MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013223	G	7	7	169947	169953	0 %	0 %	100 %	0 %	258404267
3002	NC_013223	CGT	2	6	169989	169994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404267
3003	NC_013223	GCTTG	2	10	170010	170019	0 %	40 %	40 %	20 %	258404267
3004	NC_013223	ACC	2	6	170128	170133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404267
3005	NC_013223	GTC	2	6	170140	170145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404267
3006	NC_013223	GGCGA	2	10	170155	170164	20 %	0 %	60 %	20 %	258404267
3007	NC_013223	TCC	2	6	170224	170229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404267
3008	NC_013223	TCC	2	6	170245	170250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404267
3009	NC_013223	TTC	2	6	170289	170294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404267
3010	NC_013223	CGGTCG	2	12	170296	170307	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258404267
3011	NC_013223	CCG	2	6	170385	170390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404267
3012	NC_013223	GGC	2	6	170391	170396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404267
3013	NC_013223	CGC	2	6	170417	170422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404267
3014	NC_013223	C	6	6	170424	170429	0 %	0 %	0 %	100 %	258404267
3015	NC_013223	CGT	2	6	170529	170534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404267
3016	NC_013223	CAT	2	6	170538	170543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404267
3017	NC_013223	G	7	7	170592	170598	0 %	0 %	100 %	0 %	258404268
3018	NC_013223	CCG	2	6	170617	170622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404268
3019	NC_013223	CAT	2	6	170636	170641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404268
3020	NC_013223	TGG	2	6	170671	170676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404268
3021	NC_013223	TCG	2	6	170751	170756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404268
3022	NC_013223	CAA	2	6	170809	170814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404268
3023	NC_013223	TCG	2	6	170829	170834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404268
3024	NC_013223	CGT	2	6	171085	171090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404268
3025	NC_013223	GCC	2	6	171161	171166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404268
3026	NC_013223	TGGT	2	8	171177	171184	0 %	50 %	50 %	0 %	258404268
3027	NC_013223	TTG	2	6	171198	171203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404268
3028	NC_013223	T	6	6	171272	171277	0 %	100 %	0 %	0 %	258404268
3029	NC_013223	GCC	2	6	171279	171284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404268
3030	NC_013223	GGT	2	6	171304	171309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404268
3031	NC_013223	TGA	2	6	171436	171441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404268
3032	NC_013223	CGC	2	6	171445	171450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404268
3033	NC_013223	CTT	2	6	171476	171481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404268
3034	NC_013223	CTT	2	6	171500	171505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404268
3035	NC_013223	CCG	2	6	171602	171607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404268
3036	NC_013223	TCCT	2	8	171641	171648	0 %	50 %	0 %	50 %	258404268
3037	NC_013223	GCC	2	6	171758	171763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404268
3038	NC_013223	CAC	2	6	171784	171789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404268
3039	NC_013223	GCAG	2	8	171820	171827	25 %	0 %	50 %	25 %	258404268
3040	NC_013223	ACC	2	6	171997	172002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404268
3041	NC_013223	CGAGGA	2	12	172090	172101	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	258404268
3042	NC_013223	AC	3	6	172138	172143	50 %	0 %	0 %	50 %	258404268
3043	NC_013223	GAT	2	6	172166	172171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404268
3044	NC_013223	T	8	8	172181	172188	0 %	100 %	0 %	0 %	258404268
3045	NC_013223	ATTTT	2	10	172216	172225	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_013223	GCA	2	6	172235	172240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_013223	TGC	2	6	172279	172284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_013223	T	8	8	172360	172367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_013223	G	6	6	172436	172441	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_013223	T	6	6	172450	172455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_013223	TG	3	6	172480	172485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_013223	A	7	7	172506	172512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_013223	T	6	6	172517	172522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_013223	TGT	2	6	172575	172580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_013223	CAA	2	6	172586	172591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_013223	AGG	2	6	172593	172598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_013223	AGA	2	6	172790	172795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404269
3058	NC_013223	ATA	2	6	172811	172816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258404269
3059	NC_013223	A	7	7	172841	172847	100 %	0 %	0 %	0 %	258404269
3060	NC_013223	TCGA	2	8	172887	172894	25 %	25 %	25 %	25 %	258404269
3061	NC_013223	AGG	2	6	172928	172933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404269
3062	NC_013223	TGG	2	6	172946	172951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404269
3063	NC_013223	GAG	2	6	172990	172995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404269
3064	NC_013223	GGT	2	6	173065	173070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404269
3065	NC_013223	CGG	2	6	173149	173154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_013223	GGT	2	6	173161	173166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_013223	CGC	2	6	173220	173225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404270
3068	NC_013223	CCG	2	6	173266	173271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404270
3069	NC_013223	CCGA	2	8	173310	173317	25 %	0 %	25 %	50 %	258404270
3070	NC_013223	A	6	6	173332	173337	100 %	0 %	0 %	0 %	258404270
3071	NC_013223	A	7	7	173432	173438	100 %	0 %	0 %	0 %	258404270
3072	NC_013223	AGG	2	6	173445	173450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404270
3073	NC_013223	CCGAGC	2	12	173454	173465	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258404270
3074	NC_013223	TG	3	6	173524	173529	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_013223	GGA	2	6	173806	173811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_013223	TGG	2	6	173923	173928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404271
3077	NC_013223	GAA	2	6	173979	173984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404271
3078	NC_013223	CGC	2	6	174038	174043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404271
3079	NC_013223	TAA	2	6	174100	174105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258404271
3080	NC_013223	CAT	2	6	174125	174130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404271
3081	NC_013223	CGG	2	6	174230	174235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404271
3082	NC_013223	GAA	2	6	174363	174368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404271
3083	NC_013223	CGG	2	6	174439	174444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404271
3084	NC_013223	CGT	2	6	174503	174508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404271
3085	NC_013223	TGC	2	6	174661	174666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404271
3086	NC_013223	C	6	6	174800	174805	0 %	0 %	0 %	100 %	258404271
3087	NC_013223	TGT	2	6	174809	174814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404271
3088	NC_013223	AGC	2	6	174831	174836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404271
3089	NC_013223	GTGCGG	2	12	174889	174900	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	258404271
3090	NC_013223	GCG	2	6	174959	174964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404271
3091	NC_013223	CAT	2	6	175188	175193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_013223	TGC	2	6	175357	175362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404272
3093	NC_013223	TGG	2	6	175424	175429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404272
3094	NC_013223	GGA	2	6	175562	175567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404272
3095	NC_013223	CGA	2	6	175658	175663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404272
3096	NC_013223	AGA	2	6	175667	175672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404272
3097	NC_013223	GATC	2	8	175739	175746	25 %	25 %	25 %	25 %	258404272
3098	NC_013223	GGC	2	6	175913	175918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404272
3099	NC_013223	CAAT	2	8	175975	175982	50 %	25 %	0 %	25 %	258404272
3100	NC_013223	GTGCG	2	10	176021	176030	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3101	NC_013223	GCAG	2	8	176062	176069	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3102	NC_013223	CGC	2	6	176106	176111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3103	NC_013223	GCG	2	6	176135	176140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_013223	GTC	2	6	176171	176176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404273
3105	NC_013223	GGT	2	6	176200	176205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404273
3106	NC_013223	GAC	2	6	176249	176254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404273
3107	NC_013223	GGA	2	6	176285	176290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404273
3108	NC_013223	GCA	2	6	176335	176340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404273
3109	NC_013223	ATA	2	6	176358	176363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258404273
3110	NC_013223	ACC	2	6	176413	176418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404273
3111	NC_013223	GAC	2	6	176477	176482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404273
3112	NC_013223	GTG	2	6	176523	176528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404273
3113	NC_013223	CAG	2	6	176552	176557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404273
3114	NC_013223	CAC	2	6	176564	176569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404273
3115	NC_013223	GCG	2	6	176598	176603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404273
3116	NC_013223	AGG	2	6	176664	176669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404273
3117	NC_013223	GCC	2	6	176681	176686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404273
3118	NC_013223	GAT	2	6	176891	176896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404273
3119	NC_013223	TGG	2	6	176956	176961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404273
3120	NC_013223	GCA	2	6	176967	176972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404273
3121	NC_013223	CGGC	2	8	177073	177080	0 %	0 %	50 %	50 %	258404273
3122	NC_013223	AAAC	2	8	177148	177155	75 %	0 %	0 %	25 %	258404273
3123	NC_013223	TCT	2	6	177177	177182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_013223	CGC	2	6	177255	177260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_013223	CGG	2	6	177264	177269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3126	NC_013223	GCC	2	6	177315	177320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_013223	TAA	2	6	177378	177383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258404274
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3225	NC_013223	ATT	2	6	182397	182402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3241	NC_013223	GCA	2	6	183399	183404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404280
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3243	NC_013223	ACG	2	6	183467	183472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404280
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3373	NC_013223	AAAT	2	8	190942	190949	75 %	25 %	0 %	0 %	258404284
3374	NC_013223	CAAC	2	8	191089	191096	50 %	0 %	0 %	50 %	258404285
3375	NC_013223	GAG	2	6	191124	191129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404285
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3377	NC_013223	GAG	2	6	191442	191447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404285
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3454	NC_013223	GAAG	2	8	195202	195209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3487	NC_013223	GC	3	6	196755	196760	0 %	0 %	50 %	50 %	258404290
3488	NC_013223	TGG	2	6	196792	196797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404290
3489	NC_013223	CCG	2	6	196907	196912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3490	NC_013223	GGT	2	6	196933	196938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3491	NC_013223	CCT	2	6	196965	196970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3492	NC_013223	TCC	2	6	196978	196983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3493	NC_013223	CCTG	2	8	197004	197011	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3494	NC_013223	GC	3	6	197110	197115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3495	NC_013223	AGG	2	6	197122	197127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404291
3496	NC_013223	GCG	2	6	197202	197207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404291
3497	NC_013223	CGC	2	6	197434	197439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404291
3498	NC_013223	GAG	2	6	197442	197447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404291
3499	NC_013223	GCG	2	6	197460	197465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404291
3500	NC_013223	CGA	2	6	197539	197544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404291

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