MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Deinococcus deserti VCD115 plasmid 2

Total Repeats: 6900

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012529	CGGT	2	8	161228	161235	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3502	NC_012529	ACC	3	9	161446	161454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358141
3503	NC_012529	CGG	2	6	161479	161484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358141
3504	NC_012529	CGG	2	6	161486	161491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358141
3505	NC_012529	AGC	2	6	161533	161538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358141
3506	NC_012529	CAGG	2	8	161546	161553	25 %	0 %	50 %	25 %	226358141
3507	NC_012529	CAG	3	9	161688	161696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358141
3508	NC_012529	CCG	2	6	161728	161733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358142
3509	NC_012529	GAAGGT	2	12	161767	161778	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	226358142
3510	NC_012529	GCC	2	6	161815	161820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358142
3511	NC_012529	GT	3	6	161871	161876	0 %	50 %	50 %	0 %	226358142
3512	NC_012529	CTG	3	9	162128	162136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3513	NC_012529	ACC	2	6	162170	162175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358142
3514	NC_012529	AG	3	6	162182	162187	50 %	0 %	50 %	0 %	226358142
3515	NC_012529	CGA	2	6	162194	162199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3516	NC_012529	CCG	2	6	162204	162209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358142
3517	NC_012529	AGC	2	6	162218	162223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3518	NC_012529	ATC	2	6	162290	162295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358142
3519	NC_012529	TCG	2	6	162308	162313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3520	NC_012529	AAC	2	6	162338	162343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226358142
3521	NC_012529	GAC	2	6	162454	162459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3522	NC_012529	GCT	2	6	162479	162484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3523	NC_012529	CTT	2	6	162510	162515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358142
3524	NC_012529	GCG	2	6	162580	162585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358142
3525	NC_012529	G	6	6	162613	162618	0 %	0 %	100 %	0 %	226358142
3526	NC_012529	GTC	2	6	162641	162646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3527	NC_012529	CAG	2	6	162703	162708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3528	NC_012529	GCCT	2	8	162785	162792	0 %	25 %	25 %	50 %	226358142
3529	NC_012529	AGC	2	6	162806	162811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3530	NC_012529	GGAC	2	8	162823	162830	25 %	0 %	50 %	25 %	226358142
3531	NC_012529	CGC	2	6	162879	162884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358142
3532	NC_012529	GC	3	6	162887	162892	0 %	0 %	50 %	50 %	226358142
3533	NC_012529	GGC	2	6	162952	162957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358142
3534	NC_012529	TG	3	6	162969	162974	0 %	50 %	50 %	0 %	226358142
3535	NC_012529	GC	3	6	163016	163021	0 %	0 %	50 %	50 %	226358142
3536	NC_012529	GACCTG	2	12	163027	163038	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3537	NC_012529	GCC	2	6	163050	163055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358142
3538	NC_012529	CAC	2	6	163090	163095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358142
3539	NC_012529	TGA	2	6	163109	163114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358142
3540	NC_012529	CCGT	2	8	163135	163142	0 %	25 %	25 %	50 %	226358142
3541	NC_012529	TGC	2	6	163215	163220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3542	NC_012529	CGC	2	6	163230	163235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358142
3543	NC_012529	GCA	2	6	163317	163322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3544	NC_012529	GTC	2	6	163399	163404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3545	NC_012529	GCG	2	6	163405	163410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358142
3546	NC_012529	GCC	2	6	163499	163504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358142
3547	NC_012529	GCA	2	6	163509	163514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3548	NC_012529	CGGTG	2	10	163626	163635	0 %	20 %	60 %	20 %	226358142
3549	NC_012529	G	6	6	163720	163725	0 %	0 %	100 %	0 %	226358142
3550	NC_012529	AGG	2	6	163763	163768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358142
3551	NC_012529	AGG	2	6	163790	163795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358142
3552	NC_012529	GCG	2	6	163796	163801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358142
3553	NC_012529	GGA	2	6	163839	163844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358142
3554	NC_012529	CAG	2	6	163870	163875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358142
3555	NC_012529	GCTCGC	2	12	163914	163925	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	226358142
3556	NC_012529	GGT	2	6	163933	163938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358142
3557	NC_012529	GGTC	2	8	163942	163949	0 %	25 %	50 %	25 %	226358142
3558	NC_012529	GGTG	2	8	163960	163967	0 %	25 %	75 %	0 %	226358142
3559	NC_012529	CG	4	8	164045	164052	0 %	0 %	50 %	50 %	226358143
3560	NC_012529	ACC	2	6	164059	164064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358143
3561	NC_012529	TCCGG	2	10	164127	164136	0 %	20 %	40 %	40 %	226358143
3562	NC_012529	GCC	2	6	164160	164165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358143
3563	NC_012529	GCCG	2	8	164201	164208	0 %	0 %	50 %	50 %	226358143
3564	NC_012529	GCCC	2	8	164216	164223	0 %	0 %	25 %	75 %	226358143
3565	NC_012529	G	7	7	164285	164291	0 %	0 %	100 %	0 %	226358143
3566	NC_012529	CAG	2	6	164337	164342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358143
3567	NC_012529	ACC	2	6	164419	164424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358143
3568	NC_012529	GTG	2	6	164505	164510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358143
3569	NC_012529	GT	3	6	164685	164690	0 %	50 %	50 %	0 %	226358144
3570	NC_012529	TCC	2	6	164698	164703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358144
3571	NC_012529	CCAGG	2	10	164774	164783	20 %	0 %	40 %	40 %	226358144
3572	NC_012529	ACAT	2	8	164847	164854	50 %	25 %	0 %	25 %	226358144
3573	NC_012529	ACG	2	6	164862	164867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358144
3574	NC_012529	CCG	2	6	164868	164873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358144
3575	NC_012529	GCA	2	6	164878	164883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358144
3576	NC_012529	CCGGG	2	10	164906	164915	0 %	0 %	60 %	40 %	226358144
3577	NC_012529	CGG	2	6	164941	164946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358144
3578	NC_012529	CGT	2	6	164953	164958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358144
3579	NC_012529	GCA	2	6	165043	165048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358144
3580	NC_012529	CAG	2	6	165064	165069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358144
3581	NC_012529	GCG	2	6	165090	165095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358144
3582	NC_012529	CCAG	2	8	165133	165140	25 %	0 %	25 %	50 %	226358144
3583	NC_012529	GCCT	2	8	165157	165164	0 %	25 %	25 %	50 %	226358144
3584	NC_012529	AGC	2	6	165216	165221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358144
3585	NC_012529	CAGGGT	2	12	165290	165301	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	226358144
3586	NC_012529	CGG	2	6	165342	165347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_012529	TTAAAG	2	12	165496	165507	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_012529	CTGG	2	8	165514	165521	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3589	NC_012529	CTGCC	2	10	165544	165553	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3590	NC_012529	TCC	2	6	165604	165609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358145
3591	NC_012529	GCC	2	6	165614	165619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358145
3592	NC_012529	TGA	2	6	165636	165641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358145
3593	NC_012529	GCT	2	6	165676	165681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358145
3594	NC_012529	CGG	2	6	165689	165694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358145
3595	NC_012529	GCC	2	6	165722	165727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358145
3596	NC_012529	CGA	2	6	165739	165744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358145
3597	NC_012529	TGG	2	6	165794	165799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358145
3598	NC_012529	GAC	2	6	165959	165964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358145
3599	NC_012529	CGG	2	6	165980	165985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358145
3600	NC_012529	CGG	2	6	166021	166026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358145
3601	NC_012529	CA	3	6	166041	166046	50 %	0 %	0 %	50 %	226358145
3602	NC_012529	CGGG	2	8	166126	166133	0 %	0 %	75 %	25 %	226358145
3603	NC_012529	GCT	2	6	166150	166155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358145
3604	NC_012529	CA	3	6	166171	166176	50 %	0 %	0 %	50 %	226358145
3605	NC_012529	TG	3	6	166233	166238	0 %	50 %	50 %	0 %	226358145
3606	NC_012529	GCC	2	6	166316	166321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358145
3607	NC_012529	GCAC	2	8	166322	166329	25 %	0 %	25 %	50 %	226358145
3608	NC_012529	GCC	2	6	166396	166401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358145
3609	NC_012529	GCT	2	6	166417	166422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358145
3610	NC_012529	TTC	2	6	166444	166449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358145
3611	NC_012529	AGC	2	6	166482	166487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358145
3612	NC_012529	CCA	2	6	166573	166578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358146
3613	NC_012529	GGCA	2	8	166614	166621	25 %	0 %	50 %	25 %	226358146
3614	NC_012529	ACGC	2	8	166719	166726	25 %	0 %	25 %	50 %	226358146
3615	NC_012529	TCA	2	6	166760	166765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358146
3616	NC_012529	CGC	2	6	166812	166817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358146
3617	NC_012529	CCG	2	6	166837	166842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358146
3618	NC_012529	TGA	2	6	166947	166952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358146
3619	NC_012529	ACG	2	6	166970	166975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358146
3620	NC_012529	CCG	2	6	166992	166997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358146
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3622	NC_012529	TTCG	2	8	167223	167230	0 %	50 %	25 %	25 %	226358146
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3867	NC_012529	GGA	2	6	176821	176826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358154
3868	NC_012529	ACA	2	6	176910	176915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226358154
3869	NC_012529	TTC	2	6	176918	176923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226358154
3870	NC_012529	GAC	2	6	177011	177016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358154
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3872	NC_012529	GCT	2	6	177259	177264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358154
3873	NC_012529	CAT	2	6	177344	177349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358154
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3875	NC_012529	TAC	2	6	177395	177400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358154
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3877	NC_012529	CAG	2	6	177455	177460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358154
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3887	NC_012529	CTG	2	6	178000	178005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358155
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3892	NC_012529	CCTC	2	8	178153	178160	0 %	25 %	0 %	75 %	226358155
3893	NC_012529	GCA	2	6	178179	178184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358155
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3897	NC_012529	CGG	2	6	178375	178380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358155
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3902	NC_012529	TGA	2	6	178553	178558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358156
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3932	NC_012529	TGG	2	6	180167	180172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358157
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3959	NC_012529	ACA	2	6	181052	181057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226358157
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3973	NC_012529	TCC	2	6	181511	181516	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358157
3974	NC_012529	CCTGG	2	10	181611	181620	0 %	20 %	40 %	40 %	226358157
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3981	NC_012529	CAG	2	6	181960	181965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358157
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3983	NC_012529	CAG	2	6	181995	182000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358157
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3986	NC_012529	C	7	7	182133	182139	0 %	0 %	0 %	100 %	226358157
3987	NC_012529	CCG	2	6	182178	182183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358157
3988	NC_012529	GCTG	2	8	182211	182218	0 %	25 %	50 %	25 %	226358157
3989	NC_012529	GGA	2	6	182247	182252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358157
3990	NC_012529	GCG	2	6	182315	182320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358157
3991	NC_012529	TGA	2	6	182352	182357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358157
3992	NC_012529	CGC	2	6	182373	182378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358157
3993	NC_012529	TGG	2	6	182405	182410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358157
3994	NC_012529	CTG	2	6	182413	182418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358157
3995	NC_012529	GCA	2	6	182442	182447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358157
3996	NC_012529	GC	3	6	182546	182551	0 %	0 %	50 %	50 %	355004724
3997	NC_012529	CAT	2	6	182557	182562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	355004724
3998	NC_012529	GGC	2	6	182570	182575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	355004724
3999	NC_012529	CAG	2	6	182597	182602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	355004724
4000	NC_012529	CGC	2	6	182605	182610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	355004724

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