MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP plasmid pDEIPR02

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015162	GGCCCA	2	12	1338	1349	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325284232
2	NC_015162	CTGGGC	2	12	8700	8711	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325284237
3	NC_015162	CCAGCG	2	12	8859	8870	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325284238
4	NC_015162	GTGCCT	2	12	9388	9399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325284239
5	NC_015162	CTGCAG	2	12	15456	15467	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325284248
6	NC_015162	TCACCG	2	12	15472	15483	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325284248
7	NC_015162	GCCCAG	2	12	17047	17058	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325284251
8	NC_015162	CGGTCA	2	12	18614	18625	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325284253
9	NC_015162	GTCACC	2	12	22088	22099	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325284261
10	NC_015162	TCACCC	2	12	22116	22127	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	325284261
11	NC_015162	ACCCTG	2	12	22590	22601	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325284263
12	NC_015162	GTCAGC	2	12	28358	28369	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325284271
13	NC_015162	AACACC	2	12	28540	28551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_015162	TCGCCA	2	12	29018	29029	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325284272
15	NC_015162	CAGGGC	2	12	29272	29283	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325284272
16	NC_015162	CGGCAG	2	12	29318	29329	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325284272
17	NC_015162	CCCCGG	2	12	30358	30369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325284275
18	NC_015162	GCGAGC	2	12	30396	30407	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325284275
19	NC_015162	CGAGAC	2	12	30839	30850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284276
20	NC_015162	CCACCG	2	12	33409	33420	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015162	CCTGGC	2	12	34365	34376	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325284282
22	NC_015162	CTGGCA	2	12	44517	44528	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325284291
23	NC_015162	GAAAGC	2	12	49609	49620	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	325284295
24	NC_015162	CGGCAT	2	12	51256	51267	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325284295
25	NC_015162	GAAACC	2	12	51392	51403	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	325284295
26	NC_015162	CAAGGT	2	12	51421	51432	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325284295
27	NC_015162	CGTAGA	2	12	53934	53945	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325284297
28	NC_015162	TGACCA	2	12	55334	55345	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325284298
29	NC_015162	CAAAGA	2	12	56358	56369	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	325284298
30	NC_015162	GGCCAA	2	12	56952	56963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284300
31	NC_015162	CGCTCC	2	12	57771	57782	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	325284300
32	NC_015162	AACCCG	2	12	61968	61979	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325284303
33	NC_015162	GAAGCC	2	12	62108	62119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284303
34	NC_015162	AGTACA	2	12	64177	64188	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325284306
35	NC_015162	CGGAGC	2	12	67381	67392	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325284310
36	NC_015162	AGATTC	2	12	70417	70428	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	325284314
37	NC_015162	CGCCCA	2	12	72149	72160	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	325284316
38	NC_015162	GGAACT	2	12	79860	79871	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325284327
39	NC_015162	CAGCGG	2	12	84292	84303	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325284331
40	NC_015162	CTGGCC	2	12	86120	86131	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325284333
41	NC_015162	CCTGGG	2	12	87029	87040	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325284334
42	NC_015162	CAGCGA	2	12	91741	91752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325284342
43	NC_015162	CTGGAA	2	12	92345	92356	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325284342
44	NC_015162	CGCTGC	2	12	95593	95604	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325284348
45	NC_015162	CCTGAG	2	12	95645	95656	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325284348
46	NC_015162	CTTTCA	2	12	95831	95842	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	325284348
47	NC_015162	CCCCAG	2	12	98563	98574	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	325284350
48	NC_015162	CCCAGC	2	12	101071	101082	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	325284354
49	NC_015162	CAGACC	2	12	102992	103003	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325284358
50	NC_015162	GTGCCA	2	12	105182	105193	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325284362
51	NC_015162	GCTCCA	2	12	105406	105417	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325284362
52	NC_015162	CGGCAG	2	12	105560	105571	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325284362
53	NC_015162	GCCAGG	2	12	110467	110478	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325284363
54	NC_015162	GCTGGC	2	12	110947	110958	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325284364
55	NC_015162	GGTCTG	2	12	112325	112336	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	325284364
56	NC_015162	AAGCTG	2	12	112367	112378	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325284364
57	NC_015162	TGCAGG	2	12	113257	113268	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325284365
58	NC_015162	GTCACA	2	12	113636	113647	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325284367
59	NC_015162	AATACC	2	12	115146	115157	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	325284368
60	NC_015162	AGGTCA	2	12	119238	119249	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	325284374
61	NC_015162	CCCGCA	2	12	119409	119420	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	325284374
62	NC_015162	ACCCTG	2	12	120352	120363	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325284376
63	NC_015162	TGACCT	2	12	128445	128456	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325284388
64	NC_015162	GAACCA	2	12	129193	129204	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	325284389
65	NC_015162	GCAGCT	2	12	129397	129408	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325284389
66	NC_015162	GAACCT	2	12	129607	129618	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325284389
67	NC_015162	CCCAAG	2	12	132701	132712	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325284391
68	NC_015162	GCCTCA	2	12	136381	136392	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325284394
69	NC_015162	CGCAGC	2	12	136992	137003	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325284394
70	NC_015162	CAGCCT	2	12	137681	137692	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325284394
71	NC_015162	CCCAGC	2	12	138447	138458	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	325284394
72	NC_015162	CCCTGG	2	12	138525	138536	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	325284395
73	NC_015162	AGCTAC	2	12	139565	139576	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325284395
74	NC_015162	ATTGCC	2	12	140149	140160	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325284396
75	NC_015162	GCCAAC	2	12	141779	141790	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325284399
76	NC_015162	ACCATC	2	12	144823	144834	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	325284401
77	NC_015162	GCACCT	2	12	151157	151168	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325284409
78	NC_015162	AGCGGC	2	12	151565	151576	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325284409
79	NC_015162	CTGGTG	2	12	155181	155192	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	325284412
80	NC_015162	CCTCAC	3	18	155689	155706	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	325284413
81	NC_015162	CTTCGT	2	12	159588	159599	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	325284418
82	NC_015162	GCAGCG	2	12	162824	162835	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325284420
83	NC_015162	ATCCAC	2	12	162997	163008	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	325284420
84	NC_015162	CAGGAA	2	12	164500	164511	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	325284422
85	NC_015162	CCTGAC	2	12	164714	164725	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325284423
86	NC_015162	AGCGGC	2	12	164943	164954	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325284423
87	NC_015162	CAGGTG	2	12	165513	165524	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325284423
88	NC_015162	ATGGCG	2	12	166380	166391	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325284424
89	NC_015162	CGCACC	2	12	166475	166486	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_015162	TACGGA	2	12	166858	166869	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015162	CCCCGC	2	12	171443	171454	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
92	NC_015162	CCTTTT	2	12	171558	171569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015162	CAGCCA	2	12	175043	175054	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	325284436
94	NC_015162	GTCGTG	2	12	175144	175155	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	325284436
95	NC_015162	GCGTCA	2	12	176165	176176	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	325284436
96	NC_015162	GTGGTC	2	12	176587	176598	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	325284436
97	NC_015162	GGTCAT	2	12	179463	179474	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325284439
98	NC_015162	GAACAT	2	12	179505	179516	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	325284439
99	NC_015162	AGAGGA	2	12	186145	186156	50 %	0 %	50 %	0 %	325284442
100	NC_015162	ACCGGC	2	12	186949	186960	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	325284443
101	NC_015162	CGTCAC	2	12	189038	189049	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325284445
102	NC_015162	CACCCT	2	12	189110	189121	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	325284445
103	NC_015162	CGGGCG	2	12	193207	193218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325284450
104	NC_015162	CAGCTC	2	12	193484	193495	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	325284451
105	NC_015162	GGGCCA	2	12	194520	194531	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	325284453

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.