MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 85601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_016629	CGC	2	6	269141	269146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298625
5502	NC_016629	CGGTC	2	10	269170	269179	0 %	20 %	40 %	40 %	374298625
5503	NC_016629	TAC	2	6	269250	269255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298625
5504	NC_016629	TCA	2	6	269296	269301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298625
5505	NC_016629	GGC	2	6	269315	269320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298625
5506	NC_016629	GA	3	6	269347	269352	50 %	0 %	50 %	0 %	374298625
5507	NC_016629	CGG	2	6	269415	269420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298625
5508	NC_016629	CCG	2	6	269440	269445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298625
5509	NC_016629	GAAC	2	8	269481	269488	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5510	NC_016629	TTG	2	6	269531	269536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_016629	CGT	2	6	269542	269547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_016629	CCT	2	6	269595	269600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298626
5513	NC_016629	GCAC	2	8	269607	269614	25 %	0 %	25 %	50 %	374298626
5514	NC_016629	GTG	3	9	269618	269626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298626
5515	NC_016629	CTGG	2	8	269642	269649	0 %	25 %	50 %	25 %	374298626
5516	NC_016629	CGC	2	6	269661	269666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298626
5517	NC_016629	TCC	2	6	269693	269698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298626
5518	NC_016629	CGG	2	6	269714	269719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298626
5519	NC_016629	GC	3	6	269729	269734	0 %	0 %	50 %	50 %	374298626
5520	NC_016629	TGC	2	6	269841	269846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298626
5521	NC_016629	TTC	2	6	269899	269904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298626
5522	NC_016629	CCT	2	6	269930	269935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5523	NC_016629	TGT	2	6	269973	269978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_016629	CCT	2	6	270047	270052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5525	NC_016629	TCT	2	6	270139	270144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_016629	AGG	2	6	270215	270220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_016629	GA	3	6	270234	270239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_016629	GCCG	2	8	270252	270259	0 %	0 %	50 %	50 %	374298627
5529	NC_016629	CGG	2	6	270319	270324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298627
5530	NC_016629	CCG	2	6	270370	270375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298627
5531	NC_016629	CTA	2	6	270388	270393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298627
5532	NC_016629	GCC	2	6	270400	270405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298627
5533	NC_016629	CAT	2	6	270418	270423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298627
5534	NC_016629	GC	3	6	270466	270471	0 %	0 %	50 %	50 %	374298627
5535	NC_016629	CTG	2	6	270629	270634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298627
5536	NC_016629	CTG	2	6	270637	270642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298627
5537	NC_016629	GC	3	6	270648	270653	0 %	0 %	50 %	50 %	374298627
5538	NC_016629	GCCA	2	8	270671	270678	25 %	0 %	25 %	50 %	374298627
5539	NC_016629	GCG	2	6	270687	270692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298627
5540	NC_016629	GGCTGG	2	12	270702	270713	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	374298627
5541	NC_016629	ATG	2	6	270749	270754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298627
5542	NC_016629	CGGGC	2	10	270800	270809	0 %	0 %	60 %	40 %	374298627
5543	NC_016629	GGC	2	6	270838	270843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298627
5544	NC_016629	CTG	2	6	271016	271021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298627
5545	NC_016629	GTG	2	6	271027	271032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298627
5546	NC_016629	GGC	2	6	271060	271065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298627
5547	NC_016629	T	6	6	271160	271165	0 %	100 %	0 %	0 %	374298627
5548	NC_016629	CGG	2	6	271236	271241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298627
5549	NC_016629	TTC	2	6	271244	271249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298627
5550	NC_016629	AGGGA	2	10	271265	271274	40 %	0 %	60 %	0 %	374298627
5551	NC_016629	GC	3	6	271278	271283	0 %	0 %	50 %	50 %	374298627
5552	NC_016629	CTCGCA	2	12	271307	271318	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	374298627
5553	NC_016629	TCT	3	9	271467	271475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298627
5554	NC_016629	GCG	2	6	271552	271557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298627
5555	NC_016629	TCG	2	6	271617	271622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298627
5556	NC_016629	GGCC	2	8	271709	271716	0 %	0 %	50 %	50 %	374298627
5557	NC_016629	GT	3	6	271739	271744	0 %	50 %	50 %	0 %	374298627
5558	NC_016629	ATT	2	6	271785	271790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	374298627
5559	NC_016629	CATG	2	8	271797	271804	25 %	25 %	25 %	25 %	374298628
5560	NC_016629	CTG	2	6	271849	271854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298628
5561	NC_016629	AGG	2	6	271872	271877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298628
5562	NC_016629	TCG	2	6	271926	271931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298628
5563	NC_016629	CAA	2	6	271933	271938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298628
5564	NC_016629	TCC	2	6	271964	271969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298628
5565	NC_016629	GGA	2	6	272020	272025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298628
5566	NC_016629	T	7	7	272085	272091	0 %	100 %	0 %	0 %	374298628
5567	NC_016629	TAC	2	6	272132	272137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298628
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5569	NC_016629	GC	3	6	272264	272269	0 %	0 %	50 %	50 %	374298628
5570	NC_016629	GCC	2	6	272416	272421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298629
5571	NC_016629	TG	3	6	272439	272444	0 %	50 %	50 %	0 %	374298629
5572	NC_016629	CGC	2	6	272610	272615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298629
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5574	NC_016629	GGC	2	6	272710	272715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298629
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5578	NC_016629	GGA	2	6	273156	273161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298629
5579	NC_016629	GCG	2	6	273165	273170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298629
5580	NC_016629	GGC	2	6	273211	273216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298629
5581	NC_016629	GC	3	6	273225	273230	0 %	0 %	50 %	50 %	374298629
5582	NC_016629	AC	3	6	273244	273249	50 %	0 %	0 %	50 %	374298629
5583	NC_016629	GCC	2	6	273256	273261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298629
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5588	NC_016629	AAG	2	6	273601	273606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298629
5589	NC_016629	GCG	2	6	273645	273650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298629
5590	NC_016629	CGAGC	2	10	273651	273660	20 %	0 %	40 %	40 %	374298629
5591	NC_016629	TGG	2	6	273713	273718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298629
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5593	NC_016629	AC	3	6	273827	273832	50 %	0 %	0 %	50 %	374298629
5594	NC_016629	CGA	2	6	273870	273875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298629
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5596	NC_016629	CAT	2	6	274008	274013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298629
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5599	NC_016629	GTC	2	6	274270	274275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298629
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5602	NC_016629	CCCG	2	8	274520	274527	0 %	0 %	25 %	75 %	374298629
5603	NC_016629	GCTCC	2	10	274619	274628	0 %	20 %	20 %	60 %	374298629
5604	NC_016629	CGT	2	6	274746	274751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298630
5605	NC_016629	CGCCA	2	10	274887	274896	20 %	0 %	20 %	60 %	374298630
5606	NC_016629	C	6	6	274992	274997	0 %	0 %	0 %	100 %	374298630
5607	NC_016629	ATC	2	6	275040	275045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298630
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5609	NC_016629	GC	3	6	275056	275061	0 %	0 %	50 %	50 %	374298630
5610	NC_016629	GCCATG	2	12	275099	275110	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_016629	CTT	2	6	275116	275121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_016629	GCC	2	6	275145	275150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5613	NC_016629	TAT	2	6	275161	275166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_016629	CGAC	2	8	275209	275216	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5615	NC_016629	CAG	2	6	275223	275228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_016629	GC	3	6	275235	275240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5617	NC_016629	CTGCTC	2	12	275263	275274	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	374298631
5618	NC_016629	TCG	2	6	275282	275287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298631
5619	NC_016629	GCTCG	2	10	275289	275298	0 %	20 %	40 %	40 %	374298631
5620	NC_016629	CAT	2	6	275333	275338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298631
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5622	NC_016629	CTG	2	6	275395	275400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298631
5623	NC_016629	GGC	2	6	275412	275417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298631
5624	NC_016629	T	7	7	275519	275525	0 %	100 %	0 %	0 %	374298631
5625	NC_016629	CCT	2	6	275634	275639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	374298631
5626	NC_016629	GGC	2	6	275672	275677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298631
5627	NC_016629	GCT	2	6	275703	275708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298631
5628	NC_016629	CTG	2	6	275719	275724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298631
5629	NC_016629	AGC	2	6	275728	275733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298631
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5631	NC_016629	ATC	2	6	275794	275799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298631
5632	NC_016629	CCAATT	2	12	275952	275963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298631
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5647	NC_016629	CGCC	2	8	276426	276433	0 %	0 %	25 %	75 %	374298631
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5652	NC_016629	ACT	2	6	276931	276936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298632
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5654	NC_016629	GAG	2	6	277023	277028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5655	NC_016629	TGA	2	6	277073	277078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5656	NC_016629	GGCGT	2	10	277100	277109	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5657	NC_016629	GCTCG	2	10	277113	277122	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5658	NC_016629	GCC	2	6	277130	277135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5661	NC_016629	CCGC	2	8	277452	277459	0 %	0 %	25 %	75 %	374298633
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5665	NC_016629	CGA	2	6	277627	277632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298633
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5672	NC_016629	CGCA	2	8	278111	278118	25 %	0 %	25 %	50 %	374298633
5673	NC_016629	GGT	2	6	278181	278186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298633
5674	NC_016629	GAT	2	6	278374	278379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5681	NC_016629	CTGT	2	8	278720	278727	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5682	NC_016629	CG	3	6	278787	278792	0 %	0 %	50 %	50 %	374298635
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5688	NC_016629	GTGCG	2	10	279104	279113	0 %	20 %	60 %	20 %	374298635
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5729	NC_016629	CTG	2	6	281032	281037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5733	NC_016629	CT	3	6	281224	281229	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5740	NC_016629	CCGCA	2	10	281620	281629	20 %	0 %	20 %	60 %	374298638
5741	NC_016629	TAT	2	6	281862	281867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5742	NC_016629	TCA	2	6	281895	281900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5743	NC_016629	TGCA	2	8	281905	281912	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5744	NC_016629	CT	3	6	281922	281927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5746	NC_016629	GAC	2	6	282117	282122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298639
5747	NC_016629	GCC	2	6	282126	282131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298639
5748	NC_016629	CGT	2	6	282173	282178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298639
5749	NC_016629	ACC	2	6	282224	282229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298639
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5753	NC_016629	ACC	2	6	282343	282348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298639
5754	NC_016629	GCT	2	6	282365	282370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298639
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5757	NC_016629	GGCC	2	8	282473	282480	0 %	0 %	50 %	50 %	374298639
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5764	NC_016629	GAG	2	6	282744	282749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298639
5765	NC_016629	CCA	2	6	282852	282857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5766	NC_016629	CGTAGG	2	12	282922	282933	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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5774	NC_016629	GGC	2	6	283455	283460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298640
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5781	NC_016629	TCCG	2	8	283908	283915	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5782	NC_016629	TTC	2	6	283949	283954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5784	NC_016629	CGG	2	6	284122	284127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5785	NC_016629	TTC	2	6	284203	284208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5789	NC_016629	GCTG	2	8	284282	284289	0 %	25 %	50 %	25 %	374298641
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5865	NC_016629	GC	3	6	288167	288172	0 %	0 %	50 %	50 %	374298642
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5994	NC_016629	GCC	2	6	294401	294406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298650
5995	NC_016629	ATGG	2	8	294611	294618	25 %	25 %	50 %	0 %	374298651
5996	NC_016629	CAA	2	6	294640	294645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	374298651
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5998	NC_016629	GCATGC	2	12	294816	294827	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	374298651
5999	NC_016629	CAG	2	6	294893	294898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298651
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