MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dechlorosoma suillum PS chromosome

Total Repeats: 99447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_016616	AGT	2	6	164445	164450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_016616	GAGC	2	8	164604	164611	25 %	0 %	50 %	25 %	372486857
4003	NC_016616	CGA	2	6	164624	164629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486857
4004	NC_016616	CGT	2	6	164640	164645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486857
4005	NC_016616	ACA	2	6	164664	164669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	372486857
4006	NC_016616	TCAAG	2	10	164686	164695	40 %	20 %	20 %	20 %	372486857
4007	NC_016616	AACT	2	8	164714	164721	50 %	25 %	0 %	25 %	372486857
4008	NC_016616	TCC	2	6	164739	164744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	372486857
4009	NC_016616	GTT	2	6	164747	164752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	372486857
4010	NC_016616	CTG	2	6	164806	164811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486857
4011	NC_016616	TTTCCT	2	12	164814	164825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	372486857
4012	NC_016616	TCT	2	6	164835	164840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	372486857
4013	NC_016616	CTT	3	9	164842	164850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	372486857
4014	NC_016616	CGC	2	6	165090	165095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486857
4015	NC_016616	ACC	2	6	165110	165115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	372486857
4016	NC_016616	ACCCA	2	10	165149	165158	40 %	0 %	0 %	60 %	372486857
4017	NC_016616	A	7	7	165257	165263	100 %	0 %	0 %	0 %	372486857
4018	NC_016616	CCT	2	6	165297	165302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_016616	T	6	6	165410	165415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_016616	CAC	2	6	165423	165428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_016616	CT	3	6	165460	165465	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_016616	ACC	2	6	165507	165512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4023	NC_016616	CGA	3	9	165513	165521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_016616	CTTC	2	8	165550	165557	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4025	NC_016616	CGGGG	2	10	165568	165577	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4026	NC_016616	ACG	2	6	165632	165637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_016616	CGC	2	6	165706	165711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_016616	AGA	2	6	165732	165737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_016616	GCCT	2	8	165752	165759	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4030	NC_016616	GCG	2	6	165763	165768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_016616	GTC	2	6	165839	165844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_016616	AGG	2	6	165871	165876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_016616	GAA	2	6	165929	165934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_016616	TTCT	2	8	165960	165967	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4035	NC_016616	CCAG	2	8	166004	166011	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4036	NC_016616	AGTG	2	8	166052	166059	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_016616	A	6	6	166095	166100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_016616	GGC	2	6	166154	166159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_016616	AAC	2	6	166215	166220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_016616	A	7	7	166228	166234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_016616	CGG	2	6	166244	166249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_016616	GC	3	6	166451	166456	0 %	0 %	50 %	50 %	372486858
4043	NC_016616	CCCG	2	8	166548	166555	0 %	0 %	25 %	75 %	372486858
4044	NC_016616	CTC	2	6	166558	166563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	372486858
4045	NC_016616	CA	3	6	166576	166581	50 %	0 %	0 %	50 %	372486858
4046	NC_016616	GTC	2	6	166651	166656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486858
4047	NC_016616	TCG	2	6	166682	166687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486858
4048	NC_016616	CCA	2	6	166710	166715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	372486858
4049	NC_016616	ATGC	2	8	166735	166742	25 %	25 %	25 %	25 %	372486858
4050	NC_016616	GCC	2	6	166748	166753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486858
4051	NC_016616	C	8	8	166779	166786	0 %	0 %	0 %	100 %	372486858
4052	NC_016616	GCC	3	9	166805	166813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486858
4053	NC_016616	TCA	2	6	166887	166892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	372486858
4054	NC_016616	GCA	2	6	166896	166901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486858
4055	NC_016616	GAT	2	6	166915	166920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	372486858
4056	NC_016616	TGG	2	6	166923	166928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	372486858
4057	NC_016616	ATG	2	6	166946	166951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	372486858
4058	NC_016616	CAT	2	6	166972	166977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	372486858
4059	NC_016616	GGC	2	6	167020	167025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486858
4060	NC_016616	ACG	2	6	167059	167064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486858
4061	NC_016616	CCA	2	6	167079	167084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	372486858
4062	NC_016616	TCG	2	6	167087	167092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486858
4063	NC_016616	CAA	2	6	167095	167100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	372486858
4064	NC_016616	CCA	2	6	167121	167126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	372486858
4065	NC_016616	CCG	2	6	167127	167132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486858
4066	NC_016616	CAGC	2	8	167175	167182	25 %	0 %	25 %	50 %	372486858
4067	NC_016616	AGCACC	2	12	167183	167194	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	372486858
4068	NC_016616	GCC	2	6	167209	167214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486858
4069	NC_016616	GCT	2	6	167215	167220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486858
4070	NC_016616	GAT	2	6	167221	167226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	372486858
4071	NC_016616	ACGA	2	8	167242	167249	50 %	0 %	25 %	25 %	372486858
4072	NC_016616	CAC	2	6	167251	167256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	372486858
4073	NC_016616	T	6	6	167325	167330	0 %	100 %	0 %	0 %	372486858
4074	NC_016616	AAAGG	2	10	167360	167369	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_016616	CGG	2	6	167395	167400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_016616	GC	4	8	167443	167450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4077	NC_016616	GCC	2	6	167465	167470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4078	NC_016616	CGGC	2	8	167471	167478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4079	NC_016616	CGG	2	6	167484	167489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_016616	CGG	2	6	167594	167599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486859
4081	NC_016616	CGT	2	6	167612	167617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486859
4082	NC_016616	AGGCGA	2	12	167696	167707	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	372486859
4083	NC_016616	GCC	2	6	167773	167778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486859
4084	NC_016616	GAG	2	6	167888	167893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_016616	CA	3	6	167908	167913	50 %	0 %	0 %	50 %	372486860
4086	NC_016616	A	6	6	167913	167918	100 %	0 %	0 %	0 %	372486860
4087	NC_016616	CGG	2	6	167981	167986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486860
4088	NC_016616	TGG	2	6	167992	167997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	372486860
4089	NC_016616	TCGGCA	2	12	168055	168066	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	372486860
4090	NC_016616	GCC	2	6	168130	168135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486860
4091	NC_016616	CGC	2	6	168155	168160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486860
4092	NC_016616	CGA	2	6	168239	168244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486861
4093	NC_016616	GGC	2	6	168273	168278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486861
4094	NC_016616	CCT	2	6	168289	168294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	372486861
4095	NC_016616	CCG	2	6	168296	168301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486861
4096	NC_016616	GGC	2	6	168333	168338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486861
4097	NC_016616	GGT	2	6	168342	168347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	372486861
4098	NC_016616	CGG	2	6	168350	168355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486861
4099	NC_016616	GCGG	2	8	168442	168449	0 %	0 %	75 %	25 %	372486861
4100	NC_016616	GGC	2	6	168471	168476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486861
4101	NC_016616	GAC	2	6	168477	168482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486861
4102	NC_016616	ATC	2	6	168483	168488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	372486861
4103	NC_016616	AAG	2	6	168564	168569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	372486861
4104	NC_016616	CTG	2	6	168573	168578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486861
4105	NC_016616	GGC	2	6	168585	168590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486861
4106	NC_016616	GGC	2	6	168594	168599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486861
4107	NC_016616	TCC	2	6	168621	168626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	372486861
4108	NC_016616	C	6	6	168637	168642	0 %	0 %	0 %	100 %	372486861
4109	NC_016616	CTG	2	6	168717	168722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486861
4110	NC_016616	CCG	2	6	168766	168771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486861
4111	NC_016616	CAC	2	6	168800	168805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	372486861
4112	NC_016616	GTG	2	6	168825	168830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	372486861
4113	NC_016616	ACA	2	6	168841	168846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	372486861
4114	NC_016616	TGC	3	9	168946	168954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486861
4115	NC_016616	TCG	2	6	168958	168963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486861
4116	NC_016616	CGCCAT	2	12	169004	169015	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	372486861
4117	NC_016616	GCTG	2	8	169063	169070	0 %	25 %	50 %	25 %	372486861
4118	NC_016616	CAA	2	6	169076	169081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	372486861
4119	NC_016616	CTT	2	6	169127	169132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	372486861
4120	NC_016616	GCC	2	6	169182	169187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486861
4121	NC_016616	GCG	2	6	169192	169197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486861
4122	NC_016616	GCC	2	6	169204	169209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486861
4123	NC_016616	GCC	2	6	169230	169235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486861
4124	NC_016616	GGA	2	6	169238	169243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	372486861
4125	NC_016616	GGA	2	6	169268	169273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	372486861
4126	NC_016616	ACC	2	6	169325	169330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	372486862
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4158	NC_016616	CAA	2	6	170462	170467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4247	NC_016616	CGT	2	6	173849	173854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486866
4248	NC_016616	CTT	2	6	174003	174008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	372486866
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4253	NC_016616	CTG	2	6	174123	174128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486866
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4260	NC_016616	C	6	6	174588	174593	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4368	NC_016616	GGCG	2	8	179551	179558	0 %	0 %	75 %	25 %	372486871
4369	NC_016616	CGGA	2	8	179617	179624	25 %	0 %	50 %	25 %	372486871
4370	NC_016616	CAC	2	6	179627	179632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	372486871
4371	NC_016616	CTT	2	6	179708	179713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	372486871
4372	NC_016616	CCT	2	6	179758	179763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	372486871
4373	NC_016616	GCCC	2	8	179777	179784	0 %	0 %	25 %	75 %	372486871
4374	NC_016616	GCC	2	6	179888	179893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486872
4375	NC_016616	TCG	2	6	179894	179899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486872
4376	NC_016616	TTG	2	6	179900	179905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	372486872
4377	NC_016616	GGC	2	6	179917	179922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486872
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4379	NC_016616	CGT	2	6	180003	180008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486872
4380	NC_016616	GCG	2	6	180026	180031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486872
4381	NC_016616	TCG	2	6	180068	180073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486872
4382	NC_016616	CGC	2	6	180129	180134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486872
4383	NC_016616	TCC	2	6	180137	180142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	372486872
4384	NC_016616	CCG	2	6	180149	180154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486872
4385	NC_016616	CGG	2	6	180237	180242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486872
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4388	NC_016616	TGA	2	6	180321	180326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	372486872
4389	NC_016616	CCA	2	6	180372	180377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	372486872
4390	NC_016616	AGG	2	6	180398	180403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	372486872
4391	NC_016616	CGT	2	6	180456	180461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486872
4392	NC_016616	CTTG	2	8	180462	180469	0 %	50 %	25 %	25 %	372486872
4393	NC_016616	GAG	2	6	180517	180522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	372486872
4394	NC_016616	GAG	2	6	180529	180534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	372486872
4395	NC_016616	CGG	2	6	180552	180557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486872
4396	NC_016616	TCG	2	6	180700	180705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4397	NC_016616	GCC	2	6	180775	180780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486873
4398	NC_016616	CGG	2	6	180788	180793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486873
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4400	NC_016616	CTG	2	6	180811	180816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486873
4401	NC_016616	CGG	2	6	180840	180845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486873
4402	NC_016616	GCCG	2	8	180859	180866	0 %	0 %	50 %	50 %	372486873
4403	NC_016616	TGC	2	6	180881	180886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486873
4404	NC_016616	TCG	2	6	180908	180913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486873
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4411	NC_016616	GGC	3	9	181108	181116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486873
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4417	NC_016616	GTT	2	6	181660	181665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4422	NC_016616	CGG	2	6	181888	181893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486874
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4432	NC_016616	CAC	2	6	182090	182095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	372486874
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4441	NC_016616	GTG	2	6	182713	182718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	372486876
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4443	NC_016616	GTC	2	6	182827	182832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	372486876
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4446	NC_016616	TAA	2	6	182967	182972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4447	NC_016616	AGG	2	6	182979	182984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4449	NC_016616	A	8	8	183014	183021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4450	NC_016616	GT	3	6	183043	183048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4451	NC_016616	GCG	2	6	183060	183065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4452	NC_016616	CTC	2	6	183087	183092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	372486877
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4454	NC_016616	AG	3	6	183164	183169	50 %	0 %	50 %	0 %	372486877
4455	NC_016616	ATG	2	6	183184	183189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	372486877
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4458	NC_016616	ACC	2	6	183328	183333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4459	NC_016616	CCA	2	6	183336	183341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4460	NC_016616	TGC	2	6	183376	183381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4461	NC_016616	ACC	2	6	183470	183475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4462	NC_016616	GTT	2	6	183485	183490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4463	NC_016616	CGT	2	6	183541	183546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4465	NC_016616	GGC	2	6	183649	183654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4466	NC_016616	CGG	2	6	183776	183781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486878
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4470	NC_016616	CCA	2	6	183926	183931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	372486878
4471	NC_016616	GCA	2	6	183954	183959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486878
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4478	NC_016616	T	6	6	184123	184128	0 %	100 %	0 %	0 %	372486878
4479	NC_016616	CTT	2	6	184169	184174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	372486878
4480	NC_016616	GCTG	2	8	184296	184303	0 %	25 %	50 %	25 %	372486878
4481	NC_016616	AAT	2	6	184305	184310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	372486878
4482	NC_016616	CGC	2	6	184319	184324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	372486878
4483	NC_016616	CCT	2	6	184340	184345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	372486879
4484	NC_016616	GAT	2	6	184373	184378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	372486879
4485	NC_016616	TTCA	2	8	184457	184464	25 %	50 %	0 %	25 %	372486879
4486	NC_016616	CTT	2	6	184481	184486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	372486879
4487	NC_016616	ACG	2	6	184518	184523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486879
4488	NC_016616	ATG	2	6	184557	184562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	372486879
4489	NC_016616	GCA	2	6	184588	184593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	372486879
4490	NC_016616	AGGTCG	2	12	184635	184646	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	372486879
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4492	NC_016616	GCCG	2	8	184670	184677	0 %	0 %	50 %	50 %	372486879
4493	NC_016616	CGG	2	6	184756	184761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	372486879
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