MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Desulfitobacterium hafniense DCB-2 chromosome

Total Repeats: 68532

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011830	CCT	2	6	194	199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219666072
2	NC_011830	CAT	2	6	278	283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666072
3	NC_011830	ACA	2	6	354	359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219666072
4	NC_011830	TCT	2	6	387	392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219666072
5	NC_011830	GCC	3	9	486	494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219666072
6	NC_011830	AAG	2	6	760	765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666072
7	NC_011830	AGG	2	6	772	777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219666072
8	NC_011830	TTC	2	6	780	785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219666072
9	NC_011830	ATG	2	6	805	810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666072
10	NC_011830	ATT	3	9	822	830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666072
11	NC_011830	TCC	2	6	831	836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219666072
12	NC_011830	TCC	2	6	842	847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219666072
13	NC_011830	CCG	2	6	918	923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219666072
14	NC_011830	ATT	2	6	1128	1133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666072
15	NC_011830	TGA	2	6	1313	1318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666072
16	NC_011830	GGA	2	6	1323	1328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219666072
17	NC_011830	ACC	2	6	1338	1343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219666072
18	NC_011830	GCC	2	6	1375	1380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219666072
19	NC_011830	TTA	2	6	1638	1643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011830	GAG	2	6	1683	1688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011830	GCT	2	6	1689	1694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011830	CGT	2	6	1862	1867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219666073
23	NC_011830	TTC	2	6	1900	1905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219666073
24	NC_011830	GGA	2	6	2030	2035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219666073
25	NC_011830	TTA	2	6	2043	2048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666073
26	NC_011830	CTG	2	6	2131	2136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219666073
27	NC_011830	TAT	2	6	2273	2278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666073
28	NC_011830	TAT	2	6	2464	2469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666073
29	NC_011830	CTT	2	6	2503	2508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219666073
30	NC_011830	TAT	2	6	2537	2542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666073
31	NC_011830	ATT	2	6	2685	2690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666073
32	NC_011830	CGA	2	6	2753	2758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219666073
33	NC_011830	ACC	2	6	2810	2815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_011830	GCG	2	6	3046	3051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219666074
35	NC_011830	ATT	2	6	3092	3097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666074
36	NC_011830	CAC	2	6	3239	3244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219666074
37	NC_011830	CCT	2	6	3301	3306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219666074
38	NC_011830	TCC	2	6	3369	3374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219666074
39	NC_011830	TTC	2	6	3457	3462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219666074
40	NC_011830	AGA	2	6	3469	3474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666074
41	NC_011830	GGA	2	6	3514	3519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219666074
42	NC_011830	GAC	2	6	3605	3610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219666074
43	NC_011830	GCA	2	6	3661	3666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219666074
44	NC_011830	GAT	2	6	3749	3754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666074
45	NC_011830	GCA	2	6	3814	3819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219666074
46	NC_011830	GGA	2	6	3900	3905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219666074
47	NC_011830	AAT	2	6	3909	3914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219666074
48	NC_011830	GGC	2	6	3932	3937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219666075
49	NC_011830	ATT	2	6	4085	4090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666075
50	NC_011830	TCA	2	6	4121	4126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666075
51	NC_011830	TTA	2	6	4133	4138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666075
52	NC_011830	ATC	2	6	4157	4162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666075
53	NC_011830	GAA	2	6	4166	4171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666075
54	NC_011830	AAG	2	6	4183	4188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011830	CAT	2	6	4464	4469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666076
56	NC_011830	ATA	2	6	4489	4494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219666076
57	NC_011830	CGA	2	6	4499	4504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219666076
58	NC_011830	GTG	2	6	4566	4571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219666076
59	NC_011830	GGA	2	6	4656	4661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219666076
60	NC_011830	ATC	2	6	4777	4782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666076
61	NC_011830	ACC	2	6	4854	4859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219666076
62	NC_011830	AGA	2	6	4985	4990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666076
63	NC_011830	CGG	2	6	5015	5020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219666076
64	NC_011830	AAT	2	6	5169	5174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219666076
65	NC_011830	CCG	2	6	5317	5322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219666076
66	NC_011830	AGC	2	6	5507	5512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219666076
67	NC_011830	AAG	2	6	5596	5601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666076
68	NC_011830	TCG	2	6	5669	5674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219666076
69	NC_011830	CTT	3	9	5891	5899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219666076
70	NC_011830	GAA	2	6	5966	5971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666076
71	NC_011830	TGG	2	6	6196	6201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219666076
72	NC_011830	GGA	2	6	6262	6267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011830	GGA	2	6	6292	6297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219666077
74	NC_011830	GGA	2	6	6321	6326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219666077
75	NC_011830	ATT	2	6	6347	6352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666077
76	NC_011830	CGC	2	6	6415	6420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219666077
77	NC_011830	TAA	2	6	6456	6461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219666077
78	NC_011830	TCC	2	6	6526	6531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219666077
79	NC_011830	ATG	2	6	6536	6541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666077
80	NC_011830	GGT	2	6	6543	6548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219666077
81	NC_011830	ATG	2	6	6725	6730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666077
82	NC_011830	CGG	2	6	6791	6796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219666077
83	NC_011830	TGA	2	6	6902	6907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666077
84	NC_011830	GAG	2	6	7024	7029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219666077
85	NC_011830	GAA	2	6	7258	7263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666077
86	NC_011830	TAT	2	6	7464	7469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666077
87	NC_011830	TGA	2	6	7482	7487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666077
88	NC_011830	ATT	2	6	7678	7683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666077
89	NC_011830	GAT	2	6	7780	7785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666077
90	NC_011830	GAA	2	6	7786	7791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666077
91	NC_011830	TCA	2	6	7796	7801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666077
92	NC_011830	GCG	2	6	7857	7862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219666077
93	NC_011830	ACC	2	6	7924	7929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219666077
94	NC_011830	TCT	2	6	7949	7954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219666077
95	NC_011830	ACC	2	6	7957	7962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219666077
96	NC_011830	GAA	2	6	8062	8067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666077
97	NC_011830	CCG	2	6	8075	8080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219666077
98	NC_011830	AAG	2	6	8146	8151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666077
99	NC_011830	TGA	3	9	8214	8222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666077
100	NC_011830	TGA	2	6	8250	8255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666077
101	NC_011830	ATC	2	6	8260	8265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666077
102	NC_011830	GAA	2	6	8401	8406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666077
103	NC_011830	GGC	2	6	8482	8487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219666077
104	NC_011830	CAT	2	6	8493	8498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666077
105	NC_011830	CCA	2	6	8501	8506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219666077
106	NC_011830	TGG	2	6	8531	8536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219666077
107	NC_011830	TGA	2	6	8546	8551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666077
108	NC_011830	ATG	2	6	8566	8571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666077
109	NC_011830	ATC	2	6	8572	8577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666077
110	NC_011830	ATT	2	6	8590	8595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666077
111	NC_011830	GTG	2	6	8677	8682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219666077
112	NC_011830	CGT	2	6	8691	8696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219666077
113	NC_011830	AGA	2	6	8706	8711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666077
114	NC_011830	TAG	2	6	8735	8740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666077
115	NC_011830	AAT	2	6	8756	8761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219666077
116	NC_011830	TAT	2	6	8894	8899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666078
117	NC_011830	CGC	2	6	9251	9256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219666078
118	NC_011830	ATG	2	6	9272	9277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666078
119	NC_011830	GGA	2	6	9466	9471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011830	AGT	2	6	9513	9518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666079
121	NC_011830	AAG	3	9	9575	9583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666079
122	NC_011830	CTT	2	6	9595	9600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219666079
123	NC_011830	AGC	2	6	9683	9688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219666079
124	NC_011830	TGA	2	6	9822	9827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666079
125	NC_011830	CCT	2	6	10057	10062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219666079
126	NC_011830	GAA	2	6	10114	10119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666079
127	NC_011830	ATT	2	6	10145	10150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219666079
128	NC_011830	GAA	2	6	10195	10200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219666079
129	NC_011830	TCA	2	6	10227	10232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666079
130	NC_011830	GCA	2	6	10302	10307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219666079
131	NC_011830	TAA	2	6	10314	10319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219666079
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260	NC_011830	GGA	2	6	22443	22448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219666093
261	NC_011830	ATA	2	6	22490	22495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219666093
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267	NC_011830	ATA	2	6	22898	22903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219666094
268	NC_011830	TTG	2	6	22990	22995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
269	NC_011830	TAA	2	6	23173	23178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_011830	AGA	2	6	23237	23242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
271	NC_011830	GAA	2	6	23292	23297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
272	NC_011830	GAA	2	6	23302	23307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
273	NC_011830	TCA	2	6	23385	23390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219666095
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385	NC_011830	CCG	2	6	30971	30976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219666102
386	NC_011830	CCT	2	6	31032	31037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219666102
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391	NC_011830	CTT	2	6	31285	31290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219666103
392	NC_011830	CCT	2	6	31311	31316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219666103
393	NC_011830	GTC	2	6	31346	31351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219666103
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397	NC_011830	TTC	2	6	31622	31627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219666103
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403	NC_011830	GGC	2	6	31882	31887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219666103
404	NC_011830	CTG	2	6	31892	31897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219666103
405	NC_011830	ATG	2	6	31925	31930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219666103
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413	NC_011830	TAT	2	6	32629	32634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_011830	GCG	2	6	39609	39614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219666111
499	NC_011830	CAG	2	6	39615	39620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219666111
500	NC_011830	TCG	2	6	39673	39678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219666111

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