MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 3244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013223	AT	3	6	1074	1079	50 %	50 %	0 %	0 %	258404140
2	NC_013223	TG	3	6	1127	1132	0 %	50 %	50 %	0 %	258404140
3	NC_013223	GT	3	6	2378	2383	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013223	TG	3	6	2649	2654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013223	GC	3	6	2955	2960	0 %	0 %	50 %	50 %	258404142
6	NC_013223	TG	3	6	3144	3149	0 %	50 %	50 %	0 %	258404142
7	NC_013223	AC	3	6	3627	3632	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013223	CT	3	6	4869	4874	0 %	50 %	0 %	50 %	258404144
9	NC_013223	AG	3	6	5556	5561	50 %	0 %	50 %	0 %	258404144
10	NC_013223	TC	3	6	5964	5969	0 %	50 %	0 %	50 %	258404144
11	NC_013223	GA	3	6	5971	5976	50 %	0 %	50 %	0 %	258404144
12	NC_013223	TC	3	6	6790	6795	0 %	50 %	0 %	50 %	258404144
13	NC_013223	TG	3	6	7742	7747	0 %	50 %	50 %	0 %	258404145
14	NC_013223	GA	3	6	10094	10099	50 %	0 %	50 %	0 %	258404147
15	NC_013223	TC	3	6	10208	10213	0 %	50 %	0 %	50 %	258404147
16	NC_013223	AC	3	6	10944	10949	50 %	0 %	0 %	50 %	258404148
17	NC_013223	GA	3	6	11970	11975	50 %	0 %	50 %	0 %	258404149
18	NC_013223	GT	3	6	12174	12179	0 %	50 %	50 %	0 %	258404149
19	NC_013223	GC	3	6	12690	12695	0 %	0 %	50 %	50 %	258404150
20	NC_013223	GT	3	6	13323	13328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013223	GC	3	6	13676	13681	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013223	AC	3	6	13755	13760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_013223	AC	3	6	15305	15310	50 %	0 %	0 %	50 %	258404152
24	NC_013223	CT	3	6	18704	18709	0 %	50 %	0 %	50 %	258404155
25	NC_013223	CT	3	6	18836	18841	0 %	50 %	0 %	50 %	258404155
26	NC_013223	GC	3	6	19921	19926	0 %	0 %	50 %	50 %	258404156
27	NC_013223	GC	3	6	21193	21198	0 %	0 %	50 %	50 %	258404157
28	NC_013223	GC	3	6	22810	22815	0 %	0 %	50 %	50 %	258404159
29	NC_013223	GC	3	6	23645	23650	0 %	0 %	50 %	50 %	258404159
30	NC_013223	TC	3	6	24207	24212	0 %	50 %	0 %	50 %	258404159
31	NC_013223	TG	3	6	24453	24458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013223	TC	3	6	24638	24643	0 %	50 %	0 %	50 %	258404160
33	NC_013223	CG	4	8	24699	24706	0 %	0 %	50 %	50 %	258404160
34	NC_013223	GA	3	6	24920	24925	50 %	0 %	50 %	0 %	258404160
35	NC_013223	TG	3	6	28721	28726	0 %	50 %	50 %	0 %	258404164
36	NC_013223	CG	3	6	29369	29374	0 %	0 %	50 %	50 %	258404165
37	NC_013223	GT	4	8	30055	30062	0 %	50 %	50 %	0 %	258404166
38	NC_013223	AT	3	6	30933	30938	50 %	50 %	0 %	0 %	258404166
39	NC_013223	GC	3	6	31138	31143	0 %	0 %	50 %	50 %	258404166
40	NC_013223	GC	3	6	31159	31164	0 %	0 %	50 %	50 %	258404166
41	NC_013223	AT	3	6	31350	31355	50 %	50 %	0 %	0 %	258404166
42	NC_013223	CT	3	6	31717	31722	0 %	50 %	0 %	50 %	258404166
43	NC_013223	GC	3	6	34099	34104	0 %	0 %	50 %	50 %	258404169
44	NC_013223	TG	3	6	34186	34191	0 %	50 %	50 %	0 %	258404169
45	NC_013223	CG	3	6	34819	34824	0 %	0 %	50 %	50 %	258404170
46	NC_013223	GA	3	6	35094	35099	50 %	0 %	50 %	0 %	258404170
47	NC_013223	TC	3	6	35996	36001	0 %	50 %	0 %	50 %	258404171
48	NC_013223	CA	3	6	37139	37144	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013223	CA	3	6	37251	37256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013223	GC	3	6	37657	37662	0 %	0 %	50 %	50 %	258404172
51	NC_013223	CG	3	6	37863	37868	0 %	0 %	50 %	50 %	258404172
52	NC_013223	AC	3	6	38020	38025	50 %	0 %	0 %	50 %	258404172
53	NC_013223	GT	3	6	39369	39374	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013223	CA	3	6	39730	39735	50 %	0 %	0 %	50 %	258404173
55	NC_013223	CG	3	6	39837	39842	0 %	0 %	50 %	50 %	258404173
56	NC_013223	AG	3	6	42447	42452	50 %	0 %	50 %	0 %	258404173
57	NC_013223	CG	3	6	44480	44485	0 %	0 %	50 %	50 %	258404174
58	NC_013223	GA	3	6	46503	46508	50 %	0 %	50 %	0 %	258404175
59	NC_013223	AG	3	6	49763	49768	50 %	0 %	50 %	0 %	258404177
60	NC_013223	GC	3	6	50925	50930	0 %	0 %	50 %	50 %	258404177
61	NC_013223	TG	3	6	51755	51760	0 %	50 %	50 %	0 %	258404177
62	NC_013223	AT	3	6	53734	53739	50 %	50 %	0 %	0 %	258404179
63	NC_013223	CG	3	6	54902	54907	0 %	0 %	50 %	50 %	258404180
64	NC_013223	GC	3	6	55020	55025	0 %	0 %	50 %	50 %	258404180
65	NC_013223	TA	3	6	56899	56904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013223	TC	3	6	57877	57882	0 %	50 %	0 %	50 %	258404181
67	NC_013223	GA	3	6	59837	59842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013223	GA	3	6	61872	61877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013223	TG	3	6	64910	64915	0 %	50 %	50 %	0 %	258404187
70	NC_013223	TA	3	6	65199	65204	50 %	50 %	0 %	0 %	258404188
71	NC_013223	GC	3	6	65263	65268	0 %	0 %	50 %	50 %	258404188
72	NC_013223	CT	3	6	65417	65422	0 %	50 %	0 %	50 %	258404188
73	NC_013223	AG	3	6	67300	67305	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013223	AC	3	6	67315	67320	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013223	TC	3	6	69161	69166	0 %	50 %	0 %	50 %	258404192
76	NC_013223	GC	4	8	70798	70805	0 %	0 %	50 %	50 %	258404193
77	NC_013223	AG	3	6	71990	71995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013223	GA	3	6	72088	72093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013223	AG	3	6	72239	72244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013223	CT	3	6	72791	72796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_013223	TG	3	6	73538	73543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013223	GC	3	6	73770	73775	0 %	0 %	50 %	50 %	258404194
83	NC_013223	GT	3	6	74124	74129	0 %	50 %	50 %	0 %	258404194
84	NC_013223	AG	3	6	74311	74316	50 %	0 %	50 %	0 %	258404194
85	NC_013223	GT	3	6	74556	74561	0 %	50 %	50 %	0 %	258404194
86	NC_013223	CA	3	6	75191	75196	50 %	0 %	0 %	50 %	258404195
87	NC_013223	CG	3	6	75280	75285	0 %	0 %	50 %	50 %	258404195
88	NC_013223	AT	3	6	75610	75615	50 %	50 %	0 %	0 %	258404195
89	NC_013223	CT	3	6	76943	76948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_013223	CT	3	6	77000	77005	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013223	GT	3	6	78015	78020	0 %	50 %	50 %	0 %	258404197
92	NC_013223	GC	3	6	78728	78733	0 %	0 %	50 %	50 %	258404197
93	NC_013223	TC	3	6	79645	79650	0 %	50 %	0 %	50 %	258404197
94	NC_013223	TA	3	6	81539	81544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013223	CT	3	6	81645	81650	0 %	50 %	0 %	50 %	258404199
96	NC_013223	CT	3	6	81841	81846	0 %	50 %	0 %	50 %	258404199
97	NC_013223	AG	3	6	82333	82338	50 %	0 %	50 %	0 %	258404199
98	NC_013223	AG	4	8	82420	82427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013223	AC	3	6	83042	83047	50 %	0 %	0 %	50 %	258404202
100	NC_013223	CT	3	6	83287	83292	0 %	50 %	0 %	50 %	258404202
101	NC_013223	AC	3	6	83474	83479	50 %	0 %	0 %	50 %	258404202
102	NC_013223	GC	3	6	83828	83833	0 %	0 %	50 %	50 %	258404202
103	NC_013223	CA	3	6	84060	84065	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013223	AG	3	6	86787	86792	50 %	0 %	50 %	0 %	258404205
105	NC_013223	AT	3	6	89690	89695	50 %	50 %	0 %	0 %	258404206
106	NC_013223	GT	3	6	90495	90500	0 %	50 %	50 %	0 %	258404207
107	NC_013223	AG	3	6	90826	90831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013223	AG	3	6	91043	91048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013223	CT	3	6	91356	91361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013223	CA	3	6	91676	91681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013223	GT	3	6	92040	92045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013223	AG	3	6	92646	92651	50 %	0 %	50 %	0 %	258404209
113	NC_013223	TA	3	6	92662	92667	50 %	50 %	0 %	0 %	258404209
114	NC_013223	CG	3	6	93423	93428	0 %	0 %	50 %	50 %	258404210
115	NC_013223	AG	3	6	95383	95388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013223	CG	3	6	96440	96445	0 %	0 %	50 %	50 %	258404212
117	NC_013223	GC	3	6	96926	96931	0 %	0 %	50 %	50 %	258404212
118	NC_013223	AT	3	6	97849	97854	50 %	50 %	0 %	0 %	258404213
119	NC_013223	GC	3	6	98029	98034	0 %	0 %	50 %	50 %	258404213
120	NC_013223	TC	3	6	100654	100659	0 %	50 %	0 %	50 %	258404214
121	NC_013223	CG	3	6	102085	102090	0 %	0 %	50 %	50 %	258404214
122	NC_013223	CG	3	6	103033	103038	0 %	0 %	50 %	50 %	258404215
123	NC_013223	AT	3	6	104339	104344	50 %	50 %	0 %	0 %	258404216
124	NC_013223	TG	3	6	105449	105454	0 %	50 %	50 %	0 %	258404217
125	NC_013223	AT	3	6	105568	105573	50 %	50 %	0 %	0 %	258404217
126	NC_013223	TG	3	6	106564	106569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013223	GT	3	6	107275	107280	0 %	50 %	50 %	0 %	258404218
128	NC_013223	TC	3	6	107378	107383	0 %	50 %	0 %	50 %	258404219
129	NC_013223	GT	3	6	109231	109236	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013223	CT	3	6	109814	109819	0 %	50 %	0 %	50 %	258404220
131	NC_013223	GC	3	6	112082	112087	0 %	0 %	50 %	50 %	258404220
132	NC_013223	CG	3	6	114936	114941	0 %	0 %	50 %	50 %	258404222
133	NC_013223	GC	4	8	115639	115646	0 %	0 %	50 %	50 %	258404223
134	NC_013223	CA	3	6	116534	116539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_013223	CG	4	8	120605	120612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_013223	AG	3	6	120959	120964	50 %	0 %	50 %	0 %	258404227
137	NC_013223	GC	3	6	122421	122426	0 %	0 %	50 %	50 %	258404229
138	NC_013223	AT	3	6	124699	124704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013223	GC	3	6	125050	125055	0 %	0 %	50 %	50 %	258404232
140	NC_013223	CA	3	6	126211	126216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013223	AT	3	6	128418	128423	50 %	50 %	0 %	0 %	258404234
142	NC_013223	AT	3	6	129537	129542	50 %	50 %	0 %	0 %	258404234
143	NC_013223	CA	3	6	130990	130995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_013223	GC	3	6	131482	131487	0 %	0 %	50 %	50 %	258404236
145	NC_013223	GC	3	6	132580	132585	0 %	0 %	50 %	50 %	258404236
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147	NC_013223	GT	3	6	133412	133417	0 %	50 %	50 %	0 %	258404236
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