MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dehalococcoides sp. GT chromosome

Total Repeats: 24992

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013890	C	6	6	296409	296414	0 %	0 %	0 %	100 %	289432262
5502	NC_013890	AGA	2	6	296451	296456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289432262
5503	NC_013890	CTT	2	6	296535	296540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289432262
5504	NC_013890	GGC	2	6	296602	296607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432262
5505	NC_013890	GAT	2	6	296629	296634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289432262
5506	NC_013890	GCC	2	6	296683	296688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289432262
5507	NC_013890	CGG	2	6	296735	296740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432262
5508	NC_013890	ATA	2	6	296825	296830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289432262
5509	NC_013890	CCG	2	6	296852	296857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289432262
5510	NC_013890	TTA	2	6	296952	296957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289432262
5511	NC_013890	CTG	2	6	297049	297054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289432262
5512	NC_013890	GCCT	2	8	297100	297107	0 %	25 %	25 %	50 %	289432262
5513	NC_013890	GCCAG	2	10	297153	297162	20 %	0 %	40 %	40 %	289432262
5514	NC_013890	CGG	2	6	297183	297188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432262
5515	NC_013890	TGG	2	6	297224	297229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289432262
5516	NC_013890	ATC	2	6	297346	297351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_013890	AAG	2	6	297357	297362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_013890	T	6	6	297450	297455	0 %	100 %	0 %	0 %	289432263
5519	NC_013890	CCT	2	6	297588	297593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289432263
5520	NC_013890	CTT	2	6	297714	297719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289432263
5521	NC_013890	AGGGT	2	10	297850	297859	20 %	20 %	60 %	0 %	289432263
5522	NC_013890	GA	3	6	297862	297867	50 %	0 %	50 %	0 %	289432263
5523	NC_013890	TG	3	6	297875	297880	0 %	50 %	50 %	0 %	289432263
5524	NC_013890	GTG	2	6	297893	297898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289432263
5525	NC_013890	GGC	2	6	297973	297978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432263
5526	NC_013890	CTTT	2	8	298067	298074	0 %	75 %	0 %	25 %	289432263
5527	NC_013890	ACC	2	6	298085	298090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289432263
5528	NC_013890	AGG	2	6	298242	298247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289432263
5529	NC_013890	TTC	2	6	298291	298296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289432263
5530	NC_013890	TGGAC	2	10	298353	298362	20 %	20 %	40 %	20 %	289432263
5531	NC_013890	CGC	2	6	298421	298426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289432263
5532	NC_013890	AG	3	6	298453	298458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_013890	CAG	2	6	298527	298532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289432264
5534	NC_013890	GA	3	6	298571	298576	50 %	0 %	50 %	0 %	289432264
5535	NC_013890	GCC	2	6	298584	298589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289432264
5536	NC_013890	AATA	2	8	298602	298609	75 %	25 %	0 %	0 %	289432264
5537	NC_013890	A	6	6	298611	298616	100 %	0 %	0 %	0 %	289432264
5538	NC_013890	CCG	2	6	298624	298629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289432264
5539	NC_013890	ATA	2	6	298657	298662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289432264
5540	NC_013890	CAG	2	6	298695	298700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289432264
5541	NC_013890	G	6	6	298949	298954	0 %	0 %	100 %	0 %	289432264
5542	NC_013890	CGG	2	6	299045	299050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432264
5543	NC_013890	CGG	3	9	299111	299119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432264
5544	NC_013890	ACT	2	6	299131	299136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432264
5545	NC_013890	CCA	2	6	299156	299161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289432264
5546	NC_013890	GAA	2	6	299269	299274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289432264
5547	NC_013890	TAT	2	6	299282	299287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289432264
5548	NC_013890	TCT	2	6	299299	299304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289432264
5549	NC_013890	GCC	2	6	299316	299321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289432264
5550	NC_013890	G	6	6	299379	299384	0 %	0 %	100 %	0 %	289432264
5551	NC_013890	TTC	2	6	299400	299405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289432264
5552	NC_013890	ACT	2	6	299461	299466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432264
5553	NC_013890	AGAAA	2	10	299482	299491	80 %	0 %	20 %	0 %	289432264
5554	NC_013890	CAGTT	2	10	299523	299532	20 %	40 %	20 %	20 %	289432265
5555	NC_013890	GC	3	6	299541	299546	0 %	0 %	50 %	50 %	289432265
5556	NC_013890	ATC	2	6	299568	299573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432265
5557	NC_013890	GCC	2	6	299698	299703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289432265
5558	NC_013890	CTT	2	6	299717	299722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289432265
5559	NC_013890	CCAGAC	2	12	299738	299749	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	289432265
5560	NC_013890	CCA	2	6	299921	299926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289432265
5561	NC_013890	ACC	2	6	299956	299961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289432265
5562	NC_013890	CAGC	2	8	299988	299995	25 %	0 %	25 %	50 %	289432265
5563	NC_013890	TAT	2	6	300003	300008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289432265
5564	NC_013890	TCA	2	6	300023	300028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432265
5565	NC_013890	CCG	2	6	300139	300144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289432265
5566	NC_013890	GTA	2	6	300227	300232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289432265
5567	NC_013890	CGG	2	6	300275	300280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432265
5568	NC_013890	TTG	2	6	300295	300300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289432265
5569	NC_013890	TTACC	2	10	300311	300320	20 %	40 %	0 %	40 %	289432265
5570	NC_013890	AGC	2	6	300327	300332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289432265
5571	NC_013890	CCG	2	6	300358	300363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289432265
5572	NC_013890	ACT	2	6	300373	300378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432265
5573	NC_013890	GGC	2	6	300399	300404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432265
5574	NC_013890	TCC	2	6	300409	300414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289432265
5575	NC_013890	TA	4	8	300466	300473	50 %	50 %	0 %	0 %	289432265
5576	NC_013890	GCCA	2	8	300525	300532	25 %	0 %	25 %	50 %	289432265
5577	NC_013890	CTTT	2	8	300620	300627	0 %	75 %	0 %	25 %	289432265
5578	NC_013890	TGAA	2	8	300630	300637	50 %	25 %	25 %	0 %	289432265
5579	NC_013890	GTA	3	9	300647	300655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289432266
5580	NC_013890	ATT	2	6	300696	300701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289432266
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5582	NC_013890	AGA	2	6	300801	300806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289432266
5583	NC_013890	ACCGC	2	10	300885	300894	20 %	0 %	20 %	60 %	289432266
5584	NC_013890	T	6	6	300940	300945	0 %	100 %	0 %	0 %	289432266
5585	NC_013890	A	6	6	300968	300973	100 %	0 %	0 %	0 %	289432266
5586	NC_013890	CAG	2	6	301067	301072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289432266
5587	NC_013890	CAG	2	6	301178	301183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289432266
5588	NC_013890	CTA	3	9	301318	301326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432266
5589	NC_013890	ACC	2	6	301374	301379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289432266
5590	NC_013890	CAG	2	6	301394	301399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289432266
5591	NC_013890	T	7	7	301418	301424	0 %	100 %	0 %	0 %	289432266
5592	NC_013890	ACC	2	6	301439	301444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289432267
5593	NC_013890	TTTC	2	8	301489	301496	0 %	75 %	0 %	25 %	289432267
5594	NC_013890	CGC	2	6	301582	301587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289432267
5595	NC_013890	T	6	6	301692	301697	0 %	100 %	0 %	0 %	289432267
5596	NC_013890	AAT	2	6	301706	301711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289432267
5597	NC_013890	TCA	2	6	301713	301718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432267
5598	NC_013890	CGCC	2	8	301719	301726	0 %	0 %	25 %	75 %	289432267
5599	NC_013890	CAT	2	6	301888	301893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289432267
5600	NC_013890	TCCA	2	8	302081	302088	25 %	25 %	0 %	50 %	289432267
5601	NC_013890	TTA	2	6	302089	302094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289432267
5602	NC_013890	TAT	2	6	302116	302121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289432267
5603	NC_013890	TGT	2	6	302132	302137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289432267
5604	NC_013890	AGG	2	6	302165	302170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_013890	CTT	2	6	302228	302233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289432268
5606	NC_013890	TCT	2	6	302279	302284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289432268
5607	NC_013890	GTC	2	6	302310	302315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289432268
5608	NC_013890	TTCAT	2	10	302347	302356	20 %	60 %	0 %	20 %	289432268
5609	NC_013890	CGG	2	6	302368	302373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432268
5610	NC_013890	TCT	2	6	302395	302400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289432268
5611	NC_013890	TTG	2	6	302410	302415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289432268
5612	NC_013890	GGC	2	6	302435	302440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289432268
5613	NC_013890	TTC	2	6	302442	302447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289432268
5614	NC_013890	G	8	8	302453	302460	0 %	0 %	100 %	0 %	289432268
5615	NC_013890	ATA	2	6	302473	302478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289432268
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5617	NC_013890	ATA	2	6	302518	302523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289432268
5618	NC_013890	AT	3	6	302594	302599	50 %	50 %	0 %	0 %	289432268
5619	NC_013890	GAT	2	6	302606	302611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289432268
5620	NC_013890	TGA	2	6	302667	302672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289432268
5621	NC_013890	AGA	2	6	302704	302709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289432268
5622	NC_013890	T	7	7	302731	302737	0 %	100 %	0 %	0 %	289432268
5623	NC_013890	GGA	2	6	302830	302835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289432269
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5743	NC_013890	TAA	2	6	309588	309593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5744	NC_013890	GGA	2	6	309652	309657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5745	NC_013890	TG	3	6	309690	309695	0 %	50 %	50 %	0 %	289432275
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5995	NC_013890	AAAT	2	8	323600	323607	75 %	25 %	0 %	0 %	289432291
5996	NC_013890	ACC	2	6	323619	323624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289432291
5997	NC_013890	CAA	2	6	323648	323653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289432291
5998	NC_013890	GGCT	2	8	323656	323663	0 %	25 %	50 %	25 %	289432291
5999	NC_013890	GTTT	2	8	323698	323705	0 %	75 %	25 %	0 %	289432291
6000	NC_013890	ATT	2	6	323706	323711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289432291

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