MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013223	GCCC	2	8	197553	197560	0 %	0 %	25 %	75 %	258404291
3502	NC_013223	CCA	2	6	197575	197580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404291
3503	NC_013223	C	6	6	197624	197629	0 %	0 %	0 %	100 %	258404291
3504	NC_013223	GGC	2	6	197639	197644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404291
3505	NC_013223	GTC	2	6	197714	197719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404291
3506	NC_013223	CCCG	2	8	197731	197738	0 %	0 %	25 %	75 %	258404291
3507	NC_013223	TCCGGC	2	12	197763	197774	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258404291
3508	NC_013223	CGC	2	6	197809	197814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404291
3509	NC_013223	TGTGG	2	10	197847	197856	0 %	40 %	60 %	0 %	258404291
3510	NC_013223	ATA	2	6	197906	197911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258404291
3511	NC_013223	ATG	2	6	198000	198005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404291
3512	NC_013223	GTT	2	6	198065	198070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404291
3513	NC_013223	AGG	2	6	198096	198101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404291
3514	NC_013223	TGGGC	2	10	198196	198205	0 %	20 %	60 %	20 %	258404291
3515	NC_013223	AAG	2	6	198212	198217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_013223	CCT	2	6	198289	198294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404292
3517	NC_013223	GCC	2	6	198311	198316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404292
3518	NC_013223	TTC	2	6	198317	198322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404292
3519	NC_013223	TGA	2	6	198325	198330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404292
3520	NC_013223	CCTTC	2	10	198337	198346	0 %	40 %	0 %	60 %	258404292
3521	NC_013223	TCG	2	6	198408	198413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404292
3522	NC_013223	GATC	2	8	198415	198422	25 %	25 %	25 %	25 %	258404292
3523	NC_013223	CCT	2	6	198442	198447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_013223	CA	3	6	198507	198512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3525	NC_013223	CTCG	2	8	198672	198679	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_013223	TCT	2	6	198789	198794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_013223	TTG	2	6	198900	198905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_013223	CA	3	6	198995	199000	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3529	NC_013223	CAT	2	6	199093	199098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404293
3530	NC_013223	GGT	2	6	199103	199108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404293
3531	NC_013223	GATC	2	8	199117	199124	25 %	25 %	25 %	25 %	258404293
3532	NC_013223	GGC	2	6	199126	199131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404293
3533	NC_013223	ACG	2	6	199152	199157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404293
3534	NC_013223	G	6	6	199166	199171	0 %	0 %	100 %	0 %	258404293
3535	NC_013223	GTG	2	6	199241	199246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404293
3536	NC_013223	TGC	2	6	199388	199393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404293
3537	NC_013223	GTG	2	6	199436	199441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404293
3538	NC_013223	AG	4	8	199490	199497	50 %	0 %	50 %	0 %	258404293
3539	NC_013223	GGC	2	6	199524	199529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404293
3540	NC_013223	GA	3	6	199610	199615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_013223	GGAT	2	8	199623	199630	25 %	25 %	50 %	0 %	258404294
3542	NC_013223	GC	3	6	199646	199651	0 %	0 %	50 %	50 %	258404294
3543	NC_013223	GAA	2	6	199667	199672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404294
3544	NC_013223	GTG	2	6	199673	199678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404294
3545	NC_013223	GAG	2	6	199688	199693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404294
3546	NC_013223	GTG	2	6	199704	199709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404294
3547	NC_013223	TGG	2	6	199818	199823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404294
3548	NC_013223	CGCGG	2	10	199853	199862	0 %	0 %	60 %	40 %	258404294
3549	NC_013223	GATC	2	8	199873	199880	25 %	25 %	25 %	25 %	258404294
3550	NC_013223	AGC	3	9	199899	199907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404294
3551	NC_013223	GCT	2	6	199939	199944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404294
3552	NC_013223	GGC	2	6	199969	199974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404294
3553	NC_013223	AAC	2	6	199992	199997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404294
3554	NC_013223	AGG	2	6	200028	200033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404294
3555	NC_013223	G	6	6	200058	200063	0 %	0 %	100 %	0 %	258404294
3556	NC_013223	CGA	2	6	200164	200169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404294
3557	NC_013223	CCA	2	6	200212	200217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404294
3558	NC_013223	GTG	2	6	200241	200246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404294
3559	NC_013223	GCC	2	6	200255	200260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404294
3560	NC_013223	GGA	2	6	200272	200277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404294
3561	NC_013223	GAG	2	6	200294	200299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404294
3562	NC_013223	GGA	2	6	200428	200433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_013223	AG	3	6	200464	200469	50 %	0 %	50 %	0 %	258404295
3564	NC_013223	TGA	2	6	200471	200476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404295
3565	NC_013223	GGA	2	6	200542	200547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404295
3566	NC_013223	TCCAA	2	10	200567	200576	40 %	20 %	0 %	40 %	258404295
3567	NC_013223	GCT	2	6	200613	200618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404295
3568	NC_013223	GCTG	2	8	200682	200689	0 %	25 %	50 %	25 %	258404295
3569	NC_013223	CGG	2	6	200697	200702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404295
3570	NC_013223	GCG	3	9	200720	200728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404295
3571	NC_013223	CGT	2	6	200754	200759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404295
3572	NC_013223	C	6	6	200809	200814	0 %	0 %	0 %	100 %	258404295
3573	NC_013223	GAA	2	6	200824	200829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404295
3574	NC_013223	GGC	2	6	200854	200859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404295
3575	NC_013223	A	6	6	200906	200911	100 %	0 %	0 %	0 %	258404295
3576	NC_013223	TCG	2	6	200942	200947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404295
3577	NC_013223	GCC	2	6	200993	200998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404295
3578	NC_013223	TCA	3	9	201059	201067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404295
3579	NC_013223	CGG	2	6	201141	201146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404295
3580	NC_013223	CGG	2	6	201234	201239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404295
3581	NC_013223	G	7	7	201250	201256	0 %	0 %	100 %	0 %	258404295
3582	NC_013223	G	7	7	201327	201333	0 %	0 %	100 %	0 %	258404295
3583	NC_013223	GC	3	6	201348	201353	0 %	0 %	50 %	50 %	258404295
3584	NC_013223	GCA	2	6	201360	201365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404295
3585	NC_013223	CG	4	8	201408	201415	0 %	0 %	50 %	50 %	258404295
3586	NC_013223	GGA	2	6	201453	201458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_013223	CGG	3	9	201535	201543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404296
3588	NC_013223	TCT	2	6	201705	201710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404296
3589	NC_013223	ATC	2	6	201728	201733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404296
3590	NC_013223	CGC	2	6	201760	201765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404296
3591	NC_013223	TGC	2	6	201831	201836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404296
3592	NC_013223	GCA	2	6	201840	201845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404296
3593	NC_013223	T	6	6	201912	201917	0 %	100 %	0 %	0 %	258404296
3594	NC_013223	CGG	3	9	201934	201942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404296
3595	NC_013223	GCC	2	6	202007	202012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404296
3596	NC_013223	ATT	2	6	202127	202132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404296
3597	NC_013223	TGCTG	2	10	202210	202219	0 %	40 %	40 %	20 %	258404296
3598	NC_013223	GCG	2	6	202278	202283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_013223	TGG	2	6	202317	202322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_013223	CCTGG	2	10	202385	202394	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3601	NC_013223	GTG	2	6	202405	202410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_013223	CGT	2	6	202444	202449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_013223	GTG	2	6	202518	202523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_013223	CTT	2	6	202524	202529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_013223	GTG	2	6	202577	202582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_013223	CGT	2	6	202616	202621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3607	NC_013223	GTG	2	6	202689	202694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_013223	CCTGG	2	10	202728	202737	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3609	NC_013223	CCTG	2	8	202768	202775	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3610	NC_013223	AGG	2	6	202832	202837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404297
3611	NC_013223	GTC	2	6	202840	202845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404297
3612	NC_013223	CGG	2	6	202883	202888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404297
3613	NC_013223	T	6	6	202902	202907	0 %	100 %	0 %	0 %	258404297
3614	NC_013223	ATT	2	6	202930	202935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404297
3615	NC_013223	CGG	2	6	203073	203078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404297
3616	NC_013223	ACG	2	6	203087	203092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404297
3617	NC_013223	GAT	2	6	203218	203223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404297
3618	NC_013223	GT	3	6	203226	203231	0 %	50 %	50 %	0 %	258404297
3619	NC_013223	GCT	2	6	203261	203266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404297
3620	NC_013223	GCG	2	6	203400	203405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_013223	GGGC	2	8	203409	203416	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3622	NC_013223	CT	3	6	203442	203447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3623	NC_013223	GCC	2	6	203591	203596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404298
3624	NC_013223	TCC	2	6	203624	203629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404298
3625	NC_013223	CAG	2	6	203668	203673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404298
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3749	NC_013223	GCCAC	2	10	211306	211315	20 %	0 %	20 %	60 %	258404305
3750	NC_013223	GTG	2	6	211321	211326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404305
3751	NC_013223	TGTGAT	2	12	211360	211371	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3752	NC_013223	GA	3	6	211403	211408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3753	NC_013223	TCT	2	6	211410	211415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3754	NC_013223	T	6	6	211417	211422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3755	NC_013223	A	7	7	211472	211478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3756	NC_013223	GCT	2	6	211482	211487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3758	NC_013223	GA	4	8	211614	211621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3759	NC_013223	AGG	2	6	211692	211697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3760	NC_013223	AGGA	2	8	211761	211768	50 %	0 %	50 %	0 %	258404306
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3762	NC_013223	CGGA	2	8	211785	211792	25 %	0 %	50 %	25 %	258404306
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3766	NC_013223	CCG	2	6	211972	211977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404306
3767	NC_013223	AGG	2	6	212034	212039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404306
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3773	NC_013223	GCT	2	6	212476	212481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404306
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3783	NC_013223	CCCGG	2	10	213157	213166	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3784	NC_013223	GGA	2	6	213302	213307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404307
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3787	NC_013223	ATCGG	2	10	213368	213377	20 %	20 %	40 %	20 %	258404307
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3791	NC_013223	T	6	6	213690	213695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3872	NC_013223	GTT	2	6	217934	217939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404309
3873	NC_013223	CGG	2	6	217953	217958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3874	NC_013223	G	6	6	217989	217994	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3875	NC_013223	GCC	2	6	218072	218077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3876	NC_013223	CAGT	2	8	218122	218129	25 %	25 %	25 %	25 %	258404310
3877	NC_013223	CTG	2	6	218168	218173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404310
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3879	NC_013223	T	6	6	218285	218290	0 %	100 %	0 %	0 %	258404310
3880	NC_013223	TGC	2	6	218329	218334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404310
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3887	NC_013223	GTT	2	6	218974	218979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404310
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3902	NC_013223	AG	3	6	219762	219767	50 %	0 %	50 %	0 %	258404311
3903	NC_013223	TAC	2	6	219811	219816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3904	NC_013223	GTGCT	2	10	219956	219965	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3905	NC_013223	TGG	2	6	220035	220040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404312
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3952	NC_013223	A	6	6	222462	222467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3953	NC_013223	TGC	2	6	222483	222488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3955	NC_013223	GTTTT	2	10	222576	222585	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3956	NC_013223	GTAT	2	8	222586	222593	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3957	NC_013223	A	7	7	222600	222606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3958	NC_013223	ATC	2	6	222657	222662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3960	NC_013223	GGT	2	6	222795	222800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3961	NC_013223	TGCA	2	8	222878	222885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3962	NC_013223	AGG	2	6	222997	223002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3963	NC_013223	CCCA	2	8	223119	223126	25 %	0 %	0 %	75 %	258404314
3964	NC_013223	AGG	2	6	223144	223149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404314
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3973	NC_013223	GCT	2	6	223940	223945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404314
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3986	NC_013223	GCA	2	6	224765	224770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404314
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3988	NC_013223	GGCCCA	2	12	224786	224797	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258404314
3989	NC_013223	GAAG	2	8	225024	225031	50 %	0 %	50 %	0 %	258404314
3990	NC_013223	CGG	2	6	225047	225052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404314
3991	NC_013223	GAT	2	6	225054	225059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404314
3992	NC_013223	GTG	2	6	225108	225113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404314
3993	NC_013223	GC	3	6	225125	225130	0 %	0 %	50 %	50 %	258404314
3994	NC_013223	CAG	2	6	225150	225155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404314
3995	NC_013223	CGCA	2	8	225159	225166	25 %	0 %	25 %	50 %	258404314
3996	NC_013223	GTG	2	6	225237	225242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404314
3997	NC_013223	CCG	2	6	225341	225346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404314
3998	NC_013223	G	6	6	225346	225351	0 %	0 %	100 %	0 %	258404314
3999	NC_013223	CAA	2	6	225379	225384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4000	NC_013223	G	6	6	225386	225391	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding

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