MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Desulfobacterium autotrophicum HRM2 plasmid pHRM2a

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012109	TC	3	6	64	69	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012109	AT	3	6	154	159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012109	AT	3	6	370	375	50 %	50 %	0 %	0 %	224371994
4	NC_012109	TA	3	6	423	428	50 %	50 %	0 %	0 %	224371994
5	NC_012109	CA	3	6	788	793	50 %	0 %	0 %	50 %	224371994
6	NC_012109	AG	3	6	1207	1212	50 %	0 %	50 %	0 %	224371995
7	NC_012109	AG	3	6	1255	1260	50 %	0 %	50 %	0 %	224371995
8	NC_012109	AT	3	6	1513	1518	50 %	50 %	0 %	0 %	224371995
9	NC_012109	AT	3	6	1757	1762	50 %	50 %	0 %	0 %	224371995
10	NC_012109	AT	3	6	2179	2184	50 %	50 %	0 %	0 %	224371995
11	NC_012109	AT	3	6	2745	2750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012109	GA	3	6	2857	2862	50 %	0 %	50 %	0 %	224371998
13	NC_012109	AT	3	6	3504	3509	50 %	50 %	0 %	0 %	224372000
14	NC_012109	AG	3	6	3783	3788	50 %	0 %	50 %	0 %	224372001
15	NC_012109	AT	3	6	4490	4495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012109	AT	3	6	5156	5161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012109	AT	4	8	5726	5733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012109	AT	3	6	5926	5931	50 %	50 %	0 %	0 %	224372002
19	NC_012109	TC	3	6	6345	6350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012109	AG	3	6	6836	6841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012109	AT	3	6	6994	6999	50 %	50 %	0 %	0 %	224372004
22	NC_012109	AG	3	6	7225	7230	50 %	0 %	50 %	0 %	224372004
23	NC_012109	AC	3	6	7762	7767	50 %	0 %	0 %	50 %	224372004
24	NC_012109	GA	3	6	8181	8186	50 %	0 %	50 %	0 %	224372004
25	NC_012109	AT	3	6	8316	8321	50 %	50 %	0 %	0 %	224372004
26	NC_012109	TA	3	6	8947	8952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012109	CT	3	6	9146	9151	0 %	50 %	0 %	50 %	224372006
28	NC_012109	CA	3	6	9820	9825	50 %	0 %	0 %	50 %	224372006
29	NC_012109	TA	4	8	9874	9881	50 %	50 %	0 %	0 %	224372006
30	NC_012109	TA	4	8	10227	10234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012109	TA	3	6	10299	10304	50 %	50 %	0 %	0 %	224372007
32	NC_012109	CA	3	6	10479	10484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012109	CT	3	6	11380	11385	0 %	50 %	0 %	50 %	224372009
34	NC_012109	TG	3	6	12493	12498	0 %	50 %	50 %	0 %	224372010
35	NC_012109	CT	3	6	12926	12931	0 %	50 %	0 %	50 %	224372011
36	NC_012109	TA	3	6	13160	13165	50 %	50 %	0 %	0 %	224372011
37	NC_012109	CT	3	6	13183	13188	0 %	50 %	0 %	50 %	224372011
38	NC_012109	TC	3	6	15445	15450	0 %	50 %	0 %	50 %	224372013
39	NC_012109	AT	3	6	17439	17444	50 %	50 %	0 %	0 %	224372016
40	NC_012109	CG	3	6	18227	18232	0 %	0 %	50 %	50 %	224372016
41	NC_012109	AT	3	6	18522	18527	50 %	50 %	0 %	0 %	224372016
42	NC_012109	CA	3	6	19167	19172	50 %	0 %	0 %	50 %	224372016
43	NC_012109	AT	3	6	21014	21019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012109	GA	3	6	21270	21275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012109	AT	3	6	22403	22408	50 %	50 %	0 %	0 %	224372018
46	NC_012109	GA	3	6	23391	23396	50 %	0 %	50 %	0 %	224372018
47	NC_012109	TA	3	6	23507	23512	50 %	50 %	0 %	0 %	224372018
48	NC_012109	CT	3	6	24764	24769	0 %	50 %	0 %	50 %	224372019
49	NC_012109	AT	3	6	24864	24869	50 %	50 %	0 %	0 %	224372019
50	NC_012109	GT	4	8	24964	24971	0 %	50 %	50 %	0 %	224372020
51	NC_012109	AG	3	6	25629	25634	50 %	0 %	50 %	0 %	224372022
52	NC_012109	GT	3	6	26545	26550	0 %	50 %	50 %	0 %	224372024
53	NC_012109	AT	4	8	27166	27173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012109	CT	3	6	27654	27659	0 %	50 %	0 %	50 %	224372026
55	NC_012109	GT	4	8	31440	31447	0 %	50 %	50 %	0 %	224372027
56	NC_012109	AC	3	6	34090	34095	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012109	TA	3	6	34252	34257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012109	TA	3	6	35075	35080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012109	AG	3	6	35928	35933	50 %	0 %	50 %	0 %	224372032
60	NC_012109	AG	3	6	37197	37202	50 %	0 %	50 %	0 %	224372032
61	NC_012109	TC	3	6	37598	37603	0 %	50 %	0 %	50 %	224372032
62	NC_012109	AG	3	6	37882	37887	50 %	0 %	50 %	0 %	224372032
63	NC_012109	TG	3	6	40351	40356	0 %	50 %	50 %	0 %	224372034
64	NC_012109	GT	3	6	40658	40663	0 %	50 %	50 %	0 %	224372034
65	NC_012109	TC	4	8	41485	41492	0 %	50 %	0 %	50 %	224372034
66	NC_012109	AT	3	6	42266	42271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012109	AG	4	8	42272	42279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012109	CT	5	10	42591	42600	0 %	50 %	0 %	50 %	224372036
69	NC_012109	AT	3	6	43764	43769	50 %	50 %	0 %	0 %	224372037
70	NC_012109	CA	3	6	43954	43959	50 %	0 %	0 %	50 %	224372038
71	NC_012109	AT	3	6	44220	44225	50 %	50 %	0 %	0 %	224372039
72	NC_012109	GA	3	6	44869	44874	50 %	0 %	50 %	0 %	224372041
73	NC_012109	TA	3	6	45407	45412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012109	TA	3	6	45567	45572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012109	AT	3	6	46255	46260	50 %	50 %	0 %	0 %	224372042
76	NC_012109	CG	3	6	46484	46489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_012109	TG	3	6	47074	47079	0 %	50 %	50 %	0 %	224372043
78	NC_012109	AT	3	6	47100	47105	50 %	50 %	0 %	0 %	224372043
79	NC_012109	CG	3	6	47499	47504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_012109	TC	3	6	47685	47690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_012109	CT	5	10	48338	48347	0 %	50 %	0 %	50 %	224372044
82	NC_012109	AT	3	6	49511	49516	50 %	50 %	0 %	0 %	224372045
83	NC_012109	CA	3	6	49701	49706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_012109	AT	3	6	49967	49972	50 %	50 %	0 %	0 %	224372046
85	NC_012109	GA	3	6	50616	50621	50 %	0 %	50 %	0 %	224372048
86	NC_012109	TA	3	6	51154	51159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012109	TA	3	6	51314	51319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012109	AT	3	6	52002	52007	50 %	50 %	0 %	0 %	224372049
89	NC_012109	CG	3	6	52231	52236	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012109	TG	3	6	52821	52826	0 %	50 %	50 %	0 %	224372050
91	NC_012109	AT	3	6	52847	52852	50 %	50 %	0 %	0 %	224372050
92	NC_012109	CG	3	6	53246	53251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_012109	TC	3	6	53432	53437	0 %	50 %	0 %	50 %	224372051
94	NC_012109	TA	3	6	53958	53963	50 %	50 %	0 %	0 %	224372051
95	NC_012109	GT	3	6	54268	54273	0 %	50 %	50 %	0 %	224372052
96	NC_012109	GT	3	6	54316	54321	0 %	50 %	50 %	0 %	224372052
97	NC_012109	AT	3	6	55865	55870	50 %	50 %	0 %	0 %	224372055
98	NC_012109	AT	3	6	56251	56256	50 %	50 %	0 %	0 %	224372056
99	NC_012109	CT	3	6	57206	57211	0 %	50 %	0 %	50 %	224372058
100	NC_012109	CG	3	6	57910	57915	0 %	0 %	50 %	50 %	224372060
101	NC_012109	TA	4	8	59472	59479	50 %	50 %	0 %	0 %	224372061
102	NC_012109	AT	3	6	59494	59499	50 %	50 %	0 %	0 %	224372061
103	NC_012109	TG	3	6	62392	62397	0 %	50 %	50 %	0 %	224372064
104	NC_012109	GC	3	6	62872	62877	0 %	0 %	50 %	50 %	224372065
105	NC_012109	CG	3	6	64919	64924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_012109	GT	3	6	65662	65667	0 %	50 %	50 %	0 %	224372067
107	NC_012109	TA	3	6	65937	65942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012109	AT	3	6	66063	66068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012109	TG	3	6	67337	67342	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012109	TA	4	8	68420	68427	50 %	50 %	0 %	0 %	224372069

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.