MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalococcoides sp. GT chromosome

Total Repeats: 24992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013890	CGG	2	6	158588	158593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432115
3002	NC_013890	CTG	2	6	158623	158628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289432115
3003	NC_013890	TCC	2	6	158767	158772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289432115
3004	NC_013890	ATT	2	6	158827	158832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289432115
3005	NC_013890	CTGGTG	2	12	158863	158874	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	289432115
3006	NC_013890	CGG	2	6	158893	158898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432115
3007	NC_013890	CT	3	6	158961	158966	0 %	50 %	0 %	50 %	289432115
3008	NC_013890	GGC	2	6	158997	159002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432115
3009	NC_013890	GGC	2	6	159018	159023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432115
3010	NC_013890	TC	3	6	159090	159095	0 %	50 %	0 %	50 %	289432115
3011	NC_013890	GGC	2	6	159162	159167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432115
3012	NC_013890	CGGG	2	8	159193	159200	0 %	0 %	75 %	25 %	289432115
3013	NC_013890	AAAGAT	2	12	159321	159332	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	289432115
3014	NC_013890	GTA	2	6	159361	159366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289432115
3015	NC_013890	GAT	2	6	159400	159405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289432115
3016	NC_013890	AG	3	6	159525	159530	50 %	0 %	50 %	0 %	289432115
3017	NC_013890	CTTTAG	2	12	159552	159563	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	289432115
3018	NC_013890	GCCA	2	8	159602	159609	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3019	NC_013890	T	6	6	159627	159632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_013890	AGG	2	6	159774	159779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_013890	AAG	2	6	159827	159832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289432116
3022	NC_013890	GAA	2	6	159853	159858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289432116
3023	NC_013890	CAC	2	6	159901	159906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289432116
3024	NC_013890	CAG	2	6	159977	159982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289432116
3025	NC_013890	GTA	2	6	160007	160012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289432116
3026	NC_013890	TTC	2	6	160026	160031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289432116
3027	NC_013890	GT	3	6	160085	160090	0 %	50 %	50 %	0 %	289432116
3028	NC_013890	GGA	2	6	160165	160170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289432116
3029	NC_013890	A	6	6	160232	160237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_013890	TAA	2	6	160279	160284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289432117
3031	NC_013890	TGC	2	6	160314	160319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289432117
3032	NC_013890	CGA	2	6	160354	160359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289432117
3033	NC_013890	AAC	2	6	160361	160366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289432117
3034	NC_013890	ACC	2	6	160376	160381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289432117
3035	NC_013890	GCT	2	6	160448	160453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289432117
3036	NC_013890	GGC	3	9	160490	160498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432117
3037	NC_013890	ATA	2	6	160638	160643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289432117
3038	NC_013890	CCG	2	6	160644	160649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289432117
3039	NC_013890	TAA	2	6	160651	160656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289432117
3040	NC_013890	TTA	2	6	160695	160700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289432117
3041	NC_013890	GGC	2	6	160718	160723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432117
3042	NC_013890	TTC	2	6	160830	160835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289432117
3043	NC_013890	CTG	2	6	160917	160922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289432117
3044	NC_013890	TACC	2	8	160978	160985	25 %	25 %	0 %	50 %	289432117
3045	NC_013890	CCGC	2	8	160993	161000	0 %	0 %	25 %	75 %	289432117
3046	NC_013890	ACC	2	6	161021	161026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289432117
3047	NC_013890	CAG	2	6	161075	161080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289432117
3048	NC_013890	ATA	2	6	161081	161086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289432117
3049	NC_013890	TAAAC	2	10	161109	161118	60 %	20 %	0 %	20 %	289432117
3050	NC_013890	CGG	2	6	161121	161126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_013890	CT	3	6	161163	161168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_013890	TCA	2	6	161237	161242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432118
3053	NC_013890	TAT	2	6	161286	161291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289432118
3054	NC_013890	G	6	6	161296	161301	0 %	0 %	100 %	0 %	289432118
3055	NC_013890	CTAC	2	8	161360	161367	25 %	25 %	0 %	50 %	289432118
3056	NC_013890	TGC	2	6	161501	161506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289432118
3057	NC_013890	TGG	2	6	161525	161530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289432118
3058	NC_013890	GGT	2	6	161541	161546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289432118
3059	NC_013890	GCCG	2	8	161577	161584	0 %	0 %	50 %	50 %	289432118
3060	NC_013890	G	6	6	161595	161600	0 %	0 %	100 %	0 %	289432118
3061	NC_013890	GGC	2	6	161619	161624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432118
3062	NC_013890	CTA	2	6	161654	161659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432118
3063	NC_013890	GCCA	2	8	161731	161738	25 %	0 %	25 %	50 %	289432118
3064	NC_013890	GGGT	2	8	161783	161790	0 %	25 %	75 %	0 %	289432118
3065	NC_013890	TTA	2	6	161864	161869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289432118
3066	NC_013890	TGC	2	6	161978	161983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289432118
3067	NC_013890	G	6	6	162032	162037	0 %	0 %	100 %	0 %	289432118
3068	NC_013890	GCA	2	6	162063	162068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289432119
3069	NC_013890	TGT	2	6	162090	162095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289432119
3070	NC_013890	GGCA	2	8	162100	162107	25 %	0 %	50 %	25 %	289432119
3071	NC_013890	CTG	2	6	162125	162130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289432119
3072	NC_013890	TTA	2	6	162132	162137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289432119
3073	NC_013890	ATT	2	6	162146	162151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289432119
3074	NC_013890	CCG	2	6	162194	162199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289432119
3075	NC_013890	TTC	2	6	162229	162234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289432119
3076	NC_013890	CAC	2	6	162244	162249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289432119
3077	NC_013890	GGTA	2	8	162289	162296	25 %	25 %	50 %	0 %	289432119
3078	NC_013890	TA	3	6	162307	162312	50 %	50 %	0 %	0 %	289432119
3079	NC_013890	TGG	2	6	162315	162320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289432119
3080	NC_013890	GCCT	2	8	162476	162483	0 %	25 %	25 %	50 %	289432119
3081	NC_013890	GCT	2	6	162484	162489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289432119
3082	NC_013890	AGA	2	6	162511	162516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289432119
3083	NC_013890	CGGG	2	8	162649	162656	0 %	0 %	75 %	25 %	289432119
3084	NC_013890	GCC	2	6	162701	162706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289432119
3085	NC_013890	CTT	2	6	162719	162724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289432119
3086	NC_013890	CGGG	2	8	162726	162733	0 %	0 %	75 %	25 %	289432119
3087	NC_013890	ATT	2	6	162821	162826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289432119
3088	NC_013890	ATTTC	2	10	162849	162858	20 %	60 %	0 %	20 %	289432119
3089	NC_013890	GGA	2	6	162884	162889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289432119
3090	NC_013890	TAAAA	2	10	162904	162913	80 %	20 %	0 %	0 %	289432120
3091	NC_013890	CTT	2	6	162928	162933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289432120
3092	NC_013890	AAATAT	2	12	162958	162969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289432120
3093	NC_013890	ATGA	2	8	163052	163059	50 %	25 %	25 %	0 %	289432120
3094	NC_013890	CTG	2	6	163094	163099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289432120
3095	NC_013890	GGGT	2	8	163152	163159	0 %	25 %	75 %	0 %	289432120
3096	NC_013890	CAG	2	6	163169	163174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289432120
3097	NC_013890	ACT	2	6	163235	163240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432120
3098	NC_013890	GGT	2	6	163261	163266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289432120
3099	NC_013890	A	6	6	163269	163274	100 %	0 %	0 %	0 %	289432120
3100	NC_013890	GGC	2	6	163285	163290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432120
3101	NC_013890	TCTGG	2	10	163325	163334	0 %	40 %	40 %	20 %	289432120
3102	NC_013890	CGG	2	6	163342	163347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432120
3103	NC_013890	GCA	3	9	163348	163356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289432120
3104	NC_013890	GATG	2	8	163405	163412	25 %	25 %	50 %	0 %	289432120
3105	NC_013890	GAA	2	6	163454	163459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289432120
3106	NC_013890	ATACT	2	10	163480	163489	40 %	40 %	0 %	20 %	289432120
3107	NC_013890	GCA	2	6	163513	163518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289432120
3108	NC_013890	GCC	2	6	163520	163525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289432120
3109	NC_013890	CTC	2	6	163528	163533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289432120
3110	NC_013890	GGACT	2	10	163534	163543	20 %	20 %	40 %	20 %	289432120
3111	NC_013890	CTG	2	6	163550	163555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289432120
3112	NC_013890	TGG	2	6	163566	163571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289432120
3113	NC_013890	TGG	2	6	163731	163736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289432121
3114	NC_013890	AGA	3	9	163804	163812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289432121
3115	NC_013890	GAA	2	6	163844	163849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289432121
3116	NC_013890	A	6	6	163848	163853	100 %	0 %	0 %	0 %	289432121
3117	NC_013890	ATA	2	6	163901	163906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289432121
3118	NC_013890	CGC	2	6	163954	163959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289432121
3119	NC_013890	GAA	2	6	163991	163996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289432121
3120	NC_013890	TGG	2	6	164013	164018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289432121
3121	NC_013890	ATGACG	2	12	164115	164126	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289432121
3122	NC_013890	AT	3	6	164262	164267	50 %	50 %	0 %	0 %	289432121
3123	NC_013890	GA	3	6	164270	164275	50 %	0 %	50 %	0 %	289432121
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3242	NC_013890	TTCA	2	8	170292	170299	25 %	50 %	0 %	25 %	289432128
3243	NC_013890	TCA	2	6	170335	170340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432128
3244	NC_013890	CCATGC	2	12	170390	170401	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	289432128
3245	NC_013890	CTT	2	6	170462	170467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289432128
3246	NC_013890	TCCC	2	8	170501	170508	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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3248	NC_013890	AAT	2	6	170596	170601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_013890	GAA	2	6	170612	170617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3370	NC_013890	AAG	2	6	177299	177304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289432136
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3495	NC_013890	ACGA	2	8	184485	184492	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3496	NC_013890	AGG	2	6	184496	184501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3497	NC_013890	ACCG	2	8	184613	184620	25 %	0 %	25 %	50 %	289432147
3498	NC_013890	GC	3	6	184703	184708	0 %	0 %	50 %	50 %	289432147
3499	NC_013890	AGG	2	6	184840	184845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3500	NC_013890	CACAG	2	10	184856	184865	40 %	0 %	20 %	40 %	289432148

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