MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Dinoroseobacter shibae DFL 12 plasmid pDSHI05

Total Repeats: 1836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009959	GAAG	2	8	37092	37099	50 %	0 %	50 %	0 %	159046713
1002	NC_009959	GC	4	8	37100	37107	0 %	0 %	50 %	50 %	159046713
1003	NC_009959	CGG	2	6	37136	37141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046713
1004	NC_009959	CGC	2	6	37191	37196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046713
1005	NC_009959	CCA	2	6	37201	37206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046713
1006	NC_009959	CAC	3	9	37221	37229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_009959	CA	3	6	37268	37273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_009959	GAC	2	6	37289	37294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_009959	AAG	2	6	37311	37316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159046714
1010	NC_009959	GC	3	6	37367	37372	0 %	0 %	50 %	50 %	159046714
1011	NC_009959	GTCG	2	8	37395	37402	0 %	25 %	50 %	25 %	159046714
1012	NC_009959	CAG	2	6	37426	37431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046714
1013	NC_009959	CGA	2	6	37515	37520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046714
1014	NC_009959	CGC	2	6	37650	37655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046714
1015	NC_009959	CAA	2	6	37758	37763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159046714
1016	NC_009959	CGG	2	6	37784	37789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046714
1017	NC_009959	GCA	3	9	37820	37828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046714
1018	NC_009959	GCA	2	6	37902	37907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046714
1019	NC_009959	TGA	2	6	38021	38026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046714
1020	NC_009959	CGA	2	6	38052	38057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046714
1021	NC_009959	ACGCG	2	10	38061	38070	20 %	0 %	40 %	40 %	159046714
1022	NC_009959	GCC	2	6	38077	38082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046714
1023	NC_009959	ACG	2	6	38126	38131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046714
1024	NC_009959	CTCG	2	8	38133	38140	0 %	25 %	25 %	50 %	159046714
1025	NC_009959	CGC	2	6	38190	38195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046714
1026	NC_009959	CG	3	6	38262	38267	0 %	0 %	50 %	50 %	159046714
1027	NC_009959	TCG	2	6	38270	38275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046714
1028	NC_009959	G	6	6	38303	38308	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_009959	C	6	6	38325	38330	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1030	NC_009959	ACCG	2	8	38400	38407	25 %	0 %	25 %	50 %	159046715
1031	NC_009959	CCGC	2	8	38443	38450	0 %	0 %	25 %	75 %	159046715
1032	NC_009959	GCC	2	6	38485	38490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046715
1033	NC_009959	CG	3	6	38496	38501	0 %	0 %	50 %	50 %	159046715
1034	NC_009959	GTG	2	6	38511	38516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046715
1035	NC_009959	TCG	2	6	38548	38553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046715
1036	NC_009959	CGT	2	6	38555	38560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046715
1037	NC_009959	GC	3	6	38577	38582	0 %	0 %	50 %	50 %	159046715
1038	NC_009959	CTG	2	6	38586	38591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046715
1039	NC_009959	GAG	2	6	38613	38618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046715
1040	NC_009959	CTT	2	6	38699	38704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046715
1041	NC_009959	GCCC	2	8	38717	38724	0 %	0 %	25 %	75 %	159046715
1042	NC_009959	CGT	2	6	38735	38740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046715
1043	NC_009959	GC	4	8	38742	38749	0 %	0 %	50 %	50 %	159046715
1044	NC_009959	CGG	2	6	38819	38824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046715
1045	NC_009959	GCC	3	9	38910	38918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046715
1046	NC_009959	GAC	2	6	38942	38947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046715
1047	NC_009959	C	6	6	38973	38978	0 %	0 %	0 %	100 %	159046716
1048	NC_009959	CTG	2	6	39017	39022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046716
1049	NC_009959	GAT	2	6	39037	39042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046716
1050	NC_009959	GTCG	2	8	39055	39062	0 %	25 %	50 %	25 %	159046716
1051	NC_009959	TTC	2	6	39065	39070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046716
1052	NC_009959	GAT	2	6	39115	39120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046716
1053	NC_009959	GGCG	2	8	39169	39176	0 %	0 %	75 %	25 %	159046716
1054	NC_009959	G	6	6	39191	39196	0 %	0 %	100 %	0 %	159046716
1055	NC_009959	CG	3	6	39224	39229	0 %	0 %	50 %	50 %	159046716
1056	NC_009959	GCTC	2	8	39237	39244	0 %	25 %	25 %	50 %	159046716
1057	NC_009959	GGGC	2	8	39247	39254	0 %	0 %	75 %	25 %	159046716
1058	NC_009959	TTC	2	6	39284	39289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046716
1059	NC_009959	GGC	2	6	39290	39295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046716
1060	NC_009959	CCG	2	6	39312	39317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046716
1061	NC_009959	CGG	2	6	39372	39377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046716
1062	NC_009959	CGG	2	6	39384	39389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046716
1063	NC_009959	CCT	2	6	39399	39404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046716
1064	NC_009959	CGG	2	6	39405	39410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046716
1065	NC_009959	GAT	2	6	39421	39426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046716
1066	NC_009959	GC	3	6	39480	39485	0 %	0 %	50 %	50 %	159046716
1067	NC_009959	CTG	2	6	39527	39532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046716
1068	NC_009959	CTGG	2	8	39547	39554	0 %	25 %	50 %	25 %	159046716
1069	NC_009959	GCC	2	6	39581	39586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046716
1070	NC_009959	CG	3	6	39620	39625	0 %	0 %	50 %	50 %	159046716
1071	NC_009959	ATC	2	6	39650	39655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046716
1072	NC_009959	CGG	2	6	39658	39663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046716
1073	NC_009959	GTC	2	6	39737	39742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046716
1074	NC_009959	GCG	2	6	39801	39806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046716
1075	NC_009959	GCT	2	6	39808	39813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046716
1076	NC_009959	ATC	2	6	39815	39820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046716
1077	NC_009959	CTCGG	2	10	39839	39848	0 %	20 %	40 %	40 %	159046716
1078	NC_009959	TGG	2	6	39879	39884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046716
1079	NC_009959	GCT	2	6	39928	39933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046716
1080	NC_009959	TGC	2	6	39936	39941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046716
1081	NC_009959	GAT	2	6	39964	39969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046716
1082	NC_009959	ATC	2	6	40001	40006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046716
1083	NC_009959	TCT	2	6	40020	40025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046716
1084	NC_009959	ATC	2	6	40112	40117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046716
1085	NC_009959	TGA	2	6	40152	40157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046716
1086	NC_009959	CTT	2	6	40171	40176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046716
1087	NC_009959	TCG	2	6	40185	40190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046716
1088	NC_009959	CCTGA	2	10	40238	40247	20 %	20 %	20 %	40 %	159046716
1089	NC_009959	CCG	2	6	40334	40339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046717
1090	NC_009959	GCCGAA	2	12	40366	40377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046717
1091	NC_009959	GGC	2	6	40388	40393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046717
1092	NC_009959	GGGC	2	8	40440	40447	0 %	0 %	75 %	25 %	159046717
1093	NC_009959	GCG	2	6	40494	40499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046717
1094	NC_009959	CCG	2	6	40506	40511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046717
1095	NC_009959	GCA	2	6	40542	40547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046717
1096	NC_009959	GCCC	2	8	40578	40585	0 %	0 %	25 %	75 %	159046717
1097	NC_009959	AAT	2	6	40636	40641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	159046717
1098	NC_009959	TGCCCG	2	12	40728	40739	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	159046717
1099	NC_009959	ACC	2	6	40742	40747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046717
1100	NC_009959	CAT	2	6	40792	40797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046717
1101	NC_009959	CCG	2	6	40809	40814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046717
1102	NC_009959	GCC	2	6	40831	40836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046717
1103	NC_009959	GC	3	6	40845	40850	0 %	0 %	50 %	50 %	159046717
1104	NC_009959	CGG	2	6	40929	40934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046717
1105	NC_009959	TGCAGG	2	12	41009	41020	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	159046717
1106	NC_009959	GTC	2	6	41029	41034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046717
1107	NC_009959	CGC	2	6	41086	41091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046717
1108	NC_009959	CCCG	2	8	41140	41147	0 %	0 %	25 %	75 %	159046717
1109	NC_009959	CAC	2	6	41159	41164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046717
1110	NC_009959	GGC	2	6	41176	41181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046717
1111	NC_009959	GCGCC	2	10	41199	41208	0 %	0 %	40 %	60 %	159046717
1112	NC_009959	CGG	2	6	41214	41219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046717
1113	NC_009959	TCCGC	2	10	41232	41241	0 %	20 %	20 %	60 %	159046717
1114	NC_009959	GC	3	6	41296	41301	0 %	0 %	50 %	50 %	159046717
1115	NC_009959	GC	4	8	41337	41344	0 %	0 %	50 %	50 %	159046717
1116	NC_009959	CCG	2	6	41345	41350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046717
1117	NC_009959	C	6	6	41397	41402	0 %	0 %	0 %	100 %	159046717
1118	NC_009959	GAC	2	6	41431	41436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046717
1119	NC_009959	TCC	2	6	41444	41449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046717
1120	NC_009959	CCG	2	6	41607	41612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046717
1121	NC_009959	CCA	2	6	41703	41708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046717
1122	NC_009959	CCG	4	12	41718	41729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046717
1123	NC_009959	GCC	2	6	41752	41757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046717
1124	NC_009959	CCG	2	6	41951	41956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046718
1125	NC_009959	TCA	2	6	42014	42019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046718
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1127	NC_009959	CCA	2	6	42113	42118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046718
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1248	NC_009959	C	7	7	47477	47483	0 %	0 %	0 %	100 %	159046723
1249	NC_009959	GCC	2	6	47502	47507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046723
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1253	NC_009959	GC	3	6	47697	47702	0 %	0 %	50 %	50 %	159046724
1254	NC_009959	CCT	2	6	47706	47711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046724
1255	NC_009959	GCG	2	6	47727	47732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046724
1256	NC_009959	GGC	2	6	47782	47787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046724
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1258	NC_009959	CGA	2	6	47923	47928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046724
1259	NC_009959	CGG	2	6	47941	47946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046724
1260	NC_009959	CG	3	6	47957	47962	0 %	0 %	50 %	50 %	159046724
1261	NC_009959	CGA	2	6	48174	48179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046725
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1263	NC_009959	TGC	2	6	48284	48289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046725
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1265	NC_009959	CCATCG	2	12	48383	48394	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	159046725
1266	NC_009959	TGGG	2	8	48406	48413	0 %	25 %	75 %	0 %	159046725
1267	NC_009959	CGC	2	6	48423	48428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046725
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1270	NC_009959	GAG	2	6	48457	48462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159046725
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1274	NC_009959	CGC	2	6	48609	48614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046725
1275	NC_009959	GTC	2	6	48634	48639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046725
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1277	NC_009959	CCGC	2	8	48656	48663	0 %	0 %	25 %	75 %	159046725
1278	NC_009959	TCG	2	6	48698	48703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046725
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1281	NC_009959	ATG	2	6	48760	48765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046725
1282	NC_009959	CCGCGT	2	12	48804	48815	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	159046725
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1284	NC_009959	GGC	2	6	48832	48837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046725
1285	NC_009959	CGA	2	6	48867	48872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046725
1286	NC_009959	CCG	2	6	48881	48886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046725
1287	NC_009959	GCC	2	6	48905	48910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046725
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1290	NC_009959	GTG	2	6	49153	49158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046725
1291	NC_009959	TGG	2	6	49232	49237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046725
1292	NC_009959	CCG	3	9	49278	49286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046725
1293	NC_009959	CGA	2	6	49299	49304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046725
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1299	NC_009959	CG	3	6	49512	49517	0 %	0 %	50 %	50 %	159046725
1300	NC_009959	CGT	2	6	49566	49571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046725
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1305	NC_009959	CGG	2	6	49737	49742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046725
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1311	NC_009959	TCA	2	6	49970	49975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046725
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1314	NC_009959	CGG	2	6	50127	50132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046725
1315	NC_009959	CGG	2	6	50148	50153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046725
1316	NC_009959	GCT	2	6	50193	50198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046725
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1319	NC_009959	CGC	2	6	50337	50342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046725
1320	NC_009959	ACG	2	6	50360	50365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046725
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1322	NC_009959	CCCG	2	8	50464	50471	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1323	NC_009959	GGA	2	6	50488	50493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1324	NC_009959	CAC	4	12	50516	50527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046726
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1329	NC_009959	AGGC	2	8	50665	50672	25 %	0 %	50 %	25 %	159046726
1330	NC_009959	TCG	2	6	50758	50763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046726
1331	NC_009959	GTC	2	6	50939	50944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046726
1332	NC_009959	GC	3	6	51079	51084	0 %	0 %	50 %	50 %	159046726
1333	NC_009959	ACC	2	6	51087	51092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046726
1334	NC_009959	CTT	2	6	51242	51247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046726
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1341	NC_009959	CG	4	8	51524	51531	0 %	0 %	50 %	50 %	159046726
1342	NC_009959	CGGG	2	8	51581	51588	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1343	NC_009959	CCCCCT	2	12	51621	51632	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	159046727
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1345	NC_009959	CGG	2	6	51736	51741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046727
1346	NC_009959	CGG	2	6	51748	51753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046727
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1349	NC_009959	GCC	2	6	51898	51903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046727
1350	NC_009959	CCG	2	6	51926	51931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046727
1351	NC_009959	CGC	2	6	51986	51991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046727
1352	NC_009959	AGC	2	6	52041	52046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159046727
1353	NC_009959	TTC	2	6	52062	52067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159046727
1354	NC_009959	CGG	2	6	52121	52126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046727
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1356	NC_009959	ACC	2	6	52199	52204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046727
1357	NC_009959	CATCGC	2	12	52264	52275	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	159046728
1358	NC_009959	TCG	2	6	52293	52298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046728
1359	NC_009959	CCA	2	6	52386	52391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159046728
1360	NC_009959	GCT	2	6	52414	52419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046728
1361	NC_009959	CTG	2	6	52469	52474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046728
1362	NC_009959	GAT	2	6	52480	52485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046728
1363	NC_009959	CGC	2	6	52528	52533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046728
1364	NC_009959	CGG	2	6	52623	52628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046728
1365	NC_009959	CCT	2	6	52675	52680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159046728
1366	NC_009959	ATC	2	6	52685	52690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159046728
1367	NC_009959	CGG	2	6	52717	52722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046728
1368	NC_009959	GGC	2	6	52763	52768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046728
1369	NC_009959	GTG	2	6	52772	52777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159046728
1370	NC_009959	GC	3	6	52841	52846	0 %	0 %	50 %	50 %	159046728
1371	NC_009959	CG	4	8	52876	52883	0 %	0 %	50 %	50 %	159046728
1372	NC_009959	GAT	2	6	52885	52890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159046728
1373	NC_009959	CTG	2	6	52913	52918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159046728
1374	NC_009959	CGG	2	6	52972	52977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159046728
1375	NC_009959	CGC	2	6	53015	53020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159046728
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