MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 85601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_016629	ATC	2	6	294974	294979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298651
6002	NC_016629	CGA	2	6	295078	295083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298651
6003	NC_016629	CCA	2	6	295107	295112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298651
6004	NC_016629	CTTT	2	8	295158	295165	0 %	75 %	0 %	25 %	374298651
6005	NC_016629	ACG	2	6	295167	295172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298651
6006	NC_016629	GCG	2	6	295211	295216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_016629	CGC	2	6	295247	295252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_016629	T	6	6	295260	295265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_016629	GCC	2	6	295320	295325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298652
6010	NC_016629	CCAG	2	8	295342	295349	25 %	0 %	25 %	50 %	374298652
6011	NC_016629	CT	3	6	295361	295366	0 %	50 %	0 %	50 %	374298652
6012	NC_016629	CG	3	6	295477	295482	0 %	0 %	50 %	50 %	374298652
6013	NC_016629	CGA	2	6	295495	295500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298652
6014	NC_016629	TGC	2	6	295614	295619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_016629	TGCA	2	8	295650	295657	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6016	NC_016629	TCC	2	6	295698	295703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298653
6017	NC_016629	CG	3	6	295739	295744	0 %	0 %	50 %	50 %	374298653
6018	NC_016629	CAG	2	6	295755	295760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298653
6019	NC_016629	CG	3	6	295769	295774	0 %	0 %	50 %	50 %	374298653
6020	NC_016629	GCC	2	6	295797	295802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298653
6021	NC_016629	TGA	2	6	295924	295929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298653
6022	NC_016629	CCCCG	2	10	295979	295988	0 %	0 %	20 %	80 %	374298653
6023	NC_016629	CTC	2	6	296013	296018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298653
6024	NC_016629	TCC	2	6	296032	296037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298653
6025	NC_016629	AGA	2	6	296048	296053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298653
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6027	NC_016629	GCA	2	6	296117	296122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298653
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6029	NC_016629	TTCATG	2	12	296389	296400	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6030	NC_016629	CCT	2	6	296408	296413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6031	NC_016629	GCT	2	6	296458	296463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_016629	TAT	2	6	296490	296495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_016629	CGG	2	6	296498	296503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_016629	CCTGA	2	10	296547	296556	20 %	20 %	20 %	40 %	374298654
6035	NC_016629	TGG	2	6	296632	296637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298654
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6038	NC_016629	GCGTAG	2	12	296871	296882	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6039	NC_016629	AAGGC	2	10	296971	296980	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6040	NC_016629	AAT	2	6	297010	297015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_016629	AGA	2	6	297033	297038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_016629	AAATT	2	10	297054	297063	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_016629	GAC	2	6	297087	297092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_016629	GC	3	6	297138	297143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_016629	GCCGAA	2	12	297225	297236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298655
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6047	NC_016629	CTC	2	6	297324	297329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298655
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6049	NC_016629	GCG	2	6	297435	297440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298655
6050	NC_016629	CTTGG	2	10	297462	297471	0 %	40 %	40 %	20 %	374298655
6051	NC_016629	GTG	2	6	297475	297480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298655
6052	NC_016629	ACC	2	6	297526	297531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298655
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6054	NC_016629	CCTG	2	8	297607	297614	0 %	25 %	25 %	50 %	374298655
6055	NC_016629	A	7	7	297654	297660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_016629	CAC	2	6	297665	297670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6057	NC_016629	AGT	2	6	297816	297821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298656
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6059	NC_016629	TCT	2	6	297900	297905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298656
6060	NC_016629	TGC	2	6	297936	297941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298656
6061	NC_016629	GTG	2	6	297948	297953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298656
6062	NC_016629	CTGC	2	8	297960	297967	0 %	25 %	25 %	50 %	374298656
6063	NC_016629	GC	3	6	297966	297971	0 %	0 %	50 %	50 %	374298656
6064	NC_016629	ACG	2	6	298025	298030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298656
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6071	NC_016629	ATG	2	6	298393	298398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298656
6072	NC_016629	CTGG	2	8	298432	298439	0 %	25 %	50 %	25 %	374298656
6073	NC_016629	AGT	2	6	298469	298474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298656
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6113	NC_016629	CGGCG	2	10	300367	300376	0 %	0 %	60 %	40 %	374298657
6114	NC_016629	GC	3	6	300396	300401	0 %	0 %	50 %	50 %	374298657
6115	NC_016629	TCG	2	6	300500	300505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298657
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6118	NC_016629	GCT	2	6	300741	300746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298657
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6121	NC_016629	GTC	2	6	300793	300798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298657
6122	NC_016629	ATT	2	6	300819	300824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_016629	T	6	6	300878	300883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_016629	CGT	2	6	300923	300928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6125	NC_016629	GA	3	6	300960	300965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6126	NC_016629	TGC	2	6	301082	301087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298658
6127	NC_016629	GCAG	2	8	301104	301111	25 %	0 %	50 %	25 %	374298658
6128	NC_016629	T	6	6	301118	301123	0 %	100 %	0 %	0 %	374298658
6129	NC_016629	AGG	2	6	301136	301141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298658
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6131	NC_016629	CGGG	2	8	301207	301214	0 %	0 %	75 %	25 %	374298658
6132	NC_016629	GCC	2	6	301239	301244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298658
6133	NC_016629	GC	3	6	301263	301268	0 %	0 %	50 %	50 %	374298658
6134	NC_016629	CCG	2	6	301305	301310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298658
6135	NC_016629	ACC	2	6	301330	301335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298658
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6139	NC_016629	CTG	2	6	301531	301536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298658
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6141	NC_016629	GC	3	6	301604	301609	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6142	NC_016629	GCTTT	2	10	301632	301641	0 %	60 %	20 %	20 %	374298659
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6164	NC_016629	TCC	2	6	302682	302687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298660
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6185	NC_016629	CCGG	2	8	303611	303618	0 %	0 %	50 %	50 %	374298661
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6234	NC_016629	CCGGT	2	10	305738	305747	0 %	20 %	40 %	40 %	374298661
6235	NC_016629	CGG	2	6	305763	305768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298661
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6237	NC_016629	CAG	2	6	305970	305975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298661
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6240	NC_016629	CGA	2	6	306096	306101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298661
6241	NC_016629	TGCGCG	2	12	306233	306244	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	374298661
6242	NC_016629	TGG	3	9	306369	306377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298661
6243	NC_016629	GGC	2	6	306382	306387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298661
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6491	NC_016629	ATG	2	6	317876	317881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298673
6492	NC_016629	CCG	2	6	317925	317930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298673
6493	NC_016629	GAT	2	6	317935	317940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298673
6494	NC_016629	GCG	2	6	317957	317962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298673
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