MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 85601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016629	GAT	2	6	75300	75305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298457
1502	NC_016629	GCC	2	6	75318	75323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298457
1503	NC_016629	CGC	2	6	75335	75340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298457
1504	NC_016629	CAC	2	6	75348	75353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298457
1505	NC_016629	CCA	2	6	75368	75373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298457
1506	NC_016629	GAA	2	6	75420	75425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298457
1507	NC_016629	TCC	2	6	75442	75447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298457
1508	NC_016629	CGG	3	9	75463	75471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298457
1509	NC_016629	CCA	2	6	75479	75484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298457
1510	NC_016629	CTC	2	6	75486	75491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298457
1511	NC_016629	GCA	3	9	75545	75553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298457
1512	NC_016629	CG	3	6	75587	75592	0 %	0 %	50 %	50 %	374298457
1513	NC_016629	TGG	2	6	75605	75610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298457
1514	NC_016629	CCA	2	6	75620	75625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298457
1515	NC_016629	GCC	2	6	75669	75674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298457
1516	NC_016629	CCA	2	6	75680	75685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298457
1517	NC_016629	AGC	2	6	75739	75744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298457
1518	NC_016629	CCG	2	6	75746	75751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298457
1519	NC_016629	GTT	3	9	75756	75764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374298457
1520	NC_016629	ACC	2	6	75766	75771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298457
1521	NC_016629	GGC	2	6	75794	75799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298457
1522	NC_016629	CAG	2	6	75801	75806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298457
1523	NC_016629	CAG	2	6	75915	75920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298457
1524	NC_016629	GAA	2	6	76020	76025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298457
1525	NC_016629	GCT	2	6	76040	76045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298457
1526	NC_016629	GGC	2	6	76134	76139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298457
1527	NC_016629	GCA	2	6	76187	76192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298457
1528	NC_016629	CTGT	2	8	76214	76221	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1529	NC_016629	GGC	2	6	76250	76255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298458
1530	NC_016629	TCGGGA	2	12	76362	76373	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	374298458
1531	NC_016629	A	6	6	76403	76408	100 %	0 %	0 %	0 %	374298458
1532	NC_016629	TCGC	2	8	76436	76443	0 %	25 %	25 %	50 %	374298458
1533	NC_016629	CCGT	2	8	76473	76480	0 %	25 %	25 %	50 %	374298458
1534	NC_016629	CG	3	6	76485	76490	0 %	0 %	50 %	50 %	374298458
1535	NC_016629	TCCTTG	2	12	76515	76526	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	374298458
1536	NC_016629	AGT	2	6	76539	76544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298458
1537	NC_016629	GCC	2	6	76545	76550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298458
1538	NC_016629	CTC	2	6	76565	76570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298458
1539	NC_016629	CAG	2	6	76580	76585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298458
1540	NC_016629	CG	3	6	76586	76591	0 %	0 %	50 %	50 %	374298458
1541	NC_016629	GC	3	6	76609	76614	0 %	0 %	50 %	50 %	374298458
1542	NC_016629	CAG	3	9	76619	76627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298458
1543	NC_016629	GCC	2	6	76747	76752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298458
1544	NC_016629	GGCCAG	2	12	76757	76768	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	374298458
1545	NC_016629	GCCA	2	8	76830	76837	25 %	0 %	25 %	50 %	374298458
1546	NC_016629	AGC	2	6	76848	76853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298458
1547	NC_016629	CG	3	6	76854	76859	0 %	0 %	50 %	50 %	374298458
1548	NC_016629	C	6	6	76932	76937	0 %	0 %	0 %	100 %	374298458
1549	NC_016629	GGCAT	2	10	76947	76956	20 %	20 %	40 %	20 %	374298458
1550	NC_016629	CGT	2	6	77062	77067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298458
1551	NC_016629	GCC	2	6	77072	77077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298458
1552	NC_016629	GGCC	2	8	77080	77087	0 %	0 %	50 %	50 %	374298458
1553	NC_016629	CGC	2	6	77173	77178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298458
1554	NC_016629	CAGG	2	8	77201	77208	25 %	0 %	50 %	25 %	374298458
1555	NC_016629	TCC	2	6	77217	77222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298458
1556	NC_016629	GCC	2	6	77234	77239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298458
1557	NC_016629	GA	3	6	77262	77267	50 %	0 %	50 %	0 %	374298458
1558	NC_016629	GCG	2	6	77272	77277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298458
1559	NC_016629	CGGC	2	8	77384	77391	0 %	0 %	50 %	50 %	374298458
1560	NC_016629	CAGGC	2	10	77560	77569	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1561	NC_016629	CCA	2	6	77577	77582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1562	NC_016629	GC	3	6	77852	77857	0 %	0 %	50 %	50 %	374298459
1563	NC_016629	GGC	2	6	77882	77887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298459
1564	NC_016629	CTG	2	6	77934	77939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298459
1565	NC_016629	ATCT	2	8	78012	78019	25 %	50 %	0 %	25 %	374298459
1566	NC_016629	GCC	2	6	78049	78054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298459
1567	NC_016629	CCGG	2	8	78083	78090	0 %	0 %	50 %	50 %	374298459
1568	NC_016629	TCC	2	6	78096	78101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298459
1569	NC_016629	GCT	2	6	78119	78124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298459
1570	NC_016629	TCG	2	6	78139	78144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298459
1571	NC_016629	GTC	2	6	78159	78164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298459
1572	NC_016629	GTG	2	6	78186	78191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298459
1573	NC_016629	ACT	2	6	78224	78229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298459
1574	NC_016629	GCA	2	6	78323	78328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298459
1575	NC_016629	AGC	2	6	78342	78347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298459
1576	NC_016629	CATGCT	2	12	78392	78403	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	374298459
1577	NC_016629	CCA	2	6	78412	78417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298459
1578	NC_016629	GCT	2	6	78428	78433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298459
1579	NC_016629	CT	3	6	78432	78437	0 %	50 %	0 %	50 %	374298459
1580	NC_016629	TC	3	6	78493	78498	0 %	50 %	0 %	50 %	374298459
1581	NC_016629	CA	3	6	78513	78518	50 %	0 %	0 %	50 %	374298459
1582	NC_016629	TGC	2	6	78646	78651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298459
1583	NC_016629	ACG	2	6	78655	78660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298459
1584	NC_016629	TCA	2	6	78682	78687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298459
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1586	NC_016629	CCCTGG	2	12	78733	78744	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	374298459
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1588	NC_016629	CTG	2	6	78765	78770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298459
1589	NC_016629	GCC	2	6	78779	78784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298459
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1592	NC_016629	CGG	2	6	78869	78874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298459
1593	NC_016629	CGTGGC	2	12	78884	78895	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374298459
1594	NC_016629	GC	4	8	78944	78951	0 %	0 %	50 %	50 %	374298459
1595	NC_016629	GCG	2	6	78956	78961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298459
1596	NC_016629	GCC	2	6	78999	79004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298459
1597	NC_016629	CGG	2	6	79031	79036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298459
1598	NC_016629	TCA	2	6	79048	79053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298459
1599	NC_016629	GCC	2	6	79066	79071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298459
1600	NC_016629	GC	3	6	79103	79108	0 %	0 %	50 %	50 %	374298459
1601	NC_016629	GCCC	2	8	79118	79125	0 %	0 %	25 %	75 %	374298459
1602	NC_016629	CCAG	2	8	79137	79144	25 %	0 %	25 %	50 %	374298459
1603	NC_016629	AGC	2	6	79306	79311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298459
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1605	NC_016629	CGC	2	6	79376	79381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298459
1606	NC_016629	CGA	2	6	79409	79414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298459
1607	NC_016629	CTTA	2	8	79501	79508	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_016629	TCC	2	6	79625	79630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1609	NC_016629	CAAG	2	8	79649	79656	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1610	NC_016629	CTTTT	2	10	79674	79683	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1611	NC_016629	AGG	2	6	79842	79847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_016629	GGCA	2	8	79929	79936	25 %	0 %	50 %	25 %	374298460
1613	NC_016629	GC	3	6	79961	79966	0 %	0 %	50 %	50 %	374298460
1614	NC_016629	GTT	2	6	80011	80016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374298460
1615	NC_016629	GCGG	2	8	80032	80039	0 %	0 %	75 %	25 %	374298460
1616	NC_016629	GAG	2	6	80074	80079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298460
1617	NC_016629	GC	3	6	80085	80090	0 %	0 %	50 %	50 %	374298460
1618	NC_016629	CAA	2	6	80139	80144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298460
1619	NC_016629	TTG	2	6	80171	80176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374298460
1620	NC_016629	TTCAT	2	10	80311	80320	20 %	60 %	0 %	20 %	374298460
1621	NC_016629	GCA	2	6	80362	80367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298460
1622	NC_016629	TCAAT	2	10	80435	80444	40 %	40 %	0 %	20 %	374298460
1623	NC_016629	CAA	2	6	80472	80477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298460
1624	NC_016629	GAA	2	6	80505	80510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298460
1625	NC_016629	TGGC	2	8	80575	80582	0 %	25 %	50 %	25 %	374298460
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1627	NC_016629	GGC	2	6	80629	80634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298460
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