MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Deinococcus deserti VCD115 plasmid 1

Total Repeats: 4698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012527	TTC	2	6	174	179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012527	GAT	2	6	203	208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226357405
3	NC_012527	GTG	2	6	235	240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357405
4	NC_012527	CCA	2	6	682	687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226357405
5	NC_012527	CCG	2	6	695	700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357405
6	NC_012527	ACG	2	6	745	750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357405
7	NC_012527	GCC	2	6	1080	1085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357406
8	NC_012527	CTG	2	6	1166	1171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357406
9	NC_012527	GGC	2	6	1187	1192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226357406
10	NC_012527	TTG	2	6	1200	1205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226357406
11	NC_012527	GCA	2	6	1295	1300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357406
12	NC_012527	TCG	2	6	1368	1373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357406
13	NC_012527	GAG	2	6	1433	1438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226357406
14	NC_012527	GCT	2	6	1456	1461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357406
15	NC_012527	GGA	2	6	1462	1467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226357406
16	NC_012527	GTT	2	6	1468	1473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226357406
17	NC_012527	GCC	2	6	1746	1751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357406
18	NC_012527	TGA	2	6	2004	2009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012527	GCG	2	6	2032	2037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012527	GTC	2	6	2073	2078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357407
21	NC_012527	CGA	2	6	2094	2099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357407
22	NC_012527	TCT	2	6	2100	2105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226357407
23	NC_012527	GCA	2	6	2233	2238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357407
24	NC_012527	CTC	2	6	2239	2244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226357407
25	NC_012527	AGG	2	6	2305	2310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226357407
26	NC_012527	GTC	2	6	2341	2346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357407
27	NC_012527	CCT	2	6	2366	2371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226357407
28	NC_012527	TGG	2	6	2467	2472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357407
29	NC_012527	CAC	2	6	2664	2669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_012527	ACG	2	6	2681	2686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012527	CCG	2	6	2724	2729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357408
32	NC_012527	CGT	2	6	2742	2747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357408
33	NC_012527	GGT	2	6	2881	2886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357408
34	NC_012527	CTG	2	6	2903	2908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357408
35	NC_012527	ACA	2	6	2984	2989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226357408
36	NC_012527	GTG	2	6	3039	3044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357408
37	NC_012527	ATC	2	6	3052	3057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226357408
38	NC_012527	GCC	2	6	3097	3102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357408
39	NC_012527	GGC	2	6	3151	3156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226357408
40	NC_012527	GTG	2	6	3271	3276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357408
41	NC_012527	TCA	2	6	3284	3289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226357408
42	NC_012527	AGC	2	6	3378	3383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357408
43	NC_012527	TGA	2	6	3399	3404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226357408
44	NC_012527	GCA	2	6	3456	3461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357408
45	NC_012527	GGT	2	6	3504	3509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357408
46	NC_012527	TGT	2	6	3521	3526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	226357408
47	NC_012527	CAT	2	6	3557	3562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226357409
48	NC_012527	GGA	2	6	3651	3656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226357409
49	NC_012527	GCT	2	6	3672	3677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357409
50	NC_012527	CAA	2	6	3703	3708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226357409
51	NC_012527	AGG	2	6	3773	3778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226357409
52	NC_012527	GCA	2	6	3934	3939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357409
53	NC_012527	GCA	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357409
54	NC_012527	GCT	2	6	4061	4066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357409
55	NC_012527	ACC	2	6	4191	4196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226357409
56	NC_012527	GGC	2	6	4358	4363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226357409
57	NC_012527	TGG	2	6	4416	4421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357409
58	NC_012527	CGC	2	6	4526	4531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357409
59	NC_012527	GTG	2	6	4545	4550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357409
60	NC_012527	AGG	2	6	4555	4560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226357409
61	NC_012527	GAT	2	6	4631	4636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226357409
62	NC_012527	CAC	2	6	4698	4703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_012527	CCG	2	6	4705	4710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_012527	GTC	2	6	4831	4836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357410
65	NC_012527	AGG	2	6	4858	4863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226357410
66	NC_012527	CGT	2	6	5129	5134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012527	TCA	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012527	CAC	2	6	5352	5357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_012527	TCA	2	6	5378	5383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012527	GCT	2	6	5421	5426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357411
71	NC_012527	GAC	2	6	5465	5470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357411
72	NC_012527	CAG	2	6	5475	5480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357411
73	NC_012527	CGG	2	6	5708	5713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226357411
74	NC_012527	ATC	2	6	5791	5796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226357411
75	NC_012527	GCA	2	6	5806	5811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357411
76	NC_012527	GGA	2	6	5819	5824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226357411
77	NC_012527	ATG	2	6	5878	5883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226357411
78	NC_012527	CTG	2	6	5928	5933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357411
79	NC_012527	ACA	2	6	5953	5958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226357411
80	NC_012527	ACC	2	6	5967	5972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226357411
81	NC_012527	AGC	2	6	6037	6042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357411
82	NC_012527	CGA	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357411
83	NC_012527	TCT	2	6	6124	6129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226357411
84	NC_012527	GAA	2	6	6162	6167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226357411
85	NC_012527	CGC	2	6	6287	6292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357411
86	NC_012527	TGA	2	6	6325	6330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226357411
87	NC_012527	AGA	2	6	6466	6471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226357411
88	NC_012527	CGA	2	6	6494	6499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357411
89	NC_012527	CTG	2	6	6514	6519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357411
90	NC_012527	GGC	2	6	6558	6563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226357411
91	NC_012527	TCA	2	6	6781	6786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226357411
92	NC_012527	AGG	2	6	6843	6848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012527	CGC	2	6	6900	6905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_012527	AGG	2	6	7169	7174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012527	ACA	2	6	7226	7231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012527	AGT	2	6	7263	7268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012527	ATC	2	6	7371	7376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012527	ATC	2	6	7475	7480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012527	CCT	2	6	7609	7614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226357412
100	NC_012527	ACG	2	6	7696	7701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357412
101	NC_012527	CTG	2	6	7779	7784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357412
102	NC_012527	GGA	2	6	7949	7954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226357412
103	NC_012527	GAC	2	6	7995	8000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357412
104	NC_012527	CAT	2	6	8009	8014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226357412
105	NC_012527	CTT	2	6	8057	8062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226357412
106	NC_012527	CGC	2	6	8241	8246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357412
107	NC_012527	CGC	2	6	8255	8260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357412
108	NC_012527	AGC	2	6	8374	8379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357412
109	NC_012527	GAA	2	6	8466	8471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226357412
110	NC_012527	TGC	2	6	8507	8512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357412
111	NC_012527	TGG	2	6	8515	8520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357412
112	NC_012527	AGG	2	6	8620	8625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226357412
113	NC_012527	GAC	2	6	8636	8641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357412
114	NC_012527	CAG	2	6	8795	8800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357412
115	NC_012527	CAC	2	6	8827	8832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_012527	TGC	2	6	8836	8841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012527	CTT	2	6	8852	8857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012527	CAG	2	6	8909	8914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012527	GCA	2	6	8949	8954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012527	GAG	2	6	8993	8998	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012527	TTC	2	6	9093	9098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_012527	TGA	2	6	9199	9204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226357413
123	NC_012527	ACT	2	6	9256	9261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226357413
124	NC_012527	TGC	2	6	9263	9268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357413
125	NC_012527	CAC	2	6	9281	9286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226357413
126	NC_012527	GAA	2	6	9392	9397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226357413
127	NC_012527	TGG	2	6	9442	9447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357413
128	NC_012527	CAG	2	6	9465	9470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357413
129	NC_012527	ACG	2	6	9544	9549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357413
130	NC_012527	TGG	3	9	9553	9561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226357413
131	NC_012527	CTG	2	6	9680	9685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357413
132	NC_012527	TTC	2	6	9786	9791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012527	TGG	2	6	9792	9797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012527	TTC	2	6	9900	9905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226357414
135	NC_012527	CAC	2	6	9943	9948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226357414
136	NC_012527	TGC	2	6	9967	9972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357414
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152	NC_012527	CCG	2	6	11308	11313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226357415
153	NC_012527	GCT	2	6	11402	11407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357415
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156	NC_012527	TTG	2	6	11685	11690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_012527	CTG	2	6	21651	21656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226357418
264	NC_012527	CAG	2	6	21878	21883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357418
265	NC_012527	CAG	2	6	21902	21907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357418
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274	NC_012527	GCA	2	6	22645	22650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
275	NC_012527	CAA	2	6	22888	22893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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294	NC_012527	TGT	2	6	23788	23793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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387	NC_012527	CAG	2	6	30005	30010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
388	NC_012527	CCT	2	6	30391	30396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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392	NC_012527	GCA	2	6	30697	30702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226357426
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431	NC_012527	GCG	2	6	33100	33105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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500	NC_012527	GCT	2	6	37724	37729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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