MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013223	ACA	2	6	58326	58331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404181
1002	NC_013223	GAC	2	6	58448	58453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404181
1003	NC_013223	GCC	2	6	58467	58472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404181
1004	NC_013223	TCGT	2	8	58503	58510	0 %	50 %	25 %	25 %	258404181
1005	NC_013223	GAC	2	6	58592	58597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404181
1006	NC_013223	TGA	2	6	58945	58950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404181
1007	NC_013223	CAG	2	6	58967	58972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404181
1008	NC_013223	GCC	2	6	58991	58996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404181
1009	NC_013223	TGG	2	6	59082	59087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404181
1010	NC_013223	GCG	2	6	59133	59138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404181
1011	NC_013223	CGA	2	6	59164	59169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404181
1012	NC_013223	CAT	2	6	59170	59175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404181
1013	NC_013223	GGA	2	6	59216	59221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404181
1014	NC_013223	GGT	2	6	59285	59290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404182
1015	NC_013223	GAG	2	6	59349	59354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404182
1016	NC_013223	TGG	2	6	59368	59373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404182
1017	NC_013223	TTC	2	6	59595	59600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404182
1018	NC_013223	AAC	2	6	59686	59691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404182
1019	NC_013223	GA	3	6	59837	59842	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_013223	GGA	2	6	59849	59854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_013223	GCC	2	6	59886	59891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404183
1022	NC_013223	CGC	2	6	59925	59930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404183
1023	NC_013223	CCG	2	6	59942	59947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404183
1024	NC_013223	A	6	6	59961	59966	100 %	0 %	0 %	0 %	258404183
1025	NC_013223	AGG	2	6	60086	60091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_013223	CCGC	2	8	60194	60201	0 %	0 %	25 %	75 %	258404184
1027	NC_013223	CGC	2	6	60241	60246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404184
1028	NC_013223	GCC	3	9	60292	60300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404184
1029	NC_013223	GAA	2	6	60342	60347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404184
1030	NC_013223	AGCG	2	8	60626	60633	25 %	0 %	50 %	25 %	258404185
1031	NC_013223	CAA	2	6	60655	60660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404185
1032	NC_013223	GAA	2	6	60668	60673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404185
1033	NC_013223	GCA	2	6	60723	60728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404185
1034	NC_013223	GGCAG	2	10	60774	60783	20 %	0 %	60 %	20 %	258404185
1035	NC_013223	CCG	2	6	60906	60911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404185
1036	NC_013223	GCAC	2	8	60969	60976	25 %	0 %	25 %	50 %	258404185
1037	NC_013223	GGC	2	6	61024	61029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404185
1038	NC_013223	CGC	2	6	61052	61057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404185
1039	NC_013223	CCT	2	6	61152	61157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404185
1040	NC_013223	CCA	2	6	61162	61167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404185
1041	NC_013223	T	6	6	61170	61175	0 %	100 %	0 %	0 %	258404185
1042	NC_013223	T	7	7	61207	61213	0 %	100 %	0 %	0 %	258404185
1043	NC_013223	GCG	2	6	61260	61265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404185
1044	NC_013223	GATC	2	8	61342	61349	25 %	25 %	25 %	25 %	258404185
1045	NC_013223	CCG	2	6	61350	61355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404185
1046	NC_013223	GAA	2	6	61540	61545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_013223	ATC	2	6	61568	61573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_013223	CCT	2	6	61598	61603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_013223	A	6	6	61750	61755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_013223	ATTC	2	8	61800	61807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_013223	CTCC	2	8	61853	61860	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1052	NC_013223	TGC	2	6	61864	61869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_013223	GA	3	6	61872	61877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_013223	TGT	2	6	61945	61950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_013223	AAT	2	6	61962	61967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258404186
1056	NC_013223	CTC	2	6	61969	61974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404186
1057	NC_013223	GGT	2	6	62097	62102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404186
1058	NC_013223	CGG	2	6	62172	62177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404186
1059	NC_013223	GGC	2	6	62217	62222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404186
1060	NC_013223	TCAAGA	2	12	62273	62284	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	258404186
1061	NC_013223	ACTCGG	2	12	62337	62348	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258404186
1062	NC_013223	CTT	2	6	62399	62404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404186
1063	NC_013223	CCTGGA	2	12	62415	62426	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258404186
1064	NC_013223	TGC	2	6	62502	62507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404186
1065	NC_013223	CAA	2	6	62706	62711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404186
1066	NC_013223	TCG	2	6	62714	62719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404186
1067	NC_013223	CCG	2	6	62810	62815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404186
1068	NC_013223	ACT	2	6	62833	62838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404186
1069	NC_013223	CTC	2	6	62875	62880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404186
1070	NC_013223	GCA	2	6	62951	62956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404186
1071	NC_013223	TCC	2	6	63037	63042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404186
1072	NC_013223	GTG	2	6	63056	63061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404186
1073	NC_013223	CGC	3	9	63096	63104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404186
1074	NC_013223	CAG	2	6	63150	63155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404186
1075	NC_013223	TGGACG	2	12	63224	63235	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	258404186
1076	NC_013223	TGT	2	6	63273	63278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404186
1077	NC_013223	GAG	2	6	63358	63363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404186
1078	NC_013223	T	6	6	63459	63464	0 %	100 %	0 %	0 %	258404186
1079	NC_013223	CAG	2	6	63466	63471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404186
1080	NC_013223	GAG	2	6	63742	63747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404186
1081	NC_013223	GCC	3	9	63776	63784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404186
1082	NC_013223	CGA	2	6	63807	63812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404186
1083	NC_013223	AGGA	2	8	63893	63900	50 %	0 %	50 %	0 %	258404186
1084	NC_013223	CGTG	2	8	63917	63924	0 %	25 %	50 %	25 %	258404186
1085	NC_013223	AGG	2	6	63944	63949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404186
1086	NC_013223	ATC	2	6	63955	63960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404186
1087	NC_013223	GCC	2	6	64051	64056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404186
1088	NC_013223	CCG	2	6	64093	64098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404186
1089	NC_013223	AGC	2	6	64178	64183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404186
1090	NC_013223	TGG	2	6	64202	64207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404186
1091	NC_013223	AAG	2	6	64273	64278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404186
1092	NC_013223	AGG	2	6	64292	64297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404186
1093	NC_013223	TCC	2	6	64385	64390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_013223	CCG	2	6	64433	64438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_013223	GGAG	2	8	64446	64453	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_013223	TGA	2	6	64464	64469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_013223	TGC	2	6	64547	64552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_013223	CAC	2	6	64580	64585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_013223	TGGA	2	8	64641	64648	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_013223	C	6	6	64728	64733	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1101	NC_013223	GCC	2	6	64768	64773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_013223	TGG	2	6	64832	64837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404187
1103	NC_013223	GCA	3	9	64865	64873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404187
1104	NC_013223	TG	3	6	64910	64915	0 %	50 %	50 %	0 %	258404187
1105	NC_013223	CTC	2	6	65058	65063	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404187
1106	NC_013223	TGA	2	6	65097	65102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404187
1107	NC_013223	TGG	2	6	65118	65123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404188
1108	NC_013223	TA	3	6	65199	65204	50 %	50 %	0 %	0 %	258404188
1109	NC_013223	CCT	2	6	65215	65220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404188
1110	NC_013223	TCG	2	6	65226	65231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404188
1111	NC_013223	GC	3	6	65263	65268	0 %	0 %	50 %	50 %	258404188
1112	NC_013223	CTA	2	6	65407	65412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404188
1113	NC_013223	CT	3	6	65417	65422	0 %	50 %	0 %	50 %	258404188
1114	NC_013223	TGG	2	6	65531	65536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404188
1115	NC_013223	ACG	2	6	65570	65575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404188
1116	NC_013223	TAT	2	6	65593	65598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404188
1117	NC_013223	TCA	2	6	65637	65642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404188
1118	NC_013223	CTG	2	6	65660	65665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404188
1119	NC_013223	ATCC	2	8	65736	65743	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_013223	GAA	2	6	65831	65836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_013223	CTGG	2	8	65838	65845	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_013223	CCA	2	6	65951	65956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1123	NC_013223	CTCCC	2	10	65983	65992	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1124	NC_013223	AGA	2	6	66002	66007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_013223	AAGG	2	8	66039	66046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_013223	CGG	2	6	66067	66072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_013223	AGCCGA	2	12	66073	66084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_013223	T	6	6	66102	66107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_013223	CGG	2	6	66168	66173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404189
1130	NC_013223	CCT	2	6	66177	66182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404189
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1132	NC_013223	GAC	2	6	66216	66221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404189
1133	NC_013223	GGCG	2	8	66222	66229	0 %	0 %	75 %	25 %	258404189
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1136	NC_013223	CGC	2	6	66463	66468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_013223	G	7	7	66491	66497	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_013223	AGA	2	6	66509	66514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_013223	GGA	2	6	66551	66556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1140	NC_013223	TGC	2	6	66576	66581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1141	NC_013223	TTCT	2	8	66632	66639	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1142	NC_013223	CGC	2	6	66709	66714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1143	NC_013223	TCC	2	6	66721	66726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1144	NC_013223	CCG	2	6	66912	66917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404190
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1156	NC_013223	GGT	2	6	67324	67329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1157	NC_013223	CCG	2	6	67459	67464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1159	NC_013223	GAC	2	6	67586	67591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404191
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1182	NC_013223	GCC	2	6	68946	68951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1208	NC_013223	CGC	2	6	70274	70279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1237	NC_013223	GCAG	2	8	71600	71607	25 %	0 %	50 %	25 %	258404193
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1240	NC_013223	GAA	2	6	71805	71810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1241	NC_013223	GAG	2	6	71830	71835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1242	NC_013223	GGA	2	6	71838	71843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1243	NC_013223	GAC	2	6	71853	71858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1244	NC_013223	AG	3	6	71990	71995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1245	NC_013223	CCGG	2	8	72008	72015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1246	NC_013223	GA	3	6	72088	72093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_013223	AG	3	6	72239	72244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1248	NC_013223	CTTC	2	8	72309	72316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1249	NC_013223	GAA	2	6	72367	72372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1250	NC_013223	GGCGCC	2	12	72377	72388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1251	NC_013223	GAAGAG	2	12	72398	72409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1252	NC_013223	GGT	2	6	72429	72434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1253	NC_013223	GAAG	2	8	72455	72462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1254	NC_013223	AGA	2	6	72496	72501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_013223	CGG	2	6	72512	72517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1256	NC_013223	CCG	2	6	72691	72696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1258	NC_013223	A	6	6	72749	72754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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