MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Dehalococcoides sp. GT chromosome

Total Repeats: 3484

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013890	CTTG	2	8	102	109	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013890	GGGA	2	8	232	239	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013890	ACAA	2	8	527	534	75 %	0 %	0 %	25 %	289431956
4	NC_013890	CCCA	2	8	964	971	25 %	0 %	0 %	75 %	289431956
5	NC_013890	AGGG	2	8	2278	2285	25 %	0 %	75 %	0 %	289431957
6	NC_013890	AGAT	2	8	2752	2759	50 %	25 %	25 %	0 %	289431957
7	NC_013890	TGGC	2	8	3002	3009	0 %	25 %	50 %	25 %	289431957
8	NC_013890	TAAA	2	8	3781	3788	75 %	25 %	0 %	0 %	289431958
9	NC_013890	CAGG	2	8	4559	4566	25 %	0 %	50 %	25 %	289431959
10	NC_013890	GCGG	2	8	4614	4621	0 %	0 %	75 %	25 %	289431959
11	NC_013890	ACGT	2	8	4824	4831	25 %	25 %	25 %	25 %	289431959
12	NC_013890	GTCA	2	8	5205	5212	25 %	25 %	25 %	25 %	289431959
13	NC_013890	TGGC	2	8	5985	5992	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013890	ACCC	2	8	6216	6223	25 %	0 %	0 %	75 %	289431960
15	NC_013890	AGGT	2	8	6467	6474	25 %	25 %	50 %	0 %	289431960
16	NC_013890	GTTC	2	8	6700	6707	0 %	50 %	25 %	25 %	289431960
17	NC_013890	TCTT	2	8	6802	6809	0 %	75 %	0 %	25 %	289431960
18	NC_013890	GAAG	2	8	9507	9514	50 %	0 %	50 %	0 %	289431961
19	NC_013890	GGCA	2	8	9518	9525	25 %	0 %	50 %	25 %	289431961
20	NC_013890	CCAG	2	8	11068	11075	25 %	0 %	25 %	50 %	289431963
21	NC_013890	TGCC	2	8	11206	11213	0 %	25 %	25 %	50 %	289431963
22	NC_013890	CCCG	2	8	11278	11285	0 %	0 %	25 %	75 %	289431963
23	NC_013890	CTTT	2	8	12318	12325	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_013890	AGAT	2	8	12328	12335	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013890	AGGG	2	8	12412	12419	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013890	TAAA	2	8	12445	12452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013890	GTCT	2	8	12871	12878	0 %	50 %	25 %	25 %	289431965
28	NC_013890	GCAG	2	8	13004	13011	25 %	0 %	50 %	25 %	289431965
29	NC_013890	CAGC	2	8	13014	13021	25 %	0 %	25 %	50 %	289431965
30	NC_013890	AAGG	2	8	13336	13343	50 %	0 %	50 %	0 %	289431965
31	NC_013890	AATA	2	8	13411	13418	75 %	25 %	0 %	0 %	289431965
32	NC_013890	GCAG	2	8	13709	13716	25 %	0 %	50 %	25 %	289431966
33	NC_013890	CACC	2	8	14149	14156	25 %	0 %	0 %	75 %	289431967
34	NC_013890	ATTT	2	8	14537	14544	25 %	75 %	0 %	0 %	289431967
35	NC_013890	AATC	2	8	15559	15566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_013890	TCTA	2	8	15609	15616	25 %	50 %	0 %	25 %	289431969
37	NC_013890	CAGC	2	8	16289	16296	25 %	0 %	25 %	50 %	289431969
38	NC_013890	GGCA	2	8	16365	16372	25 %	0 %	50 %	25 %	289431969
39	NC_013890	GTGA	2	8	17080	17087	25 %	25 %	50 %	0 %	289431970
40	NC_013890	TGTC	2	8	17170	17177	0 %	50 %	25 %	25 %	289431970
41	NC_013890	CAGG	2	8	17286	17293	25 %	0 %	50 %	25 %	289431970
42	NC_013890	AGCC	2	8	17713	17720	25 %	0 %	25 %	50 %	289431970
43	NC_013890	TCTT	2	8	18708	18715	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013890	CAAA	2	8	19037	19044	75 %	0 %	0 %	25 %	289431973
45	NC_013890	GGGC	2	8	20041	20048	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013890	CAGC	2	8	20156	20163	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013890	TTTA	2	8	20265	20272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013890	TAAA	2	8	20482	20489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013890	GCTT	2	8	20626	20633	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013890	TGCC	2	8	20772	20779	0 %	25 %	25 %	50 %	289431975
51	NC_013890	GTGA	2	8	20976	20983	25 %	25 %	50 %	0 %	289431975
52	NC_013890	TTAA	2	8	21085	21092	50 %	50 %	0 %	0 %	289431975
53	NC_013890	CCGA	2	8	21519	21526	25 %	0 %	25 %	50 %	289431977
54	NC_013890	GGGT	2	8	21972	21979	0 %	25 %	75 %	0 %	289431977
55	NC_013890	GAAA	2	8	22169	22176	75 %	0 %	25 %	0 %	289431977
56	NC_013890	GGCA	2	8	22505	22512	25 %	0 %	50 %	25 %	289431977
57	NC_013890	AGAC	2	8	22753	22760	50 %	0 %	25 %	25 %	289431977
58	NC_013890	GCCA	2	8	23571	23578	25 %	0 %	25 %	50 %	289431977
59	NC_013890	CTGA	2	8	23818	23825	25 %	25 %	25 %	25 %	289431978
60	NC_013890	TCGC	2	8	23894	23901	0 %	25 %	25 %	50 %	289431978
61	NC_013890	TAAA	2	8	24376	24383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013890	ACAT	2	8	25094	25101	50 %	25 %	0 %	25 %	289431979
63	NC_013890	CCAC	2	8	27409	27416	25 %	0 %	0 %	75 %	289431982
64	NC_013890	TTAT	2	8	27451	27458	25 %	75 %	0 %	0 %	289431982
65	NC_013890	TTTA	2	8	27467	27474	25 %	75 %	0 %	0 %	289431983
66	NC_013890	CGGT	2	8	27955	27962	0 %	25 %	50 %	25 %	289431983
67	NC_013890	ACTC	2	8	28289	28296	25 %	25 %	0 %	50 %	289431983
68	NC_013890	CAGA	2	8	28484	28491	50 %	0 %	25 %	25 %	289431983
69	NC_013890	TATC	2	8	29153	29160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013890	AAAT	2	8	29165	29172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013890	GAAA	2	8	29268	29275	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013890	AAAT	2	8	29276	29283	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013890	AGTT	2	8	29407	29414	25 %	50 %	25 %	0 %	289431985
74	NC_013890	ATTC	2	8	29586	29593	25 %	50 %	0 %	25 %	289431985
75	NC_013890	TTTA	2	8	29610	29617	25 %	75 %	0 %	0 %	289431985
76	NC_013890	GCTG	2	8	29669	29676	0 %	25 %	50 %	25 %	289431985
77	NC_013890	TGGT	2	8	30035	30042	0 %	50 %	50 %	0 %	289431986
78	NC_013890	GCGT	2	8	30665	30672	0 %	25 %	50 %	25 %	289431986
79	NC_013890	GTTT	2	8	30911	30918	0 %	75 %	25 %	0 %	289431986
80	NC_013890	AAAT	2	8	31166	31173	75 %	25 %	0 %	0 %	289431987
81	NC_013890	GTAT	2	8	32026	32033	25 %	50 %	25 %	0 %	289431989
82	NC_013890	GTTA	2	8	32522	32529	25 %	50 %	25 %	0 %	289431989
83	NC_013890	ATTT	2	8	33054	33061	25 %	75 %	0 %	0 %	289431990
84	NC_013890	GCCT	2	8	33437	33444	0 %	25 %	25 %	50 %	289431990
85	NC_013890	CAAG	2	8	33546	33553	50 %	0 %	25 %	25 %	289431990
86	NC_013890	CTGA	2	8	34386	34393	25 %	25 %	25 %	25 %	289431991
87	NC_013890	CTTT	2	8	34487	34494	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_013890	GAGG	2	8	34691	34698	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013890	TCGT	2	8	34760	34767	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013890	ACTT	2	8	35192	35199	25 %	50 %	0 %	25 %	289431992
91	NC_013890	GGCA	2	8	35375	35382	25 %	0 %	50 %	25 %	289431992
92	NC_013890	CTGA	2	8	36324	36331	25 %	25 %	25 %	25 %	289431994
93	NC_013890	TTGC	2	8	36887	36894	0 %	50 %	25 %	25 %	289431996
94	NC_013890	ACGG	2	8	37825	37832	25 %	0 %	50 %	25 %	289431997
95	NC_013890	GGCA	2	8	38026	38033	25 %	0 %	50 %	25 %	289431997
96	NC_013890	CAAA	2	8	39015	39022	75 %	0 %	0 %	25 %	289431999
97	NC_013890	CAAC	2	8	39147	39154	50 %	0 %	0 %	50 %	289431999
98	NC_013890	GAAG	2	8	39586	39593	50 %	0 %	50 %	0 %	289431999
99	NC_013890	GCCG	2	8	40128	40135	0 %	0 %	50 %	50 %	289432000
100	NC_013890	GACG	2	8	40528	40535	25 %	0 %	50 %	25 %	289432001
101	NC_013890	GCTT	2	8	40619	40626	0 %	50 %	25 %	25 %	289432001
102	NC_013890	CAGG	2	8	41182	41189	25 %	0 %	50 %	25 %	289432001
103	NC_013890	TATT	2	8	41282	41289	25 %	75 %	0 %	0 %	289432001
104	NC_013890	GCCA	2	8	41795	41802	25 %	0 %	25 %	50 %	289432002
105	NC_013890	GGAA	2	8	41964	41971	50 %	0 %	50 %	0 %	289432002
106	NC_013890	CCGG	2	8	42029	42036	0 %	0 %	50 %	50 %	289432002
107	NC_013890	CCTG	2	8	42205	42212	0 %	25 %	25 %	50 %	289432002
108	NC_013890	GCCT	2	8	42317	42324	0 %	25 %	25 %	50 %	289432002
109	NC_013890	GGCG	2	8	42689	42696	0 %	0 %	75 %	25 %	289432002
110	NC_013890	CGGG	2	8	43654	43661	0 %	0 %	75 %	25 %	289432002
111	NC_013890	ATGA	2	8	44514	44521	50 %	25 %	25 %	0 %	289432003
112	NC_013890	CTGA	2	8	44916	44923	25 %	25 %	25 %	25 %	289432004
113	NC_013890	GGGC	2	8	45212	45219	0 %	0 %	75 %	25 %	289432004
114	NC_013890	GGCT	2	8	45634	45641	0 %	25 %	50 %	25 %	289432004
115	NC_013890	CATA	2	8	45644	45651	50 %	25 %	0 %	25 %	289432004
116	NC_013890	GGCA	2	8	46003	46010	25 %	0 %	50 %	25 %	289432005
117	NC_013890	GCCT	2	8	46463	46470	0 %	25 %	25 %	50 %	289432005
118	NC_013890	CAGA	2	8	46861	46868	50 %	0 %	25 %	25 %	289432005
119	NC_013890	TTAA	2	8	47054	47061	50 %	50 %	0 %	0 %	289432005
120	NC_013890	GCGA	2	8	47567	47574	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013890	TTCT	2	8	47761	47768	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013890	TGGA	2	8	49675	49682	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013890	GGTC	2	8	49976	49983	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_013890	TTCA	2	8	50507	50514	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_013890	TTAA	2	8	50548	50555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013890	CTTT	2	8	50618	50625	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013890	AAAC	2	8	51120	51127	75 %	0 %	0 %	25 %	289432006
128	NC_013890	CAGA	2	8	52708	52715	50 %	0 %	25 %	25 %	289432006
129	NC_013890	TCCG	2	8	52787	52794	0 %	25 %	25 %	50 %	289432006
130	NC_013890	TAAA	2	8	52838	52845	75 %	25 %	0 %	0 %	289432006
131	NC_013890	TCCA	2	8	54048	54055	25 %	25 %	0 %	50 %	289432007
132	NC_013890	CCTG	2	8	54065	54072	0 %	25 %	25 %	50 %	289432007
133	NC_013890	TATT	2	8	54160	54167	25 %	75 %	0 %	0 %	289432007
134	NC_013890	GGTT	2	8	54401	54408	0 %	50 %	50 %	0 %	289432007
135	NC_013890	GCCG	2	8	54626	54633	0 %	0 %	50 %	50 %	289432007
136	NC_013890	TGAA	2	8	54926	54933	50 %	25 %	25 %	0 %	289432007
137	NC_013890	TCAT	2	8	55229	55236	25 %	50 %	0 %	25 %	289432008
138	NC_013890	CGGG	2	8	55979	55986	0 %	0 %	75 %	25 %	289432009
139	NC_013890	CGGC	2	8	56027	56034	0 %	0 %	50 %	50 %	289432009
140	NC_013890	ATGT	2	8	56154	56161	25 %	50 %	25 %	0 %	289432010
141	NC_013890	AGAT	2	8	56737	56744	50 %	25 %	25 %	0 %	289432010
142	NC_013890	CTTA	2	8	56985	56992	25 %	50 %	0 %	25 %	289432010
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144	NC_013890	GGTT	2	8	57775	57782	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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