %	0 %	100 %	374298488
2367	NC_016629	GCCG	2	8	116337	116344	0 %	0 %	50 %	50 %	374298488
2368	NC_016629	CCATG	2	10	116380	116389	20 %	20 %	20 %	40 %	374298488
2369	NC_016629	CTGGCC	2	12	116408	116419	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374298488
2370	NC_016629	GCC	2	6	116432	116437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298488
2371	NC_016629	GCC	2	6	116455	116460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298488
2372	NC_016629	GGTC	2	8	116463	116470	0 %	25 %	50 %	25 %	374298488
2373	NC_016629	GC	3	6	116655	116660	0 %	0 %	50 %	50 %	374298488
2374	NC_016629	GAG	2	6	116762	116767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298488
2375	NC_016629	GC	3	6	116774	116779	0 %	0 %	50 %	50 %	374298488
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2405	NC_016629	A	6	6	118290	118295	100 %	0 %	0 %	0 %	374298488
2406	NC_016629	A	6	6	118481	118486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2419	NC_016629	GCT	2	6	119079	119084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2422	NC_016629	CG	3	6	119651	119656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2423	NC_016629	AGA	2	6	119733	119738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2424	NC_016629	GACG	2	8	119776	119783	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2425	NC_016629	TGG	2	6	119836	119841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2426	NC_016629	TTC	2	6	119843	119848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2431	NC_016629	GA	3	6	120121	120126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2432	NC_016629	CT	3	6	120137	120142	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2433	NC_016629	CGCT	2	8	120274	120281	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2434	NC_016629	GCTT	2	8	120283	120290	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2435	NC_016629	GGA	2	6	120313	120318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2436	NC_016629	CAG	2	6	120420	120425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298490
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2473	NC_016629	GTC	2	6	122289	122294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298491
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2479	NC_016629	CGG	2	6	122699	122704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298491
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2481	NC_016629	GCT	2	6	122821	122826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2482	NC_016629	ACAA	2	8	122856	122863	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2483	NC_016629	GACTC	2	10	122889	122898	20 %	20 %	20 %	40 %	374298492
2484	NC_016629	CGCC	2	8	122970	122977	0 %	0 %	25 %	75 %	374298492
2485	NC_016629	CGA	2	6	122986	122991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298492
2486	NC_016629	GCCG	2	8	123020	123027	0 %	0 %	50 %	50 %	374298492
2487	NC_016629	AGT	2	6	123032	123037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298492
2488	NC_016629	CATA	2	8	123044	123051	50 %	25 %	0 %	25 %	374298492
2489	NC_016629	AGG	2	6	123073	123078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298492
2490	NC_016629	CAG	2	6	123099	123104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298492
2491	NC_016629	CCT	2	6	123122	123127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2492	NC_016629	GCTC	2	8	123160	123167	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2493	NC_016629	GCC	2	6	123173	123178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2494	NC_016629	ACGC	2	8	123238	123245	25 %	0 %	25 %	50 %	374298493
2495	NC_016629	GCTC	2	8	123249	123256	0 %	25 %	25 %	50 %	374298493
2496	NC_016629	CGG	2	6	123285	123290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298493
2497	NC_016629	GTG	2	6	123308	123313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298493
2498	NC_016629	TCT	2	6	123369	123374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298493
2499	NC_016629	TGA	2	6	123417	123422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298493
2500	NC_016629	CGG	2	6	123507	123512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298493

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