MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfobacterium autotrophicum HRM2 plasmid pHRM2a

Total Repeats: 1380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012109	CTT	2	6	17	22	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012109	TAT	2	6	43	48	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012109	TC	3	6	64	69	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012109	CAT	2	6	78	83	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012109	TTG	2	6	128	133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012109	AT	3	6	154	159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012109	AGG	2	6	172	177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012109	A	6	6	187	192	100 %	0 %	0 %	0 %	224371994
9	NC_012109	GGT	2	6	226	231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224371994
10	NC_012109	A	6	6	286	291	100 %	0 %	0 %	0 %	224371994
11	NC_012109	TTA	2	6	296	301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224371994
12	NC_012109	AAC	2	6	361	366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371994
13	NC_012109	AT	3	6	370	375	50 %	50 %	0 %	0 %	224371994
14	NC_012109	ATT	2	6	378	383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224371994
15	NC_012109	TA	3	6	423	428	50 %	50 %	0 %	0 %	224371994
16	NC_012109	ATTG	2	8	580	587	25 %	50 %	25 %	0 %	224371994
17	NC_012109	CCTAA	2	10	733	742	40 %	20 %	0 %	40 %	224371994
18	NC_012109	ATAA	2	8	760	767	75 %	25 %	0 %	0 %	224371994
19	NC_012109	CA	3	6	788	793	50 %	0 %	0 %	50 %	224371994
20	NC_012109	AAG	2	6	806	811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224371994
21	NC_012109	GAA	2	6	829	834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224371994
22	NC_012109	AAC	2	6	846	851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371994
23	NC_012109	TTTC	3	12	964	975	0 %	75 %	0 %	25 %	224371994
24	NC_012109	AAAGAG	2	12	1073	1084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224371995
25	NC_012109	CAA	2	6	1105	1110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
26	NC_012109	AAC	2	6	1147	1152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
27	NC_012109	AAC	2	6	1163	1168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
28	NC_012109	AGCA	2	8	1179	1186	50 %	0 %	25 %	25 %	224371995
29	NC_012109	AG	3	6	1207	1212	50 %	0 %	50 %	0 %	224371995
30	NC_012109	AAC	2	6	1235	1240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
31	NC_012109	AG	3	6	1255	1260	50 %	0 %	50 %	0 %	224371995
32	NC_012109	ACA	2	6	1284	1289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
33	NC_012109	ACA	2	6	1292	1297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
34	NC_012109	CCG	2	6	1457	1462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224371995
35	NC_012109	A	8	8	1503	1510	100 %	0 %	0 %	0 %	224371995
36	NC_012109	AT	3	6	1513	1518	50 %	50 %	0 %	0 %	224371995
37	NC_012109	A	6	6	1549	1554	100 %	0 %	0 %	0 %	224371995
38	NC_012109	ACT	2	6	1559	1564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224371995
39	NC_012109	CTC	2	6	1606	1611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224371995
40	NC_012109	ACA	2	6	1643	1648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
41	NC_012109	ACA	2	6	1659	1664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
42	NC_012109	AAC	2	6	1682	1687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
43	NC_012109	ACA	2	6	1691	1696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
44	NC_012109	ACA	2	6	1699	1704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
45	NC_012109	ACA	2	6	1715	1720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
46	NC_012109	AGCA	2	8	1722	1729	50 %	0 %	25 %	25 %	224371995
47	NC_012109	GACA	3	12	1744	1755	50 %	0 %	25 %	25 %	224371995
48	NC_012109	AT	3	6	1757	1762	50 %	50 %	0 %	0 %	224371995
49	NC_012109	AAT	2	6	1763	1768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224371995
50	NC_012109	ATCT	2	8	1773	1780	25 %	50 %	0 %	25 %	224371995
51	NC_012109	T	6	6	1784	1789	0 %	100 %	0 %	0 %	224371995
52	NC_012109	ATT	2	6	1800	1805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224371995
53	NC_012109	A	8	8	1828	1835	100 %	0 %	0 %	0 %	224371995
54	NC_012109	TGA	2	6	1849	1854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224371995
55	NC_012109	T	6	6	1876	1881	0 %	100 %	0 %	0 %	224371995
56	NC_012109	CAT	2	6	1907	1912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224371995
57	NC_012109	AGC	2	6	1924	1929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224371995
58	NC_012109	T	7	7	1948	1954	0 %	100 %	0 %	0 %	224371995
59	NC_012109	GTG	2	6	1968	1973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224371995
60	NC_012109	GAA	2	6	2006	2011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224371995
61	NC_012109	ACA	2	6	2047	2052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
62	NC_012109	ATT	2	6	2057	2062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224371995
63	NC_012109	AAAG	2	8	2087	2094	75 %	0 %	25 %	0 %	224371995
64	NC_012109	ATGA	2	8	2129	2136	50 %	25 %	25 %	0 %	224371995
65	NC_012109	AT	3	6	2179	2184	50 %	50 %	0 %	0 %	224371995
66	NC_012109	CAA	2	6	2190	2195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224371995
67	NC_012109	T	7	7	2214	2220	0 %	100 %	0 %	0 %	224371995
68	NC_012109	A	7	7	2221	2227	100 %	0 %	0 %	0 %	224371995
69	NC_012109	AGA	2	6	2278	2283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224371995
70	NC_012109	A	8	8	2283	2290	100 %	0 %	0 %	0 %	224371995
71	NC_012109	TCG	2	6	2305	2310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012109	T	7	7	2338	2344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012109	CAT	2	6	2359	2364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224371996
74	NC_012109	TTTTG	2	10	2423	2432	0 %	80 %	20 %	0 %	224371996
75	NC_012109	TTG	2	6	2454	2459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224371996
76	NC_012109	CCA	2	6	2609	2614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224371997
77	NC_012109	CTTTT	2	10	2674	2683	0 %	80 %	0 %	20 %	224371997
78	NC_012109	T	7	7	2697	2703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012109	AT	3	6	2745	2750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012109	AAT	2	6	2770	2775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012109	TGTT	2	8	2786	2793	0 %	75 %	25 %	0 %	224371998
82	NC_012109	GA	3	6	2857	2862	50 %	0 %	50 %	0 %	224371998
83	NC_012109	A	6	6	2904	2909	100 %	0 %	0 %	0 %	224371998
84	NC_012109	CTGC	2	8	2989	2996	0 %	25 %	25 %	50 %	224371998
85	NC_012109	CTTT	2	8	3064	3071	0 %	75 %	0 %	25 %	224371999
86	NC_012109	TCC	2	6	3114	3119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_012109	ATA	2	6	3142	3147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012109	TGA	2	6	3232	3237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372000
89	NC_012109	ACT	2	6	3284	3289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372000
90	NC_012109	T	6	6	3295	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	224372000
91	NC_012109	CAT	2	6	3356	3361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372000
92	NC_012109	ATA	2	6	3402	3407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372000
93	NC_012109	A	6	6	3446	3451	100 %	0 %	0 %	0 %	224372000
94	NC_012109	AT	3	6	3504	3509	50 %	50 %	0 %	0 %	224372000
95	NC_012109	GAT	2	6	3511	3516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372000
96	NC_012109	T	6	6	3520	3525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012109	ATG	2	6	3574	3579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012109	CTA	2	6	3618	3623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372001
99	NC_012109	TTA	2	6	3638	3643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372001
100	NC_012109	ATTG	2	8	3657	3664	25 %	50 %	25 %	0 %	224372001
101	NC_012109	ATA	2	6	3674	3679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372001
102	NC_012109	AG	3	6	3783	3788	50 %	0 %	50 %	0 %	224372001
103	NC_012109	ACGG	2	8	3901	3908	25 %	0 %	50 %	25 %	224372001
104	NC_012109	CCA	2	6	3929	3934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224372001
105	NC_012109	TGA	2	6	3960	3965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372001
106	NC_012109	CAT	2	6	4062	4067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012109	GACC	2	8	4091	4098	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012109	TAA	2	6	4216	4221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012109	GAC	2	6	4274	4279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012109	CTCAA	2	10	4284	4293	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_012109	A	6	6	4308	4313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012109	ACCT	2	8	4387	4394	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_012109	A	7	7	4428	4434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012109	T	9	9	4439	4447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012109	GGT	2	6	4466	4471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012109	AT	3	6	4490	4495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012109	ATAG	2	8	4541	4548	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012109	T	7	7	4624	4630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012109	AGA	2	6	4714	4719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012109	CAA	3	9	4734	4742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012109	AAT	2	6	4777	4782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012109	ATTT	2	8	4796	4803	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012109	T	8	8	4941	4948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012109	TTC	2	6	5029	5034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_012109	ATAG	2	8	5098	5105	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012109	AT	3	6	5156	5161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012109	TTGC	2	8	5202	5209	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_012109	GGA	2	6	5320	5325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012109	TGC	2	6	5331	5336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012109	CTT	2	6	5384	5389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012109	TTG	2	6	5410	5415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012109	ATA	2	6	5440	5445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012109	AAAAAT	2	12	5523	5534	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012109	GCAA	2	8	5610	5617	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_012109	AT	4	8	5726	5733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012109	AAT	2	6	5749	5754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012109	AGG	2	6	5755	5760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012109	ATC	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_012109	TTTG	2	8	5841	5848	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012109	ATTAA	2	10	5859	5868	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012109	AT	3	6	5926	5931	50 %	50 %	0 %	0 %	224372002
142	NC_012109	CTG	2	6	6028	6033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224372002
143	NC_012109	ATA	2	6	6173	6178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012109	A	6	6	6212	6217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012109	A	6	6	6233	6238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012109	AATT	2	8	6240	6247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_012109	AAG	2	6	11975	11980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372010
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402	NC_012109	TTTA	2	8	17550	17557	25 %	75 %	0 %	0 %	224372016
403	NC_012109	GAACA	2	10	17632	17641	60 %	0 %	20 %	20 %	224372016
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