MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfovibrio magneticus RS-1 plasmid pDMC1

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012797	CACGG	2	10	2	11	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_012797	GGCAG	2	10	1864	1873	20 %	0 %	60 %	20 %	239835336
3	NC_012797	AAGTA	2	10	2334	2343	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012797	TTGTC	2	10	2361	2370	0 %	60 %	20 %	20 %	239835337
5	NC_012797	CTATC	2	10	2776	2785	20 %	40 %	0 %	40 %	239835337
6	NC_012797	CGACG	2	10	3064	3073	20 %	0 %	40 %	40 %	239835337
7	NC_012797	GCTTG	2	10	3655	3664	0 %	40 %	40 %	20 %	239835337
8	NC_012797	CTTGC	2	10	4122	4131	0 %	40 %	20 %	40 %	239835338
9	NC_012797	TTGGC	2	10	4910	4919	0 %	40 %	40 %	20 %	239835339
10	NC_012797	CGCCA	2	10	8000	8009	20 %	0 %	20 %	60 %	239835344
11	NC_012797	ACCCA	2	10	10777	10786	40 %	0 %	0 %	60 %	239835347
12	NC_012797	TGAAC	2	10	11126	11135	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012797	TAAAA	2	10	11570	11579	80 %	20 %	0 %	0 %	239835349
14	NC_012797	GATGC	2	10	11787	11796	20 %	20 %	40 %	20 %	239835349
15	NC_012797	ATAAA	2	10	12289	12298	80 %	20 %	0 %	0 %	239835349
16	NC_012797	AGACG	2	10	12981	12990	40 %	0 %	40 %	20 %	239835350
17	NC_012797	CTGGG	2	10	13592	13601	0 %	20 %	60 %	20 %	239835350
18	NC_012797	ATTTT	2	10	13845	13854	20 %	80 %	0 %	0 %	239835350
19	NC_012797	AAGAA	2	10	16019	16028	80 %	0 %	20 %	0 %	239835351
20	NC_012797	AATTC	2	10	16262	16271	40 %	40 %	0 %	20 %	239835351
21	NC_012797	TTGTT	2	10	16780	16789	0 %	80 %	20 %	0 %	239835351
22	NC_012797	TTGGC	2	10	17572	17581	0 %	40 %	40 %	20 %	239835352
23	NC_012797	GCGTC	2	10	18247	18256	0 %	20 %	40 %	40 %	239835354
24	NC_012797	CTGGC	2	10	18698	18707	0 %	20 %	40 %	40 %	239835355
25	NC_012797	GCCGG	2	10	19696	19705	0 %	0 %	60 %	40 %	239835356
26	NC_012797	TGACC	2	10	20629	20638	20 %	20 %	20 %	40 %	239835357
27	NC_012797	CAAGC	2	10	21009	21018	40 %	0 %	20 %	40 %	239835357
28	NC_012797	CGGCA	2	10	21442	21451	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_012797	CACGC	2	10	21555	21564	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_012797	TGGTT	2	10	22010	22019	0 %	60 %	40 %	0 %	239835358
31	NC_012797	GCCTC	2	10	23946	23955	0 %	20 %	20 %	60 %	239835360
32	NC_012797	AAAGC	2	10	31666	31675	60 %	0 %	20 %	20 %	239835368
33	NC_012797	CGGAC	2	10	33689	33698	20 %	0 %	40 %	40 %	239835370
34	NC_012797	GGCCC	2	10	36852	36861	0 %	0 %	40 %	60 %	239835372
35	NC_012797	CCCAG	2	10	40332	40341	20 %	0 %	20 %	60 %	239835376
36	NC_012797	CGGCG	2	10	41416	41425	0 %	0 %	60 %	40 %	239835378
37	NC_012797	TTTTA	2	10	42262	42271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012797	ACCGA	2	10	43509	43518	40 %	0 %	20 %	40 %	239835383
39	NC_012797	CCTGT	2	10	45531	45540	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_012797	CATGG	2	10	46230	46239	20 %	20 %	40 %	20 %	239835388
41	NC_012797	AGGTA	2	10	47095	47104	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012797	GCGTG	2	10	47598	47607	0 %	20 %	60 %	20 %	239835390
43	NC_012797	GCCGC	2	10	47918	47927	0 %	0 %	40 %	60 %	239835391
44	NC_012797	GCAGT	2	10	48069	48078	20 %	20 %	40 %	20 %	239835391
45	NC_012797	TGCTC	2	10	48920	48929	0 %	40 %	20 %	40 %	239835391
46	NC_012797	GCGAC	2	10	50104	50113	20 %	0 %	40 %	40 %	239835391
47	NC_012797	TGGCC	2	10	52152	52161	0 %	20 %	40 %	40 %	239835393
48	NC_012797	GCGCA	2	10	52181	52190	20 %	0 %	40 %	40 %	239835393
49	NC_012797	GGCCG	2	10	53312	53321	0 %	0 %	60 %	40 %	239835394
50	NC_012797	GGGCC	2	10	53936	53945	0 %	0 %	60 %	40 %	239835395
51	NC_012797	CCGAG	2	10	54536	54545	20 %	0 %	40 %	40 %	239835395
52	NC_012797	GACCT	2	10	55589	55598	20 %	20 %	20 %	40 %	239835396
53	NC_012797	CTGCA	2	10	57044	57053	20 %	20 %	20 %	40 %	239835398
54	NC_012797	CCCGG	2	10	57524	57533	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_012797	ACGGC	2	10	58294	58303	20 %	0 %	40 %	40 %	239835399

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.