MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Desulfobacterium autotrophicum HRM2 plasmid pHRM2a

Total Repeats: 796

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012109	CTT	2	6	17	22	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012109	TAT	2	6	43	48	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012109	CAT	2	6	78	83	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012109	TTG	2	6	128	133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012109	AGG	2	6	172	177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012109	GGT	2	6	226	231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224371994
7	NC_012109	TTA	2	6	296	301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224371994
8	NC_012109	AAC	2	6	361	366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371994
9	NC_012109	ATT	2	6	378	383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224371994
10	NC_012109	AAG	2	6	806	811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224371994
11	NC_012109	GAA	2	6	829	834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224371994
12	NC_012109	AAC	2	6	846	851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371994
13	NC_012109	CAA	2	6	1105	1110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
14	NC_012109	AAC	2	6	1147	1152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
15	NC_012109	AAC	2	6	1163	1168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
16	NC_012109	AAC	2	6	1235	1240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
17	NC_012109	ACA	2	6	1284	1289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
18	NC_012109	ACA	2	6	1292	1297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
19	NC_012109	CCG	2	6	1457	1462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224371995
20	NC_012109	ACT	2	6	1559	1564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224371995
21	NC_012109	CTC	2	6	1606	1611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224371995
22	NC_012109	ACA	2	6	1643	1648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
23	NC_012109	ACA	2	6	1659	1664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
24	NC_012109	AAC	2	6	1682	1687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
25	NC_012109	ACA	2	6	1691	1696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
26	NC_012109	ACA	2	6	1699	1704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
27	NC_012109	ACA	2	6	1715	1720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
28	NC_012109	AAT	2	6	1763	1768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224371995
29	NC_012109	ATT	2	6	1800	1805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224371995
30	NC_012109	TGA	2	6	1849	1854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224371995
31	NC_012109	CAT	2	6	1907	1912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224371995
32	NC_012109	AGC	2	6	1924	1929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224371995
33	NC_012109	GTG	2	6	1968	1973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224371995
34	NC_012109	GAA	2	6	2006	2011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224371995
35	NC_012109	ACA	2	6	2047	2052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
36	NC_012109	ATT	2	6	2057	2062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224371995
37	NC_012109	CAA	2	6	2190	2195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
38	NC_012109	AGA	2	6	2278	2283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224371995
39	NC_012109	TCG	2	6	2305	2310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012109	CAT	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224371996
41	NC_012109	TTG	2	6	2454	2459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224371996
42	NC_012109	CCA	2	6	2609	2614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224371997
43	NC_012109	AAT	2	6	2770	2775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012109	TCC	2	6	3114	3119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_012109	ATA	2	6	3142	3147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012109	TGA	2	6	3232	3237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372000
47	NC_012109	ACT	2	6	3284	3289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372000
48	NC_012109	CAT	2	6	3356	3361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372000
49	NC_012109	ATA	2	6	3402	3407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372000
50	NC_012109	GAT	2	6	3511	3516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372000
51	NC_012109	ATG	2	6	3574	3579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012109	CTA	2	6	3618	3623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372001
53	NC_012109	TTA	2	6	3638	3643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372001
54	NC_012109	ATA	2	6	3674	3679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372001
55	NC_012109	CCA	2	6	3929	3934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224372001
56	NC_012109	TGA	2	6	3960	3965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372001
57	NC_012109	CAT	2	6	4062	4067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012109	TAA	2	6	4216	4221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012109	GAC	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012109	GGT	2	6	4466	4471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012109	AGA	2	6	4714	4719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012109	CAA	3	9	4734	4742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_012109	AAT	2	6	4777	4782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012109	TTC	2	6	5029	5034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012109	GGA	2	6	5320	5325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012109	TGC	2	6	5331	5336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012109	CTT	2	6	5384	5389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012109	TTG	2	6	5410	5415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012109	ATA	2	6	5440	5445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012109	AAT	2	6	5749	5754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012109	AGG	2	6	5755	5760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012109	ATC	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_012109	CTG	2	6	6028	6033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224372002
74	NC_012109	ATA	2	6	6173	6178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012109	ATA	2	6	6403	6408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012109	TCT	2	6	6532	6537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372003
77	NC_012109	CAT	2	6	6578	6583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372003
78	NC_012109	ATT	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372003
79	NC_012109	ATT	3	9	6783	6791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012109	CCG	2	6	7046	7051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224372004
81	NC_012109	GTG	2	6	7124	7129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224372004
82	NC_012109	ATC	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372004
83	NC_012109	AAC	2	6	7404	7409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372004
84	NC_012109	AAG	2	6	7487	7492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372004
85	NC_012109	GAG	2	6	7579	7584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	224372004
86	NC_012109	AAT	2	6	7723	7728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372004
87	NC_012109	TGA	2	6	7800	7805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372004
88	NC_012109	GGT	2	6	7837	7842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224372004
89	NC_012109	AAC	2	6	7875	7880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372004
90	NC_012109	ACC	2	6	7889	7894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224372004
91	NC_012109	AAC	2	6	8013	8018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372004
92	NC_012109	TAA	2	6	8112	8117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372004
93	NC_012109	ATA	2	6	8167	8172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372004
94	NC_012109	AGA	2	6	8214	8219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372004
95	NC_012109	TTG	2	6	8447	8452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372004
96	NC_012109	CAA	2	6	8534	8539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372004
97	NC_012109	TTG	2	6	8696	8701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372005
98	NC_012109	TTG	2	6	8769	8774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372005
99	NC_012109	ACA	2	6	8786	8791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372005
100	NC_012109	CGG	2	6	8849	8854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224372005
101	NC_012109	TTC	2	6	8896	8901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012109	ATT	2	6	8909	8914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012109	TAT	2	6	9048	9053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012109	ATC	2	6	9110	9115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372006
105	NC_012109	GTT	2	6	9190	9195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372006
106	NC_012109	TCT	2	6	9234	9239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372006
107	NC_012109	TTA	2	6	9258	9263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372006
108	NC_012109	GAA	2	6	9303	9308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372006
109	NC_012109	TTC	2	6	9386	9391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372006
110	NC_012109	TTC	2	6	9638	9643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372006
111	NC_012109	CTT	2	6	9740	9745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372006
112	NC_012109	TCT	2	6	9777	9782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372006
113	NC_012109	TTG	2	6	10021	10026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372006
114	NC_012109	GGT	2	6	10089	10094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012109	TAG	2	6	10100	10105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012109	GGA	2	6	10293	10298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012109	ATC	2	6	10307	10312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372007
118	NC_012109	CCA	2	6	10340	10345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224372007
119	NC_012109	GAA	2	6	10466	10471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372007
120	NC_012109	TGG	2	6	10591	10596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224372008
121	NC_012109	TTG	2	6	10644	10649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372008
122	NC_012109	GAC	2	6	10718	10723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224372008
123	NC_012109	ATA	2	6	10779	10784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372008
124	NC_012109	CAA	2	6	10790	10795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372008
125	NC_012109	GAA	3	9	10994	11002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372008
126	NC_012109	TAT	2	6	11123	11128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372008
127	NC_012109	TGA	2	6	11151	11156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372008
128	NC_012109	ACC	2	6	11481	11486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224372009
129	NC_012109	TCA	2	6	11626	11631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372009
130	NC_012109	AAG	2	6	11975	11980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372010
131	NC_012109	AGA	2	6	12110	12115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372010
132	NC_012109	TGA	2	6	12138	12143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372010
133	NC_012109	CAG	2	6	12178	12183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224372010
134	NC_012109	CAA	2	6	12186	12191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372010
135	NC_012109	GTT	2	6	12309	12314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372010
136	NC_012109	GAT	2	6	12472	12477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372010
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141	NC_012109	TGC	2	6	12797	12802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224372011
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143	NC_012109	GGT	2	6	12990	12995	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224372011
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145	NC_012109	TGG	2	6	13034	13039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224372011
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153	NC_012109	CAA	2	6	13678	13683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372011
154	NC_012109	GGT	3	9	13718	13726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224372011
155	NC_012109	TGC	2	6	13731	13736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224372011
156	NC_012109	TTC	2	6	13779	13784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372011
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164	NC_012109	ACA	2	6	14428	14433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372012
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175	NC_012109	ATT	2	6	15595	15600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_012109	TCT	2	6	22824	22829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372018
262	NC_012109	ATC	2	6	22976	22981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372018
263	NC_012109	CAA	2	6	23039	23044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372018
264	NC_012109	AGA	2	6	23103	23108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372018
265	NC_012109	AGA	2	6	23165	23170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372018
266	NC_012109	ATG	2	6	23216	23221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372018
267	NC_012109	AAT	2	6	23308	23313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372018
268	NC_012109	CAA	2	6	23333	23338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372018
269	NC_012109	TGT	2	6	23373	23378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372018
270	NC_012109	TGA	2	6	23478	23483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372018
271	NC_012109	TAT	2	6	23534	23539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372018
272	NC_012109	GTT	2	6	23560	23565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372018
273	NC_012109	TAA	2	6	23808	23813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372018
274	NC_012109	TTG	2	6	24195	24200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
275	NC_012109	CAA	2	6	24202	24207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_012109	GTT	2	6	24248	24253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
277	NC_012109	GTT	2	6	24260	24265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_012109	AAG	2	6	24278	24283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
279	NC_012109	GTT	2	6	24293	24298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
280	NC_012109	CAG	2	6	24391	24396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224372019
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283	NC_012109	CTG	2	6	24480	24485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224372019
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287	NC_012109	ATA	2	6	24972	24977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372020
288	NC_012109	AAT	2	6	24997	25002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372020
289	NC_012109	TGT	2	6	25101	25106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372020
290	NC_012109	ATT	2	6	25238	25243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372021
291	NC_012109	CCA	2	6	25419	25424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224372021
292	NC_012109	CTC	2	6	25440	25445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224372021
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295	NC_012109	TAT	3	9	25599	25607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_012109	TAA	2	6	25637	25642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372022
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301	NC_012109	ATG	2	6	26169	26174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372023
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312	NC_012109	TAA	2	6	26665	26670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_012109	TCT	2	6	26793	26798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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329	NC_012109	GGC	2	6	28094	28099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224372027
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369	NC_012109	ATT	2	6	32121	32126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372028
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371	NC_012109	TTC	2	6	32193	32198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
372	NC_012109	CAA	2	6	32211	32216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
373	NC_012109	GTT	2	6	32335	32340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372029
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383	NC_012109	TCA	2	6	33456	33461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372029
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498	NC_012109	TGG	2	6	43160	43165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224372037
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