MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 5906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013223	CCAA	2	8	212	219	50 %	0 %	0 %	50 %	258404139
2	NC_013223	TTCC	2	8	2292	2299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013223	AGCG	2	8	2471	2478	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_013223	GTCC	2	8	2905	2912	0 %	25 %	25 %	50 %	258404142
5	NC_013223	TGGC	2	8	2969	2976	0 %	25 %	50 %	25 %	258404142
6	NC_013223	GGGA	2	8	5425	5432	25 %	0 %	75 %	0 %	258404144
7	NC_013223	GGGA	2	8	5776	5783	25 %	0 %	75 %	0 %	258404144
8	NC_013223	AACC	2	8	6227	6234	50 %	0 %	0 %	50 %	258404144
9	NC_013223	GGCT	2	8	6260	6267	0 %	25 %	50 %	25 %	258404144
10	NC_013223	GCCA	2	8	6270	6277	25 %	0 %	25 %	50 %	258404144
11	NC_013223	TGGC	2	8	6492	6499	0 %	25 %	50 %	25 %	258404144
12	NC_013223	AGGA	2	8	6601	6608	50 %	0 %	50 %	0 %	258404144
13	NC_013223	GGGC	2	8	7287	7294	0 %	0 %	75 %	25 %	258404145
14	NC_013223	AAGG	2	8	7752	7759	50 %	0 %	50 %	0 %	258404145
15	NC_013223	TCAG	2	8	8322	8329	25 %	25 %	25 %	25 %	258404146
16	NC_013223	GGCT	2	8	8397	8404	0 %	25 %	50 %	25 %	258404146
17	NC_013223	GCTG	2	8	9204	9211	0 %	25 %	50 %	25 %	258404147
18	NC_013223	GGGA	2	8	9882	9889	25 %	0 %	75 %	0 %	258404147
19	NC_013223	GACG	2	8	10162	10169	25 %	0 %	50 %	25 %	258404147
20	NC_013223	CCAT	2	8	10262	10269	25 %	25 %	0 %	50 %	258404147
21	NC_013223	CGCT	2	8	10584	10591	0 %	25 %	25 %	50 %	258404148
22	NC_013223	GCCA	2	8	11185	11192	25 %	0 %	25 %	50 %	258404148
23	NC_013223	AGGG	2	8	12382	12389	25 %	0 %	75 %	0 %	258404149
24	NC_013223	GAGC	2	8	12415	12422	25 %	0 %	50 %	25 %	258404149
25	NC_013223	CCAG	2	8	13514	13521	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013223	CAGT	2	8	13578	13585	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013223	CAGC	2	8	14029	14036	25 %	0 %	25 %	50 %	258404151
28	NC_013223	GGGC	2	8	14924	14931	0 %	0 %	75 %	25 %	258404151
29	NC_013223	GGGC	2	8	15009	15016	0 %	0 %	75 %	25 %	258404151
30	NC_013223	TCGG	2	8	15284	15291	0 %	25 %	50 %	25 %	258404152
31	NC_013223	CCCT	2	8	15622	15629	0 %	25 %	0 %	75 %	258404152
32	NC_013223	GACC	2	8	16420	16427	25 %	0 %	25 %	50 %	258404152
33	NC_013223	CTGT	2	8	16966	16973	0 %	50 %	25 %	25 %	258404152
34	NC_013223	GCTG	2	8	17210	17217	0 %	25 %	50 %	25 %	258404153
35	NC_013223	GCGG	2	8	17384	17391	0 %	0 %	75 %	25 %	258404153
36	NC_013223	CTGC	2	8	17465	17472	0 %	25 %	25 %	50 %	258404153
37	NC_013223	AAAG	2	8	17546	17553	75 %	0 %	25 %	0 %	258404153
38	NC_013223	CGGT	2	8	18949	18956	0 %	25 %	50 %	25 %	258404155
39	NC_013223	CTGC	2	8	19064	19071	0 %	25 %	25 %	50 %	258404155
40	NC_013223	CTGC	2	8	19413	19420	0 %	25 %	25 %	50 %	258404155
41	NC_013223	CTCG	2	8	19684	19691	0 %	25 %	25 %	50 %	258404156
42	NC_013223	TACC	2	8	20876	20883	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013223	AGGA	2	8	20947	20954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013223	CGGA	2	8	21078	21085	25 %	0 %	50 %	25 %	258404157
45	NC_013223	CAGG	2	8	21270	21277	25 %	0 %	50 %	25 %	258404157
46	NC_013223	CCTC	2	8	21487	21494	0 %	25 %	0 %	75 %	258404157
47	NC_013223	GGGC	2	8	22506	22513	0 %	0 %	75 %	25 %	258404158
48	NC_013223	ATTG	2	8	22752	22759	25 %	50 %	25 %	0 %	258404159
49	NC_013223	GCCA	2	8	22801	22808	25 %	0 %	25 %	50 %	258404159
50	NC_013223	GCAG	2	8	23064	23071	25 %	0 %	50 %	25 %	258404159
51	NC_013223	GCAT	2	8	23339	23346	25 %	25 %	25 %	25 %	258404159
52	NC_013223	GCTG	2	8	24006	24013	0 %	25 %	50 %	25 %	258404159
53	NC_013223	GACG	2	8	24183	24190	25 %	0 %	50 %	25 %	258404159
54	NC_013223	TGGT	2	8	24191	24198	0 %	50 %	50 %	0 %	258404159
55	NC_013223	ATGA	2	8	24239	24246	50 %	25 %	25 %	0 %	258404159
56	NC_013223	CGGT	2	8	24674	24681	0 %	25 %	50 %	25 %	258404160
57	NC_013223	ACTG	2	8	26444	26451	25 %	25 %	25 %	25 %	258404162
58	NC_013223	CTTG	2	8	27203	27210	0 %	50 %	25 %	25 %	258404163
59	NC_013223	CAGT	2	8	27268	27275	25 %	25 %	25 %	25 %	258404163
60	NC_013223	GTCA	2	8	28673	28680	25 %	25 %	25 %	25 %	258404164
61	NC_013223	TCCC	2	8	28831	28838	0 %	25 %	0 %	75 %	258404164
62	NC_013223	GGCC	2	8	28920	28927	0 %	0 %	50 %	50 %	258404165
63	NC_013223	CTGG	2	8	28990	28997	0 %	25 %	50 %	25 %	258404165
64	NC_013223	CTGC	2	8	29830	29837	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013223	CCGG	2	8	29857	29864	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013223	TGGG	2	8	30455	30462	0 %	25 %	75 %	0 %	258404166
67	NC_013223	CCGC	2	8	30980	30987	0 %	0 %	25 %	75 %	258404166
68	NC_013223	TGGG	2	8	31129	31136	0 %	25 %	75 %	0 %	258404166
69	NC_013223	CGCC	2	8	33098	33105	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_013223	TCGC	2	8	33276	33283	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013223	CCGG	2	8	33522	33529	0 %	0 %	50 %	50 %	258404169
72	NC_013223	GCGG	2	8	33801	33808	0 %	0 %	75 %	25 %	258404169
73	NC_013223	GCGG	2	8	34590	34597	0 %	0 %	75 %	25 %	258404170
74	NC_013223	GGAC	2	8	34721	34728	25 %	0 %	50 %	25 %	258404170
75	NC_013223	GGCT	2	8	34739	34746	0 %	25 %	50 %	25 %	258404170
76	NC_013223	TCCT	2	8	35487	35494	0 %	50 %	0 %	50 %	258404171
77	NC_013223	AGGC	2	8	36352	36359	25 %	0 %	50 %	25 %	258404171
78	NC_013223	ACCC	2	8	36463	36470	25 %	0 %	0 %	75 %	258404171
79	NC_013223	ACAA	2	8	36683	36690	75 %	0 %	0 %	25 %	258404171
80	NC_013223	TGGT	2	8	36702	36709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013223	GAAA	2	8	36979	36986	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013223	CGAC	2	8	37669	37676	25 %	0 %	25 %	50 %	258404172
83	NC_013223	CCGG	2	8	38878	38885	0 %	0 %	50 %	50 %	258404172
84	NC_013223	CTGG	2	8	39990	39997	0 %	25 %	50 %	25 %	258404173
85	NC_013223	CCAA	2	8	40154	40161	50 %	0 %	0 %	50 %	258404173
86	NC_013223	TGGA	2	8	40255	40262	25 %	25 %	50 %	0 %	258404173
87	NC_013223	CCGG	2	8	40309	40316	0 %	0 %	50 %	50 %	258404173
88	NC_013223	GGCT	2	8	41902	41909	0 %	25 %	50 %	25 %	258404173
89	NC_013223	AGCC	2	8	42338	42345	25 %	0 %	25 %	50 %	258404173
90	NC_013223	TTGA	2	8	42604	42611	25 %	50 %	25 %	0 %	258404173
91	NC_013223	GGAC	2	8	43083	43090	25 %	0 %	50 %	25 %	258404174
92	NC_013223	GACC	2	8	43104	43111	25 %	0 %	25 %	50 %	258404174
93	NC_013223	TGGA	2	8	43192	43199	25 %	25 %	50 %	0 %	258404174
94	NC_013223	ACGT	2	8	43321	43328	25 %	25 %	25 %	25 %	258404174
95	NC_013223	GCAC	2	8	43559	43566	25 %	0 %	25 %	50 %	258404174
96	NC_013223	CCGG	2	8	43902	43909	0 %	0 %	50 %	50 %	258404174
97	NC_013223	GGAG	2	8	44673	44680	25 %	0 %	75 %	0 %	258404174
98	NC_013223	CGGG	2	8	45719	45726	0 %	0 %	75 %	25 %	258404175
99	NC_013223	TGGA	2	8	47260	47267	25 %	25 %	50 %	0 %	258404176
100	NC_013223	GGTT	2	8	48310	48317	0 %	50 %	50 %	0 %	258404176
101	NC_013223	TGGC	2	8	50073	50080	0 %	25 %	50 %	25 %	258404177
102	NC_013223	GGCT	2	8	53108	53115	0 %	25 %	50 %	25 %	258404179
103	NC_013223	TCCG	2	8	53418	53425	0 %	25 %	25 %	50 %	258404179
104	NC_013223	GCAC	2	8	53874	53881	25 %	0 %	25 %	50 %	258404179
105	NC_013223	CTGG	2	8	54154	54161	0 %	25 %	50 %	25 %	258404179
106	NC_013223	GCTG	2	8	55295	55302	0 %	25 %	50 %	25 %	258404180
107	NC_013223	CCGG	2	8	56093	56100	0 %	0 %	50 %	50 %	258404180
108	NC_013223	CAGC	2	8	56882	56889	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013223	CTTG	2	8	56951	56958	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_013223	TTCC	2	8	57861	57868	0 %	50 %	0 %	50 %	258404181
111	NC_013223	GACC	2	8	58188	58195	25 %	0 %	25 %	50 %	258404181
112	NC_013223	TCGT	2	8	58503	58510	0 %	50 %	25 %	25 %	258404181
113	NC_013223	CCGC	2	8	60194	60201	0 %	0 %	25 %	75 %	258404184
114	NC_013223	AGCG	2	8	60626	60633	25 %	0 %	50 %	25 %	258404185
115	NC_013223	GCAC	2	8	60969	60976	25 %	0 %	25 %	50 %	258404185
116	NC_013223	GATC	2	8	61342	61349	25 %	25 %	25 %	25 %	258404185
117	NC_013223	ATTC	2	8	61800	61807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_013223	CTCC	2	8	61853	61860	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_013223	AGGA	2	8	63893	63900	50 %	0 %	50 %	0 %	258404186
120	NC_013223	CGTG	2	8	63917	63924	0 %	25 %	50 %	25 %	258404186
121	NC_013223	GGAG	2	8	64446	64453	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013223	TGGA	2	8	64641	64648	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013223	ATCC	2	8	65736	65743	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_013223	CTGG	2	8	65838	65845	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_013223	AAGG	2	8	66039	66046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013223	CGGT	2	8	66200	66207	0 %	25 %	50 %	25 %	258404189
127	NC_013223	GGCG	2	8	66222	66229	0 %	0 %	75 %	25 %	258404189
128	NC_013223	TTCT	2	8	66632	66639	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013223	GCCA	2	8	67160	67167	25 %	0 %	25 %	50 %	258404190
130	NC_013223	CAAC	2	8	67484	67491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_013223	CGCC	2	8	67939	67946	0 %	0 %	25 %	75 %	258404191
132	NC_013223	GAGC	2	8	69906	69913	25 %	0 %	50 %	25 %	258404192
133	NC_013223	GGCC	2	8	70247	70254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013223	GCCG	2	8	70789	70796	0 %	0 %	50 %	50 %	258404193
135	NC_013223	AGGC	2	8	70970	70977	25 %	0 %	50 %	25 %	258404193
136	NC_013223	GAAG	2	8	71069	71076	50 %	0 %	50 %	0 %	258404193
137	NC_013223	GCAG	2	8	71600	71607	25 %	0 %	50 %	25 %	258404193
138	NC_013223	CCGG	2	8	72008	72015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_013223	CTTC	2	8	72309	72316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013223	GAAG	2	8	72455	72462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013223	GCGG	2	8	72739	72746	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_013223	CGGA	2	8	72809	72816	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_013223	CTCC	2	8	72924	72931	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_013223	GGGC	2	8	73176	73183	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_013223	CAAG	2	8	73434	73441	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_013223	GCAA	2	8	73553	73560	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013223	ATTT	2	8	73654	73661	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013223	AACG	2	8	74043	74050	50 %	0 %	25 %	25 %	258404194
149	NC_013223	CCGG	2	8	75116	75123	0 %	0 %	50 %	50 %	258404195
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151	NC_013223	GGGC	2	8	76722	76729	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
152	NC_013223	GGCA	2	8	77263	77270	25 %	0 %	50 %	25 %	258404196
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158	NC_013223	GTCC	2	8	79975	79982	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
159	NC_013223	CGGG	2	8	82706	82713	0 %	0 %	75 %	25 %	258404201
160	NC_013223	CGTT	2	8	83553	83560	0 %	50 %	25 %	25 %	258404202
161	NC_013223	AAAT	2	8	83942	83949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_013223	TTGC	2	8	84043	84050	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
163	NC_013223	CTTG	2	8	84162	84169	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
164	NC_013223	GAGC	2	8	85003	85010	25 %	0 %	50 %	25 %	258404203
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167	NC_013223	CGGG	2	8	87221	87228	0 %	0 %	75 %	25 %	258404205
168	NC_013223	TGTT	2	8	87595	87602	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
169	NC_013223	CAGT	2	8	87648	87655	25 %	25 %	25 %	25 %	258404206
170	NC_013223	CCGG	2	8	87723	87730	0 %	0 %	50 %	50 %	258404206
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194	NC_013223	CCAG	2	8	99157	99164	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
195	NC_013223	CTGC	2	8	99306	99313	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
196	NC_013223	CCAG	2	8	100339	100346	25 %	0 %	25 %	50 %	258404214
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253	NC_013223	GTGG	2	8	137937	137944	0 %	25 %	75 %	0 %	258404240
254	NC_013223	CCAC	2	8	139383	139390	25 %	0 %	0 %	75 %	258404242
255	NC_013223	TTGA	3	12	140399	140410	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_013223	CAGG	2	8	141447	141454	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
258	NC_013223	GGAC	2	8	141859	141866	25 %	0 %	50 %	25 %	258404244
259	NC_013223	GGGC	2	8	141889	141896	0 %	0 %	75 %	25 %	258404244
260	NC_013223	GATT	2	8	141963	141970	25 %	50 %	25 %	0 %	258404244
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262	NC_013223	GCTC	2	8	143089	143096	0 %	25 %	25 %	50 %	258404245
263	NC_013223	AGGA	2	8	143774	143781	50 %	0 %	50 %	0 %	258404246
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271	NC_013223	CGAT	2	8	149314	149321	25 %	25 %	25 %	25 %	258404248
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277	NC_013223	AGAA	2	8	153006	153013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
278	NC_013223	GGTC	2	8	153403	153410	0 %	25 %	50 %	25 %	258404252
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