MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Desulfobacterium autotrophicum HRM2 plasmid pHRM2a

Total Repeats: 1380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012109	TTTTA	2	10	22215	22224	20 %	80 %	0 %	0 %	224372018
502	NC_012109	ATGC	2	8	22267	22274	25 %	25 %	25 %	25 %	224372018
503	NC_012109	GAA	2	6	22285	22290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372018
504	NC_012109	ATA	2	6	22294	22299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372018
505	NC_012109	A	6	6	22299	22304	100 %	0 %	0 %	0 %	224372018
506	NC_012109	ATG	2	6	22319	22324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372018
507	NC_012109	GAA	2	6	22369	22374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372018
508	NC_012109	ATG	2	6	22375	22380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372018
509	NC_012109	AT	3	6	22403	22408	50 %	50 %	0 %	0 %	224372018
510	NC_012109	GAC	2	6	22546	22551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224372018
511	NC_012109	AAG	2	6	22556	22561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372018
512	NC_012109	A	9	9	22592	22600	100 %	0 %	0 %	0 %	224372018
513	NC_012109	AAT	2	6	22620	22625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372018
514	NC_012109	GAA	2	6	22642	22647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372018
515	NC_012109	TGA	2	6	22680	22685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372018
516	NC_012109	A	6	6	22769	22774	100 %	0 %	0 %	0 %	224372018
517	NC_012109	TAA	2	6	22818	22823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372018
518	NC_012109	TCT	2	6	22824	22829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372018
519	NC_012109	CCTC	2	8	22869	22876	0 %	25 %	0 %	75 %	224372018
520	NC_012109	CAAA	2	8	22944	22951	75 %	0 %	0 %	25 %	224372018
521	NC_012109	ATC	2	6	22976	22981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372018
522	NC_012109	CGTT	2	8	22992	22999	0 %	50 %	25 %	25 %	224372018
523	NC_012109	A	6	6	23003	23008	100 %	0 %	0 %	0 %	224372018
524	NC_012109	CAA	2	6	23039	23044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372018
525	NC_012109	AGA	2	6	23103	23108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372018
526	NC_012109	AGA	2	6	23165	23170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372018
527	NC_012109	ATG	2	6	23216	23221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372018
528	NC_012109	AGAC	2	8	23229	23236	50 %	0 %	25 %	25 %	224372018
529	NC_012109	AAT	2	6	23308	23313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372018
530	NC_012109	CAA	2	6	23333	23338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372018
531	NC_012109	TGT	2	6	23373	23378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372018
532	NC_012109	GA	3	6	23391	23396	50 %	0 %	50 %	0 %	224372018
533	NC_012109	TTTA	2	8	23453	23460	25 %	75 %	0 %	0 %	224372018
534	NC_012109	TGA	2	6	23478	23483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372018
535	NC_012109	TA	3	6	23507	23512	50 %	50 %	0 %	0 %	224372018
536	NC_012109	AGAA	2	8	23526	23533	75 %	0 %	25 %	0 %	224372018
537	NC_012109	TAT	2	6	23534	23539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372018
538	NC_012109	GTT	2	6	23560	23565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372018
539	NC_012109	TAA	2	6	23808	23813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372018
540	NC_012109	A	6	6	23917	23922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_012109	TATCC	2	10	24109	24118	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
542	NC_012109	CATCC	2	10	24174	24183	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
543	NC_012109	TTG	2	6	24195	24200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_012109	CAA	2	6	24202	24207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_012109	GTT	2	6	24248	24253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_012109	T	6	6	24252	24257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_012109	GTT	2	6	24260	24265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_012109	AAG	2	6	24278	24283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_012109	GTT	2	6	24293	24298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_012109	CAG	2	6	24391	24396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224372019
551	NC_012109	GCC	2	6	24405	24410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224372019
552	NC_012109	CAC	2	6	24449	24454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224372019
553	NC_012109	CTG	2	6	24480	24485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224372019
554	NC_012109	AGA	2	6	24616	24621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372019
555	NC_012109	AAGAA	2	10	24695	24704	80 %	0 %	20 %	0 %	224372019
556	NC_012109	CT	3	6	24764	24769	0 %	50 %	0 %	50 %	224372019
557	NC_012109	GAT	2	6	24774	24779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372019
558	NC_012109	AGAA	2	8	24784	24791	75 %	0 %	25 %	0 %	224372019
559	NC_012109	GAAT	2	8	24836	24843	50 %	25 %	25 %	0 %	224372019
560	NC_012109	AT	3	6	24864	24869	50 %	50 %	0 %	0 %	224372019
561	NC_012109	TGAAT	3	15	24897	24911	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
562	NC_012109	GAA	2	6	24948	24953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372020
563	NC_012109	GT	4	8	24964	24971	0 %	50 %	50 %	0 %	224372020
564	NC_012109	ATA	2	6	24972	24977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372020
565	NC_012109	AAT	2	6	24997	25002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372020
566	NC_012109	TGT	2	6	25101	25106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372020
567	NC_012109	AACA	2	8	25163	25170	75 %	0 %	0 %	25 %	224372020
568	NC_012109	ATT	2	6	25238	25243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372021
569	NC_012109	T	8	8	25333	25340	0 %	100 %	0 %	0 %	224372021
570	NC_012109	CCA	2	6	25419	25424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224372021
571	NC_012109	CTC	2	6	25440	25445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224372021
572	NC_012109	ATGCA	2	10	25498	25507	40 %	20 %	20 %	20 %	224372021
573	NC_012109	CAT	2	6	25527	25532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372021
574	NC_012109	ATA	2	6	25592	25597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372021
575	NC_012109	TAT	3	9	25599	25607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_012109	AG	3	6	25629	25634	50 %	0 %	50 %	0 %	224372022
577	NC_012109	TAA	2	6	25637	25642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372022
578	NC_012109	TTCA	2	8	25713	25720	25 %	50 %	0 %	25 %	224372022
579	NC_012109	AGCCA	2	10	26004	26013	40 %	0 %	20 %	40 %	224372023
580	NC_012109	GGT	2	6	26018	26023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224372023
581	NC_012109	CAA	2	6	26045	26050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372023
582	NC_012109	TCA	2	6	26052	26057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372023
583	NC_012109	GGT	2	6	26123	26128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224372023
584	NC_012109	ATG	2	6	26169	26174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	224372023
585	NC_012109	TGG	2	6	26206	26211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	224372023
586	NC_012109	TGC	2	6	26252	26257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224372023
587	NC_012109	CGC	2	6	26372	26377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	224372024
588	NC_012109	GCA	2	6	26437	26442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224372024
589	NC_012109	CAA	2	6	26462	26467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372024
590	NC_012109	GTT	2	6	26509	26514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372024
591	NC_012109	GGTC	2	8	26530	26537	0 %	25 %	50 %	25 %	224372024
592	NC_012109	GT	3	6	26545	26550	0 %	50 %	50 %	0 %	224372024
593	NC_012109	TCT	2	6	26568	26573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372024
594	NC_012109	CAG	2	6	26588	26593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224372024
595	NC_012109	ACG	2	6	26624	26629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224372024
596	NC_012109	CTT	2	6	26644	26649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_012109	TAA	2	6	26665	26670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_012109	TCT	2	6	26793	26798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_012109	ACC	2	6	26810	26815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	224372025
600	NC_012109	CGTACC	2	12	26849	26860	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	224372025
601	NC_012109	TAC	2	6	26993	26998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372025
602	NC_012109	T	6	6	27033	27038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_012109	GAC	2	6	27050	27055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_012109	GGT	2	6	27094	27099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_012109	AT	4	8	27166	27173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_012109	CAA	2	6	27230	27235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	224372026
607	NC_012109	TGAT	2	8	27258	27265	25 %	50 %	25 %	0 %	224372026
608	NC_012109	ATT	2	6	27280	27285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	224372026
609	NC_012109	ATC	2	6	27334	27339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372026
610	NC_012109	ATC	2	6	27351	27356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372026
611	NC_012109	AAG	2	6	27375	27380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372026
612	NC_012109	ATC	2	6	27475	27480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372026
613	NC_012109	TGAAGC	2	12	27487	27498	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	224372026
614	NC_012109	AAAT	2	8	27628	27635	75 %	25 %	0 %	0 %	224372026
615	NC_012109	T	6	6	27641	27646	0 %	100 %	0 %	0 %	224372026
616	NC_012109	CT	3	6	27654	27659	0 %	50 %	0 %	50 %	224372026
617	NC_012109	CAT	2	6	27728	27733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372026
618	NC_012109	CTG	2	6	27756	27761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224372026
619	NC_012109	AGA	2	6	27802	27807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	224372026
620	NC_012109	CAT	2	6	27891	27896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_012109	TCA	2	6	27906	27911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_012109	CAACC	2	10	27949	27958	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
623	NC_012109	CCCAC	2	10	27999	28008	20 %	0 %	0 %	80 %	224372027
624	NC_012109	GGC	2	6	28094	28099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	224372027
625	NC_012109	GCT	2	6	28179	28184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224372027
626	NC_012109	T	6	6	28214	28219	0 %	100 %	0 %	0 %	224372027
627	NC_012109	TAA	2	6	28274	28279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	224372027
628	NC_012109	TCG	2	6	28284	28289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	224372027
629	NC_012109	GTT	2	6	28297	28302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	224372027
630	NC_012109	TCT	2	6	28368	28373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	224372027
631	NC_012109	TCC	2	6	28500	28505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	224372027
632	NC_012109	TCA	2	6	28597	28602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	224372027
633	NC_012109	GCA	2	6	28692	28697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	224372027
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728	NC_012109	TTTAT	2	10	34268	34277	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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886	NC_012109	A	7	7	42767	42773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
887	NC_012109	T	8	8	42859	42866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
888	NC_012109	GTTG	2	8	42917	42924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
889	NC_012109	AGA	2	6	42929	42934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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