MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 plasmid pDRET01

Total Repeats: 922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013224	GTG	2	6	24885	24890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_013224	CAA	2	6	24906	24911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_013224	TTTC	2	8	24926	24933	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
504	NC_013224	ACA	2	6	24939	24944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_013224	T	6	6	24959	24964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_013224	A	7	7	24974	24980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_013224	T	7	7	25132	25138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_013224	GCT	2	6	25139	25144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_013224	CAA	2	6	25263	25268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406648
510	NC_013224	ACC	2	6	25282	25287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406648
511	NC_013224	TGCTG	2	10	25328	25337	0 %	40 %	40 %	20 %	258406648
512	NC_013224	GAA	2	6	25344	25349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406648
513	NC_013224	AAGA	2	8	25360	25367	75 %	0 %	25 %	0 %	258406648
514	NC_013224	A	9	9	25445	25453	100 %	0 %	0 %	0 %	258406648
515	NC_013224	TAT	2	6	25458	25463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406648
516	NC_013224	TCT	2	6	25485	25490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_013224	AT	3	6	25492	25497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_013224	ATTTT	2	10	25516	25525	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_013224	CAA	2	6	25606	25611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_013224	A	6	6	25628	25633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_013224	ATT	2	6	25645	25650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_013224	AAT	2	6	25656	25661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_013224	TTA	2	6	25741	25746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013224	ATG	2	6	25747	25752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013224	TAG	2	6	25775	25780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_013224	GAT	3	9	25827	25835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_013224	TA	3	6	25836	25841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_013224	GTA	2	6	25852	25857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_013224	TA	3	6	25862	25867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_013224	TGC	2	6	26126	26131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_013224	GGT	2	6	26289	26294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_013224	TGG	2	6	26342	26347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013224	TCC	2	6	26393	26398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_013224	GA	3	6	26441	26446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_013224	CAT	2	6	26478	26483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_013224	T	7	7	26722	26728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_013224	CTG	2	6	26770	26775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_013224	ACA	2	6	26852	26857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_013224	TTTG	2	8	27108	27115	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
540	NC_013224	TTG	2	6	27198	27203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_013224	AAG	2	6	27243	27248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_013224	CTTTAT	2	12	27350	27361	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
543	NC_013224	ATT	2	6	27371	27376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_013224	A	6	6	27426	27431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_013224	GGAG	2	8	27710	27717	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
546	NC_013224	A	6	6	27746	27751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013224	CCT	2	6	27779	27784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406649
548	NC_013224	AGC	2	6	27808	27813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406649
549	NC_013224	CAC	2	6	27841	27846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406649
550	NC_013224	CT	3	6	27883	27888	0 %	50 %	0 %	50 %	258406649
551	NC_013224	A	6	6	27910	27915	100 %	0 %	0 %	0 %	258406649
552	NC_013224	AGAA	2	8	27939	27946	75 %	0 %	25 %	0 %	258406649
553	NC_013224	CT	3	6	28007	28012	0 %	50 %	0 %	50 %	258406649
554	NC_013224	GAA	2	6	28016	28021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406649
555	NC_013224	GTG	2	6	28030	28035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406649
556	NC_013224	AC	3	6	28051	28056	50 %	0 %	0 %	50 %	258406649
557	NC_013224	CCA	2	6	28057	28062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406649
558	NC_013224	AAC	2	6	28095	28100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406649
559	NC_013224	ACA	2	6	28115	28120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258406649
560	NC_013224	A	6	6	28133	28138	100 %	0 %	0 %	0 %	258406649
561	NC_013224	TTG	2	6	28202	28207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406649
562	NC_013224	A	9	9	28214	28222	100 %	0 %	0 %	0 %	258406649
563	NC_013224	G	6	6	28236	28241	0 %	0 %	100 %	0 %	258406649
564	NC_013224	GAA	2	6	28272	28277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_013224	A	6	6	28327	28332	100 %	0 %	0 %	0 %	258406650
566	NC_013224	TCAG	2	8	28354	28361	25 %	25 %	25 %	25 %	258406650
567	NC_013224	TC	3	6	28363	28368	0 %	50 %	0 %	50 %	258406650
568	NC_013224	GGC	2	6	28376	28381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406650
569	NC_013224	TTG	2	6	28514	28519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406650
570	NC_013224	AAG	2	6	28580	28585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406650
571	NC_013224	AAG	2	6	28621	28626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406650
572	NC_013224	TTG	2	6	28646	28651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406650
573	NC_013224	CAG	2	6	28749	28754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406650
574	NC_013224	AG	3	6	28783	28788	50 %	0 %	50 %	0 %	258406650
575	NC_013224	GCA	2	6	28914	28919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406650
576	NC_013224	TCG	2	6	29166	29171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406650
577	NC_013224	GGT	2	6	29210	29215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406650
578	NC_013224	ACG	2	6	29239	29244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406650
579	NC_013224	TAAA	2	8	29258	29265	75 %	25 %	0 %	0 %	258406650
580	NC_013224	AAG	2	6	29345	29350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_013224	AAAT	2	8	29354	29361	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_013224	ATC	2	6	29554	29559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_013224	T	6	6	29607	29612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_013224	ATTG	2	8	29623	29630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
585	NC_013224	TCT	2	6	29793	29798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_013224	TCCTGG	2	12	29819	29830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_013224	AT	3	6	29979	29984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_013224	A	7	7	30014	30020	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_013224	ATT	2	6	30027	30032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_013224	GCG	2	6	30069	30074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_013224	AGG	2	6	30154	30159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_013224	AGG	2	6	30191	30196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_013224	AAGC	2	8	30218	30225	50 %	0 %	25 %	25 %	258406651
594	NC_013224	GAA	2	6	30272	30277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406651
595	NC_013224	GGC	2	6	30326	30331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406651
596	NC_013224	AAG	2	6	30345	30350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406651
597	NC_013224	A	7	7	30506	30512	100 %	0 %	0 %	0 %	258406651
598	NC_013224	GAA	2	6	30550	30555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406651
599	NC_013224	A	7	7	30554	30560	100 %	0 %	0 %	0 %	258406651
600	NC_013224	AGA	2	6	30584	30589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406651
601	NC_013224	GA	3	6	30588	30593	50 %	0 %	50 %	0 %	258406651
602	NC_013224	A	9	9	30593	30601	100 %	0 %	0 %	0 %	258406651
603	NC_013224	ATA	2	6	30604	30609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406651
604	NC_013224	GTT	2	6	30763	30768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_013224	CCT	2	6	30772	30777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_013224	TAT	2	6	30789	30794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_013224	AT	4	8	30857	30864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013224	CTT	2	6	30866	30871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_013224	TCC	2	6	30876	30881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_013224	TAAA	2	8	30890	30897	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_013224	CCT	2	6	30899	30904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_013224	ATT	2	6	30964	30969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406652
613	NC_013224	CTT	2	6	31015	31020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406652
614	NC_013224	ACC	2	6	31036	31041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406652
615	NC_013224	ACC	2	6	31240	31245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406652
616	NC_013224	GAA	2	6	31294	31299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406652
617	NC_013224	TTTTTA	2	12	31311	31322	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	258406652
618	NC_013224	ATA	2	6	31347	31352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406652
619	NC_013224	CTG	2	6	31363	31368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406652
620	NC_013224	TTG	2	6	31413	31418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406652
621	NC_013224	TAT	2	6	31421	31426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406652
622	NC_013224	CAC	2	6	31515	31520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406652
623	NC_013224	TTC	2	6	31529	31534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406652
624	NC_013224	CTT	2	6	31537	31542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406652
625	NC_013224	T	7	7	31605	31611	0 %	100 %	0 %	0 %	258406652
626	NC_013224	CTT	2	6	31648	31653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406652
627	NC_013224	GTA	2	6	31664	31669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406652
628	NC_013224	ACT	2	6	31770	31775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406652
629	NC_013224	TCT	2	6	31787	31792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406652
630	NC_013224	A	6	6	31904	31909	100 %	0 %	0 %	0 %	258406652
631	NC_013224	TA	3	6	31912	31917	50 %	50 %	0 %	0 %	258406652
632	NC_013224	ATT	2	6	31923	31928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406652
633	NC_013224	AATA	2	8	32024	32031	75 %	25 %	0 %	0 %	258406652
634	NC_013224	CTT	2	6	32092	32097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406652
635	NC_013224	ATT	2	6	32157	32162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258406652
636	NC_013224	ACC	2	6	32189	32194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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639	NC_013224	T	6	6	32267	32272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_013224	TA	3	6	32311	32316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_013224	AAT	2	6	32327	32332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_013224	ATT	2	6	32337	32342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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671	NC_013224	A	6	6	33557	33562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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707	NC_013224	A	7	7	35465	35471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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911	NC_013224	AGTT	2	8	44508	44515	25 %	50 %	25 %	0 %	258406664
912	NC_013224	GCT	2	6	44546	44551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406664
913	NC_013224	TGC	2	6	44632	44637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406664
914	NC_013224	ACC	2	6	44638	44643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406664
915	NC_013224	CCA	2	6	44696	44701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406664
916	NC_013224	TAT	2	6	44860	44865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
917	NC_013224	GGC	2	6	44870	44875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
918	NC_013224	CCTGG	2	10	44903	44912	0 %	20 %	40 %	40 %	258406665
919	NC_013224	GCT	2	6	44995	45000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406665
920	NC_013224	CCT	2	6	45006	45011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406665
921	NC_013224	GGA	2	6	45029	45034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258406665
922	NC_013224	TG	3	6	45049	45054	0 %	50 %	50 %	0 %	258406665

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