MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfohalobium retbaense DSM 5692 chromosome

Total Repeats: 51711

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013223	TGG	2	6	252689	252694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404338
4502	NC_013223	GGCG	2	8	252704	252711	0 %	0 %	75 %	25 %	258404338
4503	NC_013223	T	7	7	252727	252733	0 %	100 %	0 %	0 %	258404338
4504	NC_013223	CGG	2	6	252742	252747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404338
4505	NC_013223	CGAG	2	8	252913	252920	25 %	0 %	50 %	25 %	258404338
4506	NC_013223	TGT	2	6	252977	252982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404338
4507	NC_013223	ACC	2	6	253000	253005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404338
4508	NC_013223	CAC	2	6	253016	253021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404338
4509	NC_013223	CTG	2	6	253134	253139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404338
4510	NC_013223	GGC	2	6	253142	253147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404338
4511	NC_013223	CAT	2	6	253394	253399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404338
4512	NC_013223	TGC	2	6	253405	253410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404338
4513	NC_013223	CTG	2	6	253428	253433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404338
4514	NC_013223	AGA	2	6	253467	253472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404338
4515	NC_013223	GCA	2	6	253484	253489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404338
4516	NC_013223	TCG	2	6	253507	253512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404338
4517	NC_013223	ACA	2	6	253571	253576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404339
4518	NC_013223	CCG	2	6	253622	253627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404339
4519	NC_013223	TCG	2	6	253689	253694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404339
4520	NC_013223	TTC	2	6	253726	253731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404339
4521	NC_013223	TCG	2	6	253874	253879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404339
4522	NC_013223	GTT	2	6	253981	253986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404339
4523	NC_013223	GGC	2	6	254019	254024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404339
4524	NC_013223	GGA	2	6	254073	254078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404339
4525	NC_013223	CGC	2	6	254147	254152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404339
4526	NC_013223	TTG	2	6	254192	254197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404339
4527	NC_013223	GCG	2	6	254216	254221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404339
4528	NC_013223	TGG	2	6	254232	254237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404339
4529	NC_013223	AAC	2	6	254300	254305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258404339
4530	NC_013223	CTT	2	6	254316	254321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404339
4531	NC_013223	TGGCC	2	10	254457	254466	0 %	20 %	40 %	40 %	258404339
4532	NC_013223	A	6	6	254678	254683	100 %	0 %	0 %	0 %	258404339
4533	NC_013223	GAT	2	6	254707	254712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404339
4534	NC_013223	GTT	2	6	254723	254728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404339
4535	NC_013223	CCT	2	6	254747	254752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404340
4536	NC_013223	ATCAG	2	10	254839	254848	40 %	20 %	20 %	20 %	258404340
4537	NC_013223	GAA	2	6	254898	254903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258404340
4538	NC_013223	TCC	2	6	254905	254910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404340
4539	NC_013223	CCAG	2	8	254923	254930	25 %	0 %	25 %	50 %	258404340
4540	NC_013223	T	6	6	254990	254995	0 %	100 %	0 %	0 %	258404340
4541	NC_013223	AGG	2	6	255002	255007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404340
4542	NC_013223	GCA	2	6	255032	255037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404340
4543	NC_013223	CCG	2	6	255076	255081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404340
4544	NC_013223	GTT	2	6	255161	255166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404340
4545	NC_013223	TGA	3	9	255317	255325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404340
4546	NC_013223	CGG	2	6	255330	255335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404340
4547	NC_013223	TGA	2	6	255392	255397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404340
4548	NC_013223	TGA	2	6	255428	255433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404340
4549	NC_013223	CGG	2	6	255464	255469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404340
4550	NC_013223	GGC	2	6	255490	255495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404340
4551	NC_013223	GAT	2	6	255606	255611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404340
4552	NC_013223	TCCT	2	8	255621	255628	0 %	50 %	0 %	50 %	258404340
4553	NC_013223	GGATT	2	10	255670	255679	20 %	40 %	40 %	0 %	258404340
4554	NC_013223	AGG	2	6	255812	255817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404340
4555	NC_013223	GTT	2	6	255834	255839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404340
4556	NC_013223	GAT	2	6	255846	255851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404340
4557	NC_013223	C	6	6	255911	255916	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4558	NC_013223	GC	3	6	256005	256010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4559	NC_013223	AGA	2	6	256099	256104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_013223	GGC	2	6	256208	256213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404341
4561	NC_013223	CGG	2	6	256261	256266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404341
4562	NC_013223	GGC	2	6	256291	256296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404341
4563	NC_013223	GTC	2	6	256302	256307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404341
4564	NC_013223	CAG	2	6	256467	256472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404342
4565	NC_013223	CGTT	2	8	256492	256499	0 %	50 %	25 %	25 %	258404342
4566	NC_013223	GCG	2	6	256563	256568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404342
4567	NC_013223	GCC	2	6	256635	256640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404342
4568	NC_013223	GC	3	6	256681	256686	0 %	0 %	50 %	50 %	258404342
4569	NC_013223	CCG	2	6	256705	256710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404342
4570	NC_013223	CGC	3	9	256762	256770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404342
4571	NC_013223	CCT	2	6	256775	256780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404342
4572	NC_013223	TTC	2	6	256791	256796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404342
4573	NC_013223	GGT	2	6	256843	256848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404342
4574	NC_013223	GGC	2	6	256875	256880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404342
4575	NC_013223	CTGGTG	2	12	256900	256911	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	258404342
4576	NC_013223	GTG	2	6	256925	256930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404342
4577	NC_013223	TGG	2	6	256966	256971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404342
4578	NC_013223	CCG	2	6	256996	257001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404342
4579	NC_013223	GCGA	2	8	257037	257044	25 %	0 %	50 %	25 %	258404342
4580	NC_013223	CAG	2	6	257073	257078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404342
4581	NC_013223	A	6	6	257186	257191	100 %	0 %	0 %	0 %	258404342
4582	NC_013223	GTA	2	6	257199	257204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404342
4583	NC_013223	T	6	6	257214	257219	0 %	100 %	0 %	0 %	258404342
4584	NC_013223	GCCT	2	8	257233	257240	0 %	25 %	25 %	50 %	258404342
4585	NC_013223	TCC	2	6	257290	257295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258404342
4586	NC_013223	AGC	2	6	257332	257337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404342
4587	NC_013223	CGA	2	6	257360	257365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404342
4588	NC_013223	CCG	2	6	257370	257375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404342
4589	NC_013223	TGG	2	6	257390	257395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404342
4590	NC_013223	GCC	2	6	257415	257420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404342
4591	NC_013223	GGC	2	6	257457	257462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404342
4592	NC_013223	T	6	6	257465	257470	0 %	100 %	0 %	0 %	258404342
4593	NC_013223	GCC	2	6	257482	257487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404342
4594	NC_013223	GGT	2	6	257501	257506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404342
4595	NC_013223	GGT	2	6	257520	257525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404342
4596	NC_013223	GCG	2	6	257544	257549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404342
4597	NC_013223	GGC	2	6	257571	257576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404342
4598	NC_013223	TGG	2	6	257671	257676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404342
4599	NC_013223	AGC	2	6	257747	257752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404343
4600	NC_013223	CAGGC	2	10	257792	257801	20 %	0 %	40 %	40 %	258404343
4601	NC_013223	GGA	2	6	257895	257900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404343
4602	NC_013223	TGC	2	6	257924	257929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404343
4603	NC_013223	C	6	6	257981	257986	0 %	0 %	0 %	100 %	258404343
4604	NC_013223	A	7	7	258020	258026	100 %	0 %	0 %	0 %	258404343
4605	NC_013223	CAG	2	6	258070	258075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404343
4606	NC_013223	ATG	2	6	258089	258094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404343
4607	NC_013223	CAG	2	6	258097	258102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404343
4608	NC_013223	CAG	2	6	258118	258123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404343
4609	NC_013223	AGC	2	6	258128	258133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404343
4610	NC_013223	GGCAA	2	10	258134	258143	40 %	0 %	40 %	20 %	258404343
4611	NC_013223	GCG	2	6	258188	258193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404343
4612	NC_013223	AG	3	6	258277	258282	50 %	0 %	50 %	0 %	258404343
4613	NC_013223	GAC	2	6	258361	258366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404343
4614	NC_013223	CGCAGG	2	12	258461	258472	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258404343
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4617	NC_013223	CCA	2	6	258699	258704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404343
4618	NC_013223	GGA	2	6	258815	258820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258404343
4619	NC_013223	G	7	7	258823	258829	0 %	0 %	100 %	0 %	258404343
4620	NC_013223	GGC	2	6	258858	258863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404343
4621	NC_013223	TGGTG	2	10	258962	258971	0 %	40 %	60 %	0 %	258404343
4622	NC_013223	ATA	2	6	258982	258987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258404343
4623	NC_013223	GCG	2	6	259113	259118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404343
4624	NC_013223	AGGCCG	2	12	259223	259234	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	258404343
4625	NC_013223	CTG	2	6	259342	259347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404343
4626	NC_013223	GGC	2	6	259462	259467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404343
4627	NC_013223	CAT	2	6	259489	259494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404343
4628	NC_013223	TGA	2	6	259500	259505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404343
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4632	NC_013223	TGT	2	6	259632	259637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404343
4633	NC_013223	GTC	2	6	259654	259659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404343
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4635	NC_013223	ACG	2	6	259820	259825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404343
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4640	NC_013223	T	6	6	259993	259998	0 %	100 %	0 %	0 %	258404343
4641	NC_013223	AGAC	2	8	260109	260116	50 %	0 %	25 %	25 %	258404343
4642	NC_013223	CTT	2	6	260118	260123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258404343
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4645	NC_013223	TTG	2	6	260225	260230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404343
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4647	NC_013223	TGG	2	6	260429	260434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404343
4648	NC_013223	TCG	2	6	260513	260518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404343
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4650	NC_013223	G	6	6	260718	260723	0 %	0 %	100 %	0 %	258404343
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4655	NC_013223	ATC	2	6	261006	261011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258404344
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4692	NC_013223	CGT	2	6	263119	263124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404345
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4696	NC_013223	G	7	7	263454	263460	0 %	0 %	100 %	0 %	258404345
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4702	NC_013223	A	6	6	263703	263708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4703	NC_013223	GAA	2	6	263715	263720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4724	NC_013223	CCT	2	6	264824	264829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4728	NC_013223	CCG	2	6	265041	265046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4729	NC_013223	AG	3	6	265050	265055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4730	NC_013223	TGGA	2	8	265117	265124	25 %	25 %	50 %	0 %	258404347
4731	NC_013223	TTCCAC	2	12	265134	265145	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	258404347
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4733	NC_013223	GAC	2	6	265197	265202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404347
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4736	NC_013223	TCG	2	6	265387	265392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404347
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4740	NC_013223	GCGCTG	2	12	265513	265524	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258404347
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4742	NC_013223	TGG	2	6	265741	265746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404347
4743	NC_013223	GCCG	2	8	265821	265828	0 %	0 %	50 %	50 %	258404347
4744	NC_013223	GGT	2	6	265868	265873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404348
4745	NC_013223	TGG	2	6	265906	265911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404348
4746	NC_013223	ATG	2	6	265914	265919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404348
4747	NC_013223	GAT	2	6	266015	266020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258404348
4748	NC_013223	TGG	3	9	266070	266078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404348
4749	NC_013223	CTG	2	6	266135	266140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404348
4750	NC_013223	TCG	2	6	266211	266216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404348
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4753	NC_013223	GCG	2	6	266580	266585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404349
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4773	NC_013223	GTG	2	6	267476	267481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404350
4774	NC_013223	GGC	2	6	267573	267578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404350
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4781	NC_013223	GTTG	2	8	268005	268012	0 %	50 %	50 %	0 %	258404350
4782	NC_013223	G	6	6	268020	268025	0 %	0 %	100 %	0 %	258404350
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4786	NC_013223	CGA	2	6	268260	268265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404350
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4789	NC_013223	TTG	2	6	268472	268477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258404350
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4792	NC_013223	GCC	2	6	268652	268657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404351
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4797	NC_013223	GCCAG	2	10	268946	268955	20 %	0 %	40 %	40 %	258404351
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4803	NC_013223	CGG	2	6	269316	269321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404352
4804	NC_013223	GACC	2	8	269376	269383	25 %	0 %	25 %	50 %	258404352
4805	NC_013223	CCG	2	6	269390	269395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258404352
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4808	NC_013223	GCA	3	9	269526	269534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404352
4809	NC_013223	CAGGA	2	10	269596	269605	40 %	0 %	40 %	20 %	258404352
4810	NC_013223	CAG	2	6	269782	269787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404352
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4813	NC_013223	CTG	2	6	270048	270053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4821	NC_013223	GCCG	2	8	270326	270333	0 %	0 %	50 %	50 %	258404353
4822	NC_013223	ACC	2	6	270400	270405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404353
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4840	NC_013223	GTC	2	6	271249	271254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404354
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4846	NC_013223	TGG	2	6	272033	272038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404354
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4850	NC_013223	GGC	2	6	272268	272273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258404354
4851	NC_013223	TCCTC	2	10	272310	272319	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4852	NC_013223	GGC	2	6	272410	272415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4853	NC_013223	CAGG	2	8	272446	272453	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4854	NC_013223	CGT	2	6	272500	272505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404355
4855	NC_013223	CAGC	2	8	272594	272601	25 %	0 %	25 %	50 %	258404355
4856	NC_013223	GCA	2	6	272623	272628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258404355
4857	NC_013223	CTG	2	6	272630	272635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258404355
4858	NC_013223	CTGG	2	8	272644	272651	0 %	25 %	50 %	25 %	258404355
4859	NC_013223	GCCT	2	8	272666	272673	0 %	25 %	25 %	50 %	258404355
4860	NC_013223	G	6	6	272688	272693	0 %	0 %	100 %	0 %	258404355
4861	NC_013223	ACC	2	6	272723	272728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404355
4862	NC_013223	GGT	2	6	272818	272823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404355
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4864	NC_013223	GTCC	2	8	272851	272858	0 %	25 %	25 %	50 %	258404355
4865	NC_013223	TCCT	2	8	273073	273080	0 %	50 %	0 %	50 %	258404355
4866	NC_013223	CCA	2	6	273094	273099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258404355
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4870	NC_013223	GGT	2	6	273226	273231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258404355
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