MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Deinococcus deserti VCD115 plasmid 2

Total Repeats: 6900

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012529	GGA	2	6	205455	205460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358176
4502	NC_012529	CCT	2	6	205461	205466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358176
4503	NC_012529	GCG	2	6	205532	205537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358176
4504	NC_012529	CAG	2	6	205720	205725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358176
4505	NC_012529	GCT	2	6	205773	205778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358176
4506	NC_012529	CAC	2	6	205789	205794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358176
4507	NC_012529	GT	3	6	206049	206054	0 %	50 %	50 %	0 %	226358176
4508	NC_012529	GC	3	6	206068	206073	0 %	0 %	50 %	50 %	226358177
4509	NC_012529	GCC	2	6	206204	206209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358177
4510	NC_012529	CTGAC	2	10	206242	206251	20 %	20 %	20 %	40 %	226358177
4511	NC_012529	GCG	2	6	206273	206278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358177
4512	NC_012529	GCC	2	6	206571	206576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358177
4513	NC_012529	GCC	2	6	206620	206625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358177
4514	NC_012529	CAT	2	6	206757	206762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358177
4515	NC_012529	GCTCA	2	10	206790	206799	20 %	20 %	20 %	40 %	226358177
4516	NC_012529	CGTC	2	8	206888	206895	0 %	25 %	25 %	50 %	226358177
4517	NC_012529	GGC	2	6	207021	207026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358177
4518	NC_012529	CCT	2	6	207059	207064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226358177
4519	NC_012529	CTGG	2	8	207130	207137	0 %	25 %	50 %	25 %	226358177
4520	NC_012529	GGCA	2	8	207144	207151	25 %	0 %	50 %	25 %	226358177
4521	NC_012529	T	6	6	207210	207215	0 %	100 %	0 %	0 %	226358177
4522	NC_012529	CAC	2	6	207404	207409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4523	NC_012529	GC	3	6	207452	207457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4524	NC_012529	TCA	2	6	207516	207521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_012529	TTG	2	6	207546	207551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_012529	AAT	2	6	207619	207624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_012529	CT	3	6	207695	207700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4528	NC_012529	GTC	2	6	207707	207712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_012529	T	6	6	207791	207796	0 %	100 %	0 %	0 %	226358178
4530	NC_012529	CGC	2	6	207821	207826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358178
4531	NC_012529	GC	4	8	207897	207904	0 %	0 %	50 %	50 %	226358178
4532	NC_012529	GCT	2	6	207944	207949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358178
4533	NC_012529	CTG	2	6	207957	207962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358178
4534	NC_012529	TGC	2	6	208036	208041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358178
4535	NC_012529	TGG	2	6	208054	208059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358178
4536	NC_012529	CG	3	6	208094	208099	0 %	0 %	50 %	50 %	226358178
4537	NC_012529	GTG	2	6	208155	208160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358178
4538	NC_012529	GCT	2	6	208163	208168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358178
4539	NC_012529	CTG	2	6	208182	208187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358178
4540	NC_012529	TGG	2	6	208216	208221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358178
4541	NC_012529	CG	3	6	208232	208237	0 %	0 %	50 %	50 %	226358178
4542	NC_012529	CTG	2	6	208248	208253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358178
4543	NC_012529	CG	3	6	208274	208279	0 %	0 %	50 %	50 %	226358178
4544	NC_012529	CTG	3	9	208350	208358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358178
4545	NC_012529	CTG	2	6	208401	208406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358178
4546	NC_012529	CGC	2	6	208418	208423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358178
4547	NC_012529	TGC	2	6	208475	208480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358178
4548	NC_012529	GTG	2	6	208488	208493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358178
4549	NC_012529	TG	3	6	208495	208500	0 %	50 %	50 %	0 %	226358178
4550	NC_012529	CCA	2	6	208514	208519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358178
4551	NC_012529	AGGC	2	8	208595	208602	25 %	0 %	50 %	25 %	226358179
4552	NC_012529	GCCT	2	8	208609	208616	0 %	25 %	25 %	50 %	226358179
4553	NC_012529	GGC	2	6	208638	208643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358179
4554	NC_012529	GC	3	6	208689	208694	0 %	0 %	50 %	50 %	226358179
4555	NC_012529	C	6	6	208817	208822	0 %	0 %	0 %	100 %	226358179
4556	NC_012529	CAC	2	6	208851	208856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358179
4557	NC_012529	TGC	2	6	208947	208952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358179
4558	NC_012529	CGG	3	9	209006	209014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358179
4559	NC_012529	GCG	2	6	209027	209032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358179
4560	NC_012529	CGCGT	2	10	209046	209055	0 %	20 %	40 %	40 %	226358179
4561	NC_012529	TGG	2	6	209062	209067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358179
4562	NC_012529	GCC	2	6	209072	209077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358179
4563	NC_012529	GGC	2	6	209101	209106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358179
4564	NC_012529	TGC	2	6	209120	209125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_012529	CAT	2	6	209143	209148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_012529	CTGG	2	8	209258	209265	0 %	25 %	50 %	25 %	226358180
4567	NC_012529	GGCGT	2	10	209388	209397	0 %	20 %	60 %	20 %	226358180
4568	NC_012529	GAC	2	6	209448	209453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358180
4569	NC_012529	AGC	2	6	209455	209460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358180
4570	NC_012529	CGT	2	6	209465	209470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358180
4571	NC_012529	GTG	2	6	209496	209501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358180
4572	NC_012529	CTG	2	6	209730	209735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358180
4573	NC_012529	ACG	2	6	209749	209754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358180
4574	NC_012529	TGG	2	6	209793	209798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358180
4575	NC_012529	GATC	2	8	209840	209847	25 %	25 %	25 %	25 %	226358180
4576	NC_012529	GGT	2	6	209942	209947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358180
4577	NC_012529	GCA	2	6	210032	210037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_012529	AGG	2	6	210125	210130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_012529	TTC	2	6	210238	210243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_012529	AC	3	6	210308	210313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4581	NC_012529	GCT	2	6	210354	210359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_012529	GAG	2	6	210384	210389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_012529	GA	3	6	210406	210411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_012529	ATC	2	6	210513	210518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_012529	CAC	2	6	210545	210550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4586	NC_012529	GGA	2	6	210613	210618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4587	NC_012529	TGT	2	6	210654	210659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_012529	CCTG	2	8	210923	210930	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4589	NC_012529	AAC	2	6	210999	211004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_012529	CG	4	8	211024	211031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4591	NC_012529	CGC	2	6	211056	211061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4592	NC_012529	CCA	2	6	211076	211081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4593	NC_012529	AAC	2	6	211117	211122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_012529	CAT	2	6	211149	211154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_012529	GGCA	2	8	211168	211175	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4596	NC_012529	CTG	2	6	211180	211185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_012529	GTT	2	6	211287	211292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_012529	GTT	2	6	211299	211304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_012529	TGT	2	6	211343	211348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_012529	GGT	2	6	211412	211417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_012529	ACG	2	6	211427	211432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_012529	AGC	2	6	211436	211441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_012529	AATGG	2	10	211448	211457	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_012529	CA	3	6	211461	211466	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4605	NC_012529	CCA	2	6	211471	211476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4606	NC_012529	TGG	2	6	211500	211505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_012529	ACT	2	6	211577	211582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358181
4608	NC_012529	CCAGG	2	10	211623	211632	20 %	0 %	40 %	40 %	226358181
4609	NC_012529	ATC	2	6	211660	211665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358181
4610	NC_012529	TCG	2	6	211693	211698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358181
4611	NC_012529	TTG	2	6	211699	211704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226358181
4612	NC_012529	GCT	2	6	211739	211744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358182
4613	NC_012529	CAG	2	6	211816	211821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358182
4614	NC_012529	CAC	2	6	211837	211842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358182
4615	NC_012529	CAG	2	6	211843	211848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358182
4616	NC_012529	CCA	2	6	211851	211856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358182
4617	NC_012529	CGGC	2	8	211884	211891	0 %	0 %	50 %	50 %	226358182
4618	NC_012529	CGA	2	6	211944	211949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358182
4619	NC_012529	CAG	3	9	211969	211977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358182
4620	NC_012529	GCC	2	6	212047	212052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358182
4621	NC_012529	GAT	2	6	212068	212073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358182
4622	NC_012529	GAA	2	6	212155	212160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226358182
4623	NC_012529	GGT	2	6	212170	212175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358182
4624	NC_012529	AGA	2	6	212208	212213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226358182
4625	NC_012529	C	7	7	212218	212224	0 %	0 %	0 %	100 %	226358182
4626	NC_012529	CAG	2	6	212239	212244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358182
4627	NC_012529	GCA	3	9	212264	212272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358182
4628	NC_012529	GGT	2	6	212293	212298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358182
4629	NC_012529	TGAC	2	8	212322	212329	25 %	25 %	25 %	25 %	226358182
4630	NC_012529	CAG	2	6	212383	212388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358182
4631	NC_012529	GCG	2	6	212397	212402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358182
4632	NC_012529	ATC	2	6	212441	212446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358182
4633	NC_012529	CGT	2	6	212475	212480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358182
4634	NC_012529	CAG	2	6	212484	212489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358182
4635	NC_012529	CAT	2	6	212533	212538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358182
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4637	NC_012529	CCA	2	6	212600	212605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226358182
4638	NC_012529	TCA	2	6	212616	212621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226358182
4639	NC_012529	TGA	2	6	212622	212627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358182
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4641	NC_012529	ATG	2	6	212669	212674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226358182
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4643	NC_012529	GCC	2	6	212761	212766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358182
4644	NC_012529	GCT	2	6	212799	212804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358182
4645	NC_012529	TGG	2	6	212805	212810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358182
4646	NC_012529	GCG	2	6	212822	212827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358182
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4648	NC_012529	AAG	2	6	212846	212851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226358182
4649	NC_012529	GCG	2	6	212855	212860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358182
4650	NC_012529	GGC	2	6	212911	212916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358182
4651	NC_012529	CAG	2	6	212965	212970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358182
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4653	NC_012529	TTG	2	6	212999	213004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226358182
4654	NC_012529	CCAG	2	8	213066	213073	25 %	0 %	25 %	50 %	226358182
4655	NC_012529	GCG	2	6	213087	213092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358182
4656	NC_012529	CCT	2	6	213131	213136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4657	NC_012529	CAG	2	6	213164	213169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4658	NC_012529	GCC	2	6	213200	213205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358183
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4662	NC_012529	GCT	2	6	213383	213388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358183
4663	NC_012529	GGT	2	6	213400	213405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358183
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4666	NC_012529	CGG	2	6	213520	213525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358183
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4668	NC_012529	CGC	2	6	213542	213547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358183
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4674	NC_012529	CTG	2	6	213687	213692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358183
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4679	NC_012529	CAGGA	2	10	213992	214001	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4680	NC_012529	TGG	2	6	214010	214015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4681	NC_012529	GCA	2	6	214021	214026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4682	NC_012529	GAG	2	6	214051	214056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226358184
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4686	NC_012529	CAG	2	6	214292	214297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358184
4687	NC_012529	CCGC	2	8	214306	214313	0 %	0 %	25 %	75 %	226358184
4688	NC_012529	GTTC	2	8	214324	214331	0 %	50 %	25 %	25 %	226358184
4689	NC_012529	GCC	2	6	214364	214369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226358184
4690	NC_012529	GAC	2	6	214373	214378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358184
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4697	NC_012529	GAC	2	6	214864	214869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358185
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4727	NC_012529	ACCAG	2	10	216266	216275	40 %	0 %	20 %	40 %	226358185
4728	NC_012529	TGC	2	6	216294	216299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358185
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4730	NC_012529	TGG	2	6	216339	216344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358185
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4732	NC_012529	GCTG	2	8	216535	216542	0 %	25 %	50 %	25 %	226358185
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4735	NC_012529	GGCCG	2	10	216646	216655	0 %	0 %	60 %	40 %	226358185
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4743	NC_012529	TGC	2	6	217166	217171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358185
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4869	NC_012529	AGC	2	6	223908	223913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	355004725
4870	NC_012529	TGG	2	6	223914	223919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	355004725
4871	NC_012529	GGC	2	6	223996	224001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	355004725
4872	NC_012529	GC	3	6	224000	224005	0 %	0 %	50 %	50 %	355004725
4873	NC_012529	TGC	2	6	224052	224057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	355004725
4874	NC_012529	GCC	2	6	224060	224065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	355004725
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4882	NC_012529	CCGG	2	8	224368	224375	0 %	0 %	50 %	50 %	355004725
4883	NC_012529	GC	4	8	224393	224400	0 %	0 %	50 %	50 %	355004725
4884	NC_012529	CGC	3	9	224398	224406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	355004725
4885	NC_012529	CTG	2	6	224441	224446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	355004725
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4889	NC_012529	GCA	2	6	224659	224664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	355004725
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4986	NC_012529	GCAGA	2	10	228475	228484	40 %	0 %	40 %	20 %	226358196
4987	NC_012529	CGG	2	6	228491	228496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226358196
4988	NC_012529	GCA	2	6	228498	228503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358196
4989	NC_012529	GC	3	6	228512	228517	0 %	0 %	50 %	50 %	226358196
4990	NC_012529	GCT	2	6	228576	228581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358196
4991	NC_012529	CG	3	6	228625	228630	0 %	0 %	50 %	50 %	226358196
4992	NC_012529	CG	3	6	228639	228644	0 %	0 %	50 %	50 %	226358196
4993	NC_012529	GCA	2	6	228675	228680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226358196
4994	NC_012529	CTG	2	6	228718	228723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226358196
4995	NC_012529	GTGGCT	2	12	228772	228783	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	226358196
4996	NC_012529	GTG	2	6	228784	228789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226358196
4997	NC_012529	GCAG	2	8	228843	228850	25 %	0 %	50 %	25 %	355004726
4998	NC_012529	CGG	2	6	228987	228992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	355004726
4999	NC_012529	AGG	2	6	229000	229005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	355004726
5000	NC_012529	TCG	2	6	229015	229020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	355004726

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