MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Deinococcus proteolyticus MRP chromosome

Total Repeats: 53264

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015161	CCGG	2	8	125828	125835	0 %	0 %	50 %	50 %	325282366
3002	NC_015161	TGG	2	6	125842	125847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282366
3003	NC_015161	CGC	2	6	125848	125853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282366
3004	NC_015161	CCGCGC	2	12	125868	125879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282366
3005	NC_015161	GCG	2	6	125942	125947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282366
3006	NC_015161	GC	3	6	125958	125963	0 %	0 %	50 %	50 %	325282366
3007	NC_015161	CGC	2	6	125991	125996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282366
3008	NC_015161	CTG	3	9	126001	126009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282366
3009	NC_015161	ACC	3	9	126034	126042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325282366
3010	NC_015161	TGC	2	6	126062	126067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282366
3011	NC_015161	GTG	2	6	126094	126099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282366
3012	NC_015161	GTG	2	6	126132	126137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282366
3013	NC_015161	GGT	2	6	126165	126170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282366
3014	NC_015161	GCC	2	6	126172	126177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282366
3015	NC_015161	CGC	2	6	126182	126187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282366
3016	NC_015161	CTGA	2	8	126280	126287	25 %	25 %	25 %	25 %	325282367
3017	NC_015161	TTC	2	6	126304	126309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325282367
3018	NC_015161	GTGC	2	8	126310	126317	0 %	25 %	50 %	25 %	325282367
3019	NC_015161	GCC	2	6	126322	126327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282367
3020	NC_015161	GTG	2	6	126355	126360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282367
3021	NC_015161	GTG	2	6	126370	126375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282367
3022	NC_015161	TGG	2	6	126464	126469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282367
3023	NC_015161	GGC	2	6	126480	126485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282367
3024	NC_015161	GCTG	2	8	126489	126496	0 %	25 %	50 %	25 %	325282367
3025	NC_015161	TGC	2	6	126590	126595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282367
3026	NC_015161	GCG	2	6	126691	126696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282367
3027	NC_015161	G	6	6	126706	126711	0 %	0 %	100 %	0 %	325282367
3028	NC_015161	CTG	3	9	126712	126720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282367
3029	NC_015161	TGC	2	6	126737	126742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282367
3030	NC_015161	AGC	2	6	126800	126805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282367
3031	NC_015161	TGC	2	6	126806	126811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282367
3032	NC_015161	TGG	3	9	126827	126835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282367
3033	NC_015161	TGG	2	6	126851	126856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282367
3034	NC_015161	CAC	2	6	126858	126863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325282367
3035	NC_015161	CTG	2	6	126877	126882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282367
3036	NC_015161	CGGCG	2	10	126888	126897	0 %	0 %	60 %	40 %	325282367
3037	NC_015161	GCG	4	12	126892	126903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282367
3038	NC_015161	GAT	2	6	126930	126935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325282367
3039	NC_015161	GCG	2	6	126965	126970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282367
3040	NC_015161	CGG	2	6	127004	127009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282367
3041	NC_015161	GGT	2	6	127020	127025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282367
3042	NC_015161	TGC	3	9	127049	127057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282367
3043	NC_015161	GGCTAG	2	12	127093	127104	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	325282367
3044	NC_015161	CTGC	2	8	127111	127118	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3045	NC_015161	GGC	2	6	127164	127169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282368
3046	NC_015161	T	6	6	127200	127205	0 %	100 %	0 %	0 %	325282368
3047	NC_015161	GCA	2	6	127218	127223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282368
3048	NC_015161	GGA	2	6	127275	127280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325282368
3049	NC_015161	CAT	2	6	127374	127379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325282368
3050	NC_015161	CGC	2	6	127380	127385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282368
3051	NC_015161	GCG	2	6	127420	127425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282368
3052	NC_015161	GCG	2	6	127457	127462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282368
3053	NC_015161	CGG	2	6	127524	127529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282368
3054	NC_015161	TCG	2	6	127544	127549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282368
3055	NC_015161	CGC	2	6	127635	127640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282368
3056	NC_015161	CTG	2	6	127642	127647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282368
3057	NC_015161	GGC	2	6	127683	127688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282368
3058	NC_015161	CCG	2	6	127747	127752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282368
3059	NC_015161	GCA	2	6	127856	127861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282369
3060	NC_015161	AGC	2	6	127961	127966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282369
3061	NC_015161	GCC	2	6	127985	127990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282369
3062	NC_015161	GCT	2	6	128028	128033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282369
3063	NC_015161	GCG	3	9	128068	128076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282369
3064	NC_015161	GCT	2	6	128084	128089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282369
3065	NC_015161	GCC	2	6	128125	128130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282369
3066	NC_015161	GGA	2	6	128148	128153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325282369
3067	NC_015161	ACC	2	6	128173	128178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325282369
3068	NC_015161	TGG	2	6	128186	128191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282369
3069	NC_015161	AGCG	2	8	128200	128207	25 %	0 %	50 %	25 %	325282369
3070	NC_015161	CTG	2	6	128236	128241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282369
3071	NC_015161	CGC	2	6	128329	128334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282369
3072	NC_015161	GAG	2	6	128335	128340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325282369
3073	NC_015161	CGC	2	6	128352	128357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282369
3074	NC_015161	CTG	2	6	128383	128388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282369
3075	NC_015161	GGCGA	2	10	128398	128407	20 %	0 %	60 %	20 %	325282369
3076	NC_015161	CGA	2	6	128427	128432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282369
3077	NC_015161	GCC	2	6	128463	128468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282369
3078	NC_015161	CAGG	2	8	128533	128540	25 %	0 %	50 %	25 %	325282369
3079	NC_015161	GCCG	2	8	128571	128578	0 %	0 %	50 %	50 %	325282369
3080	NC_015161	GCC	2	6	128611	128616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282369
3081	NC_015161	CGC	2	6	128631	128636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282369
3082	NC_015161	CCG	2	6	128663	128668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282369
3083	NC_015161	GA	3	6	128720	128725	50 %	0 %	50 %	0 %	325282369
3084	NC_015161	GA	3	6	128758	128763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_015161	TGG	2	6	128788	128793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_015161	CAGC	2	8	128860	128867	25 %	0 %	25 %	50 %	325282370
3087	NC_015161	GGCGG	2	10	128916	128925	0 %	0 %	80 %	20 %	325282370
3088	NC_015161	GCG	3	9	128959	128967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282370
3089	NC_015161	GTG	2	6	129028	129033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282370
3090	NC_015161	GCA	3	9	129054	129062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282370
3091	NC_015161	GAT	2	6	129103	129108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325282370
3092	NC_015161	GCA	2	6	129114	129119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282370
3093	NC_015161	GCC	2	6	129152	129157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282370
3094	NC_015161	CG	3	6	129158	129163	0 %	0 %	50 %	50 %	325282370
3095	NC_015161	GCT	3	9	129178	129186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282370
3096	NC_015161	CTT	2	6	129192	129197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325282370
3097	NC_015161	GGC	2	6	129240	129245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282370
3098	NC_015161	TTGCGG	2	12	129272	129283	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	325282370
3099	NC_015161	GCCA	2	8	129284	129291	25 %	0 %	25 %	50 %	325282370
3100	NC_015161	CCG	2	6	129306	129311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282370
3101	NC_015161	CAG	3	9	129319	129327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282370
3102	NC_015161	CTC	3	9	129352	129360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325282370
3103	NC_015161	GTC	2	6	129376	129381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282370
3104	NC_015161	CGT	2	6	129396	129401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282370
3105	NC_015161	AAT	2	6	129544	129549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_015161	ATG	2	6	129557	129562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_015161	TGATTG	2	12	129591	129602	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	325282371
3108	NC_015161	TGT	2	6	129615	129620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325282371
3109	NC_015161	GGC	2	6	129625	129630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282371
3110	NC_015161	ACG	2	6	129674	129679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282371
3111	NC_015161	GTCA	2	8	129758	129765	25 %	25 %	25 %	25 %	325282371
3112	NC_015161	TTC	2	6	129790	129795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325282371
3113	NC_015161	GAG	2	6	129800	129805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325282371
3114	NC_015161	ACAT	2	8	130046	130053	50 %	25 %	0 %	25 %	325282371
3115	NC_015161	CAG	2	6	130084	130089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282371
3116	NC_015161	CAGG	2	8	130119	130126	25 %	0 %	50 %	25 %	325282371
3117	NC_015161	CAT	2	6	130210	130215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325282371
3118	NC_015161	G	7	7	130234	130240	0 %	0 %	100 %	0 %	325282371
3119	NC_015161	GC	3	6	130278	130283	0 %	0 %	50 %	50 %	325282371
3120	NC_015161	CAGAG	2	10	130292	130301	40 %	0 %	40 %	20 %	325282371
3121	NC_015161	CG	3	6	130305	130310	0 %	0 %	50 %	50 %	325282371
3122	NC_015161	CCA	2	6	130320	130325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325282371
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3237	NC_015161	GCG	2	6	135379	135384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282375
3238	NC_015161	GAA	2	6	135443	135448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3239	NC_015161	GGC	2	6	135453	135458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3240	NC_015161	GCC	2	6	135475	135480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3241	NC_015161	CTG	2	6	135481	135486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3243	NC_015161	CTG	2	6	135548	135553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282376
3244	NC_015161	TTC	2	6	135587	135592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325282376
3245	NC_015161	CGG	2	6	135628	135633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282376
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3247	NC_015161	CGC	2	6	135717	135722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282376
3248	NC_015161	TCG	2	6	135750	135755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282376
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3250	NC_015161	TGGCCG	2	12	135835	135846	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	325282376
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3252	NC_015161	CGG	3	9	135883	135891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282376
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3257	NC_015161	GCA	2	6	136084	136089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282376
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3267	NC_015161	CAC	2	6	136689	136694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325282377
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3272	NC_015161	CTT	2	6	136880	136885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325282377
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3278	NC_015161	CCA	2	6	137109	137114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3279	NC_015161	CGT	2	6	137168	137173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3280	NC_015161	GAC	2	6	137256	137261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282378
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3322	NC_015161	C	8	8	138730	138737	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3323	NC_015161	CGC	2	6	138871	138876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282380
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3347	NC_015161	GGGC	2	8	139525	139532	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3348	NC_015161	CAC	2	6	139568	139573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325282381
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3350	NC_015161	ATG	2	6	139647	139652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325282381
3351	NC_015161	CAG	3	9	139676	139684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282381
3352	NC_015161	GC	3	6	139737	139742	0 %	0 %	50 %	50 %	325282381
3353	NC_015161	GAT	2	6	139796	139801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325282381
3354	NC_015161	AGT	2	6	139804	139809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325282381
3355	NC_015161	CGGCG	2	10	139855	139864	0 %	0 %	60 %	40 %	325282381
3356	NC_015161	TTTG	2	8	139915	139922	0 %	75 %	25 %	0 %	325282381
3357	NC_015161	CGG	2	6	140001	140006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3358	NC_015161	G	6	6	140018	140023	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3359	NC_015161	CCG	2	6	140025	140030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3360	NC_015161	GGTGAG	2	12	140109	140120	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3361	NC_015161	CGG	2	6	140121	140126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3362	NC_015161	CCAG	2	8	140142	140149	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3363	NC_015161	CT	3	6	140158	140163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3364	NC_015161	CGC	2	6	140178	140183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3365	NC_015161	GCT	2	6	140189	140194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282382
3366	NC_015161	TCC	2	6	140227	140232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325282382
3367	NC_015161	GCCG	2	8	140249	140256	0 %	0 %	50 %	50 %	325282382
3368	NC_015161	GCG	2	6	140265	140270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282382
3369	NC_015161	GCA	2	6	140276	140281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282382
3370	NC_015161	CGC	2	6	140330	140335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282382
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3372	NC_015161	CGG	2	6	140402	140407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282382
3373	NC_015161	GCT	2	6	140430	140435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282382
3374	NC_015161	GGC	2	6	140446	140451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282382
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3382	NC_015161	CTG	2	6	140637	140642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325282382
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3423	NC_015161	GCG	2	6	142379	142384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3424	NC_015161	AGC	2	6	142389	142394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3426	NC_015161	CCG	2	6	142463	142468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3427	NC_015161	G	6	6	142479	142484	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3428	NC_015161	GCTGGC	2	12	142524	142535	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3429	NC_015161	TGCC	2	8	142614	142621	0 %	25 %	25 %	50 %	325282384
3430	NC_015161	CGC	2	6	142671	142676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282384
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3433	NC_015161	GCC	2	6	142822	142827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282384
3434	NC_015161	CGG	2	6	142828	142833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282384
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3436	NC_015161	GCC	2	6	142880	142885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282384
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3438	NC_015161	GCA	2	6	142953	142958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282384
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3483	NC_015161	GAG	2	6	144660	144665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3484	NC_015161	GCG	2	6	144724	144729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3485	NC_015161	TGG	2	6	144805	144810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282386
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3487	NC_015161	GGC	2	6	144846	144851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325282386
3488	NC_015161	CCG	2	6	145115	145120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282386
3489	NC_015161	CAC	2	6	145133	145138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325282386
3490	NC_015161	GC	3	6	145169	145174	0 %	0 %	50 %	50 %	325282386
3491	NC_015161	GTG	3	9	145236	145244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282386
3492	NC_015161	CGC	2	6	145261	145266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282386
3493	NC_015161	GCC	2	6	145310	145315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282386
3494	NC_015161	CGA	2	6	145334	145339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325282386
3495	NC_015161	GCCA	2	8	145341	145348	25 %	0 %	25 %	50 %	325282386
3496	NC_015161	GCC	2	6	145491	145496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325282386
3497	NC_015161	TGG	2	6	145537	145542	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325282386
3498	NC_015161	TCT	3	9	145630	145638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325282386
3499	NC_015161	AAG	2	6	145647	145652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325282386
3500	NC_015161	TGTGC	2	10	145751	145760	0 %	40 %	40 %	20 %	325282386

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