MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR03

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015170	TC	3	6	93	98	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_015170	TG	3	6	126	131	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015170	GC	3	6	448	453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015170	GC	3	6	1101	1106	0 %	0 %	50 %	50 %	325284807
5	NC_015170	GC	3	6	1131	1136	0 %	0 %	50 %	50 %	325284807
6	NC_015170	GC	3	6	1417	1422	0 %	0 %	50 %	50 %	325284807
7	NC_015170	GC	3	6	2441	2446	0 %	0 %	50 %	50 %	325284808
8	NC_015170	GC	3	6	4929	4934	0 %	0 %	50 %	50 %	325284810
9	NC_015170	GC	3	6	7091	7096	0 %	0 %	50 %	50 %	325284811
10	NC_015170	CT	3	6	7150	7155	0 %	50 %	0 %	50 %	325284811
11	NC_015170	CT	3	6	7335	7340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015170	CG	3	6	7634	7639	0 %	0 %	50 %	50 %	325284812
13	NC_015170	GC	4	8	8585	8592	0 %	0 %	50 %	50 %	325284812
14	NC_015170	GC	3	6	9148	9153	0 %	0 %	50 %	50 %	325284813
15	NC_015170	GC	3	6	9907	9912	0 %	0 %	50 %	50 %	325284813
16	NC_015170	CA	3	6	10358	10363	50 %	0 %	0 %	50 %	325284813
17	NC_015170	AG	3	6	13096	13101	50 %	0 %	50 %	0 %	325284815
18	NC_015170	GC	3	6	13990	13995	0 %	0 %	50 %	50 %	325284816
19	NC_015170	GC	3	6	14351	14356	0 %	0 %	50 %	50 %	325284816
20	NC_015170	GC	3	6	15304	15309	0 %	0 %	50 %	50 %	325284817
21	NC_015170	AG	3	6	16194	16199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015170	AT	3	6	16210	16215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015170	TC	3	6	22474	22479	0 %	50 %	0 %	50 %	325284824
24	NC_015170	TC	3	6	22618	22623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015170	AC	3	6	23137	23142	50 %	0 %	0 %	50 %	325284825
26	NC_015170	CG	3	6	24421	24426	0 %	0 %	50 %	50 %	325284827
27	NC_015170	CG	3	6	24938	24943	0 %	0 %	50 %	50 %	325284828
28	NC_015170	CG	3	6	26448	26453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015170	CT	4	8	26491	26498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015170	GC	3	6	27397	27402	0 %	0 %	50 %	50 %	325284830
31	NC_015170	CA	3	6	30697	30702	50 %	0 %	0 %	50 %	325284832
32	NC_015170	CG	3	6	30825	30830	0 %	0 %	50 %	50 %	325284832
33	NC_015170	CG	3	6	30848	30853	0 %	0 %	50 %	50 %	325284832
34	NC_015170	GC	3	6	31888	31893	0 %	0 %	50 %	50 %	325284833
35	NC_015170	GC	3	6	32904	32909	0 %	0 %	50 %	50 %	325284833
36	NC_015170	TC	3	6	33046	33051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015170	TC	3	6	34823	34828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_015170	TC	3	6	35061	35066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_015170	TC	3	6	37135	37140	0 %	50 %	0 %	50 %	325284836
40	NC_015170	AG	3	6	37369	37374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015170	AG	4	8	38484	38491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015170	GT	4	8	39198	39205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015170	GC	3	6	44730	44735	0 %	0 %	50 %	50 %	325284839
44	NC_015170	GC	3	6	47257	47262	0 %	0 %	50 %	50 %	325284841
45	NC_015170	CA	3	6	49327	49332	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015170	GC	3	6	50134	50139	0 %	0 %	50 %	50 %	325284843
47	NC_015170	GC	3	6	50410	50415	0 %	0 %	50 %	50 %	325284843
48	NC_015170	GA	3	6	51124	51129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015170	TG	3	6	52601	52606	0 %	50 %	50 %	0 %	325284845
50	NC_015170	AG	3	6	53323	53328	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015170	TC	3	6	53376	53381	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015170	CA	3	6	53690	53695	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015170	CA	3	6	53751	53756	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015170	CG	3	6	54063	54068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015170	CG	3	6	56772	56777	0 %	0 %	50 %	50 %	325284848
56	NC_015170	GT	3	6	57337	57342	0 %	50 %	50 %	0 %	325284849
57	NC_015170	CT	3	6	58062	58067	0 %	50 %	0 %	50 %	325284849
58	NC_015170	CG	3	6	58448	58453	0 %	0 %	50 %	50 %	325284849
59	NC_015170	CT	3	6	60102	60107	0 %	50 %	0 %	50 %	325284850
60	NC_015170	AG	3	6	64223	64228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015170	CA	3	6	64665	64670	50 %	0 %	0 %	50 %	325284854
62	NC_015170	CG	3	6	66488	66493	0 %	0 %	50 %	50 %	325284855
63	NC_015170	GC	3	6	67074	67079	0 %	0 %	50 %	50 %	325284856
64	NC_015170	AC	3	6	67334	67339	50 %	0 %	0 %	50 %	325284857
65	NC_015170	AC	3	6	67867	67872	50 %	0 %	0 %	50 %	325284857
66	NC_015170	CA	3	6	67890	67895	50 %	0 %	0 %	50 %	325284857
67	NC_015170	GT	3	6	68594	68599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015170	GT	3	6	68655	68660	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015170	GA	3	6	70005	70010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015170	CG	3	6	77451	77456	0 %	0 %	50 %	50 %	325284865
71	NC_015170	TG	3	6	78654	78659	0 %	50 %	50 %	0 %	325284866
72	NC_015170	GT	3	6	80521	80526	0 %	50 %	50 %	0 %	325284867
73	NC_015170	AT	3	6	80563	80568	50 %	50 %	0 %	0 %	325284867
74	NC_015170	GC	3	6	80985	80990	0 %	0 %	50 %	50 %	325284868
75	NC_015170	GC	3	6	81334	81339	0 %	0 %	50 %	50 %	325284868
76	NC_015170	TC	3	6	81438	81443	0 %	50 %	0 %	50 %	325284868
77	NC_015170	GC	3	6	82309	82314	0 %	0 %	50 %	50 %	325284869
78	NC_015170	GC	3	6	82580	82585	0 %	0 %	50 %	50 %	325284869
79	NC_015170	CG	3	6	83286	83291	0 %	0 %	50 %	50 %	325284869
80	NC_015170	CT	3	6	84119	84124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015170	GC	3	6	86181	86186	0 %	0 %	50 %	50 %	325284871
82	NC_015170	GC	3	6	87099	87104	0 %	0 %	50 %	50 %	325284872
83	NC_015170	GC	3	6	87399	87404	0 %	0 %	50 %	50 %	325284872
84	NC_015170	GC	3	6	88064	88069	0 %	0 %	50 %	50 %	325284873
85	NC_015170	CG	3	6	91410	91415	0 %	0 %	50 %	50 %	325284876
86	NC_015170	TC	3	6	93734	93739	0 %	50 %	0 %	50 %	325284878
87	NC_015170	TG	3	6	93988	93993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015170	CA	3	6	94174	94179	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_015170	TC	3	6	96076	96081	0 %	50 %	0 %	50 %	325284880
90	NC_015170	CG	3	6	97828	97833	0 %	0 %	50 %	50 %	325284881
91	NC_015170	TC	3	6	99459	99464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_015170	CT	3	6	100132	100137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_015170	CT	3	6	100163	100168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015170	TC	5	10	100184	100193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015170	TA	3	6	100313	100318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015170	CA	3	6	100693	100698	50 %	0 %	0 %	50 %	325284884
97	NC_015170	GC	3	6	100833	100838	0 %	0 %	50 %	50 %	325284884
98	NC_015170	GC	3	6	101451	101456	0 %	0 %	50 %	50 %	325284885
99	NC_015170	AG	3	6	101570	101575	50 %	0 %	50 %	0 %	325284885
100	NC_015170	GA	3	6	102415	102420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015170	CG	3	6	102789	102794	0 %	0 %	50 %	50 %	325284886
102	NC_015170	CG	3	6	103921	103926	0 %	0 %	50 %	50 %	325284887
103	NC_015170	CG	3	6	104446	104451	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015170	GC	3	6	105341	105346	0 %	0 %	50 %	50 %	325284890
105	NC_015170	CA	3	6	105986	105991	50 %	0 %	0 %	50 %	325284890
106	NC_015170	GC	3	6	107185	107190	0 %	0 %	50 %	50 %	325284892
107	NC_015170	GC	3	6	107266	107271	0 %	0 %	50 %	50 %	325284892
108	NC_015170	CT	3	6	108310	108315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_015170	GC	3	6	109920	109925	0 %	0 %	50 %	50 %	325284894
110	NC_015170	GC	3	6	110285	110290	0 %	0 %	50 %	50 %	325284894
111	NC_015170	GC	3	6	110475	110480	0 %	0 %	50 %	50 %	325284894
112	NC_015170	GC	3	6	111169	111174	0 %	0 %	50 %	50 %	325284895
113	NC_015170	GC	3	6	112458	112463	0 %	0 %	50 %	50 %	325284896
114	NC_015170	TG	3	6	114610	114615	0 %	50 %	50 %	0 %	325284899
115	NC_015170	GC	3	6	114693	114698	0 %	0 %	50 %	50 %	325284899
116	NC_015170	GC	3	6	117465	117470	0 %	0 %	50 %	50 %	325284902
117	NC_015170	AC	3	6	118248	118253	50 %	0 %	0 %	50 %	325284903
118	NC_015170	GC	3	6	120607	120612	0 %	0 %	50 %	50 %	325284904
119	NC_015170	CG	3	6	125050	125055	0 %	0 %	50 %	50 %	325284909
120	NC_015170	CG	3	6	126449	126454	0 %	0 %	50 %	50 %	325284909
121	NC_015170	CT	3	6	126916	126921	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015170	TC	3	6	127199	127204	0 %	50 %	0 %	50 %	325284910
123	NC_015170	GC	3	6	129185	129190	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_015170	CG	3	6	129399	129404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_015170	TC	3	6	129520	129525	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.