MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013223	CGA	2	6	307510	307515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404384
5502	NC_013223	ATC	2	6	307631	307636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404384
5503	NC_013223	ACC	2	6	307685	307690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404384
5504	NC_013223	CTG	3	9	307722	307730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404384
5505	NC_013223	GAAC	2	8	307745	307752	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5506	NC_013223	CGG	2	6	308075	308080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404385
5507	NC_013223	ATCCC	2	10	308312	308321	20 %	20 %	0 %	60 %	258404385
5508	NC_013223	GAA	2	6	308377	308382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404385
5509	NC_013223	TTA	2	6	308541	308546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404385
5510	NC_013223	TGA	2	6	308607	308612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404385
5511	NC_013223	GGC	2	6	308650	308655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404385
5512	NC_013223	GCG	2	6	308753	308758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404385
5513	NC_013223	GGT	2	6	308880	308885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404385
5514	NC_013223	CTT	2	6	308985	308990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404385
5515	NC_013223	C	6	6	309083	309088	0 %	0 %	0 %	100 %	258404385
5516	NC_013223	CCG	2	6	309110	309115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404385
5517	NC_013223	CCTC	2	8	309131	309138	0 %	25 %	0 %	75 %	258404385
5518	NC_013223	CT	3	6	309212	309217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5519	NC_013223	GT	3	6	309293	309298	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_013223	TTCG	2	8	309302	309309	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5521	NC_013223	A	7	7	309507	309513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_013223	AAT	2	6	309531	309536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_013223	TAT	2	6	309537	309542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_013223	GGA	2	6	309568	309573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_013223	GAA	2	6	309632	309637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404386
5526	NC_013223	CAA	2	6	309664	309669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404386
5527	NC_013223	CGC	2	6	309674	309679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404386
5528	NC_013223	ACT	2	6	309720	309725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404386
5529	NC_013223	GCG	2	6	309769	309774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404386
5530	NC_013223	GAA	2	6	309791	309796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404386
5531	NC_013223	GCC	2	6	309814	309819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404386
5532	NC_013223	GT	3	6	309864	309869	0 %	50 %	50 %	0 %	258404386
5533	NC_013223	AGC	2	6	309906	309911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404386
5534	NC_013223	TCC	2	6	309940	309945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5535	NC_013223	GAC	2	6	309959	309964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_013223	GTTTT	2	10	309986	309995	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_013223	T	6	6	309992	309997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_013223	T	6	6	310013	310018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_013223	AC	3	6	310043	310048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5540	NC_013223	GCC	2	6	310073	310078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5541	NC_013223	GGC	2	6	310086	310091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_013223	T	6	6	310149	310154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_013223	CTG	2	6	310206	310211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404387
5544	NC_013223	A	8	8	310274	310281	100 %	0 %	0 %	0 %	258404387
5545	NC_013223	CTG	2	6	310285	310290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404387
5546	NC_013223	T	8	8	310397	310404	0 %	100 %	0 %	0 %	258404387
5547	NC_013223	CGC	2	6	310438	310443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404387
5548	NC_013223	TGC	2	6	310533	310538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404387
5549	NC_013223	TG	3	6	310605	310610	0 %	50 %	50 %	0 %	258404387
5550	NC_013223	CGGC	2	8	310743	310750	0 %	0 %	50 %	50 %	258404387
5551	NC_013223	GGT	2	6	310785	310790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404387
5552	NC_013223	GTG	2	6	310887	310892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404388
5553	NC_013223	GCC	2	6	310907	310912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404388
5554	NC_013223	CCT	2	6	310957	310962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404388
5555	NC_013223	GCA	2	6	311007	311012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404388
5556	NC_013223	AGG	2	6	311025	311030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404388
5557	NC_013223	GGAG	2	8	311118	311125	25 %	0 %	75 %	0 %	258404388
5558	NC_013223	GCG	2	6	311207	311212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404388
5559	NC_013223	GA	3	6	311244	311249	50 %	0 %	50 %	0 %	258404388
5560	NC_013223	TCC	2	6	311253	311258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404388
5561	NC_013223	CGT	2	6	311287	311292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404388
5562	NC_013223	GAG	2	6	311310	311315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404388
5563	NC_013223	AAGA	2	8	311362	311369	75 %	0 %	25 %	0 %	258404388
5564	NC_013223	TGA	2	6	311428	311433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404388
5565	NC_013223	CCG	2	6	311467	311472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404388
5566	NC_013223	CAGG	2	8	311523	311530	25 %	0 %	50 %	25 %	258404388
5567	NC_013223	G	6	6	311587	311592	0 %	0 %	100 %	0 %	258404388
5568	NC_013223	CCA	2	6	311651	311656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404388
5569	NC_013223	G	7	7	311687	311693	0 %	0 %	100 %	0 %	258404388
5570	NC_013223	ATGG	2	8	311698	311705	25 %	25 %	50 %	0 %	258404388
5571	NC_013223	CGG	2	6	311797	311802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404388
5572	NC_013223	ACAT	2	8	311847	311854	50 %	25 %	0 %	25 %	258404388
5573	NC_013223	GCT	2	6	311917	311922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404388
5574	NC_013223	GTG	2	6	311960	311965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404388
5575	NC_013223	GGC	2	6	312104	312109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404388
5576	NC_013223	AGC	2	6	312137	312142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_013223	GGT	2	6	312180	312185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_013223	GAA	2	6	312219	312224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_013223	CCG	2	6	312255	312260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5580	NC_013223	AT	3	6	312296	312301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_013223	GCA	2	6	312396	312401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_013223	GCT	2	6	312405	312410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_013223	CCA	2	6	312471	312476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5584	NC_013223	GCG	3	9	312484	312492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_013223	T	8	8	312528	312535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_013223	GAA	2	6	312556	312561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_013223	TC	3	6	312588	312593	0 %	50 %	0 %	50 %	258404389
5588	NC_013223	GGT	2	6	312626	312631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404389
5589	NC_013223	GGA	2	6	312678	312683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404389
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5591	NC_013223	AT	3	6	312773	312778	50 %	50 %	0 %	0 %	258404389
5592	NC_013223	TTG	2	6	312920	312925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404389
5593	NC_013223	GGC	2	6	312955	312960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404389
5594	NC_013223	AAG	2	6	313169	313174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404389
5595	NC_013223	ACG	2	6	313234	313239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404389
5596	NC_013223	GGA	2	6	313284	313289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404389
5597	NC_013223	ATC	2	6	313354	313359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404389
5598	NC_013223	GAC	2	6	313477	313482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404389
5599	NC_013223	GGT	2	6	313551	313556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404389
5600	NC_013223	AGA	2	6	313592	313597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404389
5601	NC_013223	ATA	2	6	313775	313780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258404389
5602	NC_013223	TGG	2	6	313810	313815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404389
5603	NC_013223	TTC	2	6	313947	313952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404389
5604	NC_013223	GCTGG	2	10	313974	313983	0 %	20 %	60 %	20 %	258404389
5605	NC_013223	GAT	4	12	314070	314081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404389
5606	NC_013223	ACG	2	6	314114	314119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404389
5607	NC_013223	CCTG	2	8	314352	314359	0 %	25 %	25 %	50 %	258404389
5608	NC_013223	GGC	2	6	314451	314456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404389
5609	NC_013223	GAA	2	6	314461	314466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404389
5610	NC_013223	ATG	2	6	314477	314482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404389
5611	NC_013223	TGC	2	6	314597	314602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404389
5612	NC_013223	TGC	2	6	314609	314614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404389
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5615	NC_013223	AGG	3	9	314891	314899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404389
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5617	NC_013223	GCCG	2	8	315129	315136	0 %	0 %	50 %	50 %	258404389
5618	NC_013223	TGT	2	6	315138	315143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404389
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5620	NC_013223	GCA	2	6	315204	315209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404389
5621	NC_013223	GCGT	2	8	315248	315255	0 %	25 %	50 %	25 %	258404390
5622	NC_013223	GTC	2	6	315335	315340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404390
5623	NC_013223	ATT	2	6	315345	315350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258404390
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5742	NC_013223	A	6	6	321685	321690	100 %	0 %	0 %	0 %	258404397
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5748	NC_013223	T	6	6	322034	322039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5749	NC_013223	CGG	2	6	322081	322086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5750	NC_013223	GCC	2	6	322136	322141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404398
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5752	NC_013223	TTGGA	2	10	322247	322256	20 %	40 %	40 %	0 %	258404398
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5944	NC_013223	GGC	2	6	332989	332994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5946	NC_013223	GGA	2	6	333085	333090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5994	NC_013223	GGC	2	6	336027	336032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404410
5995	NC_013223	GTCA	2	8	336036	336043	25 %	25 %	25 %	25 %	258404410
5996	NC_013223	GGC	2	6	336080	336085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404410
5997	NC_013223	CG	3	6	336178	336183	0 %	0 %	50 %	50 %	258404410
5998	NC_013223	GGT	2	6	336185	336190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404410
5999	NC_013223	CCA	2	6	336209	336214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404410
6000	NC_013223	GCG	2	6	336222	336227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404410

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