MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
51001	NC_013223	GA	3	6	2822368	2822373	50 %	0 %	50 %	0 %	258406578
51002	NC_013223	A	7	7	2822475	2822481	100 %	0 %	0 %	0 %	258406578
51003	NC_013223	TA	3	6	2822505	2822510	50 %	50 %	0 %	0 %	258406578
51004	NC_013223	C	6	6	2822547	2822552	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51005	NC_013223	TCA	2	6	2822556	2822561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51006	NC_013223	T	6	6	2822582	2822587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51007	NC_013223	A	6	6	2822647	2822652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51008	NC_013223	A	7	7	2822654	2822660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51009	NC_013223	A	6	6	2822783	2822788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51010	NC_013223	AGG	2	6	2822796	2822801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51011	NC_013223	G	6	6	2822894	2822899	0 %	0 %	100 %	0 %	258406579
51012	NC_013223	CGA	2	6	2822929	2822934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406579
51013	NC_013223	TGC	2	6	2823006	2823011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406579
51014	NC_013223	GCG	2	6	2823107	2823112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406579
51015	NC_013223	A	7	7	2823172	2823178	100 %	0 %	0 %	0 %	258406579
51016	NC_013223	GGC	2	6	2823272	2823277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406579
51017	NC_013223	GGA	2	6	2823320	2823325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258406579
51018	NC_013223	AAAGG	2	10	2823462	2823471	60 %	0 %	40 %	0 %	258406579
51019	NC_013223	GAC	2	6	2823508	2823513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406579
51020	NC_013223	CGC	2	6	2823571	2823576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406579
51021	NC_013223	TGC	2	6	2823577	2823582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406579
51022	NC_013223	GCT	2	6	2823637	2823642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406579
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51025	NC_013223	G	6	6	2823692	2823697	0 %	0 %	100 %	0 %	258406579
51026	NC_013223	CCAG	2	8	2823704	2823711	25 %	0 %	25 %	50 %	258406579
51027	NC_013223	A	7	7	2823725	2823731	100 %	0 %	0 %	0 %	258406579
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51041	NC_013223	CCCG	2	8	2824451	2824458	0 %	0 %	25 %	75 %	258406581
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51044	NC_013223	GCC	2	6	2824794	2824799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406581
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51051	NC_013223	TCG	2	6	2825095	2825100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406582
51052	NC_013223	ATA	2	6	2825151	2825156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406582
51053	NC_013223	GCG	2	6	2825186	2825191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406582
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51066	NC_013223	CAGC	2	8	2826314	2826321	25 %	0 %	25 %	50 %	258406582
51067	NC_013223	ATCA	2	8	2826393	2826400	50 %	25 %	0 %	25 %	258406582
51068	NC_013223	G	6	6	2826436	2826441	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51069	NC_013223	A	8	8	2826443	2826450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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51115	NC_013223	CCGT	2	8	2830530	2830537	0 %	25 %	25 %	50 %	258406588
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51119	NC_013223	CCA	2	6	2830740	2830745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258406588
51120	NC_013223	A	8	8	2830787	2830794	100 %	0 %	0 %	0 %	258406588
51121	NC_013223	A	6	6	2830841	2830846	100 %	0 %	0 %	0 %	258406588
51122	NC_013223	GCG	2	6	2830866	2830871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406588
51123	NC_013223	A	6	6	2830941	2830946	100 %	0 %	0 %	0 %	258406588
51124	NC_013223	CGA	2	6	2830963	2830968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406588
51125	NC_013223	TGC	2	6	2831091	2831096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406588
51126	NC_013223	TGCC	2	8	2831140	2831147	0 %	25 %	25 %	50 %	258406588
51127	NC_013223	T	6	6	2831170	2831175	0 %	100 %	0 %	0 %	258406588
51128	NC_013223	A	7	7	2831274	2831280	100 %	0 %	0 %	0 %	258406588
51129	NC_013223	CTC	2	6	2831312	2831317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406588
51130	NC_013223	TAA	2	6	2831355	2831360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258406588
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51132	NC_013223	ATC	2	6	2831423	2831428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406588
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51134	NC_013223	ACCAC	2	10	2831637	2831646	40 %	0 %	0 %	60 %	258406588
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51139	NC_013223	GAA	2	6	2831886	2831891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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51204	NC_013223	TGC	2	6	2835330	2835335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406590
51205	NC_013223	CCG	2	6	2835409	2835414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406590
51206	NC_013223	GGA	2	6	2835502	2835507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51207	NC_013223	CAAT	2	8	2835524	2835531	50 %	25 %	0 %	25 %	258406591
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51210	NC_013223	GGGC	2	8	2835590	2835597	0 %	0 %	75 %	25 %	258406591
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51212	NC_013223	A	6	6	2835689	2835694	100 %	0 %	0 %	0 %	258406591
51213	NC_013223	TCG	2	6	2835705	2835710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406591
51214	NC_013223	GGGCA	2	10	2835812	2835821	20 %	0 %	60 %	20 %	258406591
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51217	NC_013223	CCAA	2	8	2835977	2835984	50 %	0 %	0 %	50 %	258406591
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51224	NC_013223	CGGC	2	8	2836171	2836178	0 %	0 %	50 %	50 %	258406591
51225	NC_013223	GCA	2	6	2836212	2836217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406591
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51227	NC_013223	A	6	6	2836320	2836325	100 %	0 %	0 %	0 %	258406591
51228	NC_013223	CGA	2	6	2836375	2836380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406591
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51230	NC_013223	TCA	2	6	2836443	2836448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258406591
51231	NC_013223	CCT	2	6	2836479	2836484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406591
51232	NC_013223	GGT	2	6	2836504	2836509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406591
51233	NC_013223	TTG	2	6	2836526	2836531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406591
51234	NC_013223	TCC	2	6	2836581	2836586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258406591
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51236	NC_013223	CGA	2	6	2836666	2836671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406591
51237	NC_013223	GCCG	2	8	2836702	2836709	0 %	0 %	50 %	50 %	258406591
51238	NC_013223	GGT	2	6	2836894	2836899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406591
51239	NC_013223	GGT	2	6	2837011	2837016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406591
51240	NC_013223	C	6	6	2837052	2837057	0 %	0 %	0 %	100 %	258406591
51241	NC_013223	CAG	2	6	2837069	2837074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406591
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51252	NC_013223	CGGG	2	8	2837620	2837627	0 %	0 %	75 %	25 %	258406591
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51266	NC_013223	CGC	2	6	2838039	2838044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51267	NC_013223	CTGTC	2	10	2838154	2838163	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
51268	NC_013223	CAGG	2	8	2838199	2838206	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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51271	NC_013223	GA	3	6	2838303	2838308	50 %	0 %	50 %	0 %	258406592
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51288	NC_013223	GTG	2	6	2839047	2839052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51289	NC_013223	A	6	6	2839059	2839064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51290	NC_013223	A	8	8	2839078	2839085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51291	NC_013223	GAC	2	6	2839114	2839119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51292	NC_013223	C	6	6	2839152	2839157	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51293	NC_013223	ACCT	2	8	2839327	2839334	25 %	25 %	0 %	50 %	258406593
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51303	NC_013223	CGG	2	6	2840359	2840364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406594
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51321	NC_013223	CTTC	2	8	2841586	2841593	0 %	50 %	0 %	50 %	258406596
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51346	NC_013223	GCA	2	6	2843155	2843160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406596
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51350	NC_013223	CG	3	6	2843362	2843367	0 %	0 %	50 %	50 %	258406596
51351	NC_013223	GGT	2	6	2843437	2843442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406596
51352	NC_013223	GCTCC	2	10	2843453	2843462	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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51354	NC_013223	CAG	2	6	2843669	2843674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406597
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51356	NC_013223	CTTG	2	8	2843758	2843765	0 %	50 %	25 %	25 %	258406597
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51461	NC_013223	TGA	2	6	2849345	2849350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51462	NC_013223	GCCAA	2	10	2849353	2849362	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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51465	NC_013223	GGC	2	6	2849499	2849504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406602
51466	NC_013223	CGGAC	2	10	2849568	2849577	20 %	0 %	40 %	40 %	258406602
51467	NC_013223	TGG	2	6	2849674	2849679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406602
51468	NC_013223	TCTG	2	8	2849680	2849687	0 %	50 %	25 %	25 %	258406602
51469	NC_013223	TGGCG	2	10	2849710	2849719	0 %	20 %	60 %	20 %	258406602
51470	NC_013223	GAA	2	6	2849799	2849804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258406602
51471	NC_013223	CGG	2	6	2849832	2849837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406603
51472	NC_013223	GCC	2	6	2849915	2849920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406603
51473	NC_013223	CACGC	2	10	2849957	2849966	20 %	0 %	20 %	60 %	258406603
51474	NC_013223	TCG	2	6	2850012	2850017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406603
51475	NC_013223	GAC	2	6	2850026	2850031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258406603
51476	NC_013223	CTT	2	6	2850074	2850079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258406603
51477	NC_013223	TGG	2	6	2850105	2850110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406603
51478	NC_013223	GGC	2	6	2850125	2850130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406603
51479	NC_013223	TCG	2	6	2850300	2850305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406603
51480	NC_013223	GGC	2	6	2850333	2850338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406603
51481	NC_013223	ACGCG	2	10	2850358	2850367	20 %	0 %	40 %	40 %	258406603
51482	NC_013223	CCCA	2	8	2850432	2850439	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
51483	NC_013223	CGCAA	2	10	2850453	2850462	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
51484	NC_013223	CA	3	6	2850463	2850468	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51485	NC_013223	ACG	2	6	2850491	2850496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51486	NC_013223	ACG	2	6	2850516	2850521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51487	NC_013223	GCC	2	6	2850582	2850587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406604
51488	NC_013223	GCT	2	6	2850589	2850594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406604
51489	NC_013223	GGT	2	6	2850610	2850615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406604
51490	NC_013223	GCT	2	6	2850653	2850658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258406604
51491	NC_013223	GAG	2	6	2850686	2850691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258406604
51492	NC_013223	TG	3	6	2850692	2850697	0 %	50 %	50 %	0 %	258406604
51493	NC_013223	CCG	2	6	2850710	2850715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406604
51494	NC_013223	GTG	2	6	2850897	2850902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258406604
51495	NC_013223	CGG	2	6	2850940	2850945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258406604
51496	NC_013223	CCG	2	6	2850947	2850952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258406604
51497	NC_013223	GTT	2	6	2850976	2850981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258406604
51498	NC_013223	GGGC	2	8	2851029	2851036	0 %	0 %	75 %	25 %	258406604
51499	NC_013223	ATG	2	6	2851076	2851081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258406604
51500	NC_013223	CTTG	2	8	2851105	2851112	0 %	50 %	25 %	25 %	258406604

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