MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Delftia acidovorans SPH-1 chromosome

Total Repeats: 175253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010002	ACA	2	6	55940	55945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_010002	GCG	2	6	56027	56032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895501
1503	NC_010002	GC	3	6	56123	56128	0 %	0 %	50 %	50 %	160895501
1504	NC_010002	CAT	2	6	56163	56168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895501
1505	NC_010002	GCC	2	6	56186	56191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895501
1506	NC_010002	ATC	2	6	56224	56229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895501
1507	NC_010002	GCG	2	6	56238	56243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895501
1508	NC_010002	CGA	2	6	56304	56309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895501
1509	NC_010002	GCC	3	9	56311	56319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895501
1510	NC_010002	CACG	2	8	56412	56419	25 %	0 %	25 %	50 %	160895501
1511	NC_010002	GGC	2	6	56424	56429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895501
1512	NC_010002	CGCAG	2	10	56449	56458	20 %	0 %	40 %	40 %	160895501
1513	NC_010002	CCA	2	6	56459	56464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160895501
1514	NC_010002	CGACAT	2	12	56520	56531	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	160895501
1515	NC_010002	GC	4	8	56539	56546	0 %	0 %	50 %	50 %	160895501
1516	NC_010002	CTG	2	6	56548	56553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895501
1517	NC_010002	CG	3	6	56563	56568	0 %	0 %	50 %	50 %	160895501
1518	NC_010002	CGGC	2	8	56579	56586	0 %	0 %	50 %	50 %	160895501
1519	NC_010002	AAG	2	6	56602	56607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160895501
1520	NC_010002	CGAGGC	2	12	56619	56630	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	160895501
1521	NC_010002	AAG	2	6	56638	56643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160895501
1522	NC_010002	AAG	2	6	56680	56685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160895501
1523	NC_010002	CG	3	6	56696	56701	0 %	0 %	50 %	50 %	160895501
1524	NC_010002	GAA	2	6	56716	56721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160895501
1525	NC_010002	CTG	2	6	56734	56739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895501
1526	NC_010002	AAG	2	6	56764	56769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160895501
1527	NC_010002	GGC	2	6	56782	56787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895501
1528	NC_010002	AGC	2	6	56927	56932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_010002	GC	3	6	56965	56970	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_010002	TG	3	6	56987	56992	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_010002	TGGC	2	8	57000	57007	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1532	NC_010002	CGC	2	6	57010	57015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_010002	AGACC	2	10	57055	57064	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1534	NC_010002	GAA	2	6	57081	57086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160895502
1535	NC_010002	ACC	2	6	57136	57141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160895502
1536	NC_010002	CTC	2	6	57240	57245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160895502
1537	NC_010002	CAG	2	6	57304	57309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895502
1538	NC_010002	GCC	2	6	57318	57323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895502
1539	NC_010002	GCT	2	6	57333	57338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895502
1540	NC_010002	TGA	2	6	57344	57349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160895502
1541	NC_010002	CAG	2	6	57352	57357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895502
1542	NC_010002	TCG	2	6	57371	57376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895502
1543	NC_010002	CGCGG	2	10	57382	57391	0 %	0 %	60 %	40 %	160895502
1544	NC_010002	CG	3	6	57418	57423	0 %	0 %	50 %	50 %	160895502
1545	NC_010002	GCG	2	6	57446	57451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895502
1546	NC_010002	GCA	2	6	57452	57457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895502
1547	NC_010002	TGG	2	6	57476	57481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895502
1548	NC_010002	CGG	2	6	57531	57536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895502
1549	NC_010002	GCG	2	6	57542	57547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895502
1550	NC_010002	CGG	2	6	57552	57557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895502
1551	NC_010002	GGC	2	6	57565	57570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895502
1552	NC_010002	GC	3	6	57578	57583	0 %	0 %	50 %	50 %	160895502
1553	NC_010002	CCA	2	6	57593	57598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	160895502
1554	NC_010002	CG	3	6	57602	57607	0 %	0 %	50 %	50 %	160895502
1555	NC_010002	TGG	2	6	57629	57634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895502
1556	NC_010002	GGC	2	6	57694	57699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895502
1557	NC_010002	GC	3	6	57704	57709	0 %	0 %	50 %	50 %	160895502
1558	NC_010002	CGG	2	6	57714	57719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895502
1559	NC_010002	CCG	2	6	57722	57727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895502
1560	NC_010002	AC	3	6	57746	57751	50 %	0 %	0 %	50 %	160895502
1561	NC_010002	CGC	3	9	57774	57782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895502
1562	NC_010002	CG	3	6	57811	57816	0 %	0 %	50 %	50 %	160895502
1563	NC_010002	AGGGCC	2	12	57845	57856	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	160895502
1564	NC_010002	GCG	2	6	57860	57865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895502
1565	NC_010002	CGG	2	6	57885	57890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895502
1566	NC_010002	GCC	2	6	57928	57933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895502
1567	NC_010002	GC	3	6	57945	57950	0 %	0 %	50 %	50 %	160895502
1568	NC_010002	GCC	2	6	58070	58075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895502
1569	NC_010002	GCA	2	6	58117	58122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_010002	G	6	6	58163	58168	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_010002	CGGC	2	8	58177	58184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_010002	GGC	2	6	58201	58206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_010002	GCG	2	6	58304	58309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895503
1574	NC_010002	GGCC	2	8	58318	58325	0 %	0 %	50 %	50 %	160895503
1575	NC_010002	CTT	2	6	58332	58337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160895503
1576	NC_010002	GGGC	2	8	58342	58349	0 %	0 %	75 %	25 %	160895503
1577	NC_010002	CGC	2	6	58364	58369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895503
1578	NC_010002	GCC	2	6	58395	58400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895503
1579	NC_010002	TGGC	2	8	58401	58408	0 %	25 %	50 %	25 %	160895503
1580	NC_010002	T	6	6	58415	58420	0 %	100 %	0 %	0 %	160895503
1581	NC_010002	CTG	2	6	58437	58442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895503
1582	NC_010002	TGG	2	6	58452	58457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895503
1583	NC_010002	GGC	2	6	58472	58477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895503
1584	NC_010002	CCTG	2	8	58492	58499	0 %	25 %	25 %	50 %	160895503
1585	NC_010002	GGC	2	6	58515	58520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895503
1586	NC_010002	GCC	2	6	58524	58529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895503
1587	NC_010002	TGGCTG	2	12	58539	58550	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	160895503
1588	NC_010002	GCG	2	6	58551	58556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895503
1589	NC_010002	CTG	2	6	58563	58568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895503
1590	NC_010002	CCGA	2	8	58620	58627	25 %	0 %	25 %	50 %	160895503
1591	NC_010002	GCCGC	2	10	58650	58659	0 %	0 %	40 %	60 %	160895503
1592	NC_010002	GC	4	8	58712	58719	0 %	0 %	50 %	50 %	160895503
1593	NC_010002	TGGAG	2	10	58756	58765	20 %	20 %	60 %	0 %	160895503
1594	NC_010002	GCTG	2	8	58777	58784	0 %	25 %	50 %	25 %	160895503
1595	NC_010002	GC	3	6	58786	58791	0 %	0 %	50 %	50 %	160895503
1596	NC_010002	CTGG	2	8	58829	58836	0 %	25 %	50 %	25 %	160895503
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1598	NC_010002	GCC	2	6	58908	58913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895503
1599	NC_010002	CTGG	2	8	58934	58941	0 %	25 %	50 %	25 %	160895503
1600	NC_010002	CCT	2	6	58975	58980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	160895503
1601	NC_010002	GCC	2	6	58999	59004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895503
1602	NC_010002	GTG	2	6	59052	59057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895503
1603	NC_010002	GCCCGA	2	12	59063	59074	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	160895503
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1605	NC_010002	CTT	2	6	59140	59145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160895504
1606	NC_010002	GCG	2	6	59177	59182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895504
1607	NC_010002	CG	4	8	59253	59260	0 %	0 %	50 %	50 %	160895504
1608	NC_010002	TCG	2	6	59276	59281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895504
1609	NC_010002	GC	3	6	59334	59339	0 %	0 %	50 %	50 %	160895504
1610	NC_010002	GGCG	2	8	59341	59348	0 %	0 %	75 %	25 %	160895504
1611	NC_010002	CTT	2	6	59365	59370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160895504
1612	NC_010002	CAG	2	6	59416	59421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895504
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1614	NC_010002	CAG	2	6	59446	59451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895504
1615	NC_010002	G	6	6	59542	59547	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_010002	GC	3	6	59556	59561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1617	NC_010002	GTT	2	6	59613	59618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160895505
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1619	NC_010002	CG	4	8	59663	59670	0 %	0 %	50 %	50 %	160895505
1620	NC_010002	GC	3	6	59712	59717	0 %	0 %	50 %	50 %	160895505
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1626	NC_010002	GGCT	2	8	59938	59945	0 %	25 %	50 %	25 %	160895505
1627	NC_010002	TGC	2	6	59957	59962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895505
1628	NC_010002	GCG	2	6	59966	59971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895505
1629	NC_010002	ATG	2	6	59992	59997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160895505
1630	NC_010002	CG	3	6	60011	60016	0 %	0 %	50 %	50 %	160895505
1631	NC_010002	GCT	2	6	60029	60034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895505
1632	NC_010002	TGT	2	6	60047	60052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	160895505
1633	NC_010002	CAG	2	6	60135	60140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895505
1634	NC_010002	CGA	2	6	60176	60181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895505
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1637	NC_010002	CCG	2	6	60244	60249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895505
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1642	NC_010002	AAG	2	6	60358	60363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160895505
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1646	NC_010002	TGG	3	9	60593	60601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895505
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1650	NC_010002	GCG	2	6	60745	60750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895505
1651	NC_010002	GCGCTG	2	12	60757	60768	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	160895505
1652	NC_010002	CAG	2	6	60774	60779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895505
1653	NC_010002	GCG	2	6	60783	60788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895505
1654	NC_010002	CG	3	6	60787	60792	0 %	0 %	50 %	50 %	160895505
1655	NC_010002	GTG	2	6	60837	60842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1656	NC_010002	GCG	2	6	60864	60869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1657	NC_010002	TCT	2	6	60946	60951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160895506
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1667	NC_010002	GCCG	2	8	61166	61173	0 %	0 %	50 %	50 %	160895506
1668	NC_010002	GCG	2	6	61184	61189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895506
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1742	NC_010002	TTC	3	9	63959	63967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160895509
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1744	NC_010002	GCG	2	6	64080	64085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895509
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1751	NC_010002	CG	3	6	64269	64274	0 %	0 %	50 %	50 %	160895509
1752	NC_010002	GC	3	6	64288	64293	0 %	0 %	50 %	50 %	160895509
1753	NC_010002	CGC	2	6	64296	64301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895509
1754	NC_010002	GTG	2	6	64448	64453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	160895509
1755	NC_010002	AAG	2	6	64484	64489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	160895509
1756	NC_010002	GGC	2	6	64490	64495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895509
1757	NC_010002	CTTTG	2	10	64566	64575	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1758	NC_010002	TGCG	2	8	64608	64615	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1759	NC_010002	GCG	2	6	64622	64627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1760	NC_010002	CGCTGG	2	12	64720	64731	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	160895510
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1762	NC_010002	CAG	2	6	64809	64814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895510
1763	NC_010002	GCA	2	6	64858	64863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895510
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1765	NC_010002	CAAGGG	2	12	65012	65023	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	160895510
1766	NC_010002	CAT	2	6	65033	65038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	160895510
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1768	NC_010002	CGA	2	6	65135	65140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895510
1769	NC_010002	TGC	2	6	65179	65184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895510
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1771	NC_010002	CGA	2	6	65234	65239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895510
1772	NC_010002	GC	4	8	65257	65264	0 %	0 %	50 %	50 %	160895510
1773	NC_010002	TCT	2	6	65302	65307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160895510
1774	NC_010002	GGC	3	9	65316	65324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895510
1775	NC_010002	CGG	2	6	65330	65335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895510
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1779	NC_010002	CG	3	6	65574	65579	0 %	0 %	50 %	50 %	160895510
1780	NC_010002	GCT	2	6	65639	65644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895510
1781	NC_010002	GCC	2	6	65680	65685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895510
1782	NC_010002	CGC	2	6	65686	65691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895510
1783	NC_010002	GCG	2	6	65791	65796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895510
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1785	NC_010002	GC	3	6	65869	65874	0 %	0 %	50 %	50 %	160895510
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1787	NC_010002	C	6	6	66011	66016	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1788	NC_010002	CGG	2	6	66047	66052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1789	NC_010002	A	6	6	66093	66098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1790	NC_010002	GC	3	6	66215	66220	0 %	0 %	50 %	50 %	160895511
1791	NC_010002	TCT	2	6	66271	66276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	160895511
1792	NC_010002	GCTCGG	2	12	66283	66294	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	160895511
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1802	NC_010002	CGGC	2	8	66553	66560	0 %	0 %	50 %	50 %	160895511
1803	NC_010002	GC	3	6	66559	66564	0 %	0 %	50 %	50 %	160895511
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1822	NC_010002	GC	3	6	67217	67222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1823	NC_010002	GAT	2	6	67228	67233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	160895512
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1825	NC_010002	GCG	2	6	67250	67255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895512
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1828	NC_010002	GCA	2	6	67287	67292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	160895512
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1830	NC_010002	GT	3	6	67301	67306	0 %	50 %	50 %	0 %	160895512
1831	NC_010002	GCG	3	9	67317	67325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895512
1832	NC_010002	GGC	2	6	67326	67331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895512
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1880	NC_010002	GCT	2	6	69099	69104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895513
1881	NC_010002	CGG	2	6	69161	69166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	160895513
1882	NC_010002	ACTTCC	2	12	69224	69235	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	160895513
1883	NC_010002	TGC	2	6	69248	69253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	160895513
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1990	NC_010002	CGAT	2	8	73104	73111	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1991	NC_010002	GATT	2	8	73140	73147	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1999	NC_010002	CCG	2	6	73637	73642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	160895518
2000	NC_010002	GGCT	2	8	73677	73684	0 %	25 %	50 %	25 %	160895518

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