MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 plasmid pDRET01

Total Repeats: 483

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013224	ATT	2	6	31	36	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013224	ACC	2	6	70	75	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_013224	TCG	2	6	245	250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013224	CAC	2	6	281	286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_013224	CAT	2	6	312	317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013224	TGG	2	6	329	334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013224	GGT	2	6	381	386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013224	TAA	2	6	440	445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013224	AAG	2	6	485	490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013224	AGC	2	6	598	603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013224	CGC	2	6	627	632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_013224	GTT	2	6	861	866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406619
13	NC_013224	GGC	2	6	1003	1008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406620
14	NC_013224	GTT	2	6	1017	1022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406620
15	NC_013224	CCA	2	6	1041	1046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406620
16	NC_013224	GCC	2	6	1168	1173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406620
17	NC_013224	GCC	2	6	1223	1228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406620
18	NC_013224	CCA	2	6	1266	1271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406620
19	NC_013224	TTC	2	6	1876	1881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406622
20	NC_013224	AAC	2	6	1897	1902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406622
21	NC_013224	GCC	2	6	1918	1923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406622
22	NC_013224	TTG	2	6	1943	1948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406622
23	NC_013224	TCC	2	6	1997	2002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406622
24	NC_013224	GCA	2	6	2010	2015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406622
25	NC_013224	ATA	2	6	2384	2389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013224	CCT	2	6	2404	2409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_013224	TCT	2	6	2591	2596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406623
28	NC_013224	GTT	2	6	2767	2772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406623
29	NC_013224	ATA	2	6	2818	2823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406623
30	NC_013224	ATG	2	6	2835	2840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406624
31	NC_013224	ATA	2	6	2986	2991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406624
32	NC_013224	GAA	2	6	3000	3005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406624
33	NC_013224	ATG	2	6	3034	3039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406624
34	NC_013224	GAA	3	9	3096	3104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406624
35	NC_013224	CCA	2	6	3219	3224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406624
36	NC_013224	CAA	2	6	3348	3353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406624
37	NC_013224	CCA	2	6	3527	3532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406624
38	NC_013224	AGA	2	6	3536	3541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406624
39	NC_013224	TGA	2	6	3638	3643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406624
40	NC_013224	ACC	2	6	3780	3785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406625
41	NC_013224	CAA	2	6	3900	3905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406625
42	NC_013224	TAA	3	9	3908	3916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406625
43	NC_013224	AAC	2	6	4005	4010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406625
44	NC_013224	AAC	2	6	4071	4076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406625
45	NC_013224	TCC	2	6	4225	4230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406625
46	NC_013224	ACC	2	6	4308	4313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406625
47	NC_013224	AAT	2	6	4364	4369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406625
48	NC_013224	ATA	2	6	4449	4454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406625
49	NC_013224	CGA	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406625
50	NC_013224	AAG	2	6	4819	4824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406625
51	NC_013224	TAT	2	6	4881	4886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406625
52	NC_013224	CGT	2	6	4887	4892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406625
53	NC_013224	GAA	2	6	4914	4919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406625
54	NC_013224	GAA	2	6	4941	4946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406625
55	NC_013224	CAA	2	6	4959	4964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406625
56	NC_013224	ACA	2	6	5112	5117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406625
57	NC_013224	TAA	2	6	5190	5195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013224	TTC	2	6	5259	5264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_013224	GGA	2	6	5365	5370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013224	TTA	2	6	5423	5428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013224	CGA	2	6	5455	5460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013224	ACA	2	6	5649	5654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_013224	CTG	2	6	5660	5665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013224	CCG	2	6	5918	5923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_013224	CGA	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013224	TGG	2	6	6169	6174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013224	AGG	2	6	6265	6270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013224	GCA	2	6	6500	6505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013224	GGT	2	6	6539	6544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013224	AGA	2	6	6662	6667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406626
71	NC_013224	ATT	2	6	6990	6995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406627
72	NC_013224	ACC	2	6	7029	7034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406627
73	NC_013224	TGG	2	6	7159	7164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406627
74	NC_013224	TCG	2	6	7204	7209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406627
75	NC_013224	CAT	2	6	7271	7276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406627
76	NC_013224	TGG	2	6	7288	7293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406627
77	NC_013224	GGT	2	6	7340	7345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406627
78	NC_013224	TAA	2	6	7399	7404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406627
79	NC_013224	AGG	2	6	7444	7449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258406627
80	NC_013224	GTG	2	6	7500	7505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406627
81	NC_013224	GCC	2	6	7563	7568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406627
82	NC_013224	GGA	2	6	7700	7705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258406628
83	NC_013224	AAG	2	6	7722	7727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406628
84	NC_013224	TGA	2	6	7805	7810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406628
85	NC_013224	GGT	2	6	7851	7856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013224	CAA	2	6	7906	7911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013224	TTG	2	6	7943	7948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013224	GCC	2	6	7954	7959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_013224	TTG	2	6	7999	8004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013224	GGT	2	6	8109	8114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013224	CAA	2	6	8137	8142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013224	TAT	2	6	8511	8516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013224	ATA	2	6	8569	8574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013224	GAA	2	6	8601	8606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013224	CTA	2	6	8680	8685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013224	ATT	2	6	8798	8803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013224	AAG	2	6	8888	8893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013224	TAA	2	6	8898	8903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013224	GGA	2	6	8915	8920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013224	GCT	2	6	9034	9039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406629
101	NC_013224	AGA	2	6	9173	9178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406629
102	NC_013224	TTA	2	6	9181	9186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406629
103	NC_013224	ATG	2	6	9620	9625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406630
104	NC_013224	ATG	2	6	9720	9725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406630
105	NC_013224	ATG	2	6	9764	9769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406630
106	NC_013224	TCT	2	6	9782	9787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406630
107	NC_013224	GAA	2	6	9800	9805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406630
108	NC_013224	CAT	2	6	9819	9824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406630
109	NC_013224	ACA	2	6	9909	9914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406630
110	NC_013224	TTC	2	6	9944	9949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406630
111	NC_013224	AGA	2	6	9960	9965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406630
112	NC_013224	AGT	2	6	10022	10027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406630
113	NC_013224	TGA	2	6	10138	10143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406630
114	NC_013224	CTT	2	6	10228	10233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_013224	GTT	2	6	10251	10256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013224	CTC	2	6	10292	10297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_013224	AGG	2	6	10426	10431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013224	CCA	2	6	10625	10630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_013224	CGG	2	6	10668	10673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013224	AGA	2	6	10703	10708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406631
121	NC_013224	GAG	2	6	10773	10778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258406631
122	NC_013224	ATT	2	6	10843	10848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406632
123	NC_013224	TTC	2	6	10850	10855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406632
124	NC_013224	GGC	2	6	11276	11281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406632
125	NC_013224	TGG	2	6	11283	11288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406632
126	NC_013224	TGG	2	6	11319	11324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406632
127	NC_013224	TAT	2	6	11570	11575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406633
128	NC_013224	GTA	2	6	11627	11632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406633
129	NC_013224	ATA	2	6	11845	11850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406634
130	NC_013224	CTT	2	6	11955	11960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406634
131	NC_013224	GAT	2	6	12088	12093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406634
132	NC_013224	GAA	2	6	12121	12126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406634
133	NC_013224	GAA	2	6	12205	12210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406634
134	NC_013224	AGT	2	6	12391	12396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013224	ACC	2	6	12436	12441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_013224	GTT	2	6	12449	12454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013224	ATT	2	6	12705	12710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406635
138	NC_013224	GTA	2	6	12875	12880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406635
139	NC_013224	ATA	2	6	12890	12895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406635
140	NC_013224	ACT	2	6	12919	12924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406635
141	NC_013224	ATT	2	6	12936	12941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406635
142	NC_013224	TTG	2	6	12965	12970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406635
143	NC_013224	CAC	2	6	12992	12997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_013224	GCA	3	9	13080	13088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406636
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264	NC_013224	GTG	2	6	24885	24890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
265	NC_013224	CAA	2	6	24906	24911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_013224	ACA	2	6	24939	24944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_013224	GCT	2	6	25139	25144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_013224	CAA	2	6	25263	25268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406648
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273	NC_013224	CAA	2	6	25606	25611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_013224	ATT	2	6	25645	25650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_013224	TTA	2	6	25741	25746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_013224	ATG	2	6	25747	25752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_013224	TAG	2	6	25775	25780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_013224	GAT	3	9	25827	25835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_013224	GTA	2	6	25852	25857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_013224	TGC	2	6	26126	26131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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283	NC_013224	TGG	2	6	26342	26347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_013224	ACA	2	6	26852	26857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_013224	TTG	2	6	27198	27203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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352	NC_013224	ACT	2	6	32384	32389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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395	NC_013224	AAG	2	6	36916	36921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406657
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424	NC_013224	ATT	2	6	39831	39836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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