MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfovibrio aespoeensis Aspo-2 chromosome

Total Repeats: 78861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014844	CCA	2	6	168095	168100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317151874
3502	NC_014844	CTGCC	2	10	168119	168128	0 %	20 %	20 %	60 %	317151874
3503	NC_014844	A	7	7	168133	168139	100 %	0 %	0 %	0 %	317151874
3504	NC_014844	CCA	2	6	168185	168190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317151874
3505	NC_014844	CCCG	2	8	168246	168253	0 %	0 %	25 %	75 %	317151874
3506	NC_014844	GCC	2	6	168298	168303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151874
3507	NC_014844	TGG	2	6	168304	168309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317151874
3508	NC_014844	GAA	2	6	168333	168338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317151874
3509	NC_014844	AGC	2	6	168355	168360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151874
3510	NC_014844	CCG	2	6	168361	168366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151874
3511	NC_014844	GCG	2	6	168380	168385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317151874
3512	NC_014844	CCG	2	6	168447	168452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151874
3513	NC_014844	TGC	2	6	168482	168487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317151874
3514	NC_014844	CTG	2	6	168488	168493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317151874
3515	NC_014844	TGA	2	6	168521	168526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317151874
3516	NC_014844	GAA	2	6	168606	168611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317151874
3517	NC_014844	CGC	2	6	168698	168703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151874
3518	NC_014844	TGG	2	6	168788	168793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317151874
3519	NC_014844	CTC	2	6	168825	168830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_014844	GGCG	2	8	168960	168967	0 %	0 %	75 %	25 %	317151875
3521	NC_014844	GC	3	6	169021	169026	0 %	0 %	50 %	50 %	317151875
3522	NC_014844	CGG	2	6	169071	169076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317151875
3523	NC_014844	CAT	2	6	169114	169119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317151875
3524	NC_014844	CGT	2	6	169167	169172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317151875
3525	NC_014844	CCA	2	6	169203	169208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317151875
3526	NC_014844	GGGT	2	8	169217	169224	0 %	25 %	75 %	0 %	317151875
3527	NC_014844	GGT	2	6	169234	169239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317151875
3528	NC_014844	GC	3	6	169293	169298	0 %	0 %	50 %	50 %	317151875
3529	NC_014844	GT	3	6	169354	169359	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_014844	GCG	2	6	169398	169403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_014844	GTGGCC	2	12	169438	169449	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	317151876
3532	NC_014844	GCC	2	6	169453	169458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151876
3533	NC_014844	GGT	3	9	169617	169625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317151876
3534	NC_014844	CG	3	6	169631	169636	0 %	0 %	50 %	50 %	317151876
3535	NC_014844	TGCC	2	8	169643	169650	0 %	25 %	25 %	50 %	317151876
3536	NC_014844	TCG	2	6	169672	169677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317151876
3537	NC_014844	CCTCGA	2	12	169775	169786	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	317151876
3538	NC_014844	GCA	2	6	169827	169832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151876
3539	NC_014844	ACCGT	2	10	169925	169934	20 %	20 %	20 %	40 %	317151877
3540	NC_014844	GTC	2	6	169939	169944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317151877
3541	NC_014844	AGT	2	6	170079	170084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317151877
3542	NC_014844	CG	3	6	170223	170228	0 %	0 %	50 %	50 %	317151877
3543	NC_014844	GAG	2	6	170293	170298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317151877
3544	NC_014844	CGGG	2	8	170361	170368	0 %	0 %	75 %	25 %	317151877
3545	NC_014844	GCC	2	6	170440	170445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151877
3546	NC_014844	GCC	2	6	170450	170455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151877
3547	NC_014844	ATG	2	6	170483	170488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317151877
3548	NC_014844	GCA	2	6	170490	170495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151877
3549	NC_014844	CCGGG	2	10	170517	170526	0 %	0 %	60 %	40 %	317151877
3550	NC_014844	CCCG	2	8	170577	170584	0 %	0 %	25 %	75 %	317151877
3551	NC_014844	TGG	2	6	170640	170645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317151877
3552	NC_014844	CCA	2	6	170680	170685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_014844	GGCA	2	8	170797	170804	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3554	NC_014844	GCC	3	9	170811	170819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_014844	CGC	2	6	170847	170852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_014844	AAT	2	6	170853	170858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_014844	A	6	6	170868	170873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_014844	CAG	2	6	170899	170904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_014844	GAT	2	6	170944	170949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317151878
3560	NC_014844	TTG	2	6	170975	170980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317151878
3561	NC_014844	GGC	2	6	171067	171072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317151878
3562	NC_014844	TGG	2	6	171125	171130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317151878
3563	NC_014844	CG	3	6	171224	171229	0 %	0 %	50 %	50 %	317151878
3564	NC_014844	GGCT	2	8	171239	171246	0 %	25 %	50 %	25 %	317151878
3565	NC_014844	TGTGC	2	10	171311	171320	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3566	NC_014844	CGA	2	6	171397	171402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_014844	CG	3	6	171409	171414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3568	NC_014844	CGA	2	6	171418	171423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_014844	CGG	2	6	171450	171455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_014844	GTC	2	6	171495	171500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_014844	AATTA	2	10	171513	171522	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_014844	A	7	7	171570	171576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_014844	CAG	2	6	171595	171600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_014844	TCC	2	6	171680	171685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317151879
3575	NC_014844	CG	3	6	171797	171802	0 %	0 %	50 %	50 %	317151879
3576	NC_014844	GCAG	2	8	171861	171868	25 %	0 %	50 %	25 %	317151879
3577	NC_014844	CGC	2	6	171876	171881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151879
3578	NC_014844	TGTCGG	2	12	171921	171932	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	317151879
3579	NC_014844	TGA	2	6	171933	171938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317151879
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3581	NC_014844	GCCGTC	2	12	171952	171963	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	317151879
3582	NC_014844	CAC	2	6	171964	171969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317151879
3583	NC_014844	GCC	2	6	171976	171981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317151879
3584	NC_014844	CGG	2	6	172005	172010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317151879
3585	NC_014844	TCG	3	9	172025	172033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317151879
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3587	NC_014844	CTT	2	6	172048	172053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317151879
3588	NC_014844	ATG	2	6	172058	172063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317151879
3589	NC_014844	GTA	2	6	172090	172095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317151879
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3591	NC_014844	TCA	2	6	172221	172226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317151879
3592	NC_014844	TCA	2	6	172239	172244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317151879
3593	NC_014844	CAC	2	6	172267	172272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317151879
3594	NC_014844	TTC	2	6	172289	172294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317151879
3595	NC_014844	TCC	2	6	172309	172314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3596	NC_014844	TG	3	6	172315	172320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_014844	GGCA	2	8	172345	172352	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3598	NC_014844	AT	3	6	172404	172409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_014844	CGC	2	6	172447	172452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_014844	GGCC	2	8	172475	172482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3601	NC_014844	AGT	2	6	172567	172572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_014844	GT	3	6	172583	172588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_014844	CG	3	6	172711	172716	0 %	0 %	50 %	50 %	317151880
3604	NC_014844	CGGCT	2	10	172751	172760	0 %	20 %	40 %	40 %	317151880
3605	NC_014844	GCG	3	9	172848	172856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317151880
3606	NC_014844	CAT	2	6	172876	172881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317151880
3607	NC_014844	GAC	2	6	172889	172894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151880
3608	NC_014844	TGC	2	6	172998	173003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317151880
3609	NC_014844	TGG	2	6	173007	173012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317151880
3610	NC_014844	AGG	2	6	173013	173018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317151880
3611	NC_014844	TGG	2	6	173031	173036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317151880
3612	NC_014844	CCT	2	6	173100	173105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317151880
3613	NC_014844	GAGACC	2	12	173114	173125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151880
3614	NC_014844	TGG	2	6	173139	173144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317151880
3615	NC_014844	TCT	2	6	173172	173177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317151880
3616	NC_014844	ACG	2	6	173184	173189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151880
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3619	NC_014844	GAG	2	6	173435	173440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317151880
3620	NC_014844	GC	3	6	173444	173449	0 %	0 %	50 %	50 %	317151880
3621	NC_014844	GGT	2	6	173491	173496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317151880
3622	NC_014844	CCAG	2	8	173500	173507	25 %	0 %	25 %	50 %	317151880
3623	NC_014844	GCT	2	6	173554	173559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317151880
3624	NC_014844	CGA	2	6	173575	173580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151880
3625	NC_014844	CGGGC	2	10	173645	173654	0 %	0 %	60 %	40 %	317151880
3626	NC_014844	ATCC	2	8	173692	173699	25 %	25 %	0 %	50 %	317151880
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3629	NC_014844	CAGC	2	8	173859	173866	25 %	0 %	25 %	50 %	317151881
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3632	NC_014844	GCG	2	6	174011	174016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317151881
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3636	NC_014844	CTG	2	6	174208	174213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317151881
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3645	NC_014844	TCG	2	6	174744	174749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317151881
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3648	NC_014844	GGC	2	6	174885	174890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317151881
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3656	NC_014844	ATC	2	6	175321	175326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317151881
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3683	NC_014844	GCC	2	6	176656	176661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3684	NC_014844	CAG	2	6	176733	176738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151883
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3692	NC_014844	GGGCC	2	10	177212	177221	0 %	0 %	60 %	40 %	317151883
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3722	NC_014844	TCT	2	6	178731	178736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317151885
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3726	NC_014844	CCT	2	6	178834	178839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3731	NC_014844	GATG	2	8	178983	178990	25 %	25 %	50 %	0 %	317151886
3732	NC_014844	CGA	2	6	179067	179072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317151886
3733	NC_014844	GGC	2	6	179104	179109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317151886
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3737	NC_014844	GTA	2	6	179338	179343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317151886
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3744	NC_014844	TGG	2	6	179832	179837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317151886
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3746	NC_014844	CCTT	2	8	180017	180024	0 %	50 %	0 %	50 %	317151886
3747	NC_014844	GCAGG	2	10	180040	180049	20 %	0 %	60 %	20 %	317151886
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3868	NC_014844	CCCGG	2	10	185081	185090	0 %	0 %	40 %	60 %	317151890
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3993	NC_014844	GGA	2	6	189720	189725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317151896
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