MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR04

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015163	TA	3	6	345	350	50 %	50 %	0 %	0 %	325284458
2	NC_015163	CA	3	6	1557	1562	50 %	0 %	0 %	50 %	325284459
3	NC_015163	GC	3	6	2581	2586	0 %	0 %	50 %	50 %	325284461
4	NC_015163	AT	3	6	2972	2977	50 %	50 %	0 %	0 %	325284462
5	NC_015163	TC	3	6	3036	3041	0 %	50 %	0 %	50 %	325284462
6	NC_015163	GA	3	6	3634	3639	50 %	0 %	50 %	0 %	325284463
7	NC_015163	CT	3	6	4011	4016	0 %	50 %	0 %	50 %	325284464
8	NC_015163	TG	4	8	5019	5026	0 %	50 %	50 %	0 %	325284466
9	NC_015163	GA	3	6	5790	5795	50 %	0 %	50 %	0 %	325284468
10	NC_015163	TA	3	6	7784	7789	50 %	50 %	0 %	0 %	325284470
11	NC_015163	GA	3	6	7925	7930	50 %	0 %	50 %	0 %	325284470
12	NC_015163	CT	3	6	8451	8456	0 %	50 %	0 %	50 %	325284471
13	NC_015163	GC	3	6	9458	9463	0 %	0 %	50 %	50 %	325284472
14	NC_015163	CT	4	8	9809	9816	0 %	50 %	0 %	50 %	325284473
15	NC_015163	TG	3	6	10149	10154	0 %	50 %	50 %	0 %	325284473
16	NC_015163	GC	3	6	13517	13522	0 %	0 %	50 %	50 %	325284477
17	NC_015163	GC	3	6	14480	14485	0 %	0 %	50 %	50 %	325284477
18	NC_015163	TC	3	6	14731	14736	0 %	50 %	0 %	50 %	325284477
19	NC_015163	GC	3	6	15375	15380	0 %	0 %	50 %	50 %	325284478
20	NC_015163	CG	3	6	16040	16045	0 %	0 %	50 %	50 %	325284478
21	NC_015163	CT	3	6	16246	16251	0 %	50 %	0 %	50 %	325284478
22	NC_015163	GA	3	6	16252	16257	50 %	0 %	50 %	0 %	325284478
23	NC_015163	AG	3	6	17027	17032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015163	AG	4	8	17148	17155	50 %	0 %	50 %	0 %	325284479
25	NC_015163	CT	3	6	18066	18071	0 %	50 %	0 %	50 %	325284479
26	NC_015163	AG	3	6	18335	18340	50 %	0 %	50 %	0 %	325284479
27	NC_015163	TC	3	6	19874	19879	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015163	CG	4	8	19941	19948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_015163	CG	3	6	20013	20018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015163	GC	3	6	20509	20514	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_015163	CT	3	6	20574	20579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_015163	TA	3	6	21438	21443	50 %	50 %	0 %	0 %	325284480
33	NC_015163	GC	3	6	21517	21522	0 %	0 %	50 %	50 %	325284480
34	NC_015163	CA	4	8	21870	21877	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015163	CA	3	6	22432	22437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015163	CT	3	6	22912	22917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015163	AG	3	6	23075	23080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015163	AG	3	6	24262	24267	50 %	0 %	50 %	0 %	325284482
39	NC_015163	AC	3	6	24288	24293	50 %	0 %	0 %	50 %	325284482
40	NC_015163	GT	3	6	26124	26129	0 %	50 %	50 %	0 %	325284483
41	NC_015163	GA	3	6	26398	26403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015163	GC	3	6	26591	26596	0 %	0 %	50 %	50 %	325284484
43	NC_015163	AG	3	6	26776	26781	50 %	0 %	50 %	0 %	325284484
44	NC_015163	CG	3	6	26916	26921	0 %	0 %	50 %	50 %	325284484
45	NC_015163	GC	3	6	27089	27094	0 %	0 %	50 %	50 %	325284484
46	NC_015163	TC	3	6	27786	27791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015163	CG	3	6	28227	28232	0 %	0 %	50 %	50 %	325284486
48	NC_015163	TC	3	6	30286	30291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015163	GA	3	6	30687	30692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015163	GC	3	6	31134	31139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015163	CG	3	6	31146	31151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015163	GC	3	6	32206	32211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015163	TG	3	6	32311	32316	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015163	GT	3	6	33065	33070	0 %	50 %	50 %	0 %	325284488
55	NC_015163	GT	3	6	33761	33766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015163	TC	3	6	33796	33801	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015163	AC	3	6	34679	34684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015163	AG	4	8	34832	34839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015163	CT	4	8	34860	34867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015163	AG	3	6	35840	35845	50 %	0 %	50 %	0 %	325284490
61	NC_015163	CA	3	6	35992	35997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015163	TC	3	6	36189	36194	0 %	50 %	0 %	50 %	325284491
63	NC_015163	AG	3	6	36492	36497	50 %	0 %	50 %	0 %	325284491
64	NC_015163	AC	3	6	39623	39628	50 %	0 %	0 %	50 %	325284496
65	NC_015163	TC	3	6	39753	39758	0 %	50 %	0 %	50 %	325284497
66	NC_015163	CT	3	6	40057	40062	0 %	50 %	0 %	50 %	325284497
67	NC_015163	CA	3	6	40070	40075	50 %	0 %	0 %	50 %	325284497
68	NC_015163	AC	3	6	40497	40502	50 %	0 %	0 %	50 %	325284497
69	NC_015163	GT	3	6	41385	41390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015163	TC	3	6	41806	41811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_015163	GT	3	6	42011	42016	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015163	GT	3	6	42305	42310	0 %	50 %	50 %	0 %	325284499
73	NC_015163	AG	3	6	42990	42995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015163	CA	3	6	43127	43132	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015163	CT	3	6	43994	43999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015163	CA	4	8	45235	45242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_015163	CT	3	6	47113	47118	0 %	50 %	0 %	50 %	325284501
78	NC_015163	GA	3	6	48132	48137	50 %	0 %	50 %	0 %	325284501
79	NC_015163	TG	3	6	48198	48203	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015163	TG	3	6	49922	49927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015163	AC	3	6	50356	50361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_015163	GC	3	6	51139	51144	0 %	0 %	50 %	50 %	325284504
83	NC_015163	GC	4	8	55619	55626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_015163	GT	3	6	55681	55686	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015163	CT	3	6	56883	56888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_015163	TC	3	6	57113	57118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015163	GA	3	6	58262	58267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015163	GC	3	6	59433	59438	0 %	0 %	50 %	50 %	325284509
89	NC_015163	TC	3	6	59484	59489	0 %	50 %	0 %	50 %	325284509
90	NC_015163	GA	3	6	60794	60799	50 %	0 %	50 %	0 %	325284510
91	NC_015163	GT	4	8	63976	63983	0 %	50 %	50 %	0 %	325284513
92	NC_015163	AT	3	6	64190	64195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015163	TC	3	6	64251	64256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_015163	CT	3	6	64481	64486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015163	AG	4	8	65459	65466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015163	CT	4	8	65487	65494	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015163	GA	3	6	66584	66589	50 %	0 %	50 %	0 %	325284514
98	NC_015163	AG	4	8	67670	67677	50 %	0 %	50 %	0 %	325284515
99	NC_015163	CG	3	6	69654	69659	0 %	0 %	50 %	50 %	325284519
100	NC_015163	GC	3	6	71021	71026	0 %	0 %	50 %	50 %	325284522
101	NC_015163	GC	3	6	71739	71744	0 %	0 %	50 %	50 %	325284523
102	NC_015163	TG	3	6	73409	73414	0 %	50 %	50 %	0 %	325284524
103	NC_015163	CT	3	6	73744	73749	0 %	50 %	0 %	50 %	325284525
104	NC_015163	GT	3	6	75609	75614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015163	AC	3	6	76537	76542	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015163	AG	3	6	76683	76688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015163	AC	3	6	78984	78989	50 %	0 %	0 %	50 %	325284531
108	NC_015163	TG	3	6	80482	80487	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015163	CT	3	6	81333	81338	0 %	50 %	0 %	50 %	325284532
110	NC_015163	GC	3	6	82597	82602	0 %	0 %	50 %	50 %	325284533
111	NC_015163	CG	3	6	82611	82616	0 %	0 %	50 %	50 %	325284533
112	NC_015163	CT	3	6	82710	82715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_015163	GT	3	6	85094	85099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015163	CA	4	8	85270	85277	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_015163	CT	3	6	88011	88016	0 %	50 %	0 %	50 %	325284540
116	NC_015163	CA	4	8	89776	89783	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015163	CT	3	6	93795	93800	0 %	50 %	0 %	50 %	325284547
118	NC_015163	GC	3	6	94000	94005	0 %	0 %	50 %	50 %	325284547
119	NC_015163	GA	3	6	94030	94035	50 %	0 %	50 %	0 %	325284547
120	NC_015163	CA	3	6	94344	94349	50 %	0 %	0 %	50 %	325284547
121	NC_015163	TG	3	6	95533	95538	0 %	50 %	50 %	0 %	325284549
122	NC_015163	GC	3	6	95912	95917	0 %	0 %	50 %	50 %	325284549
123	NC_015163	GT	3	6	96742	96747	0 %	50 %	50 %	0 %	325284550

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.