MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013223	TCT	2	6	85807	85812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404203
1502	NC_013223	AAG	2	6	85818	85823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404203
1503	NC_013223	GGA	2	6	85909	85914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_013223	CAGG	2	8	85990	85997	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_013223	GAAGAG	2	12	86011	86022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_013223	GGT	2	6	86042	86047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_013223	CGG	2	6	86080	86085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_013223	AGA	2	6	86098	86103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_013223	TAGAG	2	10	86117	86126	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_013223	CGC	3	9	86173	86181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404204
1511	NC_013223	CAG	2	6	86185	86190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404204
1512	NC_013223	CCA	2	6	86208	86213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404204
1513	NC_013223	TGC	2	6	86251	86256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404204
1514	NC_013223	TCG	2	6	86313	86318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404204
1515	NC_013223	GTC	2	6	86402	86407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404204
1516	NC_013223	GAG	2	6	86469	86474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404204
1517	NC_013223	CGC	2	6	86488	86493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404204
1518	NC_013223	TCG	2	6	86538	86543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404204
1519	NC_013223	GTC	2	6	86588	86593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404204
1520	NC_013223	TTC	2	6	86684	86689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404204
1521	NC_013223	CCT	2	6	86714	86719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404205
1522	NC_013223	GGA	2	6	86756	86761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404205
1523	NC_013223	AG	3	6	86787	86792	50 %	0 %	50 %	0 %	258404205
1524	NC_013223	ACA	2	6	86876	86881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404205
1525	NC_013223	GGA	2	6	86945	86950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404205
1526	NC_013223	ATCGGG	2	12	87004	87015	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258404205
1527	NC_013223	GAA	2	6	87084	87089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404205
1528	NC_013223	CGG	2	6	87151	87156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404205
1529	NC_013223	GCCAG	2	10	87174	87183	20 %	0 %	40 %	40 %	258404205
1530	NC_013223	GAA	2	6	87197	87202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404205
1531	NC_013223	CGGG	2	8	87221	87228	0 %	0 %	75 %	25 %	258404205
1532	NC_013223	AGA	2	6	87513	87518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_013223	CCCCCT	2	12	87550	87561	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
1534	NC_013223	AGGGGG	2	12	87567	87578	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_013223	TGC	2	6	87589	87594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_013223	TGTT	2	8	87595	87602	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_013223	GTC	2	6	87603	87608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_013223	CCG	2	6	87623	87628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_013223	CAGT	2	8	87648	87655	25 %	25 %	25 %	25 %	258404206
1540	NC_013223	TTC	2	6	87691	87696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404206
1541	NC_013223	CCGG	2	8	87723	87730	0 %	0 %	50 %	50 %	258404206
1542	NC_013223	TAG	2	6	87731	87736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404206
1543	NC_013223	ACC	2	6	87740	87745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404206
1544	NC_013223	AAGG	2	8	87925	87932	50 %	0 %	50 %	0 %	258404206
1545	NC_013223	GCC	2	6	87946	87951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404206
1546	NC_013223	GCG	2	6	87989	87994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404206
1547	NC_013223	GTA	2	6	88039	88044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404206
1548	NC_013223	CGG	2	6	88122	88127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404206
1549	NC_013223	AGGC	2	8	88259	88266	25 %	0 %	50 %	25 %	258404206
1550	NC_013223	TGT	2	6	88359	88364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404206
1551	NC_013223	C	6	6	88528	88533	0 %	0 %	0 %	100 %	258404206
1552	NC_013223	GCA	2	6	88573	88578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404206
1553	NC_013223	TCT	2	6	88592	88597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404206
1554	NC_013223	TGA	2	6	88614	88619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404206
1555	NC_013223	TTG	2	6	88781	88786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404206
1556	NC_013223	CATTTC	2	12	88789	88800	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	258404206
1557	NC_013223	CAG	2	6	88828	88833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404206
1558	NC_013223	CGC	2	6	88836	88841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404206
1559	NC_013223	GCC	2	6	88915	88920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404206
1560	NC_013223	TTG	2	6	89030	89035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404206
1561	NC_013223	CTT	2	6	89256	89261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404206
1562	NC_013223	CCT	2	6	89415	89420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404206
1563	NC_013223	GGC	2	6	89436	89441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404206
1564	NC_013223	GCGA	2	8	89572	89579	25 %	0 %	50 %	25 %	258404206
1565	NC_013223	AT	3	6	89690	89695	50 %	50 %	0 %	0 %	258404206
1566	NC_013223	TCT	2	6	89735	89740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404206
1567	NC_013223	TCC	2	6	89753	89758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1568	NC_013223	GAC	2	6	89794	89799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_013223	TGC	2	6	89809	89814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_013223	CAGA	2	8	89820	89827	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1571	NC_013223	TGT	2	6	89871	89876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_013223	TTCCA	2	10	89924	89933	20 %	40 %	0 %	40 %	258404207
1573	NC_013223	TGG	2	6	89950	89955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404207
1574	NC_013223	GTC	2	6	89963	89968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404207
1575	NC_013223	GGC	2	6	89979	89984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404207
1576	NC_013223	CAGG	2	8	90047	90054	25 %	0 %	50 %	25 %	258404207
1577	NC_013223	CCA	2	6	90130	90135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404207
1578	NC_013223	ACG	2	6	90168	90173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404207
1579	NC_013223	GCAGG	2	10	90203	90212	20 %	0 %	60 %	20 %	258404207
1580	NC_013223	GTCCA	2	10	90242	90251	20 %	20 %	20 %	40 %	258404207
1581	NC_013223	CGC	2	6	90268	90273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404207
1582	NC_013223	TGA	2	6	90277	90282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404207
1583	NC_013223	AGCC	2	8	90368	90375	25 %	0 %	25 %	50 %	258404207
1584	NC_013223	ACC	2	6	90410	90415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404207
1585	NC_013223	GT	3	6	90495	90500	0 %	50 %	50 %	0 %	258404207
1586	NC_013223	TGG	2	6	90563	90568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_013223	CAC	2	6	90569	90574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1588	NC_013223	GCAT	2	8	90603	90610	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1589	NC_013223	GTG	2	6	90707	90712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_013223	ATC	2	6	90713	90718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_013223	AG	3	6	90826	90831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_013223	A	6	6	90876	90881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_013223	GCT	2	6	90896	90901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_013223	GCC	2	6	90962	90967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_013223	GGA	2	6	90987	90992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_013223	GCA	2	6	91037	91042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_013223	AG	3	6	91043	91048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_013223	TGT	2	6	91065	91070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404208
1599	NC_013223	TTTA	2	8	91184	91191	25 %	75 %	0 %	0 %	258404208
1600	NC_013223	G	6	6	91205	91210	0 %	0 %	100 %	0 %	258404208
1601	NC_013223	CTG	2	6	91256	91261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404208
1602	NC_013223	CGG	2	6	91273	91278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404208
1603	NC_013223	CTG	2	6	91329	91334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404208
1604	NC_013223	CT	3	6	91356	91361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_013223	GGC	2	6	91408	91413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_013223	GCC	2	6	91464	91469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_013223	TCT	2	6	91470	91475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_013223	TTG	2	6	91581	91586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_013223	CA	3	6	91676	91681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1610	NC_013223	GCT	2	6	91768	91773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_013223	CCA	2	6	91795	91800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_013223	GTG	2	6	91853	91858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_013223	T	7	7	91873	91879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_013223	TAA	2	6	91889	91894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_013223	CGT	2	6	91975	91980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_013223	CAC	2	6	92000	92005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1617	NC_013223	GT	3	6	92040	92045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_013223	A	6	6	92147	92152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_013223	GGT	2	6	92225	92230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_013223	GTT	2	6	92340	92345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404209
1621	NC_013223	ATG	2	6	92383	92388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404209
1622	NC_013223	CTAT	2	8	92454	92461	25 %	50 %	0 %	25 %	258404209
1623	NC_013223	AG	3	6	92646	92651	50 %	0 %	50 %	0 %	258404209
1624	NC_013223	TA	3	6	92662	92667	50 %	50 %	0 %	0 %	258404209
1625	NC_013223	TTG	2	6	92707	92712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404209
1626	NC_013223	GCG	2	6	92725	92730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404209
1627	NC_013223	AGGG	2	8	92777	92784	25 %	0 %	75 %	0 %	258404209
1628	NC_013223	CGG	2	6	92869	92874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404210
1629	NC_013223	CCA	2	6	92907	92912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404210
1630	NC_013223	TGT	2	6	92925	92930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404210
1631	NC_013223	CAGC	2	8	92938	92945	25 %	0 %	25 %	50 %	258404210
1632	NC_013223	CTG	2	6	93026	93031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404210
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1675	NC_013223	AG	3	6	95383	95388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1758	NC_013223	CAG	2	6	100235	100240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404214
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1823	NC_013223	TGCCGG	2	12	103053	103064	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258404215
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1858	NC_013223	GAC	2	6	104386	104391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404216
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1863	NC_013223	T	6	6	104623	104628	0 %	100 %	0 %	0 %	258404216
1864	NC_013223	CCAG	2	8	104639	104646	25 %	0 %	25 %	50 %	258404216
1865	NC_013223	GAC	2	6	104683	104688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404216
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1871	NC_013223	CGT	2	6	105033	105038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404216
1872	NC_013223	GGT	3	9	105068	105076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1873	NC_013223	GCA	2	6	105183	105188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1874	NC_013223	CATA	2	8	105220	105227	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1875	NC_013223	ATT	2	6	105266	105271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1876	NC_013223	TGC	2	6	105316	105321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404217
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