MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio africanus str. Walvis Bay chromosome

Total Repeats: 85601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016629	TCA	2	6	218890	218895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298581
4502	NC_016629	CTG	2	6	218901	218906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298581
4503	NC_016629	GCC	2	6	218907	218912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298581
4504	NC_016629	AGA	2	6	218956	218961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298581
4505	NC_016629	CGCA	2	8	218967	218974	25 %	0 %	25 %	50 %	374298581
4506	NC_016629	CCG	2	6	219118	219123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298581
4507	NC_016629	CAGT	2	8	219134	219141	25 %	25 %	25 %	25 %	374298581
4508	NC_016629	CTG	2	6	219180	219185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298581
4509	NC_016629	GGAGAG	2	12	219213	219224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298581
4510	NC_016629	GGC	2	6	219282	219287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298582
4511	NC_016629	CCGT	2	8	219357	219364	0 %	25 %	25 %	50 %	374298582
4512	NC_016629	GGC	2	6	219372	219377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298582
4513	NC_016629	ATC	2	6	219393	219398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298582
4514	NC_016629	TCA	2	6	219409	219414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298582
4515	NC_016629	GGCC	2	8	219482	219489	0 %	0 %	50 %	50 %	374298582
4516	NC_016629	GC	3	6	219516	219521	0 %	0 %	50 %	50 %	374298582
4517	NC_016629	CTG	2	6	219531	219536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298582
4518	NC_016629	CCTG	2	8	219553	219560	0 %	25 %	25 %	50 %	374298582
4519	NC_016629	CCTGG	2	10	219632	219641	0 %	20 %	40 %	40 %	374298582
4520	NC_016629	CCG	2	6	219649	219654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298582
4521	NC_016629	GC	3	6	219699	219704	0 %	0 %	50 %	50 %	374298582
4522	NC_016629	TGC	2	6	219739	219744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298582
4523	NC_016629	TGA	2	6	219831	219836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298582
4524	NC_016629	CG	5	10	219839	219848	0 %	0 %	50 %	50 %	374298583
4525	NC_016629	GTCC	2	8	219871	219878	0 %	25 %	25 %	50 %	374298583
4526	NC_016629	TCT	2	6	219969	219974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298583
4527	NC_016629	GCC	2	6	220014	220019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298583
4528	NC_016629	GTG	2	6	220034	220039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298583
4529	NC_016629	GAT	2	6	220085	220090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298583
4530	NC_016629	CGA	2	6	220186	220191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298583
4531	NC_016629	GCT	2	6	220207	220212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298583
4532	NC_016629	GGC	2	6	220268	220273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298583
4533	NC_016629	GAT	2	6	220325	220330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298583
4534	NC_016629	GGA	2	6	220381	220386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298583
4535	NC_016629	GAA	2	6	220400	220405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298583
4536	NC_016629	GGC	2	6	220411	220416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298583
4537	NC_016629	AC	3	6	220428	220433	50 %	0 %	0 %	50 %	374298584
4538	NC_016629	CA	3	6	220446	220451	50 %	0 %	0 %	50 %	374298584
4539	NC_016629	G	6	6	220463	220468	0 %	0 %	100 %	0 %	374298584
4540	NC_016629	C	6	6	220476	220481	0 %	0 %	0 %	100 %	374298584
4541	NC_016629	GCC	2	6	220483	220488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298584
4542	NC_016629	GGT	2	6	220545	220550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298584
4543	NC_016629	GCT	2	6	220677	220682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298584
4544	NC_016629	CGA	2	6	220686	220691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298584
4545	NC_016629	ACC	2	6	220780	220785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298584
4546	NC_016629	CG	3	6	220807	220812	0 %	0 %	50 %	50 %	374298584
4547	NC_016629	TTC	2	6	220825	220830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298584
4548	NC_016629	GAA	2	6	220856	220861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298584
4549	NC_016629	ACT	2	6	220925	220930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298584
4550	NC_016629	GCTT	2	8	221015	221022	0 %	50 %	25 %	25 %	374298584
4551	NC_016629	GGA	2	6	221079	221084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298584
4552	NC_016629	GCC	2	6	221104	221109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298584
4553	NC_016629	CGG	2	6	221153	221158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298584
4554	NC_016629	GGA	2	6	221215	221220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298584
4555	NC_016629	GC	3	6	221270	221275	0 %	0 %	50 %	50 %	374298585
4556	NC_016629	TGG	2	6	221293	221298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298585
4557	NC_016629	GGC	2	6	221324	221329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298585
4558	NC_016629	CCA	2	6	221347	221352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298585
4559	NC_016629	GC	3	6	221355	221360	0 %	0 %	50 %	50 %	374298585
4560	NC_016629	CGG	2	6	221392	221397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298585
4561	NC_016629	ACCT	2	8	221406	221413	25 %	25 %	0 %	50 %	374298585
4562	NC_016629	CTG	2	6	221475	221480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298585
4563	NC_016629	GC	3	6	221481	221486	0 %	0 %	50 %	50 %	374298585
4564	NC_016629	A	6	6	221512	221517	100 %	0 %	0 %	0 %	374298585
4565	NC_016629	TGG	2	6	221529	221534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298585
4566	NC_016629	GGA	2	6	221564	221569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298585
4567	NC_016629	TGG	2	6	221590	221595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298585
4568	NC_016629	GGC	2	6	221654	221659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298585
4569	NC_016629	GGA	2	6	221669	221674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298585
4570	NC_016629	CGG	2	6	221677	221682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298585
4571	NC_016629	CGG	2	6	221744	221749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298585
4572	NC_016629	ACT	2	6	221761	221766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298585
4573	NC_016629	CCTA	2	8	221785	221792	25 %	25 %	0 %	50 %	374298585
4574	NC_016629	GAG	2	6	221820	221825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298585
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4576	NC_016629	CACGG	2	10	221862	221871	20 %	0 %	40 %	40 %	374298585
4577	NC_016629	CTG	2	6	221895	221900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298585
4578	NC_016629	GGC	2	6	221907	221912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298585
4579	NC_016629	TGA	2	6	221959	221964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374298585
4580	NC_016629	GCCGA	2	10	222015	222024	20 %	0 %	40 %	40 %	374298585
4581	NC_016629	CAT	2	6	222175	222180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298585
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4583	NC_016629	ATCTC	2	10	222217	222226	20 %	40 %	0 %	40 %	374298586
4584	NC_016629	CTG	3	9	222247	222255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298586
4585	NC_016629	ACCT	2	8	222328	222335	25 %	25 %	0 %	50 %	374298586
4586	NC_016629	GAA	2	6	222343	222348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298586
4587	NC_016629	CGA	2	6	222417	222422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298586
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4589	NC_016629	CACG	2	8	222555	222562	25 %	0 %	25 %	50 %	374298586
4590	NC_016629	CAGC	2	8	222573	222580	25 %	0 %	25 %	50 %	374298586
4591	NC_016629	AGC	2	6	222590	222595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298586
4592	NC_016629	GTG	2	6	222613	222618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298586
4593	NC_016629	GCT	2	6	222639	222644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298586
4594	NC_016629	GGA	2	6	222645	222650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298586
4595	NC_016629	TGC	2	6	222683	222688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298586
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4598	NC_016629	GA	3	6	222746	222751	50 %	0 %	50 %	0 %	374298586
4599	NC_016629	CAT	2	6	222786	222791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298586
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4602	NC_016629	GCG	2	6	223053	223058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298586
4603	NC_016629	GCC	2	6	223087	223092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298586
4604	NC_016629	CTG	3	9	223093	223101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298586
4605	NC_016629	GCTG	2	8	223107	223114	0 %	25 %	50 %	25 %	374298586
4606	NC_016629	CGA	2	6	223203	223208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298586
4607	NC_016629	TGC	2	6	223301	223306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298586
4608	NC_016629	GCC	2	6	223326	223331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298586
4609	NC_016629	ACG	2	6	223402	223407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298586
4610	NC_016629	GGCC	2	8	223503	223510	0 %	0 %	50 %	50 %	374298586
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4612	NC_016629	CCG	2	6	223565	223570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298587
4613	NC_016629	CTA	2	6	223629	223634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374298587
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4615	NC_016629	GGC	2	6	223722	223727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298587
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4617	NC_016629	CCA	2	6	223889	223894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374298587
4618	NC_016629	GCA	2	6	223995	224000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298587
4619	NC_016629	CA	3	6	224006	224011	50 %	0 %	0 %	50 %	374298587
4620	NC_016629	GAG	2	6	224056	224061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374298587
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4622	NC_016629	CCAG	2	8	224099	224106	25 %	0 %	25 %	50 %	374298587
4623	NC_016629	ATT	2	6	224115	224120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_016629	GCA	2	6	224163	224168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4634	NC_016629	CGG	2	6	224574	224579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374298588
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4745	NC_016629	TGG	2	6	229668	229673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298590
4746	NC_016629	GCT	2	6	229708	229713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374298590
4747	NC_016629	AT	3	6	229734	229739	50 %	50 %	0 %	0 %	374298590
4748	NC_016629	AAT	2	6	229803	229808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	374298590
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4752	NC_016629	TAC	2	6	230321	230326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4753	NC_016629	AAT	2	6	230452	230457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4754	NC_016629	TCATT	2	10	230470	230479	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4858	NC_016629	T	7	7	235768	235774	0 %	100 %	0 %	0 %	374298596
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4989	NC_016629	TTG	2	6	241711	241716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	374298599
4990	NC_016629	CTT	4	12	241761	241772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298599
4991	NC_016629	TGG	2	6	241784	241789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	374298599
4992	NC_016629	TTC	2	6	241797	241802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298599
4993	NC_016629	TCT	2	6	241820	241825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298599
4994	NC_016629	CAG	2	6	241842	241847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374298599
4995	NC_016629	GC	3	6	241849	241854	0 %	0 %	50 %	50 %	374298599
4996	NC_016629	CGC	2	6	242116	242121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298599
4997	NC_016629	CGC	2	6	242144	242149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374298599
4998	NC_016629	AGA	2	6	242240	242245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	374298599
4999	NC_016629	CTT	2	6	242292	242297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298599
5000	NC_016629	TCT	2	6	242324	242329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	374298599

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