MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP chromosome

Total Repeats: 2186

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015161	TGAGA	2	10	1734	1743	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015161	CTGAA	2	10	2587	2596	40 %	20 %	20 %	20 %	325282257
3	NC_015161	AGGTG	2	10	2789	2798	20 %	20 %	60 %	0 %	325282257
4	NC_015161	GCGCT	2	10	4077	4086	0 %	20 %	40 %	40 %	325282258
5	NC_015161	GCGGA	2	10	6432	6441	20 %	0 %	60 %	20 %	325282259
6	NC_015161	TGTCA	2	10	8033	8042	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015161	GCCGC	2	10	9339	9348	0 %	0 %	40 %	60 %	325282263
8	NC_015161	CTGGG	2	10	9951	9960	0 %	20 %	60 %	20 %	325282264
9	NC_015161	GCGCC	2	10	10410	10419	0 %	0 %	40 %	60 %	325282264
10	NC_015161	CGGCG	2	10	10585	10594	0 %	0 %	60 %	40 %	325282265
11	NC_015161	GCGCC	2	10	10978	10987	0 %	0 %	40 %	60 %	325282265
12	NC_015161	GGGCC	2	10	12270	12279	0 %	0 %	60 %	40 %	325282267
13	NC_015161	CAGGC	2	10	14737	14746	20 %	0 %	40 %	40 %	325282270
14	NC_015161	CAGGC	2	10	16081	16090	20 %	0 %	40 %	40 %	325282271
15	NC_015161	CTGCG	2	10	18062	18071	0 %	20 %	40 %	40 %	325282274
16	NC_015161	AGCCC	2	10	18268	18277	20 %	0 %	20 %	60 %	325282274
17	NC_015161	CAGCG	2	10	19533	19542	20 %	0 %	40 %	40 %	325282275
18	NC_015161	GCGGG	2	10	19563	19572	0 %	0 %	80 %	20 %	325282275
19	NC_015161	CAGCA	2	10	21174	21183	40 %	0 %	20 %	40 %	325282277
20	NC_015161	GCGGT	2	10	22875	22884	0 %	20 %	60 %	20 %	325282279
21	NC_015161	AGAGG	2	10	23116	23125	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015161	TCCCA	2	10	23697	23706	20 %	20 %	0 %	60 %	325282280
23	NC_015161	GGGTC	2	10	24889	24898	0 %	20 %	60 %	20 %	325282281
24	NC_015161	TCGTG	2	10	26718	26727	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015161	AGGGT	2	10	27409	27418	20 %	20 %	60 %	0 %	325282282
26	NC_015161	CTGGC	2	10	28396	28405	0 %	20 %	40 %	40 %	325282282
27	NC_015161	GCCGC	2	10	29783	29792	0 %	0 %	40 %	60 %	325282284
28	NC_015161	GGGTC	2	10	30289	30298	0 %	20 %	60 %	20 %	325282284
29	NC_015161	CCGGC	2	10	30689	30698	0 %	0 %	40 %	60 %	325282285
30	NC_015161	CGGCG	2	10	30916	30925	0 %	0 %	60 %	40 %	325282285
31	NC_015161	GCCAG	2	10	30995	31004	20 %	0 %	40 %	40 %	325282285
32	NC_015161	GGCAG	2	10	31636	31645	20 %	0 %	60 %	20 %	325282285
33	NC_015161	CAGGG	2	10	31707	31716	20 %	0 %	60 %	20 %	325282285
34	NC_015161	CTGCC	2	10	31828	31837	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_015161	CGGCG	2	10	32796	32805	0 %	0 %	60 %	40 %	325282286
36	NC_015161	GAGCG	2	10	36698	36707	20 %	0 %	60 %	20 %	325282289
37	NC_015161	GCGCC	2	10	36724	36733	0 %	0 %	40 %	60 %	325282289
38	NC_015161	CCAGT	2	10	36895	36904	20 %	20 %	20 %	40 %	325282289
39	NC_015161	AGGCC	2	10	37078	37087	20 %	0 %	40 %	40 %	325282289
40	NC_015161	GGGCG	2	10	37624	37633	0 %	0 %	80 %	20 %	325282289
41	NC_015161	GCCGC	2	10	38556	38565	0 %	0 %	40 %	60 %	325282290
42	NC_015161	GGTCG	2	10	38805	38814	0 %	20 %	60 %	20 %	325282290
43	NC_015161	CGGCC	2	10	38918	38927	0 %	0 %	40 %	60 %	325282290
44	NC_015161	CCAGC	2	10	38928	38937	20 %	0 %	20 %	60 %	325282290
45	NC_015161	GGGCC	2	10	40279	40288	0 %	0 %	60 %	40 %	325282292
46	NC_015161	CGGGC	2	10	40350	40359	0 %	0 %	60 %	40 %	325282292
47	NC_015161	CCGCC	2	10	41246	41255	0 %	0 %	20 %	80 %	325282292
48	NC_015161	GCGGG	2	10	41328	41337	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015161	GAGCG	2	10	42586	42595	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_015161	TTACT	2	10	46268	46277	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015161	GCAGA	2	10	47168	47177	40 %	0 %	40 %	20 %	325282294
52	NC_015161	GAAAG	2	10	48287	48296	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015161	GGGCA	2	10	49064	49073	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015161	AGGAA	2	10	53059	53068	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015161	CGCCA	2	10	55090	55099	20 %	0 %	20 %	60 %	325282303
56	NC_015161	TGGCC	2	10	55383	55392	0 %	20 %	40 %	40 %	325282303
57	NC_015161	TCGGC	2	10	55829	55838	0 %	20 %	40 %	40 %	325282303
58	NC_015161	CAGGG	2	10	56449	56458	20 %	0 %	60 %	20 %	325282304
59	NC_015161	CGGCC	2	10	56830	56839	0 %	0 %	40 %	60 %	325282304
60	NC_015161	GGCGC	2	10	57239	57248	0 %	0 %	60 %	40 %	325282304
61	NC_015161	GCTGG	2	10	57772	57781	0 %	20 %	60 %	20 %	325282305
62	NC_015161	CGCGG	2	10	59286	59295	0 %	0 %	60 %	40 %	325282306
63	NC_015161	GTTGG	2	10	60806	60815	0 %	40 %	60 %	0 %	325282309
64	NC_015161	CAGTG	2	10	61226	61235	20 %	20 %	40 %	20 %	325282310
65	NC_015161	ATGAT	2	10	61827	61836	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015161	TCCAC	2	10	63451	63460	20 %	20 %	0 %	60 %	325282313
67	NC_015161	TGCCG	2	10	63865	63874	0 %	20 %	40 %	40 %	325282313
68	NC_015161	CAGGT	2	10	64538	64547	20 %	20 %	40 %	20 %	325282314
69	NC_015161	CGCGC	2	10	66682	66691	0 %	0 %	40 %	60 %	325282315
70	NC_015161	GCCGC	2	10	66923	66932	0 %	0 %	40 %	60 %	325282315
71	NC_015161	AAGCC	2	10	67689	67698	40 %	0 %	20 %	40 %	325282316
72	NC_015161	GCCGC	2	10	69139	69148	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
73	NC_015161	GCAGG	2	10	69662	69671	20 %	0 %	60 %	20 %	325282318
74	NC_015161	GCGAC	2	10	70406	70415	20 %	0 %	40 %	40 %	325282319
75	NC_015161	TACCA	2	10	70888	70897	40 %	20 %	0 %	40 %	325282319
76	NC_015161	CCATC	2	10	71405	71414	20 %	20 %	0 %	60 %	325282320
77	NC_015161	GGCGC	2	10	72683	72692	0 %	0 %	60 %	40 %	325282321
78	NC_015161	TTCTT	2	10	75844	75853	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_015161	GGCCG	2	10	76913	76922	0 %	0 %	60 %	40 %	325282323
80	NC_015161	GTGCC	2	10	77323	77332	0 %	20 %	40 %	40 %	325282324
81	NC_015161	GCCCG	2	10	78561	78570	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
82	NC_015161	GCGCG	2	10	79012	79021	0 %	0 %	60 %	40 %	325282325
83	NC_015161	GGGGT	2	10	79317	79326	0 %	20 %	80 %	0 %	325282325
84	NC_015161	CCGCG	2	10	80634	80643	0 %	0 %	40 %	60 %	325282326
85	NC_015161	GCCGC	2	10	80851	80860	0 %	0 %	40 %	60 %	325282327
86	NC_015161	CCGCG	2	10	80901	80910	0 %	0 %	40 %	60 %	325282327
87	NC_015161	GCCCG	2	10	82182	82191	0 %	0 %	40 %	60 %	325282328
88	NC_015161	GGCCC	2	10	82876	82885	0 %	0 %	40 %	60 %	325282329
89	NC_015161	CTGAG	2	10	83286	83295	20 %	20 %	40 %	20 %	325282329
90	NC_015161	ACCAC	2	10	83367	83376	40 %	0 %	0 %	60 %	325282329
91	NC_015161	TTCTG	2	10	83969	83978	0 %	60 %	20 %	20 %	325282330
92	NC_015161	GTGCG	2	10	84632	84641	0 %	20 %	60 %	20 %	325282331
93	NC_015161	CGGGC	2	10	85925	85934	0 %	0 %	60 %	40 %	325282331
94	NC_015161	GGCGC	2	10	86383	86392	0 %	0 %	60 %	40 %	325282331
95	NC_015161	CAGCC	2	10	86480	86489	20 %	0 %	20 %	60 %	325282331
96	NC_015161	GCCTG	2	10	86597	86606	0 %	20 %	40 %	40 %	325282331
97	NC_015161	GCCGA	2	10	86770	86779	20 %	0 %	40 %	40 %	325282331
98	NC_015161	GGCTT	2	10	87116	87125	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015161	CGGGC	2	10	89294	89303	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
100	NC_015161	CAAGC	2	10	89710	89719	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_015161	GCGCC	2	10	91503	91512	0 %	0 %	40 %	60 %	325282335
102	NC_015161	GGGCG	2	10	92631	92640	0 %	0 %	80 %	20 %	325282335
103	NC_015161	GTGTG	2	10	95270	95279	0 %	40 %	60 %	0 %	325282338
104	NC_015161	TTTGC	2	10	96997	97006	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_015161	CCGTA	2	10	97426	97435	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_015161	AATTG	2	10	97806	97815	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015161	GAAGC	2	10	100232	100241	40 %	0 %	40 %	20 %	325282339
108	NC_015161	CTGAC	2	10	103647	103656	20 %	20 %	20 %	40 %	325282341
109	NC_015161	CATGC	2	10	106209	106218	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_015161	GTCCC	2	10	107542	107551	0 %	20 %	20 %	60 %	325282345
111	NC_015161	GGGCG	2	10	108069	108078	0 %	0 %	80 %	20 %	325282345
112	NC_015161	TACGG	2	10	108631	108640	20 %	20 %	40 %	20 %	325282346
113	NC_015161	CCTGC	2	10	109655	109664	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
114	NC_015161	TCGCC	2	10	111552	111561	0 %	20 %	20 %	60 %	325282349
115	NC_015161	AGCGC	2	10	111639	111648	20 %	0 %	40 %	40 %	325282349
116	NC_015161	GCAGC	2	10	111691	111700	20 %	0 %	40 %	40 %	325282349
117	NC_015161	CGACC	2	10	112108	112117	20 %	0 %	20 %	60 %	325282349
118	NC_015161	GCCGC	2	10	112122	112131	0 %	0 %	40 %	60 %	325282349
119	NC_015161	CCTGG	2	10	112542	112551	0 %	20 %	40 %	40 %	325282349
120	NC_015161	GCCCA	2	10	112823	112832	20 %	0 %	20 %	60 %	325282349
121	NC_015161	CCCAG	2	10	114506	114515	20 %	0 %	20 %	60 %	325282351
122	NC_015161	AGGCT	2	10	114924	114933	20 %	20 %	40 %	20 %	325282352
123	NC_015161	GTCCA	2	10	115759	115768	20 %	20 %	20 %	40 %	325282353
124	NC_015161	GCTGC	2	10	118781	118790	0 %	20 %	40 %	40 %	325282356
125	NC_015161	AGGGC	2	10	120170	120179	20 %	0 %	60 %	20 %	325282358
126	NC_015161	ACTGG	2	10	120354	120363	20 %	20 %	40 %	20 %	325282359
127	NC_015161	GTCGC	2	10	120959	120968	0 %	20 %	40 %	40 %	325282360
128	NC_015161	GGGCA	2	10	121723	121732	20 %	0 %	60 %	20 %	325282361
129	NC_015161	GGCTG	2	10	123316	123325	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_015161	GGGCT	2	10	123711	123720	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
131	NC_015161	CGGCG	2	10	126888	126897	0 %	0 %	60 %	40 %	325282367
132	NC_015161	GGCGA	2	10	128398	128407	20 %	0 %	60 %	20 %	325282369
133	NC_015161	GGCGG	2	10	128916	128925	0 %	0 %	80 %	20 %	325282370
134	NC_015161	CAGAG	2	10	130292	130301	40 %	0 %	40 %	20 %	325282371
135	NC_015161	CCCAA	2	10	130425	130434	40 %	0 %	0 %	60 %	325282371
136	NC_015161	TATTC	2	10	131137	131146	20 %	60 %	0 %	20 %	325282371
137	NC_015161	ACAGG	2	10	131258	131267	40 %	0 %	40 %	20 %	325282371
138	NC_015161	ACTGC	2	10	133068	133077	20 %	20 %	20 %	40 %	325282374
139	NC_015161	CGCTG	2	10	133881	133890	0 %	20 %	40 %	40 %	325282375
140	NC_015161	CCGCG	2	10	134862	134871	0 %	0 %	40 %	60 %	325282375
141	NC_015161	TGGCC	2	10	134985	134994	0 %	20 %	40 %	40 %	325282375
142	NC_015161	GCGCC	2	10	136936	136945	0 %	0 %	40 %	60 %	325282377
143	NC_015161	GCGTT	2	10	137709	137718	0 %	40 %	40 %	20 %	325282379
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146	NC_015161	CGCGG	3	15	138061	138075	0 %	0 %	60 %	40 %	325282379
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148	NC_015161	TCCAG	2	10	139279	139288	20 %	20 %	20 %	40 %	325282380
149	NC_015161	CGGCG	2	10	139855	139864	0 %	0 %	60 %	40 %	325282381
150	NC_015161	GGGCC	2	10	140504	140513	0 %	0 %	60 %	40 %	325282382
151	NC_015161	CGCAG	2	10	141377	141386	20 %	0 %	40 %	40 %	325282382
152	NC_015161	GCCCC	2	10	141496	141505	0 %	0 %	20 %	80 %	325282382
153	NC_015161	ACCAC	2	10	144389	144398	40 %	0 %	0 %	60 %	325282385
154	NC_015161	TGTGC	2	10	145751	145760	0 %	40 %	40 %	20 %	325282386
155	NC_015161	GAGCG	2	10	148407	148416	20 %	0 %	60 %	20 %	325282390
156	NC_015161	CTCAT	2	10	149402	149411	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
157	NC_015161	AGGCC	2	10	150433	150442	20 %	0 %	40 %	40 %	325282393
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160	NC_015161	GCGCC	2	10	151552	151561	0 %	0 %	40 %	60 %	325282394
161	NC_015161	GCCGG	2	10	152187	152196	0 %	0 %	60 %	40 %	325282395
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167	NC_015161	GCTGC	2	10	155646	155655	0 %	20 %	40 %	40 %	325282399
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169	NC_015161	CGGCA	2	10	157241	157250	20 %	0 %	40 %	40 %	325282399
170	NC_015161	CAGTG	2	10	159793	159802	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
171	NC_015161	GCCGC	2	10	161959	161968	0 %	0 %	40 %	60 %	325282402
172	NC_015161	GCAGC	2	10	162045	162054	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
173	NC_015161	AGCCC	2	10	163339	163348	20 %	0 %	20 %	60 %	325282404
174	NC_015161	CGCTG	2	10	163480	163489	0 %	20 %	40 %	40 %	325282404
175	NC_015161	GGGCC	2	10	163644	163653	0 %	0 %	60 %	40 %	325282404
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179	NC_015161	GCCGC	2	10	169646	169655	0 %	0 %	40 %	60 %	325282411
180	NC_015161	TGGCC	2	10	170634	170643	0 %	20 %	40 %	40 %	325282411
181	NC_015161	GCAGA	2	10	170994	171003	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
182	NC_015161	TTTGC	2	10	172343	172352	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
183	NC_015161	CCGTA	2	10	172772	172781	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
184	NC_015161	AATTG	2	10	173152	173161	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_015161	GGCGG	2	10	175197	175206	0 %	0 %	80 %	20 %	325282412
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188	NC_015161	GCTGG	2	10	176901	176910	0 %	20 %	60 %	20 %	325282413
189	NC_015161	TAGTG	2	10	177342	177351	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_015161	GGCTG	2	10	186019	186028	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
198	NC_015161	CGGGG	2	10	186591	186600	0 %	0 %	80 %	20 %	325282421
199	NC_015161	CGGCG	2	10	188309	188318	0 %	0 %	60 %	40 %	325282423
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214	NC_015161	CTGGG	2	10	196493	196502	0 %	20 %	60 %	20 %	325282430
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249	NC_015161	CGGCG	2	10	229858	229867	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
250	NC_015161	CTGGC	2	10	230315	230324	0 %	20 %	40 %	40 %	325282466
251	NC_015161	CACTG	2	10	230409	230418	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
252	NC_015161	CGCAC	2	10	231273	231282	20 %	0 %	20 %	60 %	325282467
253	NC_015161	TGGCC	2	10	231756	231765	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
254	NC_015161	CCCTG	2	10	234459	234468	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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270	NC_015161	ATTCC	2	10	245970	245979	20 %	40 %	0 %	40 %	325282471
271	NC_015161	GCCGC	2	10	247683	247692	0 %	0 %	40 %	60 %	325282474
272	NC_015161	TGGTG	2	10	247830	247839	0 %	40 %	60 %	0 %	325282474
273	NC_015161	GCGCC	2	10	247870	247879	0 %	0 %	40 %	60 %	325282474
274	NC_015161	ACCCC	2	10	248073	248082	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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284	NC_015161	GCACC	2	10	253702	253711	20 %	0 %	20 %	60 %	325282481
285	NC_015161	TGCGC	2	10	256935	256944	0 %	20 %	40 %	40 %	325282484
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289	NC_015161	TGACC	2	10	261649	261658	20 %	20 %	20 %	40 %	325282488
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295	NC_015161	CTGAC	2	10	268532	268541	20 %	20 %	20 %	40 %	325282494
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297	NC_015161	GGGCT	2	10	269108	269117	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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302	NC_015161	CTGGA	2	10	273309	273318	20 %	20 %	40 %	20 %	325282501
303	NC_015161	GCCGG	2	10	274745	274754	0 %	0 %	60 %	40 %	325282501
304	NC_015161	AGCTC	2	10	275505	275514	20 %	20 %	20 %	40 %	325282503
305	NC_015161	GCCGC	2	10	275581	275590	0 %	0 %	40 %	60 %	325282503
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373	NC_015161	CGCTC	2	10	343309	343318	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
374	NC_015161	CGTCC	2	10	344261	344270	0 %	20 %	20 %	60 %	325282568
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