MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfurivibrio alkaliphilus AHT2 chromosome

Total Repeats: 77613

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014216	GGC	2	6	159719	159724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568121
4002	NC_014216	CCA	2	6	159736	159741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568121
4003	NC_014216	CCA	2	6	159811	159816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568121
4004	NC_014216	TTGC	2	8	159912	159919	0 %	50 %	25 %	25 %	297568121
4005	NC_014216	GGC	2	6	159929	159934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568121
4006	NC_014216	GGA	2	6	159956	159961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568121
4007	NC_014216	TGC	2	6	159995	160000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568121
4008	NC_014216	CAGCCC	2	12	160079	160090	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	297568121
4009	NC_014216	CGC	2	6	160091	160096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568121
4010	NC_014216	GCC	3	9	160113	160121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568121
4011	NC_014216	CAATGT	2	12	160274	160285	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	297568121
4012	NC_014216	CCA	2	6	160337	160342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568121
4013	NC_014216	CGG	2	6	160370	160375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568121
4014	NC_014216	CGG	2	6	160387	160392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568121
4015	NC_014216	C	6	6	160438	160443	0 %	0 %	0 %	100 %	297568121
4016	NC_014216	GAT	2	6	160539	160544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568121
4017	NC_014216	GGA	2	6	160556	160561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	297568121
4018	NC_014216	ACCCTG	2	12	160584	160595	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	297568121
4019	NC_014216	ACA	2	6	160600	160605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	297568121
4020	NC_014216	TGC	2	6	160630	160635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568121
4021	NC_014216	GTG	2	6	160683	160688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568121
4022	NC_014216	GCGG	2	8	160751	160758	0 %	0 %	75 %	25 %	297568121
4023	NC_014216	GCA	2	6	160796	160801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568121
4024	NC_014216	GGCC	2	8	160852	160859	0 %	0 %	50 %	50 %	297568121
4025	NC_014216	CCG	2	6	160876	160881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568121
4026	NC_014216	GCC	2	6	160959	160964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568121
4027	NC_014216	GCC	3	9	161006	161014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568121
4028	NC_014216	GTG	2	6	161041	161046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568121
4029	NC_014216	GCC	2	6	161058	161063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568121
4030	NC_014216	GCC	2	6	161084	161089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568121
4031	NC_014216	CGG	2	6	161101	161106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568121
4032	NC_014216	GCT	2	6	161168	161173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568121
4033	NC_014216	CGC	2	6	161219	161224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568121
4034	NC_014216	ATGG	2	8	161243	161250	25 %	25 %	50 %	0 %	297568121
4035	NC_014216	GCT	2	6	161276	161281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568121
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4039	NC_014216	GC	3	6	161420	161425	0 %	0 %	50 %	50 %	297568121
4040	NC_014216	G	6	6	161434	161439	0 %	0 %	100 %	0 %	297568121
4041	NC_014216	GCC	2	6	161475	161480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568121
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4043	NC_014216	GGC	2	6	161504	161509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568121
4044	NC_014216	GAA	2	6	161520	161525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	297568121
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4047	NC_014216	GGC	2	6	161651	161656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568121
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4049	NC_014216	GCT	2	6	161765	161770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568121
4050	NC_014216	TGC	2	6	161797	161802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568121
4051	NC_014216	GGT	2	6	161816	161821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568121
4052	NC_014216	ACG	2	6	161857	161862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568121
4053	NC_014216	CCGG	2	8	161908	161915	0 %	0 %	50 %	50 %	297568121
4054	NC_014216	CGGC	2	8	161939	161946	0 %	0 %	50 %	50 %	297568121
4055	NC_014216	TGC	2	6	161983	161988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568121
4056	NC_014216	GCC	2	6	161989	161994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568121
4057	NC_014216	CCA	2	6	162008	162013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	297568121
4058	NC_014216	GTT	2	6	162107	162112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_014216	TAG	2	6	162131	162136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_014216	GCG	2	6	162207	162212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_014216	AAATG	2	10	162261	162270	60 %	20 %	20 %	0 %	297568122
4062	NC_014216	GGT	2	6	162283	162288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	297568122
4063	NC_014216	GCTG	2	8	162307	162314	0 %	25 %	50 %	25 %	297568122
4064	NC_014216	GCA	3	9	162318	162326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	297568122
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4069	NC_014216	GGCC	2	8	162451	162458	0 %	0 %	50 %	50 %	297568122
4070	NC_014216	CAT	2	6	162463	162468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	297568122
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4073	NC_014216	GAT	2	6	162512	162517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568122
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4091	NC_014216	TTAC	2	8	163299	163306	25 %	50 %	0 %	25 %	297568122
4092	NC_014216	GCT	2	6	163321	163326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568122
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4099	NC_014216	CGG	2	6	163638	163643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_014216	GCC	2	6	163646	163651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4101	NC_014216	GCC	2	6	163685	163690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4102	NC_014216	CGC	2	6	163728	163733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568123
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4104	NC_014216	CTG	2	6	163843	163848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568123
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4109	NC_014216	CCG	2	6	164098	164103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568123
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4112	NC_014216	CCAT	2	8	164195	164202	25 %	25 %	0 %	50 %	297568123
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4117	NC_014216	GTT	2	6	164306	164311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_014216	TCC	2	6	164314	164319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4119	NC_014216	TAA	2	6	164325	164330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_014216	GA	3	6	164334	164339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_014216	A	6	6	164406	164411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_014216	AC	3	6	164467	164472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4123	NC_014216	C	6	6	164505	164510	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4124	NC_014216	GGC	2	6	164534	164539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4246	NC_014216	CGG	2	6	169296	169301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4370	NC_014216	CTGA	2	8	174992	174999	25 %	25 %	25 %	25 %	297568131
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4373	NC_014216	GA	3	6	175035	175040	50 %	0 %	50 %	0 %	297568131
4374	NC_014216	GGC	2	6	175073	175078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568131
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4376	NC_014216	GTA	2	6	175232	175237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568131
4377	NC_014216	GGC	2	6	175238	175243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568131
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4431	NC_014216	TCC	2	6	177813	177818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4457	NC_014216	AGG	2	6	178989	178994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4461	NC_014216	GACT	2	8	179193	179200	25 %	25 %	25 %	25 %	297568134
4462	NC_014216	GTT	2	6	179206	179211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	297568134
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4493	NC_014216	GCC	2	6	180337	180342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	297568136
4494	NC_014216	GAT	2	6	180481	180486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	297568136
4495	NC_014216	GCG	2	6	180503	180508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568136
4496	NC_014216	CTG	2	6	180538	180543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	297568136
4497	NC_014216	CAGGC	2	10	180575	180584	20 %	0 %	40 %	40 %	297568136
4498	NC_014216	CGG	2	6	180639	180644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568136
4499	NC_014216	GGC	2	6	180646	180651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	297568136
4500	NC_014216	CT	3	6	180653	180658	0 %	50 %	0 %	50 %	297568136

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