MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 85601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016629	GCTTGG	2	12	25224	25235	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	374298411
502	NC_016629	TC	3	6	25312	25317	0 %	50 %	0 %	50 %	374298411
503	NC_016629	TCG	2	6	25375	25380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298411
504	NC_016629	CTA	2	6	25459	25464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_016629	CGC	2	6	25489	25494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_016629	GCG	2	6	25550	25555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_016629	C	6	6	25569	25574	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
508	NC_016629	GCCCG	2	10	25681	25690	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
509	NC_016629	CGGG	2	8	25772	25779	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
510	NC_016629	GCA	2	6	25806	25811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_016629	CTA	2	6	25828	25833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_016629	GCC	2	6	25857	25862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_016629	ATC	2	6	25872	25877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_016629	GC	3	6	25885	25890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
515	NC_016629	GCC	2	6	25940	25945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_016629	GACGC	2	10	25949	25958	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
517	NC_016629	GCA	2	6	26005	26010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298412
518	NC_016629	CGG	2	6	26033	26038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298412
519	NC_016629	TGG	2	6	26044	26049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298412
520	NC_016629	ATG	2	6	26056	26061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298412
521	NC_016629	GCG	2	6	26127	26132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298412
522	NC_016629	GCG	2	6	26167	26172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298412
523	NC_016629	TGC	2	6	26179	26184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298412
524	NC_016629	GAC	2	6	26253	26258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298412
525	NC_016629	ACG	3	9	26311	26319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298412
526	NC_016629	TCGC	2	8	26322	26329	0 %	25 %	25 %	50 %	374298412
527	NC_016629	CCT	2	6	26339	26344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298412
528	NC_016629	ACC	2	6	26361	26366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298412
529	NC_016629	GTC	2	6	26388	26393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298412
530	NC_016629	CAT	2	6	26468	26473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298412
531	NC_016629	CGG	2	6	26495	26500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298412
532	NC_016629	TCC	2	6	26526	26531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298412
533	NC_016629	CGC	2	6	26566	26571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298412
534	NC_016629	CGG	2	6	26587	26592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298412
535	NC_016629	AGG	2	6	26605	26610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298412
536	NC_016629	GC	3	6	26711	26716	0 %	0 %	50 %	50 %	374298412
537	NC_016629	CCAT	2	8	26737	26744	25 %	25 %	0 %	50 %	374298412
538	NC_016629	CAC	2	6	26922	26927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298412
539	NC_016629	CCTG	2	8	26928	26935	0 %	25 %	25 %	50 %	374298412
540	NC_016629	GCT	2	6	26975	26980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298412
541	NC_016629	TGGGGC	2	12	26998	27009	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	374298412
542	NC_016629	CGA	2	6	27011	27016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298412
543	NC_016629	CGA	2	6	27029	27034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298412
544	NC_016629	CCT	2	6	27068	27073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298412
545	NC_016629	CCT	2	6	27103	27108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298412
546	NC_016629	CCA	2	6	27139	27144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298412
547	NC_016629	CTC	2	6	27159	27164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298412
548	NC_016629	CGG	2	6	27170	27175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298412
549	NC_016629	CCT	2	6	27212	27217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298412
550	NC_016629	GC	3	6	27241	27246	0 %	0 %	50 %	50 %	374298412
551	NC_016629	GTG	2	6	27339	27344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298412
552	NC_016629	GACG	2	8	27348	27355	25 %	0 %	50 %	25 %	374298412
553	NC_016629	GAC	2	6	27385	27390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298412
554	NC_016629	AGG	2	6	27427	27432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298412
555	NC_016629	AGC	2	6	27497	27502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298412
556	NC_016629	CGG	2	6	27530	27535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_016629	C	6	6	27577	27582	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
558	NC_016629	GCC	2	6	27627	27632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_016629	CCA	2	6	27702	27707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298413
560	NC_016629	CTG	2	6	27712	27717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298413
561	NC_016629	CCGGG	2	10	27744	27753	0 %	0 %	60 %	40 %	374298413
562	NC_016629	CGT	2	6	27801	27806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298413
563	NC_016629	CAC	2	6	27817	27822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298413
564	NC_016629	CATC	2	8	27837	27844	25 %	25 %	0 %	50 %	374298413
565	NC_016629	TGG	2	6	28104	28109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298413
566	NC_016629	GGGCTT	2	12	28177	28188	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	374298413
567	NC_016629	CCG	2	6	28250	28255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298413
568	NC_016629	TCG	2	6	28289	28294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298413
569	NC_016629	TCC	2	6	28337	28342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298413
570	NC_016629	TCT	2	6	28551	28556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298413
571	NC_016629	CTT	2	6	28638	28643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298414
572	NC_016629	GCA	2	6	28649	28654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298414
573	NC_016629	CGC	2	6	28660	28665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298414
574	NC_016629	TGT	2	6	28715	28720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374298414
575	NC_016629	CGA	2	6	28724	28729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298414
576	NC_016629	CGA	2	6	28778	28783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298414
577	NC_016629	TCT	2	6	28826	28831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298414
578	NC_016629	GCG	2	6	28892	28897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298414
579	NC_016629	A	6	6	28943	28948	100 %	0 %	0 %	0 %	374298414
580	NC_016629	CGG	2	6	28961	28966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298414
581	NC_016629	GTC	2	6	28986	28991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298414
582	NC_016629	TCT	2	6	29000	29005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298414
583	NC_016629	GGCA	2	8	29071	29078	25 %	0 %	50 %	25 %	374298414
584	NC_016629	CGA	2	6	29159	29164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298414
585	NC_016629	TGG	2	6	29222	29227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298414
586	NC_016629	CAC	2	6	29250	29255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298414
587	NC_016629	GAT	2	6	29289	29294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298414
588	NC_016629	CTG	2	6	29397	29402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298414
589	NC_016629	TCCC	2	8	29432	29439	0 %	25 %	0 %	75 %	374298414
590	NC_016629	CGG	2	6	29534	29539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298414
591	NC_016629	GAG	2	6	29548	29553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298414
592	NC_016629	GCT	2	6	29582	29587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298414
593	NC_016629	TGCT	2	8	29650	29657	0 %	50 %	25 %	25 %	374298414
594	NC_016629	A	6	6	29674	29679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_016629	GCT	2	6	29695	29700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_016629	TTG	2	6	29718	29723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_016629	GC	3	6	29805	29810	0 %	0 %	50 %	50 %	374298415
598	NC_016629	CTT	2	6	29824	29829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298415
599	NC_016629	TCCAGG	2	12	29900	29911	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374298415
600	NC_016629	GCA	2	6	29982	29987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298415
601	NC_016629	ATG	2	6	29996	30001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298415
602	NC_016629	GAA	2	6	30061	30066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298415
603	NC_016629	CGAT	2	8	30095	30102	25 %	25 %	25 %	25 %	374298415
604	NC_016629	GCG	2	6	30153	30158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298415
605	NC_016629	GCCG	2	8	30166	30173	0 %	0 %	50 %	50 %	374298415
606	NC_016629	CTC	2	6	30238	30243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298415
607	NC_016629	CGC	2	6	30282	30287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298415
608	NC_016629	GCC	2	6	30448	30453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298415
609	NC_016629	GGC	2	6	30487	30492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298415
610	NC_016629	GAA	2	6	30514	30519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298415
611	NC_016629	A	6	6	30550	30555	100 %	0 %	0 %	0 %	374298415
612	NC_016629	GCAG	2	8	30678	30685	25 %	0 %	50 %	25 %	374298416
613	NC_016629	CGG	2	6	30698	30703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298416
614	NC_016629	AGT	2	6	30829	30834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298416
615	NC_016629	CTC	2	6	30860	30865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298416
616	NC_016629	CG	3	6	30876	30881	0 %	0 %	50 %	50 %	374298416
617	NC_016629	CCA	2	6	30932	30937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298416
618	NC_016629	CGTC	2	8	30981	30988	0 %	25 %	25 %	50 %	374298416
619	NC_016629	GAT	2	6	30995	31000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298416
620	NC_016629	CAG	2	6	31048	31053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298417
621	NC_016629	GTC	2	6	31054	31059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298417
622	NC_016629	GATC	2	8	31137	31144	25 %	25 %	25 %	25 %	374298417
623	NC_016629	CGG	2	6	31185	31190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298417
624	NC_016629	CCA	2	6	31197	31202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298417
625	NC_016629	CGA	2	6	31260	31265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298417
626	NC_016629	CTC	2	6	31360	31365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298418
627	NC_016629	CAG	2	6	31369	31374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298418
628	NC_016629	TCG	2	6	31376	31381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298418
629	NC_016629	TCC	2	6	31409	31414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298418
630	NC_016629	GCT	2	6	31437	31442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298418
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649	NC_016629	CCA	2	6	32127	32132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298418
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652	NC_016629	CAG	2	6	32182	32187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298418
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659	NC_016629	CGC	2	6	32516	32521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298418
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661	NC_016629	GGC	2	6	32560	32565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298418
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696	NC_016629	TCA	2	6	34223	34228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298420
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704	NC_016629	GC	3	6	34615	34620	0 %	0 %	50 %	50 %	374298420
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733	NC_016629	GGT	2	6	35799	35804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298421
734	NC_016629	TGA	2	6	35874	35879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298421
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739	NC_016629	AAAG	2	8	36091	36098	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
740	NC_016629	TGG	2	6	36118	36123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
741	NC_016629	TGC	2	6	36315	36320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
742	NC_016629	CGA	2	6	36399	36404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298422
743	NC_016629	AAG	2	6	36415	36420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298422
744	NC_016629	GCT	2	6	36456	36461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298422
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746	NC_016629	AAG	2	6	36511	36516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298422
747	NC_016629	GCT	2	6	36522	36527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298422
748	NC_016629	CAA	2	6	36582	36587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298422
749	NC_016629	GCT	2	6	36588	36593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298422
750	NC_016629	CCG	2	6	36650	36655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298422
751	NC_016629	TGA	2	6	36662	36667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298422
752	NC_016629	ATC	2	6	36721	36726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298422
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754	NC_016629	GC	3	6	36804	36809	0 %	0 %	50 %	50 %	374298422
755	NC_016629	CACC	2	8	36893	36900	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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