MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 85601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016629	CTG	2	6	49098	49103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_016629	ACT	2	6	49105	49110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_016629	TGC	2	6	49252	49257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298434
1004	NC_016629	CAT	2	6	49322	49327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298434
1005	NC_016629	AAG	2	6	49401	49406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298434
1006	NC_016629	AGC	2	6	49411	49416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298434
1007	NC_016629	CACGGC	2	12	49430	49441	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	374298434
1008	NC_016629	CATCG	2	10	49447	49456	20 %	20 %	20 %	40 %	374298434
1009	NC_016629	TCA	2	6	49543	49548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298434
1010	NC_016629	GCC	2	6	49674	49679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298434
1011	NC_016629	AGA	2	6	49693	49698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298434
1012	NC_016629	CCA	2	6	49718	49723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298434
1013	NC_016629	AGA	2	6	49744	49749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298434
1014	NC_016629	C	6	6	49808	49813	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1015	NC_016629	TG	3	6	49816	49821	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016629	GTA	2	6	49849	49854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298435
1017	NC_016629	ACC	2	6	49892	49897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298435
1018	NC_016629	GCCTT	2	10	49937	49946	0 %	40 %	20 %	40 %	374298435
1019	NC_016629	CGG	2	6	49958	49963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298435
1020	NC_016629	GAA	2	6	50005	50010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298435
1021	NC_016629	TCG	2	6	50015	50020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298435
1022	NC_016629	CTC	2	6	50050	50055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298435
1023	NC_016629	GAC	2	6	50056	50061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298435
1024	NC_016629	CGG	2	6	50076	50081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298435
1025	NC_016629	GCG	2	6	50130	50135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298435
1026	NC_016629	TCG	2	6	50222	50227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298435
1027	NC_016629	TGGCCT	2	12	50283	50294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298435
1028	NC_016629	TCA	2	6	50298	50303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298435
1029	NC_016629	AGG	3	9	50328	50336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298435
1030	NC_016629	CAT	2	6	50440	50445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298435
1031	NC_016629	TGA	2	6	50523	50528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298435
1032	NC_016629	CCGT	2	8	50624	50631	0 %	25 %	25 %	50 %	374298435
1033	NC_016629	GTGA	2	8	50683	50690	25 %	25 %	50 %	0 %	374298435
1034	NC_016629	TTCGC	2	10	50702	50711	0 %	40 %	20 %	40 %	374298435
1035	NC_016629	GGTT	2	8	50786	50793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_016629	AGCA	2	8	50832	50839	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_016629	GCG	2	6	50850	50855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298436
1038	NC_016629	GAA	2	6	51015	51020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298436
1039	NC_016629	GCG	2	6	51130	51135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_016629	CAG	2	6	51296	51301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_016629	GT	3	6	51353	51358	0 %	50 %	50 %	0 %	374298437
1042	NC_016629	GCGTA	2	10	51364	51373	20 %	20 %	40 %	20 %	374298437
1043	NC_016629	TCG	2	6	51418	51423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298437
1044	NC_016629	GCC	2	6	51463	51468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298437
1045	NC_016629	ACG	2	6	51511	51516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298437
1046	NC_016629	CGG	2	6	51612	51617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298437
1047	NC_016629	CTC	2	6	51701	51706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298437
1048	NC_016629	TCG	2	6	51751	51756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298437
1049	NC_016629	ACTCG	2	10	51788	51797	20 %	20 %	20 %	40 %	374298437
1050	NC_016629	TTC	2	6	51813	51818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298437
1051	NC_016629	AAC	2	6	51844	51849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298437
1052	NC_016629	GAT	2	6	51873	51878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298437
1053	NC_016629	TGT	2	6	52069	52074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_016629	GGC	2	6	52124	52129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_016629	TC	3	6	52197	52202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_016629	GCCTAC	2	12	52270	52281	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_016629	GCG	2	6	52282	52287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_016629	TCGG	2	8	52354	52361	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_016629	TGA	2	6	52399	52404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_016629	CCA	2	6	52427	52432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_016629	A	6	6	52446	52451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016629	TTA	2	6	52454	52459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_016629	GTC	2	6	52468	52473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_016629	TAG	2	6	52525	52530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298438
1065	NC_016629	TCC	2	6	52603	52608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298438
1066	NC_016629	CAGC	2	8	52640	52647	25 %	0 %	25 %	50 %	374298438
1067	NC_016629	CAG	2	6	52713	52718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298438
1068	NC_016629	CCG	2	6	52729	52734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298438
1069	NC_016629	AGCGC	2	10	52784	52793	20 %	0 %	40 %	40 %	374298438
1070	NC_016629	CCT	2	6	52854	52859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_016629	TAA	2	6	52883	52888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_016629	GCAG	2	8	52911	52918	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_016629	TGG	2	6	52948	52953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_016629	CCAGA	2	10	53004	53013	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1075	NC_016629	CTC	2	6	53317	53322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_016629	CCTT	2	8	53417	53424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_016629	GTC	2	6	53430	53435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_016629	TGC	2	6	53444	53449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_016629	GC	3	6	53514	53519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1080	NC_016629	TG	3	6	53583	53588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_016629	TAA	3	9	53651	53659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_016629	ATA	2	6	53661	53666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_016629	GCA	2	6	53684	53689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298439
1084	NC_016629	TTC	2	6	53782	53787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298439
1085	NC_016629	AG	3	6	53793	53798	50 %	0 %	50 %	0 %	374298439
1086	NC_016629	ATGGTC	2	12	53925	53936	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	374298439
1087	NC_016629	TCA	2	6	53998	54003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298439
1088	NC_016629	CT	4	8	54033	54040	0 %	50 %	0 %	50 %	374298439
1089	NC_016629	TAT	2	6	54060	54065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374298439
1090	NC_016629	CTT	2	6	54101	54106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298439
1091	NC_016629	CCTT	2	8	54112	54119	0 %	50 %	0 %	50 %	374298439
1092	NC_016629	GGA	2	6	54140	54145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298439
1093	NC_016629	A	7	7	54145	54151	100 %	0 %	0 %	0 %	374298439
1094	NC_016629	ATA	2	6	54234	54239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374298439
1095	NC_016629	CCA	2	6	54241	54246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298439
1096	NC_016629	TCA	2	6	54268	54273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298439
1097	NC_016629	ATAG	2	8	54392	54399	50 %	25 %	25 %	0 %	374298439
1098	NC_016629	T	6	6	54497	54502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_016629	GCCTAC	2	12	54567	54578	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1100	NC_016629	GCG	2	6	54579	54584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_016629	AAG	2	6	54638	54643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_016629	GGC	2	6	54661	54666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_016629	GCA	2	6	54669	54674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_016629	CCG	2	6	54679	54684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_016629	GAAC	2	8	54706	54713	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_016629	TGG	2	6	54741	54746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_016629	GGA	2	6	54759	54764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_016629	GCC	2	6	54832	54837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_016629	GCA	2	6	54844	54849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_016629	GGC	2	6	54894	54899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298440
1111	NC_016629	CCA	2	6	54940	54945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298440
1112	NC_016629	GCA	2	6	54961	54966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298440
1113	NC_016629	CTC	2	6	55048	55053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_016629	GGGA	2	8	55079	55086	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_016629	GCC	2	6	55182	55187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_016629	GCCG	2	8	55353	55360	0 %	0 %	50 %	50 %	374298441
1117	NC_016629	GCC	2	6	55414	55419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298441
1118	NC_016629	AGA	2	6	55469	55474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298441
1119	NC_016629	TGA	2	6	55490	55495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298441
1120	NC_016629	GCCA	2	8	55516	55523	25 %	0 %	25 %	50 %	374298441
1121	NC_016629	GGCC	2	8	55532	55539	0 %	0 %	50 %	50 %	374298441
1122	NC_016629	CGG	2	6	55574	55579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298441
1123	NC_016629	GAA	2	6	55584	55589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298441
1124	NC_016629	CAG	2	6	55599	55604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298441
1125	NC_016629	CGC	2	6	55639	55644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298441
1126	NC_016629	AAC	2	6	55678	55683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298441
1127	NC_016629	CGG	2	6	55697	55702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298441
1128	NC_016629	CAG	2	6	55710	55715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298441
1129	NC_016629	CCGC	2	8	55750	55757	0 %	0 %	25 %	75 %	374298441
1130	NC_016629	CG	3	6	55823	55828	0 %	0 %	50 %	50 %	374298441
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1256	NC_016629	CGC	2	6	63367	63372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298450
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